MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta smaragdinae DSM 11293 chromosome

Total Repeats: 85225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_014364	GGTC	2	8	550914	550921	0 %	25 %	50 %	25 %	302337066
10003	NC_014364	GCC	2	6	550945	550950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302337066
10004	NC_014364	CCG	2	6	551076	551081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302337066
10005	NC_014364	T	6	6	551105	551110	0 %	100 %	0 %	0 %	302337066
10006	NC_014364	CAG	2	6	551223	551228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302337066
10007	NC_014364	T	6	6	551284	551289	0 %	100 %	0 %	0 %	302337066
10008	NC_014364	T	6	6	551309	551314	0 %	100 %	0 %	0 %	302337066
10009	NC_014364	TCC	2	6	551370	551375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302337066
10010	NC_014364	GAT	2	6	551398	551403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302337066
10011	NC_014364	TAT	2	6	551418	551423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302337066
10012	NC_014364	A	6	6	551430	551435	100 %	0 %	0 %	0 %	302337066
10013	NC_014364	TCC	2	6	551462	551467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302337066
10014	NC_014364	A	6	6	551499	551504	100 %	0 %	0 %	0 %	302337066
10015	NC_014364	CGG	2	6	551523	551528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302337066
10016	NC_014364	ATC	2	6	551632	551637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302337067
10017	NC_014364	GCG	2	6	551646	551651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302337067
10018	NC_014364	AAT	2	6	551700	551705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302337067
10019	NC_014364	CAG	2	6	551718	551723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302337067
10020	NC_014364	CAG	2	6	551775	551780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302337067
10021	NC_014364	GATT	2	8	551851	551858	25 %	50 %	25 %	0 %	302337067
10022	NC_014364	GCC	2	6	551875	551880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302337067
10023	NC_014364	GGCC	2	8	551957	551964	0 %	0 %	50 %	50 %	302337067
10024	NC_014364	CAT	2	6	551990	551995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302337067
10025	NC_014364	TCG	2	6	552079	552084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302337067
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10028	NC_014364	A	6	6	552207	552212	100 %	0 %	0 %	0 %	302337067
10029	NC_014364	CCT	2	6	552244	552249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302337067
10030	NC_014364	ATG	2	6	552270	552275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302337067
10031	NC_014364	TCT	2	6	552283	552288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302337067
10032	NC_014364	TC	3	6	552329	552334	0 %	50 %	0 %	50 %	302337067
10033	NC_014364	TCT	2	6	552483	552488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302337068
10034	NC_014364	TCA	2	6	552521	552526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302337068
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10037	NC_014364	CTTC	2	8	552833	552840	0 %	50 %	0 %	50 %	302337068
10038	NC_014364	CTG	2	6	552916	552921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302337068
10039	NC_014364	TGC	2	6	552944	552949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302337068
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10041	NC_014364	GCA	2	6	553028	553033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302337068
10042	NC_014364	TTAC	2	8	553079	553086	25 %	50 %	0 %	25 %	302337068
10043	NC_014364	TAA	2	6	553092	553097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302337068
10044	NC_014364	TCA	2	6	553118	553123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302337068
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10050	NC_014364	T	6	6	553316	553321	0 %	100 %	0 %	0 %	302337068
10051	NC_014364	GATC	2	8	553329	553336	25 %	25 %	25 %	25 %	302337068
10052	NC_014364	TTTAG	2	10	553352	553361	20 %	60 %	20 %	0 %	302337068
10053	NC_014364	GAT	2	6	553525	553530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302337068
10054	NC_014364	CTGT	2	8	553538	553545	0 %	50 %	25 %	25 %	302337068
10055	NC_014364	CTG	2	6	553550	553555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302337068
10056	NC_014364	TCTT	2	8	553583	553590	0 %	75 %	0 %	25 %	302337068
10057	NC_014364	TTC	2	6	553643	553648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302337068
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10061	NC_014364	CTGA	2	8	553786	553793	25 %	25 %	25 %	25 %	302337068
10062	NC_014364	GGA	2	6	553801	553806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302337068
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10088	NC_014364	CAT	2	6	555106	555111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302337068
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10091	NC_014364	TGA	2	6	555210	555215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302337068
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10100	NC_014364	GAT	2	6	555538	555543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302337068
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10107	NC_014364	GAC	2	6	556065	556070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302337069
10108	NC_014364	TGA	2	6	556087	556092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302337069
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10110	NC_014364	CAGG	2	8	556162	556169	25 %	0 %	50 %	25 %	302337069
10111	NC_014364	TGC	2	6	556206	556211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302337069
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10122	NC_014364	TCG	2	6	557010	557015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302337070
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10220	NC_014364	CGATGC	2	12	562163	562174	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302337075
10221	NC_014364	TCCA	2	8	562351	562358	25 %	25 %	0 %	50 %	302337075
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10223	NC_014364	TGA	2	6	562476	562481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302337075
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10225	NC_014364	CGG	2	6	562591	562596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302337075
10226	NC_014364	CTC	3	9	562637	562645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302337075
10227	NC_014364	TCC	2	6	562662	562667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302337075
10228	NC_014364	GAT	2	6	562684	562689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302337075
10229	NC_014364	TGCCGA	2	12	562836	562847	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302337075
10230	NC_014364	CT	3	6	562882	562887	0 %	50 %	0 %	50 %	302337075
10231	NC_014364	ACT	2	6	562913	562918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302337075
10232	NC_014364	AGGCC	3	15	562948	562962	20 %	0 %	40 %	40 %	302337075
10233	NC_014364	GCTCG	2	10	563021	563030	0 %	20 %	40 %	40 %	302337075
10234	NC_014364	AGA	2	6	563055	563060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302337075
10235	NC_014364	CAA	2	6	563076	563081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302337075
10236	NC_014364	TGA	2	6	563100	563105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302337075
10237	NC_014364	GCG	2	6	563124	563129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302337075
10238	NC_014364	T	6	6	563170	563175	0 %	100 %	0 %	0 %	302337076
10239	NC_014364	CGG	2	6	563191	563196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302337076
10240	NC_014364	AGC	2	6	563226	563231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302337076
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10242	NC_014364	CTT	2	6	563260	563265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302337076
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10272	NC_014364	TTG	2	6	564681	564686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302337077
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10339	NC_014364	CAT	3	9	567647	567655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302337080
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10343	NC_014364	TTAT	2	8	568009	568016	25 %	75 %	0 %	0 %	302337080
10344	NC_014364	AAG	2	6	568053	568058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302337080
10345	NC_014364	A	6	6	568183	568188	100 %	0 %	0 %	0 %	302337081
10346	NC_014364	T	7	7	568237	568243	0 %	100 %	0 %	0 %	302337081
10347	NC_014364	GCA	2	6	568247	568252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302337081
10348	NC_014364	ACG	2	6	568259	568264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302337081
10349	NC_014364	A	7	7	568277	568283	100 %	0 %	0 %	0 %	302337081
10350	NC_014364	GGA	2	6	568322	568327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302337081
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10352	NC_014364	TC	3	6	568533	568538	0 %	50 %	0 %	50 %	302337081
10353	NC_014364	T	6	6	568646	568651	0 %	100 %	0 %	0 %	302337081
10354	NC_014364	ACA	2	6	568652	568657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302337081
10355	NC_014364	TC	3	6	568710	568715	0 %	50 %	0 %	50 %	302337081
10356	NC_014364	GGC	2	6	568734	568739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302337081
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10358	NC_014364	CGG	2	6	568824	568829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302337081
10359	NC_014364	ACG	2	6	568850	568855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302337081
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10478	NC_014364	A	7	7	576447	576453	100 %	0 %	0 %	0 %	302337085
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10481	NC_014364	CGG	2	6	576563	576568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302337086
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