MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta smaragdinae DSM 11293 chromosome

Total Repeats: 85225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014364	GGA	2	6	270024	270029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336809
5002	NC_014364	TCG	2	6	270045	270050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336809
5003	NC_014364	CGG	2	6	270120	270125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336809
5004	NC_014364	TCT	2	6	270301	270306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336809
5005	NC_014364	GGC	2	6	270335	270340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336809
5006	NC_014364	TGA	2	6	270389	270394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336809
5007	NC_014364	CAA	2	6	270405	270410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302336809
5008	NC_014364	GCTC	2	8	270416	270423	0 %	25 %	25 %	50 %	302336809
5009	NC_014364	ACC	2	6	270430	270435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302336809
5010	NC_014364	CAA	2	6	270438	270443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302336809
5011	NC_014364	TG	3	6	270485	270490	0 %	50 %	50 %	0 %	302336809
5012	NC_014364	ATC	2	6	270601	270606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336809
5013	NC_014364	CCTC	2	8	270613	270620	0 %	25 %	0 %	75 %	302336809
5014	NC_014364	GGA	2	6	270633	270638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336809
5015	NC_014364	TCCC	2	8	270655	270662	0 %	25 %	0 %	75 %	302336809
5016	NC_014364	ACT	2	6	270695	270700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336809
5017	NC_014364	GAA	2	6	270705	270710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336809
5018	NC_014364	CGGG	2	8	270733	270740	0 %	0 %	75 %	25 %	302336809
5019	NC_014364	TC	3	6	270768	270773	0 %	50 %	0 %	50 %	302336809
5020	NC_014364	A	6	6	270783	270788	100 %	0 %	0 %	0 %	302336809
5021	NC_014364	ACG	2	6	270798	270803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336809
5022	NC_014364	CAG	2	6	270897	270902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336810
5023	NC_014364	CTT	3	9	270932	270940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336810
5024	NC_014364	GCG	2	6	270954	270959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336810
5025	NC_014364	GTC	2	6	270984	270989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336810
5026	NC_014364	C	7	7	271037	271043	0 %	0 %	0 %	100 %	302336810
5027	NC_014364	CAG	2	6	271230	271235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336810
5028	NC_014364	GAA	2	6	271256	271261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336810
5029	NC_014364	CTC	2	6	271266	271271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336810
5030	NC_014364	GCT	2	6	271378	271383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336810
5031	NC_014364	CTC	2	6	271443	271448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336810
5032	NC_014364	AGA	2	6	271468	271473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336810
5033	NC_014364	ATC	2	6	271483	271488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336810
5034	NC_014364	TTC	2	6	271500	271505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336810
5035	NC_014364	ATCGT	2	10	271576	271585	20 %	40 %	20 %	20 %	302336810
5036	NC_014364	AAG	2	6	271587	271592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336810
5037	NC_014364	AAG	2	6	271656	271661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336810
5038	NC_014364	CT	3	6	271674	271679	0 %	50 %	0 %	50 %	302336810
5039	NC_014364	CG	3	6	271689	271694	0 %	0 %	50 %	50 %	302336810
5040	NC_014364	TA	3	6	271762	271767	50 %	50 %	0 %	0 %	302336810
5041	NC_014364	AAG	2	6	271798	271803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336810
5042	NC_014364	TGA	2	6	271868	271873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336810
5043	NC_014364	GCT	2	6	271889	271894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336810
5044	NC_014364	CT	3	6	271965	271970	0 %	50 %	0 %	50 %	302336810
5045	NC_014364	CGA	2	6	271984	271989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336810
5046	NC_014364	TTGA	2	8	272027	272034	25 %	50 %	25 %	0 %	302336810
5047	NC_014364	GTT	2	6	272040	272045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336810
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5049	NC_014364	TTC	2	6	272229	272234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336810
5050	NC_014364	TCA	2	6	272327	272332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336810
5051	NC_014364	GTCGCC	2	12	272355	272366	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	302336810
5052	NC_014364	ATT	2	6	272397	272402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302336810
5053	NC_014364	T	6	6	272452	272457	0 %	100 %	0 %	0 %	302336810
5054	NC_014364	TTC	2	6	272481	272486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336810
5055	NC_014364	CGAA	2	8	272542	272549	50 %	0 %	25 %	25 %	302336810
5056	NC_014364	CAT	2	6	272559	272564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336810
5057	NC_014364	CT	3	6	272625	272630	0 %	50 %	0 %	50 %	302336810
5058	NC_014364	CGC	2	6	272702	272707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336810
5059	NC_014364	CTT	2	6	272745	272750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336810
5060	NC_014364	GCG	2	6	272764	272769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336810
5061	NC_014364	TGA	2	6	272777	272782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336810
5062	NC_014364	CAC	2	6	272820	272825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302336810
5063	NC_014364	CGT	2	6	272888	272893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336810
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5065	NC_014364	ACG	2	6	273013	273018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336810
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5070	NC_014364	GA	3	6	273404	273409	50 %	0 %	50 %	0 %	302336810
5071	NC_014364	CA	3	6	273421	273426	50 %	0 %	0 %	50 %	302336810
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5087	NC_014364	GA	3	6	273993	273998	50 %	0 %	50 %	0 %	302336810
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5090	NC_014364	TGA	2	6	274055	274060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336810
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5103	NC_014364	GGAC	2	8	274814	274821	25 %	0 %	50 %	25 %	302336811
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5107	NC_014364	TCC	2	6	275001	275006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336812
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5110	NC_014364	TGG	2	6	275194	275199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336812
5111	NC_014364	GAT	3	9	275261	275269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336812
5112	NC_014364	GCG	2	6	275289	275294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336812
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5119	NC_014364	CCT	2	6	275662	275667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336813
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5121	NC_014364	CCG	3	9	275836	275844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336813
5122	NC_014364	T	6	6	275855	275860	0 %	100 %	0 %	0 %	302336813
5123	NC_014364	CCA	2	6	275900	275905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302336813
5124	NC_014364	C	6	6	275922	275927	0 %	0 %	0 %	100 %	302336813
5125	NC_014364	GTT	2	6	275967	275972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336813
5126	NC_014364	TCC	3	9	276015	276023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336813
5127	NC_014364	T	7	7	276057	276063	0 %	100 %	0 %	0 %	302336813
5128	NC_014364	CGG	2	6	276074	276079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336813
5129	NC_014364	CGG	2	6	276124	276129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336813
5130	NC_014364	TCA	2	6	276160	276165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336813
5131	NC_014364	CA	3	6	276164	276169	50 %	0 %	0 %	50 %	302336813
5132	NC_014364	ACC	2	6	276178	276183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302336813
5133	NC_014364	T	6	6	276216	276221	0 %	100 %	0 %	0 %	302336813
5134	NC_014364	TCC	2	6	276243	276248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336813
5135	NC_014364	TGCA	2	8	276254	276261	25 %	25 %	25 %	25 %	302336813
5136	NC_014364	CGC	2	6	276323	276328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336813
5137	NC_014364	CCGA	2	8	276351	276358	25 %	0 %	25 %	50 %	302336813
5138	NC_014364	GATC	2	8	276380	276387	25 %	25 %	25 %	25 %	302336813
5139	NC_014364	TTC	2	6	276465	276470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336813
5140	NC_014364	TGT	2	6	276531	276536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336813
5141	NC_014364	TGA	2	6	276551	276556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336813
5142	NC_014364	AAT	2	6	276648	276653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336814
5143	NC_014364	GA	3	6	276768	276773	50 %	0 %	50 %	0 %	302336814
5144	NC_014364	ATG	2	6	276778	276783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336814
5145	NC_014364	CCTGAG	2	12	276818	276829	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302336814
5146	NC_014364	CTG	2	6	276848	276853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336814
5147	NC_014364	CCG	3	9	276888	276896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336814
5148	NC_014364	T	6	6	276965	276970	0 %	100 %	0 %	0 %	302336814
5149	NC_014364	A	6	6	276983	276988	100 %	0 %	0 %	0 %	302336814
5150	NC_014364	AGG	2	6	277044	277049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336814
5151	NC_014364	CTG	2	6	277138	277143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336814
5152	NC_014364	GATT	2	8	277210	277217	25 %	50 %	25 %	0 %	302336814
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5155	NC_014364	G	6	6	277493	277498	0 %	0 %	100 %	0 %	302336815
5156	NC_014364	TGC	2	6	277514	277519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336815
5157	NC_014364	CCG	4	12	277525	277536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336815
5158	NC_014364	ATCTG	2	10	277624	277633	20 %	40 %	20 %	20 %	302336815
5159	NC_014364	GGA	2	6	277644	277649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336815
5160	NC_014364	ACG	2	6	277726	277731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336815
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5163	NC_014364	GAT	2	6	277818	277823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336815
5164	NC_014364	GA	3	6	277873	277878	50 %	0 %	50 %	0 %	302336815
5165	NC_014364	GCG	2	6	277968	277973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336815
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5168	NC_014364	GTA	2	6	278098	278103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336815
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5170	NC_014364	ACG	2	6	278185	278190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336815
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5172	NC_014364	TCTT	2	8	278225	278232	0 %	75 %	0 %	25 %	302336815
5173	NC_014364	CTT	2	6	278382	278387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336815
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5179	NC_014364	CTGC	2	8	278496	278503	0 %	25 %	25 %	50 %	302336816
5180	NC_014364	ACC	2	6	278517	278522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302336816
5181	NC_014364	TGA	2	6	278563	278568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336816
5182	NC_014364	T	7	7	278624	278630	0 %	100 %	0 %	0 %	302336816
5183	NC_014364	ACT	2	6	278658	278663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336816
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5202	NC_014364	TGT	2	6	279305	279310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336817
5203	NC_014364	AGGAT	2	10	279358	279367	40 %	20 %	40 %	0 %	302336817
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5207	NC_014364	TGT	2	6	279473	279478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336817
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5209	NC_014364	CAC	2	6	279487	279492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302336817
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5212	NC_014364	GGCA	2	8	279542	279549	25 %	0 %	50 %	25 %	302336817
5213	NC_014364	CAT	2	6	279654	279659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336817
5214	NC_014364	GTC	2	6	279725	279730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336817
5215	NC_014364	TCG	2	6	279802	279807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336817
5216	NC_014364	ATGA	2	8	279879	279886	50 %	25 %	25 %	0 %	302336817
5217	NC_014364	TGCC	2	8	279887	279894	0 %	25 %	25 %	50 %	302336817
5218	NC_014364	CTTT	2	8	279922	279929	0 %	75 %	0 %	25 %	302336817
5219	NC_014364	CTG	2	6	279933	279938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336817
5220	NC_014364	ATC	2	6	279954	279959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336817
5221	NC_014364	TCC	2	6	279987	279992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336817
5222	NC_014364	GCC	2	6	280272	280277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336818
5223	NC_014364	TTG	2	6	280295	280300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336818
5224	NC_014364	TGC	2	6	280320	280325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336818
5225	NC_014364	GGC	2	6	280353	280358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336818
5226	NC_014364	GAT	3	9	280360	280368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336818
5227	NC_014364	TCA	2	6	280401	280406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336818
5228	NC_014364	AGG	2	6	280469	280474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336818
5229	NC_014364	GAG	2	6	280477	280482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336818
5230	NC_014364	C	6	6	280492	280497	0 %	0 %	0 %	100 %	302336818
5231	NC_014364	ATT	2	6	280581	280586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302336818
5232	NC_014364	T	6	6	280630	280635	0 %	100 %	0 %	0 %	302336818
5233	NC_014364	AAGG	2	8	280654	280661	50 %	0 %	50 %	0 %	302336818
5234	NC_014364	GAA	2	6	280807	280812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336818
5235	NC_014364	CATCTC	2	12	280831	280842	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	302336818
5236	NC_014364	AGGGA	2	10	280896	280905	40 %	0 %	60 %	0 %	302336818
5237	NC_014364	TTG	2	6	280928	280933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336819
5238	NC_014364	AT	3	6	280946	280951	50 %	50 %	0 %	0 %	302336819
5239	NC_014364	TC	3	6	280983	280988	0 %	50 %	0 %	50 %	302336819
5240	NC_014364	TCG	2	6	281015	281020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336819
5241	NC_014364	GATC	2	8	281061	281068	25 %	25 %	25 %	25 %	302336819
5242	NC_014364	CTG	2	6	281083	281088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336819
5243	NC_014364	CGG	2	6	281190	281195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336819
5244	NC_014364	GTC	2	6	281203	281208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336819
5245	NC_014364	GCC	2	6	281257	281262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336819
5246	NC_014364	CGG	2	6	281298	281303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336819
5247	NC_014364	TGA	2	6	281438	281443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336819
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5249	NC_014364	CT	3	6	281674	281679	0 %	50 %	0 %	50 %	302336819
5250	NC_014364	GCA	2	6	281785	281790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336819
5251	NC_014364	CCATCC	2	12	281817	281828	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	302336819
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5253	NC_014364	TCT	2	6	282183	282188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336819
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5267	NC_014364	T	7	7	282702	282708	0 %	100 %	0 %	0 %	302336819
5268	NC_014364	TCT	2	6	282864	282869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336820
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5321	NC_014364	CTG	2	6	285863	285868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336823
5322	NC_014364	CAT	2	6	285889	285894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336823
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5329	NC_014364	TCAG	2	8	286254	286261	25 %	25 %	25 %	25 %	302336823
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5332	NC_014364	TCC	2	6	286514	286519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336823
5333	NC_014364	TCA	2	6	286648	286653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336823
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5339	NC_014364	TCCCTT	2	12	286853	286864	0 %	50 %	0 %	50 %	302336823
5340	NC_014364	CCAG	2	8	286933	286940	25 %	0 %	25 %	50 %	302336823
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5344	NC_014364	T	7	7	287127	287133	0 %	100 %	0 %	0 %	302336823
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5351	NC_014364	ACT	2	6	287318	287323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336823
5352	NC_014364	ATACG	2	10	287328	287337	40 %	20 %	20 %	20 %	302336823
5353	NC_014364	T	6	6	287575	287580	0 %	100 %	0 %	0 %	302336824
5354	NC_014364	CAG	2	6	287651	287656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336824
5355	NC_014364	GTT	2	6	287689	287694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336824
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5357	NC_014364	AGAA	2	8	287892	287899	75 %	0 %	25 %	0 %	302336824
5358	NC_014364	GA	3	6	287940	287945	50 %	0 %	50 %	0 %	302336824
5359	NC_014364	ATA	2	6	288009	288014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336824
5360	NC_014364	TTTA	2	8	288030	288037	25 %	75 %	0 %	0 %	302336824
5361	NC_014364	AAGA	2	8	288085	288092	75 %	0 %	25 %	0 %	302336824
5362	NC_014364	GTT	2	6	288184	288189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336824
5363	NC_014364	GCG	2	6	288195	288200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336824
5364	NC_014364	A	7	7	288226	288232	100 %	0 %	0 %	0 %	302336824
5365	NC_014364	TCG	2	6	288257	288262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336824
5366	NC_014364	AGAAA	2	10	288338	288347	80 %	0 %	20 %	0 %	302336824
5367	NC_014364	TCCT	2	8	288391	288398	0 %	50 %	0 %	50 %	302336824
5368	NC_014364	TCA	2	6	288417	288422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336824
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5371	NC_014364	ATCG	2	8	288750	288757	25 %	25 %	25 %	25 %	302336825
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5379	NC_014364	TTC	2	6	289082	289087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336825
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5472	NC_014364	CATT	2	8	293665	293672	25 %	50 %	0 %	25 %	302336827
5473	NC_014364	GCA	2	6	293677	293682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336827
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5480	NC_014364	T	6	6	294125	294130	0 %	100 %	0 %	0 %	302336827
5481	NC_014364	A	6	6	294164	294169	100 %	0 %	0 %	0 %	302336827
5482	NC_014364	CGC	2	6	294219	294224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336827
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5486	NC_014364	T	6	6	294642	294647	0 %	100 %	0 %	0 %	302336827
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5488	NC_014364	GTA	2	6	294681	294686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336827
5489	NC_014364	GGT	2	6	294777	294782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336827
5490	NC_014364	CCG	2	6	294821	294826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336827
5491	NC_014364	AT	3	6	294894	294899	50 %	50 %	0 %	0 %	302336827
5492	NC_014364	CGG	2	6	294990	294995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336827
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