MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 36584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014251	AAGGA	2	10	171075	171084	60 %	0 %	40 %	0 %	298501675
3002	NC_014251	CTT	2	6	171206	171211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501675
3003	NC_014251	TGT	2	6	171216	171221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501675
3004	NC_014251	CTT	2	6	171335	171340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501675
3005	NC_014251	GT	3	6	171347	171352	0 %	50 %	50 %	0 %	298501675
3006	NC_014251	TTC	2	6	171375	171380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501675
3007	NC_014251	ATTTT	2	10	171397	171406	20 %	80 %	0 %	0 %	298501675
3008	NC_014251	AGC	2	6	171438	171443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501675
3009	NC_014251	TTTTG	2	10	171544	171553	0 %	80 %	20 %	0 %	298501675
3010	NC_014251	TTC	2	6	171619	171624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501675
3011	NC_014251	T	6	6	171636	171641	0 %	100 %	0 %	0 %	298501675
3012	NC_014251	CTG	2	6	171653	171658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501675
3013	NC_014251	CTA	2	6	171680	171685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501675
3014	NC_014251	TGA	2	6	171736	171741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501675
3015	NC_014251	CTT	2	6	171743	171748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501675
3016	NC_014251	CATGGT	2	12	171752	171763	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298501675
3017	NC_014251	CTT	2	6	171770	171775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501675
3018	NC_014251	T	6	6	171828	171833	0 %	100 %	0 %	0 %	298501675
3019	NC_014251	TTTTCA	2	12	171877	171888	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298501675
3020	NC_014251	CTTG	2	8	172004	172011	0 %	50 %	25 %	25 %	298501675
3021	NC_014251	TAA	2	6	172116	172121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501675
3022	NC_014251	T	7	7	172127	172133	0 %	100 %	0 %	0 %	298501675
3023	NC_014251	AAT	2	6	172197	172202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501676
3024	NC_014251	ACTTGC	2	12	172209	172220	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298501676
3025	NC_014251	TAG	2	6	172234	172239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501676
3026	NC_014251	AGC	2	6	172288	172293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501676
3027	NC_014251	AGA	2	6	172363	172368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501676
3028	NC_014251	CTG	2	6	172373	172378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501676
3029	NC_014251	GAA	2	6	172499	172504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501676
3030	NC_014251	TCAAAA	2	12	172514	172525	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298501676
3031	NC_014251	CCG	2	6	172529	172534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298501676
3032	NC_014251	TTC	2	6	172560	172565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501676
3033	NC_014251	CCG	2	6	172733	172738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298501676
3034	NC_014251	TAG	2	6	172757	172762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501676
3035	NC_014251	TCA	2	6	172835	172840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501676
3036	NC_014251	GAC	2	6	172847	172852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501676
3037	NC_014251	ATA	2	6	172937	172942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501676
3038	NC_014251	CCT	2	6	172959	172964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501677
3039	NC_014251	AAC	2	6	172986	172991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501677
3040	NC_014251	CTT	2	6	173049	173054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501677
3041	NC_014251	ATC	2	6	173069	173074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501677
3042	NC_014251	ATG	3	9	173089	173097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501677
3043	NC_014251	CATC	2	8	173142	173149	25 %	25 %	0 %	50 %	298501677
3044	NC_014251	CGCT	2	8	173212	173219	0 %	25 %	25 %	50 %	298501677
3045	NC_014251	CTC	2	6	173302	173307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501677
3046	NC_014251	ACG	2	6	173323	173328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501677
3047	NC_014251	TTG	2	6	173410	173415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501677
3048	NC_014251	TGA	2	6	173511	173516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501677
3049	NC_014251	CGT	2	6	173518	173523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501677
3050	NC_014251	ATA	2	6	173611	173616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501677
3051	NC_014251	AT	3	6	173639	173644	50 %	50 %	0 %	0 %	298501677
3052	NC_014251	ATT	2	6	173648	173653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501677
3053	NC_014251	CTA	2	6	173663	173668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501678
3054	NC_014251	ATGGTG	2	12	173754	173765	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	298501678
3055	NC_014251	CTC	2	6	173769	173774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501678
3056	NC_014251	AGTC	2	8	173792	173799	25 %	25 %	25 %	25 %	298501678
3057	NC_014251	A	6	6	173807	173812	100 %	0 %	0 %	0 %	298501678
3058	NC_014251	CCTT	2	8	173854	173861	0 %	50 %	0 %	50 %	298501678
3059	NC_014251	GCC	2	6	173890	173895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298501678
3060	NC_014251	TGAC	2	8	173896	173903	25 %	25 %	25 %	25 %	298501678
3061	NC_014251	GAC	2	6	173909	173914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501678
3062	NC_014251	A	6	6	174055	174060	100 %	0 %	0 %	0 %	298501678
3063	NC_014251	TCCTT	2	10	174097	174106	0 %	60 %	0 %	40 %	298501678
3064	NC_014251	T	6	6	174118	174123	0 %	100 %	0 %	0 %	298501678
3065	NC_014251	CCAA	2	8	174369	174376	50 %	0 %	0 %	50 %	298501679
3066	NC_014251	CCAA	2	8	174378	174385	50 %	0 %	0 %	50 %	298501679
3067	NC_014251	AAAG	2	8	174405	174412	75 %	0 %	25 %	0 %	298501679
3068	NC_014251	CCG	2	6	174418	174423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298501679
3069	NC_014251	TCT	2	6	174479	174484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501679
3070	NC_014251	TTG	2	6	174492	174497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501679
3071	NC_014251	TCCA	2	8	174526	174533	25 %	25 %	0 %	50 %	298501679
3072	NC_014251	T	6	6	174534	174539	0 %	100 %	0 %	0 %	298501679
3073	NC_014251	TTC	2	6	174664	174669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501679
3074	NC_014251	CTT	2	6	174675	174680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501679
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3080	NC_014251	A	6	6	174858	174863	100 %	0 %	0 %	0 %	298501679
3081	NC_014251	AAT	2	6	174892	174897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501679
3082	NC_014251	TCATT	2	10	174902	174911	20 %	60 %	0 %	20 %	298501679
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3089	NC_014251	CTG	2	6	175385	175390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501679
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3091	NC_014251	CAA	2	6	175455	175460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501679
3092	NC_014251	ATC	2	6	175486	175491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501679
3093	NC_014251	TTA	2	6	175538	175543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501680
3094	NC_014251	GTC	2	6	175555	175560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501680
3095	NC_014251	TCAAC	2	10	175617	175626	40 %	20 %	0 %	40 %	298501680
3096	NC_014251	CATC	2	8	175668	175675	25 %	25 %	0 %	50 %	298501680
3097	NC_014251	TCA	2	6	175703	175708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501680
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3100	NC_014251	ACA	2	6	175804	175809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501681
3101	NC_014251	ACA	2	6	175812	175817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501681
3102	NC_014251	T	6	6	175883	175888	0 %	100 %	0 %	0 %	298501681
3103	NC_014251	T	7	7	175906	175912	0 %	100 %	0 %	0 %	298501681
3104	NC_014251	CAT	2	6	175927	175932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501681
3105	NC_014251	TGA	2	6	175933	175938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501681
3106	NC_014251	CTTT	2	8	176062	176069	0 %	75 %	0 %	25 %	298501681
3107	NC_014251	AGA	2	6	176257	176262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501681
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3109	NC_014251	TTC	2	6	176334	176339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501681
3110	NC_014251	AGG	2	6	176342	176347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501681
3111	NC_014251	TC	3	6	176356	176361	0 %	50 %	0 %	50 %	298501681
3112	NC_014251	CGAT	2	8	176490	176497	25 %	25 %	25 %	25 %	298501681
3113	NC_014251	GGA	2	6	176536	176541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501681
3114	NC_014251	TC	3	6	176574	176579	0 %	50 %	0 %	50 %	298501681
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3117	NC_014251	AGGTA	2	10	176608	176617	40 %	20 %	40 %	0 %	298501681
3118	NC_014251	ACTA	2	8	176705	176712	50 %	25 %	0 %	25 %	298501681
3119	NC_014251	AGA	2	6	176716	176721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501681
3120	NC_014251	CCAC	2	8	176823	176830	25 %	0 %	0 %	75 %	298501681
3121	NC_014251	AGA	2	6	176848	176853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501681
3122	NC_014251	GCA	2	6	176922	176927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501681
3123	NC_014251	A	6	6	176984	176989	100 %	0 %	0 %	0 %	298501681
3124	NC_014251	CAT	2	6	176993	176998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501681
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3126	NC_014251	CAT	2	6	177088	177093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501682
3127	NC_014251	CAT	2	6	177100	177105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501682
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3132	NC_014251	TCT	2	6	177287	177292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501682
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3135	NC_014251	TG	3	6	177385	177390	0 %	50 %	50 %	0 %	298501682
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3140	NC_014251	CTG	2	6	177612	177617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501682
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3144	NC_014251	TGA	2	6	177867	177872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501682
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3148	NC_014251	GAC	2	6	177972	177977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501682
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3152	NC_014251	ATC	2	6	178099	178104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501682
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3210	NC_014251	T	6	6	182697	182702	0 %	100 %	0 %	0 %	298501688
3211	NC_014251	A	6	6	182752	182757	100 %	0 %	0 %	0 %	298501688
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3214	NC_014251	TGA	2	6	183049	183054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501689
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3221	NC_014251	TAC	2	6	183500	183505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501689
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3223	NC_014251	T	6	6	183739	183744	0 %	100 %	0 %	0 %	298501690
3224	NC_014251	AGCTC	2	10	183752	183761	20 %	20 %	20 %	40 %	298501690
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3228	NC_014251	TAT	2	6	184025	184030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501691
3229	NC_014251	T	6	6	184047	184052	0 %	100 %	0 %	0 %	298501691
3230	NC_014251	GCT	2	6	184240	184245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501692
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3232	NC_014251	GTCTCC	2	12	184287	184298	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	298501692
3233	NC_014251	TGT	2	6	184371	184376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501692
3234	NC_014251	CCTG	2	8	184435	184442	0 %	25 %	25 %	50 %	298501692
3235	NC_014251	CAAAG	2	10	184458	184467	60 %	0 %	20 %	20 %	298501692
3236	NC_014251	TCT	2	6	184576	184581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501692
3237	NC_014251	AACCA	2	10	184606	184615	60 %	0 %	0 %	40 %	298501692
3238	NC_014251	ACC	2	6	184683	184688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501692
3239	NC_014251	GAA	2	6	184829	184834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501692
3240	NC_014251	CAA	2	6	184844	184849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501692
3241	NC_014251	AGA	2	6	184861	184866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501692
3242	NC_014251	ATTC	2	8	184901	184908	25 %	50 %	0 %	25 %	298501692
3243	NC_014251	ATC	2	6	184909	184914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501692
3244	NC_014251	T	6	6	184987	184992	0 %	100 %	0 %	0 %	298501693
3245	NC_014251	GCT	2	6	185020	185025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501693
3246	NC_014251	TCT	3	9	185053	185061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501693
3247	NC_014251	TGGT	2	8	185140	185147	0 %	50 %	50 %	0 %	298501693
3248	NC_014251	ACG	2	6	185148	185153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501693
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3253	NC_014251	T	6	6	185651	185656	0 %	100 %	0 %	0 %	298501693
3254	NC_014251	GA	3	6	185662	185667	50 %	0 %	50 %	0 %	298501693
3255	NC_014251	TCA	2	6	185704	185709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501693
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3273	NC_014251	TG	3	6	186521	186526	0 %	50 %	50 %	0 %	298501693
3274	NC_014251	TTG	2	6	186534	186539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501693
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3283	NC_014251	TGT	2	6	187040	187045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501694
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3303	NC_014251	GATTT	2	10	188135	188144	20 %	60 %	20 %	0 %	298501694
3304	NC_014251	ACTG	2	8	188181	188188	25 %	25 %	25 %	25 %	298501694
3305	NC_014251	CAACC	2	10	188221	188230	40 %	0 %	0 %	60 %	298501694
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3334	NC_014251	AGAC	2	8	189727	189734	50 %	0 %	25 %	25 %	298501695
3335	NC_014251	TCT	2	6	189746	189751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501695
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3342	NC_014251	ATT	2	6	190119	190124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501697
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3344	NC_014251	CT	3	6	190319	190324	0 %	50 %	0 %	50 %	298501697
3345	NC_014251	TAT	2	6	190331	190336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501697
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3350	NC_014251	AAGA	2	8	190656	190663	75 %	0 %	25 %	0 %	298501697
3351	NC_014251	CGA	2	6	190727	190732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501697
3352	NC_014251	CTC	2	6	190746	190751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501697
3353	NC_014251	GAA	3	9	190791	190799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501697
3354	NC_014251	ACT	2	6	190926	190931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501697
3355	NC_014251	TGA	2	6	190940	190945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501697
3356	NC_014251	GGA	2	6	190955	190960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501697
3357	NC_014251	TGGC	2	8	191039	191046	0 %	25 %	50 %	25 %	298501698
3358	NC_014251	ACA	2	6	191135	191140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501698
3359	NC_014251	A	6	6	191144	191149	100 %	0 %	0 %	0 %	298501698
3360	NC_014251	GCA	2	6	191233	191238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501698
3361	NC_014251	TCG	2	6	191270	191275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501698
3362	NC_014251	CAA	2	6	191298	191303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501698
3363	NC_014251	GAA	2	6	191310	191315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501698
3364	NC_014251	ATC	2	6	191362	191367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501698
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3478	NC_014251	ACCA	2	8	197828	197835	50 %	0 %	0 %	50 %	298501704
3479	NC_014251	AG	3	6	197885	197890	50 %	0 %	50 %	0 %	298501704
3480	NC_014251	A	6	6	197893	197898	100 %	0 %	0 %	0 %	298501704
3481	NC_014251	A	7	7	197994	198000	100 %	0 %	0 %	0 %	298501704
3482	NC_014251	AAT	2	6	198026	198031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501704
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3484	NC_014251	AAAT	2	8	198288	198295	75 %	25 %	0 %	0 %	298501705
3485	NC_014251	AG	3	6	198339	198344	50 %	0 %	50 %	0 %	298501705
3486	NC_014251	GAC	2	6	198450	198455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501705
3487	NC_014251	CTA	2	6	198533	198538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501705
3488	NC_014251	AGA	2	6	198591	198596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501705
3489	NC_014251	CTT	2	6	198605	198610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501705
3490	NC_014251	TTAT	2	8	198637	198644	25 %	75 %	0 %	0 %	298501705
3491	NC_014251	AT	3	6	198655	198660	50 %	50 %	0 %	0 %	298501705
3492	NC_014251	GAT	2	6	198665	198670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501705
3493	NC_014251	TGC	2	6	198691	198696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501705
3494	NC_014251	CAA	2	6	198831	198836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501705
3495	NC_014251	CATA	2	8	198842	198849	50 %	25 %	0 %	25 %	298501705
3496	NC_014251	TCA	2	6	198895	198900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501705
3497	NC_014251	A	6	6	198953	198958	100 %	0 %	0 %	0 %	298501705
3498	NC_014251	A	6	6	198992	198997	100 %	0 %	0 %	0 %	298501705
3499	NC_014251	CTT	2	6	199061	199066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501705
3500	NC_014251	CTG	2	6	199115	199120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501705

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