MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 36584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_014251	TCA	2	6	1867137	1867142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503539
33003	NC_014251	GAA	2	6	1867152	1867157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503539
33004	NC_014251	T	7	7	1867215	1867221	0 %	100 %	0 %	0 %	298503539
33005	NC_014251	CTT	2	6	1867250	1867255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503539
33006	NC_014251	CAAA	2	8	1867351	1867358	75 %	0 %	0 %	25 %	298503539
33007	NC_014251	CTG	2	6	1867360	1867365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503539
33008	NC_014251	TC	3	6	1867429	1867434	0 %	50 %	0 %	50 %	298503539
33009	NC_014251	T	6	6	1867435	1867440	0 %	100 %	0 %	0 %	298503539
33010	NC_014251	TCA	2	6	1867474	1867479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503539
33011	NC_014251	T	6	6	1867492	1867497	0 %	100 %	0 %	0 %	298503539
33012	NC_014251	ATT	2	6	1867835	1867840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503540
33013	NC_014251	TGG	2	6	1867888	1867893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298503540
33014	NC_014251	CGA	2	6	1867916	1867921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503540
33015	NC_014251	TGA	2	6	1868008	1868013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503540
33016	NC_014251	TCAA	2	8	1868110	1868117	50 %	25 %	0 %	25 %	298503540
33017	NC_014251	ATG	2	6	1868314	1868319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503540
33018	NC_014251	CTT	2	6	1868405	1868410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503540
33019	NC_014251	TCT	2	6	1868479	1868484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503540
33020	NC_014251	GCT	2	6	1868569	1868574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503540
33021	NC_014251	T	7	7	1868589	1868595	0 %	100 %	0 %	0 %	298503540
33022	NC_014251	CTT	2	6	1868623	1868628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503541
33023	NC_014251	TGC	2	6	1868629	1868634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503541
33024	NC_014251	CTT	2	6	1868820	1868825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503541
33025	NC_014251	CTG	2	6	1868907	1868912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503541
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33028	NC_014251	TCT	2	6	1869074	1869079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503541
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33030	NC_014251	CTA	2	6	1869129	1869134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503541
33031	NC_014251	TGT	2	6	1869173	1869178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503541
33032	NC_014251	ATC	2	6	1869268	1869273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503541
33033	NC_014251	CG	3	6	1869324	1869329	0 %	0 %	50 %	50 %	298503541
33034	NC_014251	GCA	2	6	1869449	1869454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503541
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33037	NC_014251	TAA	2	6	1869638	1869643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503541
33038	NC_014251	CTG	2	6	1869747	1869752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503541
33039	NC_014251	TCA	2	6	1869753	1869758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503541
33040	NC_014251	CCG	2	6	1869779	1869784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298503541
33041	NC_014251	CT	3	6	1869837	1869842	0 %	50 %	0 %	50 %	298503542
33042	NC_014251	TCT	2	6	1869848	1869853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503542
33043	NC_014251	TAC	2	6	1869938	1869943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503542
33044	NC_014251	AAG	2	6	1869972	1869977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503542
33045	NC_014251	AAAT	2	8	1870136	1870143	75 %	25 %	0 %	0 %	298503542
33046	NC_014251	CAG	2	6	1870202	1870207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503542
33047	NC_014251	CTG	2	6	1870342	1870347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503542
33048	NC_014251	CTT	2	6	1870366	1870371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503542
33049	NC_014251	CTGC	2	8	1870439	1870446	0 %	25 %	25 %	50 %	298503543
33050	NC_014251	GTT	2	6	1870611	1870616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503543
33051	NC_014251	TTC	2	6	1870734	1870739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503543
33052	NC_014251	GAT	2	6	1870794	1870799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503543
33053	NC_014251	TTG	2	6	1870825	1870830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503543
33054	NC_014251	ATC	2	6	1870915	1870920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503543
33055	NC_014251	TTC	2	6	1870932	1870937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503543
33056	NC_014251	TGA	2	6	1871035	1871040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503543
33057	NC_014251	TTC	2	6	1871041	1871046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503543
33058	NC_014251	TCCT	2	8	1871234	1871241	0 %	50 %	0 %	50 %	298503544
33059	NC_014251	CAC	2	6	1871368	1871373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503544
33060	NC_014251	CATAG	2	10	1871384	1871393	40 %	20 %	20 %	20 %	298503544
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33062	NC_014251	GTT	2	6	1871466	1871471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503544
33063	NC_014251	GAC	2	6	1871575	1871580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503544
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33065	NC_014251	ATG	2	6	1871676	1871681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503544
33066	NC_014251	GATT	2	8	1871773	1871780	25 %	50 %	25 %	0 %	298503544
33067	NC_014251	AGA	2	6	1871816	1871821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503544
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33069	NC_014251	CAT	2	6	1871941	1871946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503544
33070	NC_014251	TTC	2	6	1872005	1872010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503544
33071	NC_014251	GA	3	6	1872044	1872049	50 %	0 %	50 %	0 %	298503544
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33076	NC_014251	ATG	2	6	1872286	1872291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503545
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33080	NC_014251	CATG	2	8	1872440	1872447	25 %	25 %	25 %	25 %	298503545
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33082	NC_014251	CAAA	2	8	1872504	1872511	75 %	0 %	0 %	25 %	298503545
33083	NC_014251	CTT	2	6	1872525	1872530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503545
33084	NC_014251	ACCAGG	2	12	1872582	1872593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503545
33085	NC_014251	AGACC	2	10	1872599	1872608	40 %	0 %	20 %	40 %	298503545
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33087	NC_014251	ATC	2	6	1872642	1872647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503545
33088	NC_014251	TCAA	2	8	1872721	1872728	50 %	25 %	0 %	25 %	298503545
33089	NC_014251	GATGGC	2	12	1872875	1872886	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	298503546
33090	NC_014251	CAG	2	6	1873009	1873014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503546
33091	NC_014251	GCAA	2	8	1873053	1873060	50 %	0 %	25 %	25 %	298503546
33092	NC_014251	CTG	2	6	1873198	1873203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503546
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33095	NC_014251	GTCTT	2	10	1873239	1873248	0 %	60 %	20 %	20 %	298503546
33096	NC_014251	GAT	2	6	1873343	1873348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503546
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33098	NC_014251	GCTG	2	8	1873453	1873460	0 %	25 %	50 %	25 %	298503546
33099	NC_014251	CCA	2	6	1873510	1873515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503546
33100	NC_014251	GAG	2	6	1873531	1873536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298503546
33101	NC_014251	TCT	2	6	1873687	1873692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503546
33102	NC_014251	CTT	2	6	1873694	1873699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503546
33103	NC_014251	TTC	2	6	1873781	1873786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503546
33104	NC_014251	CCA	3	9	1873827	1873835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503546
33105	NC_014251	GTG	2	6	1873850	1873855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298503546
33106	NC_014251	ATCA	2	8	1873901	1873908	50 %	25 %	0 %	25 %	298503546
33107	NC_014251	TC	3	6	1873998	1874003	0 %	50 %	0 %	50 %	298503546
33108	NC_014251	CT	3	6	1874010	1874015	0 %	50 %	0 %	50 %	298503546
33109	NC_014251	ATGA	2	8	1874078	1874085	50 %	25 %	25 %	0 %	298503546
33110	NC_014251	TAA	2	6	1875478	1875483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503548
33111	NC_014251	ATC	2	6	1875602	1875607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503548
33112	NC_014251	GCAC	2	8	1875632	1875639	25 %	0 %	25 %	50 %	298503548
33113	NC_014251	AAT	2	6	1875677	1875682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503548
33114	NC_014251	TGC	2	6	1875708	1875713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503548
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33116	NC_014251	TCC	2	6	1875839	1875844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503548
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33228	NC_014251	TGTAC	2	10	1881233	1881242	20 %	40 %	20 %	20 %	298503553
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33231	NC_014251	CAC	2	6	1881413	1881418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503553
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33468	NC_014251	TTCT	2	8	1893244	1893251	0 %	75 %	0 %	25 %	298503563
33469	NC_014251	TCT	3	9	1893261	1893269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503563
33470	NC_014251	GT	3	6	1893338	1893343	0 %	50 %	50 %	0 %	298503564
33471	NC_014251	GAT	2	6	1893353	1893358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503564
33472	NC_014251	AAATC	2	10	1893379	1893388	60 %	20 %	0 %	20 %	298503564
33473	NC_014251	TTGTC	2	10	1893430	1893439	0 %	60 %	20 %	20 %	298503564
33474	NC_014251	ATC	2	6	1893506	1893511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503564
33475	NC_014251	GCT	2	6	1893562	1893567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503564
33476	NC_014251	GACT	2	8	1893583	1893590	25 %	25 %	25 %	25 %	298503564
33477	NC_014251	CTG	2	6	1893676	1893681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503564
33478	NC_014251	CCAA	2	8	1893894	1893901	50 %	0 %	0 %	50 %	298503564
33479	NC_014251	AGT	2	6	1894094	1894099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503564
33480	NC_014251	CCAA	2	8	1894209	1894216	50 %	0 %	0 %	50 %	298503564
33481	NC_014251	CAA	2	6	1894240	1894245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503564
33482	NC_014251	AGC	2	6	1894421	1894426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503564
33483	NC_014251	CAA	2	6	1894507	1894512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503564
33484	NC_014251	CAA	2	6	1894547	1894552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503564
33485	NC_014251	TGA	2	6	1894682	1894687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503564
33486	NC_014251	ATAC	2	8	1894757	1894764	50 %	25 %	0 %	25 %	298503564
33487	NC_014251	CA	3	6	1894767	1894772	50 %	0 %	0 %	50 %	298503564
33488	NC_014251	AAG	2	6	1894823	1894828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503564
33489	NC_014251	CTG	2	6	1894835	1894840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503564
33490	NC_014251	AGG	2	6	1894889	1894894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298503564
33491	NC_014251	ACCAAG	2	12	1894914	1894925	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	298503564
33492	NC_014251	ACC	2	6	1894969	1894974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503564
33493	NC_014251	AAT	2	6	1894985	1894990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503564
33494	NC_014251	GTCA	2	8	1895352	1895359	25 %	25 %	25 %	25 %	298503565
33495	NC_014251	CCA	2	6	1895665	1895670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503566
33496	NC_014251	GTCT	2	8	1895681	1895688	0 %	50 %	25 %	25 %	298503566
33497	NC_014251	ATA	2	6	1895747	1895752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503566
33498	NC_014251	AAC	2	6	1895840	1895845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503566
33499	NC_014251	ATGAA	2	10	1895850	1895859	60 %	20 %	20 %	0 %	298503566
33500	NC_014251	A	7	7	1896006	1896012	100 %	0 %	0 %	0 %	298503567

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