MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 36584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_014251	TCT	2	6	1754029	1754034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503415
31002	NC_014251	CTGA	3	12	1754078	1754089	25 %	25 %	25 %	25 %	298503415
31003	NC_014251	AAAG	2	8	1754091	1754098	75 %	0 %	25 %	0 %	298503415
31004	NC_014251	CGCA	2	8	1754127	1754134	25 %	0 %	25 %	50 %	298503415
31005	NC_014251	CCA	2	6	1754182	1754187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503415
31006	NC_014251	AAT	2	6	1754196	1754201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503415
31007	NC_014251	GTTT	2	8	1754203	1754210	0 %	75 %	25 %	0 %	298503415
31008	NC_014251	CTG	2	6	1754544	1754549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503416
31009	NC_014251	AAG	2	6	1754842	1754847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503416
31010	NC_014251	T	6	6	1754849	1754854	0 %	100 %	0 %	0 %	298503416
31011	NC_014251	CGT	2	6	1754868	1754873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503416
31012	NC_014251	TCAA	2	8	1754951	1754958	50 %	25 %	0 %	25 %	298503416
31013	NC_014251	TA	3	6	1755019	1755024	50 %	50 %	0 %	0 %	298503417
31014	NC_014251	TAT	2	6	1755076	1755081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503417
31015	NC_014251	ACT	2	6	1755090	1755095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503417
31016	NC_014251	TAT	2	6	1755145	1755150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503417
31017	NC_014251	CTT	2	6	1755154	1755159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503417
31018	NC_014251	ACC	2	6	1755161	1755166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503417
31019	NC_014251	TTG	2	6	1755321	1755326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503417
31020	NC_014251	ATT	2	6	1755377	1755382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503417
31021	NC_014251	CAA	2	6	1755397	1755402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503417
31022	NC_014251	GAG	2	6	1755406	1755411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298503417
31023	NC_014251	CAT	2	6	1755424	1755429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503417
31024	NC_014251	CAA	2	6	1755640	1755645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503417
31025	NC_014251	GGTTT	2	10	1755818	1755827	0 %	60 %	40 %	0 %	298503417
31026	NC_014251	ACT	2	6	1755876	1755881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503417
31027	NC_014251	CAA	2	6	1756067	1756072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503417
31028	NC_014251	TAC	2	6	1756129	1756134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503417
31029	NC_014251	AGG	2	6	1756240	1756245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298503417
31030	NC_014251	T	6	6	1756274	1756279	0 %	100 %	0 %	0 %	298503417
31031	NC_014251	CTT	2	6	1756294	1756299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503417
31032	NC_014251	CTAC	2	8	1756332	1756339	25 %	25 %	0 %	50 %	298503417
31033	NC_014251	AGA	2	6	1756343	1756348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503417
31034	NC_014251	AG	3	6	1756350	1756355	50 %	0 %	50 %	0 %	298503417
31035	NC_014251	AAG	2	6	1756378	1756383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503417
31036	NC_014251	AGAT	2	8	1756509	1756516	50 %	25 %	25 %	0 %	298503417
31037	NC_014251	TTCT	2	8	1756517	1756524	0 %	75 %	0 %	25 %	298503417
31038	NC_014251	TAGTT	2	10	1756539	1756548	20 %	60 %	20 %	0 %	298503417
31039	NC_014251	TTG	2	6	1756552	1756557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503417
31040	NC_014251	T	7	7	1756651	1756657	0 %	100 %	0 %	0 %	298503417
31041	NC_014251	CAGC	2	8	1756687	1756694	25 %	0 %	25 %	50 %	298503417
31042	NC_014251	AAC	2	6	1756799	1756804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503417
31043	NC_014251	CAT	2	6	1756843	1756848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503417
31044	NC_014251	T	7	7	1756905	1756911	0 %	100 %	0 %	0 %	298503417
31045	NC_014251	ACA	2	6	1756942	1756947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503417
31046	NC_014251	AAT	2	6	1756955	1756960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503417
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31048	NC_014251	TCGC	2	8	1757299	1757306	0 %	25 %	25 %	50 %	298503418
31049	NC_014251	T	6	6	1757309	1757314	0 %	100 %	0 %	0 %	298503418
31050	NC_014251	GAT	2	6	1757334	1757339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503418
31051	NC_014251	TC	3	6	1757374	1757379	0 %	50 %	0 %	50 %	298503418
31052	NC_014251	GCT	2	6	1757382	1757387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503418
31053	NC_014251	ATTT	2	8	1757432	1757439	25 %	75 %	0 %	0 %	298503418
31054	NC_014251	CCAA	2	8	1757470	1757477	50 %	0 %	0 %	50 %	298503418
31055	NC_014251	AACA	2	8	1757536	1757543	75 %	0 %	0 %	25 %	298503418
31056	NC_014251	TTGA	2	8	1757550	1757557	25 %	50 %	25 %	0 %	298503418
31057	NC_014251	CTT	2	6	1757612	1757617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503418
31058	NC_014251	TTG	2	6	1757638	1757643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503418
31059	NC_014251	TGAAA	2	10	1757648	1757657	60 %	20 %	20 %	0 %	298503418
31060	NC_014251	TAT	2	6	1757729	1757734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503418
31061	NC_014251	T	6	6	1757836	1757841	0 %	100 %	0 %	0 %	298503418
31062	NC_014251	CCAC	2	8	1757893	1757900	25 %	0 %	0 %	75 %	298503418
31063	NC_014251	TCT	2	6	1757907	1757912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503418
31064	NC_014251	CTT	2	6	1757948	1757953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503418
31065	NC_014251	GATTT	2	10	1757958	1757967	20 %	60 %	20 %	0 %	298503418
31066	NC_014251	AATC	2	8	1757984	1757991	50 %	25 %	0 %	25 %	298503418
31067	NC_014251	A	6	6	1758033	1758038	100 %	0 %	0 %	0 %	298503418
31068	NC_014251	TTGTT	2	10	1758102	1758111	0 %	80 %	20 %	0 %	298503419
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31071	NC_014251	GCT	3	9	1758427	1758435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503419
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31074	NC_014251	TGCATA	2	12	1758487	1758498	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298503419
31075	NC_014251	CCAT	2	8	1758544	1758551	25 %	25 %	0 %	50 %	298503419
31076	NC_014251	ACC	2	6	1758561	1758566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503419
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31083	NC_014251	GTA	2	6	1758969	1758974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503419
31084	NC_014251	TTAGA	2	10	1758993	1759002	40 %	40 %	20 %	0 %	298503420
31085	NC_014251	GAAC	2	8	1759086	1759093	50 %	0 %	25 %	25 %	298503420
31086	NC_014251	CTT	2	6	1759129	1759134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503420
31087	NC_014251	TGA	2	6	1759135	1759140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503420
31088	NC_014251	GCA	2	6	1759161	1759166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503420
31089	NC_014251	AAG	2	6	1759254	1759259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503420
31090	NC_014251	ACC	2	6	1759283	1759288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503420
31091	NC_014251	GGC	2	6	1759312	1759317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298503420
31092	NC_014251	TGT	2	6	1759495	1759500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503420
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31099	NC_014251	ACTT	2	8	1759841	1759848	25 %	50 %	0 %	25 %	298503420
31100	NC_014251	TCA	2	6	1759857	1759862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503420
31101	NC_014251	T	6	6	1759898	1759903	0 %	100 %	0 %	0 %	298503420
31102	NC_014251	GAA	2	6	1760240	1760245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503421
31103	NC_014251	CTT	2	6	1760290	1760295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503421
31104	NC_014251	TAGC	2	8	1760328	1760335	25 %	25 %	25 %	25 %	298503421
31105	NC_014251	TAGA	2	8	1760510	1760517	50 %	25 %	25 %	0 %	298503421
31106	NC_014251	CTT	2	6	1760543	1760548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503421
31107	NC_014251	GAC	2	6	1760615	1760620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503421
31108	NC_014251	AGA	2	6	1760625	1760630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503421
31109	NC_014251	TGC	2	6	1760693	1760698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503421
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31111	NC_014251	T	6	6	1760821	1760826	0 %	100 %	0 %	0 %	298503422
31112	NC_014251	T	6	6	1760836	1760841	0 %	100 %	0 %	0 %	298503422
31113	NC_014251	TA	4	8	1760868	1760875	50 %	50 %	0 %	0 %	298503422
31114	NC_014251	GT	3	6	1760911	1760916	0 %	50 %	50 %	0 %	298503422
31115	NC_014251	TCA	2	6	1760917	1760922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503422
31116	NC_014251	A	7	7	1760983	1760989	100 %	0 %	0 %	0 %	298503422
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31118	NC_014251	ATCC	2	8	1761127	1761134	25 %	25 %	0 %	50 %	298503423
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31335	NC_014251	ATTC	2	8	1771442	1771449	25 %	50 %	0 %	25 %	298503433
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31347	NC_014251	TCT	2	6	1772066	1772071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503433
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31469	NC_014251	ATA	2	6	1780914	1780919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503440
31470	NC_014251	ACA	2	6	1780998	1781003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503440
31471	NC_014251	GAA	2	6	1781107	1781112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503440
31472	NC_014251	TCCT	2	8	1781132	1781139	0 %	50 %	0 %	50 %	298503440
31473	NC_014251	CTTC	2	8	1781142	1781149	0 %	50 %	0 %	50 %	298503440
31474	NC_014251	ACTTG	2	10	1781167	1781176	20 %	40 %	20 %	20 %	298503440
31475	NC_014251	TCC	2	6	1781196	1781201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503440
31476	NC_014251	TCT	2	6	1781301	1781306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503440
31477	NC_014251	TTCT	2	8	1781655	1781662	0 %	75 %	0 %	25 %	298503441
31478	NC_014251	TCT	2	6	1781698	1781703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503441
31479	NC_014251	TAGC	2	8	1781728	1781735	25 %	25 %	25 %	25 %	298503441
31480	NC_014251	CTT	2	6	1781747	1781752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503441
31481	NC_014251	ATA	2	6	1781773	1781778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503441
31482	NC_014251	TCC	2	6	1781854	1781859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503441
31483	NC_014251	C	6	6	1781960	1781965	0 %	0 %	0 %	100 %	298503441
31484	NC_014251	CGT	2	6	1782072	1782077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503441
31485	NC_014251	TC	3	6	1782099	1782104	0 %	50 %	0 %	50 %	298503441
31486	NC_014251	AGA	2	6	1782157	1782162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503441
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31488	NC_014251	GTC	2	6	1782190	1782195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503441
31489	NC_014251	CTC	2	6	1782198	1782203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503441
31490	NC_014251	TTC	2	6	1782243	1782248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503441
31491	NC_014251	GA	3	6	1782257	1782262	50 %	0 %	50 %	0 %	298503441
31492	NC_014251	CTG	2	6	1782365	1782370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503441
31493	NC_014251	TCA	2	6	1782446	1782451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503441
31494	NC_014251	TGC	2	6	1782514	1782519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503441
31495	NC_014251	ATA	2	6	1782526	1782531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503441
31496	NC_014251	AATCA	2	10	1782588	1782597	60 %	20 %	0 %	20 %	298503441
31497	NC_014251	CT	4	8	1782627	1782634	0 %	50 %	0 %	50 %	298503441
31498	NC_014251	AG	3	6	1782662	1782667	50 %	0 %	50 %	0 %	298503441
31499	NC_014251	CTG	2	6	1782758	1782763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503441
31500	NC_014251	TGG	2	6	1782841	1782846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298503441

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