MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 36584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_014251	AGC	2	6	1584535	1584540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503229
28003	NC_014251	ATT	2	6	1584595	1584600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503229
28004	NC_014251	TTC	2	6	1584644	1584649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503229
28005	NC_014251	TTA	2	6	1584665	1584670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503229
28006	NC_014251	T	6	6	1584724	1584729	0 %	100 %	0 %	0 %	298503230
28007	NC_014251	TGCTTC	2	12	1584742	1584753	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	298503230
28008	NC_014251	TTG	2	6	1584772	1584777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503230
28009	NC_014251	T	7	7	1584791	1584797	0 %	100 %	0 %	0 %	298503230
28010	NC_014251	T	6	6	1584820	1584825	0 %	100 %	0 %	0 %	298503230
28011	NC_014251	A	6	6	1584873	1584878	100 %	0 %	0 %	0 %	298503230
28012	NC_014251	TTG	2	6	1584888	1584893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503230
28013	NC_014251	A	6	6	1585063	1585068	100 %	0 %	0 %	0 %	298503231
28014	NC_014251	TAA	2	6	1585105	1585110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503231
28015	NC_014251	CTTT	2	8	1585119	1585126	0 %	75 %	0 %	25 %	298503231
28016	NC_014251	GGT	2	6	1585175	1585180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298503231
28017	NC_014251	CAA	2	6	1585383	1585388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503231
28018	NC_014251	ACG	2	6	1585405	1585410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503231
28019	NC_014251	AT	3	6	1585496	1585501	50 %	50 %	0 %	0 %	298503231
28020	NC_014251	T	7	7	1585586	1585592	0 %	100 %	0 %	0 %	298503232
28021	NC_014251	A	6	6	1585668	1585673	100 %	0 %	0 %	0 %	298503232
28022	NC_014251	GAC	2	6	1585733	1585738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503232
28023	NC_014251	CT	3	6	1585749	1585754	0 %	50 %	0 %	50 %	298503232
28024	NC_014251	TCTT	2	8	1585772	1585779	0 %	75 %	0 %	25 %	298503232
28025	NC_014251	AG	3	6	1585791	1585796	50 %	0 %	50 %	0 %	298503233
28026	NC_014251	A	6	6	1585813	1585818	100 %	0 %	0 %	0 %	298503233
28027	NC_014251	A	6	6	1586215	1586220	100 %	0 %	0 %	0 %	298503234
28028	NC_014251	TTGG	2	8	1586277	1586284	0 %	50 %	50 %	0 %	298503234
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28031	NC_014251	CAGC	2	8	1586554	1586561	25 %	0 %	25 %	50 %	298503234
28032	NC_014251	ACT	2	6	1586643	1586648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503234
28033	NC_014251	TTGA	2	8	1586718	1586725	25 %	50 %	25 %	0 %	298503234
28034	NC_014251	TTGA	2	8	1586793	1586800	25 %	50 %	25 %	0 %	298503234
28035	NC_014251	AC	3	6	1586830	1586835	50 %	0 %	0 %	50 %	298503234
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28038	NC_014251	GCAA	2	8	1586915	1586922	50 %	0 %	25 %	25 %	298503234
28039	NC_014251	CTG	2	6	1586923	1586928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503234
28040	NC_014251	AGC	2	6	1586972	1586977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503234
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28042	NC_014251	GTC	2	6	1587001	1587006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503234
28043	NC_014251	GTGTTG	2	12	1587052	1587063	0 %	50 %	50 %	0 %	298503234
28044	NC_014251	TTC	2	6	1587067	1587072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503234
28045	NC_014251	CT	3	6	1587181	1587186	0 %	50 %	0 %	50 %	298503234
28046	NC_014251	A	6	6	1587283	1587288	100 %	0 %	0 %	0 %	298503234
28047	NC_014251	GAA	2	6	1587300	1587305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503234
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28049	NC_014251	GAA	2	6	1587336	1587341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503234
28050	NC_014251	TGC	2	6	1587416	1587421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503234
28051	NC_014251	CTA	2	6	1587422	1587427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503234
28052	NC_014251	GAA	2	6	1587462	1587467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503234
28053	NC_014251	CTA	2	6	1587485	1587490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503234
28054	NC_014251	A	6	6	1587496	1587501	100 %	0 %	0 %	0 %	298503234
28055	NC_014251	CAA	2	6	1587569	1587574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503234
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28059	NC_014251	GAA	2	6	1587789	1587794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503234
28060	NC_014251	TGCG	2	8	1588008	1588015	0 %	25 %	50 %	25 %	298503235
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28062	NC_014251	A	6	6	1588031	1588036	100 %	0 %	0 %	0 %	298503235
28063	NC_014251	CTT	2	6	1588048	1588053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503235
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28067	NC_014251	CTT	2	6	1588593	1588598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503236
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28103	NC_014251	AAT	2	6	1590448	1590453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503238
28104	NC_014251	ATA	2	6	1590499	1590504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503238
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28115	NC_014251	TCT	2	6	1591200	1591205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503239
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28117	NC_014251	CAT	2	6	1591240	1591245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503239
28118	NC_014251	AGC	2	6	1591268	1591273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503239
28119	NC_014251	CTT	2	6	1591333	1591338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503239
28120	NC_014251	GCT	2	6	1591414	1591419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503239
28121	NC_014251	TTC	2	6	1591445	1591450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503239
28122	NC_014251	AG	3	6	1591696	1591701	50 %	0 %	50 %	0 %	298503239
28123	NC_014251	AAT	2	6	1591728	1591733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503239
28124	NC_014251	CTT	2	6	1591846	1591851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503239
28125	NC_014251	AGA	2	6	1591986	1591991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503239
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28127	NC_014251	CTC	2	6	1592051	1592056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503239
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28129	NC_014251	GA	3	6	1592291	1592296	50 %	0 %	50 %	0 %	298503240
28130	NC_014251	ACT	2	6	1592338	1592343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503240
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28134	NC_014251	GAT	2	6	1592490	1592495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503240
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28139	NC_014251	ATC	2	6	1592817	1592822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503240
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28148	NC_014251	CTTA	2	8	1593123	1593130	25 %	50 %	0 %	25 %	298503240
28149	NC_014251	AAT	2	6	1593151	1593156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503240
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28157	NC_014251	C	6	6	1593798	1593803	0 %	0 %	0 %	100 %	298503241
28158	NC_014251	TCA	2	6	1593870	1593875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503241
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28170	NC_014251	GATATC	2	12	1594588	1594599	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298503242
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28173	NC_014251	ATC	2	6	1594696	1594701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503242
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28200	NC_014251	TTTC	2	8	1596165	1596172	0 %	75 %	0 %	25 %	298503243
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28204	NC_014251	TCTCCT	2	12	1596283	1596294	0 %	50 %	0 %	50 %	298503243
28205	NC_014251	CGC	2	6	1596420	1596425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298503244
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28215	NC_014251	TTC	2	6	1596924	1596929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503244
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28217	NC_014251	TCT	2	6	1597013	1597018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503244
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28219	NC_014251	TTC	2	6	1597134	1597139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503244
28220	NC_014251	AGC	2	6	1597155	1597160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503244
28221	NC_014251	T	6	6	1597198	1597203	0 %	100 %	0 %	0 %	298503244
28222	NC_014251	GATT	2	8	1597276	1597283	25 %	50 %	25 %	0 %	298503245
28223	NC_014251	GCA	2	6	1597300	1597305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503245
28224	NC_014251	CTT	2	6	1597316	1597321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503245
28225	NC_014251	AAG	2	6	1597378	1597383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503245
28226	NC_014251	ATC	2	6	1597413	1597418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503245
28227	NC_014251	GTT	2	6	1597502	1597507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503245
28228	NC_014251	ACG	2	6	1597524	1597529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503245
28229	NC_014251	TGC	2	6	1597554	1597559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503245
28230	NC_014251	CTT	2	6	1597638	1597643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503245
28231	NC_014251	ACC	2	6	1597665	1597670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503245
28232	NC_014251	GTTG	2	8	1597770	1597777	0 %	50 %	50 %	0 %	298503245
28233	NC_014251	CCA	3	9	1597837	1597845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503245
28234	NC_014251	TCA	2	6	1597849	1597854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503245
28235	NC_014251	GGA	2	6	1597927	1597932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298503245
28236	NC_014251	CGA	2	6	1597933	1597938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503245
28237	NC_014251	ATC	2	6	1597983	1597988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503245
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28342	NC_014251	GCAAG	2	10	1604535	1604544	40 %	0 %	40 %	20 %	298503254
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28347	NC_014251	CGT	2	6	1604719	1604724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503254
28348	NC_014251	TTG	2	6	1604742	1604747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503254
28349	NC_014251	GGACCT	2	12	1604789	1604800	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	298503254
28350	NC_014251	TTC	2	6	1604815	1604820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503254
28351	NC_014251	GAA	2	6	1604828	1604833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503254
28352	NC_014251	CTG	2	6	1604889	1604894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503254
28353	NC_014251	TTC	2	6	1604986	1604991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503254
28354	NC_014251	ACT	2	6	1605020	1605025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503254
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28358	NC_014251	TCT	3	9	1605107	1605115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503254
28359	NC_014251	T	6	6	1605216	1605221	0 %	100 %	0 %	0 %	298503255
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28468	NC_014251	A	7	7	1610814	1610820	100 %	0 %	0 %	0 %	298503259
28469	NC_014251	TTC	2	6	1611011	1611016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503259
28470	NC_014251	CTT	2	6	1611022	1611027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503259
28471	NC_014251	TCA	2	6	1611057	1611062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503259
28472	NC_014251	CA	3	6	1611095	1611100	50 %	0 %	0 %	50 %	298503259
28473	NC_014251	A	7	7	1611116	1611122	100 %	0 %	0 %	0 %	298503259
28474	NC_014251	A	6	6	1611133	1611138	100 %	0 %	0 %	0 %	298503259
28475	NC_014251	ATC	2	6	1611143	1611148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503259
28476	NC_014251	TTC	3	9	1611167	1611175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503259
28477	NC_014251	TGA	2	6	1611211	1611216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503259
28478	NC_014251	CTT	2	6	1611417	1611422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503260
28479	NC_014251	CTTC	2	8	1611467	1611474	0 %	50 %	0 %	50 %	298503260
28480	NC_014251	CAA	2	6	1611523	1611528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503260
28481	NC_014251	TCA	2	6	1611542	1611547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503260
28482	NC_014251	CTTG	2	8	1611666	1611673	0 %	50 %	25 %	25 %	298503260
28483	NC_014251	ATT	2	6	1611751	1611756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503260
28484	NC_014251	T	6	6	1611818	1611823	0 %	100 %	0 %	0 %	298503260
28485	NC_014251	TCT	2	6	1611993	1611998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503260
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28488	NC_014251	CCT	2	6	1612065	1612070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503260
28489	NC_014251	CCA	2	6	1612074	1612079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503260
28490	NC_014251	AATC	2	8	1612144	1612151	50 %	25 %	0 %	25 %	298503260
28491	NC_014251	ATT	2	6	1612156	1612161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503260
28492	NC_014251	GGGT	2	8	1612183	1612190	0 %	25 %	75 %	0 %	298503260
28493	NC_014251	TTAA	2	8	1612202	1612209	50 %	50 %	0 %	0 %	298503260
28494	NC_014251	CGCCT	2	10	1612213	1612222	0 %	20 %	20 %	60 %	298503260
28495	NC_014251	TTAA	2	8	1612340	1612347	50 %	50 %	0 %	0 %	298503260
28496	NC_014251	GTTTCT	2	12	1612472	1612483	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	298503260
28497	NC_014251	CTG	2	6	1612660	1612665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503261
28498	NC_014251	TAA	2	6	1612699	1612704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503261
28499	NC_014251	AGA	2	6	1612738	1612743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503261
28500	NC_014251	CTG	2	6	1612837	1612842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503261

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