MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 36584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_014251	ATA	2	6	1411724	1411729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503034
25002	NC_014251	AGG	2	6	1411739	1411744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298503034
25003	NC_014251	ACT	2	6	1411760	1411765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503034
25004	NC_014251	GTC	2	6	1411800	1411805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503034
25005	NC_014251	AAG	2	6	1411826	1411831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503034
25006	NC_014251	TAA	2	6	1412036	1412041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503035
25007	NC_014251	CAG	2	6	1412142	1412147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503035
25008	NC_014251	AAT	2	6	1412170	1412175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503035
25009	NC_014251	TGA	2	6	1412515	1412520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503036
25010	NC_014251	T	6	6	1412521	1412526	0 %	100 %	0 %	0 %	298503036
25011	NC_014251	TC	3	6	1412592	1412597	0 %	50 %	0 %	50 %	298503036
25012	NC_014251	TCC	2	6	1412603	1412608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503036
25013	NC_014251	ATC	2	6	1412665	1412670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503036
25014	NC_014251	TCC	2	6	1412674	1412679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503036
25015	NC_014251	TAC	2	6	1412751	1412756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503036
25016	NC_014251	TTTG	2	8	1412762	1412769	0 %	75 %	25 %	0 %	298503036
25017	NC_014251	TGCTTC	2	12	1412795	1412806	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	298503036
25018	NC_014251	CTC	2	6	1412922	1412927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503036
25019	NC_014251	GTC	2	6	1412969	1412974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503036
25020	NC_014251	ACC	2	6	1413019	1413024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503036
25021	NC_014251	AAT	2	6	1413289	1413294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503036
25022	NC_014251	GAAAG	2	10	1413342	1413351	60 %	0 %	40 %	0 %	298503036
25023	NC_014251	AAATA	2	10	1413355	1413364	80 %	20 %	0 %	0 %	298503036
25024	NC_014251	AAG	2	6	1413377	1413382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503036
25025	NC_014251	GTCAA	2	10	1413383	1413392	40 %	20 %	20 %	20 %	298503036
25026	NC_014251	CCCCT	2	10	1413514	1413523	0 %	20 %	0 %	80 %	298503036
25027	NC_014251	TGGTCA	2	12	1413531	1413542	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298503036
25028	NC_014251	CTC	2	6	1413570	1413575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503036
25029	NC_014251	CTG	2	6	1413576	1413581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503036
25030	NC_014251	A	6	6	1413809	1413814	100 %	0 %	0 %	0 %	298503036
25031	NC_014251	TCAT	2	8	1413872	1413879	25 %	50 %	0 %	25 %	298503036
25032	NC_014251	CTC	2	6	1413880	1413885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503036
25033	NC_014251	T	7	7	1414038	1414044	0 %	100 %	0 %	0 %	298503036
25034	NC_014251	CCA	2	6	1414100	1414105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503036
25035	NC_014251	CTT	2	6	1414182	1414187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503036
25036	NC_014251	TCC	2	6	1414190	1414195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503036
25037	NC_014251	AAAC	2	8	1414356	1414363	75 %	0 %	0 %	25 %	298503036
25038	NC_014251	ATT	2	6	1414385	1414390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503036
25039	NC_014251	CAG	2	6	1414401	1414406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503036
25040	NC_014251	AGAC	2	8	1414430	1414437	50 %	0 %	25 %	25 %	298503036
25041	NC_014251	CAA	2	6	1414456	1414461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503036
25042	NC_014251	AAGAT	2	10	1414465	1414474	60 %	20 %	20 %	0 %	298503036
25043	NC_014251	TAA	2	6	1414490	1414495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503036
25044	NC_014251	CCA	2	6	1414587	1414592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503037
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25049	NC_014251	CTT	2	6	1414733	1414738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503037
25050	NC_014251	GAA	2	6	1414752	1414757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503037
25051	NC_014251	CTT	2	6	1414789	1414794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503037
25052	NC_014251	TAG	2	6	1414801	1414806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503037
25053	NC_014251	TCA	2	6	1414824	1414829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503037
25054	NC_014251	TGCT	2	8	1414865	1414872	0 %	50 %	25 %	25 %	298503037
25055	NC_014251	CCA	2	6	1414881	1414886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503037
25056	NC_014251	CAT	2	6	1414900	1414905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503037
25057	NC_014251	CTAC	2	8	1414914	1414921	25 %	25 %	0 %	50 %	298503037
25058	NC_014251	TTC	2	6	1414994	1414999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503037
25059	NC_014251	TTC	2	6	1415003	1415008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503037
25060	NC_014251	TCC	2	6	1415117	1415122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503037
25061	NC_014251	CAAG	2	8	1415125	1415132	50 %	0 %	25 %	25 %	298503037
25062	NC_014251	GAT	2	6	1415153	1415158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503037
25063	NC_014251	TTAT	2	8	1415262	1415269	25 %	75 %	0 %	0 %	298503038
25064	NC_014251	TCT	2	6	1415450	1415455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503038
25065	NC_014251	AGCT	2	8	1415460	1415467	25 %	25 %	25 %	25 %	298503038
25066	NC_014251	CTT	2	6	1415544	1415549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503038
25067	NC_014251	AATC	2	8	1415558	1415565	50 %	25 %	0 %	25 %	298503038
25068	NC_014251	TTC	2	6	1415670	1415675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503038
25069	NC_014251	TTGG	2	8	1415686	1415693	0 %	50 %	50 %	0 %	298503038
25070	NC_014251	CAT	2	6	1415747	1415752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503038
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25073	NC_014251	GCA	2	6	1416203	1416208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503039
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25075	NC_014251	CGA	2	6	1416262	1416267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503039
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25085	NC_014251	GA	3	6	1416691	1416696	50 %	0 %	50 %	0 %	298503040
25086	NC_014251	AGATG	2	10	1416757	1416766	40 %	20 %	40 %	0 %	298503040
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25088	NC_014251	TGGC	2	8	1416977	1416984	0 %	25 %	50 %	25 %	298503041
25089	NC_014251	AGA	2	6	1417558	1417563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503042
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25097	NC_014251	TCA	2	6	1417996	1418001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503043
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25099	NC_014251	A	6	6	1418061	1418066	100 %	0 %	0 %	0 %	298503043
25100	NC_014251	TGG	2	6	1418136	1418141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298503043
25101	NC_014251	ATC	2	6	1418245	1418250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503043
25102	NC_014251	GATG	2	8	1418546	1418553	25 %	25 %	50 %	0 %	298503044
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25104	NC_014251	ATC	2	6	1418635	1418640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503044
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25107	NC_014251	GTCC	2	8	1418734	1418741	0 %	25 %	25 %	50 %	298503044
25108	NC_014251	GTT	2	6	1418794	1418799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503044
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25112	NC_014251	CT	3	6	1418893	1418898	0 %	50 %	0 %	50 %	298503044
25113	NC_014251	CAT	2	6	1419023	1419028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503044
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25117	NC_014251	TCT	2	6	1419259	1419264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503044
25118	NC_014251	CAC	2	6	1419300	1419305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503044
25119	NC_014251	CTT	2	6	1419314	1419319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503044
25120	NC_014251	CTC	2	6	1419562	1419567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503045
25121	NC_014251	TCA	2	6	1419584	1419589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503045
25122	NC_014251	ATC	2	6	1419592	1419597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503045
25123	NC_014251	TG	3	6	1419598	1419603	0 %	50 %	50 %	0 %	298503045
25124	NC_014251	CTTG	2	8	1419746	1419753	0 %	50 %	25 %	25 %	298503046
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25129	NC_014251	CGCT	2	8	1420021	1420028	0 %	25 %	25 %	50 %	298503046
25130	NC_014251	ATT	2	6	1420050	1420055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503046
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25132	NC_014251	TGGC	2	8	1420103	1420110	0 %	25 %	50 %	25 %	298503046
25133	NC_014251	TGT	3	9	1420127	1420135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503046
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25137	NC_014251	CTT	2	6	1420236	1420241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503046
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25143	NC_014251	GTC	2	6	1420673	1420678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503047
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25145	NC_014251	CTT	2	6	1420843	1420848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503047
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25154	NC_014251	TTC	2	6	1421209	1421214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503048
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25226	NC_014251	T	6	6	1424729	1424734	0 %	100 %	0 %	0 %	298503051
25227	NC_014251	CTTTC	2	10	1424750	1424759	0 %	60 %	0 %	40 %	298503051
25228	NC_014251	TCAT	2	8	1424764	1424771	25 %	50 %	0 %	25 %	298503051
25229	NC_014251	TTTC	2	8	1424785	1424792	0 %	75 %	0 %	25 %	298503052
25230	NC_014251	ACTCTT	2	12	1424874	1424885	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	298503052
25231	NC_014251	ATC	2	6	1424951	1424956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503052
25232	NC_014251	CTTT	2	8	1424991	1424998	0 %	75 %	0 %	25 %	298503052
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25234	NC_014251	CTA	2	6	1425007	1425012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503052
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25351	NC_014251	TCT	2	6	1431507	1431512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503057
25352	NC_014251	CCA	2	6	1431520	1431525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503057
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25467	NC_014251	CAA	2	6	1437694	1437699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503066
25468	NC_014251	GCA	2	6	1437702	1437707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503066
25469	NC_014251	TAA	2	6	1437788	1437793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503066
25470	NC_014251	AAGC	2	8	1437842	1437849	50 %	0 %	25 %	25 %	298503066
25471	NC_014251	CCT	2	6	1437897	1437902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503066
25472	NC_014251	CAT	2	6	1437922	1437927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503066
25473	NC_014251	CAT	2	6	1438000	1438005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503066
25474	NC_014251	CAT	2	6	1438099	1438104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503066
25475	NC_014251	TGG	2	6	1438105	1438110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298503066
25476	NC_014251	TAAA	2	8	1438118	1438125	75 %	25 %	0 %	0 %	298503066
25477	NC_014251	ATAG	2	8	1438159	1438166	50 %	25 %	25 %	0 %	298503066
25478	NC_014251	CCA	2	6	1438174	1438179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503066
25479	NC_014251	GAT	2	6	1438214	1438219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503066
25480	NC_014251	AGC	2	6	1438238	1438243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503066
25481	NC_014251	ATG	2	6	1438298	1438303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503066
25482	NC_014251	CTG	2	6	1438315	1438320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503066
25483	NC_014251	T	7	7	1438337	1438343	0 %	100 %	0 %	0 %	298503066
25484	NC_014251	CAT	2	6	1438352	1438357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503066
25485	NC_014251	TAT	2	6	1438461	1438466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503067
25486	NC_014251	GTCT	2	8	1438506	1438513	0 %	50 %	25 %	25 %	298503067
25487	NC_014251	AGA	2	6	1438576	1438581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503067
25488	NC_014251	ATG	2	6	1438861	1438866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503067
25489	NC_014251	ACC	3	9	1438867	1438875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503067
25490	NC_014251	TTC	2	6	1438918	1438923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503067
25491	NC_014251	GTT	2	6	1438937	1438942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503067
25492	NC_014251	ATC	2	6	1438948	1438953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503067
25493	NC_014251	TC	3	6	1439164	1439169	0 %	50 %	0 %	50 %	298503067
25494	NC_014251	TCC	2	6	1439207	1439212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298503067
25495	NC_014251	TTC	2	6	1439263	1439268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503067
25496	NC_014251	GATA	2	8	1439312	1439319	50 %	25 %	25 %	0 %	298503067
25497	NC_014251	GCAA	2	8	1439366	1439373	50 %	0 %	25 %	25 %	298503067
25498	NC_014251	CTT	2	6	1439391	1439396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503067
25499	NC_014251	CCA	2	6	1439486	1439491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503068
25500	NC_014251	TGGATC	2	12	1439550	1439561	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298503068

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