MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 36584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_014251	AGTA	2	8	1216757	1216764	50 %	25 %	25 %	0 %	298502824
21502	NC_014251	GTATTG	2	12	1217194	1217205	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	298502825
21503	NC_014251	GTT	2	6	1217247	1217252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502825
21504	NC_014251	AGG	2	6	1217297	1217302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298502825
21505	NC_014251	GGA	2	6	1217313	1217318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298502825
21506	NC_014251	GTT	2	6	1217349	1217354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502825
21507	NC_014251	CAG	2	6	1217365	1217370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502825
21508	NC_014251	TACTT	2	10	1217372	1217381	20 %	60 %	0 %	20 %	298502825
21509	NC_014251	T	6	6	1217385	1217390	0 %	100 %	0 %	0 %	298502825
21510	NC_014251	ATC	3	9	1217448	1217456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502825
21511	NC_014251	GCT	2	6	1217493	1217498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502825
21512	NC_014251	CTT	2	6	1217499	1217504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502825
21513	NC_014251	AATA	2	8	1217559	1217566	75 %	25 %	0 %	0 %	298502825
21514	NC_014251	TCGACC	2	12	1218048	1218059	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	298502826
21515	NC_014251	CTT	2	6	1218065	1218070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502826
21516	NC_014251	TGC	2	6	1218079	1218084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502826
21517	NC_014251	AGA	2	6	1218115	1218120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502826
21518	NC_014251	ATT	2	6	1218150	1218155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502826
21519	NC_014251	CT	3	6	1218174	1218179	0 %	50 %	0 %	50 %	298502826
21520	NC_014251	GAA	2	6	1218196	1218201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502826
21521	NC_014251	CAG	2	6	1218311	1218316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502826
21522	NC_014251	TGC	2	6	1218382	1218387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502826
21523	NC_014251	TCAA	2	8	1218450	1218457	50 %	25 %	0 %	25 %	298502826
21524	NC_014251	T	6	6	1218501	1218506	0 %	100 %	0 %	0 %	298502826
21525	NC_014251	AAAGA	2	10	1218542	1218551	80 %	0 %	20 %	0 %	298502826
21526	NC_014251	TGA	2	6	1218555	1218560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502826
21527	NC_014251	CCG	2	6	1218576	1218581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298502826
21528	NC_014251	AAT	2	6	1218596	1218601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502826
21529	NC_014251	TCA	2	6	1218631	1218636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502826
21530	NC_014251	CA	4	8	1218647	1218654	50 %	0 %	0 %	50 %	298502826
21531	NC_014251	A	7	7	1218761	1218767	100 %	0 %	0 %	0 %	298502827
21532	NC_014251	T	6	6	1218891	1218896	0 %	100 %	0 %	0 %	298502827
21533	NC_014251	CAT	2	6	1218943	1218948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502827
21534	NC_014251	AAG	2	6	1218955	1218960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502827
21535	NC_014251	AT	3	6	1219015	1219020	50 %	50 %	0 %	0 %	298502827
21536	NC_014251	T	6	6	1219098	1219103	0 %	100 %	0 %	0 %	298502827
21537	NC_014251	ATAC	2	8	1219105	1219112	50 %	25 %	0 %	25 %	298502827
21538	NC_014251	TAA	2	6	1219151	1219156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502827
21539	NC_014251	TAT	2	6	1219167	1219172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502827
21540	NC_014251	TGA	2	6	1219235	1219240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502827
21541	NC_014251	A	7	7	1219249	1219255	100 %	0 %	0 %	0 %	298502827
21542	NC_014251	GTA	2	6	1219357	1219362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502827
21543	NC_014251	A	6	6	1219392	1219397	100 %	0 %	0 %	0 %	298502827
21544	NC_014251	ATCA	2	8	1219599	1219606	50 %	25 %	0 %	25 %	298502828
21545	NC_014251	ATT	2	6	1219635	1219640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502828
21546	NC_014251	CT	3	6	1219669	1219674	0 %	50 %	0 %	50 %	298502828
21547	NC_014251	ACA	2	6	1219677	1219682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502828
21548	NC_014251	GAA	2	6	1219689	1219694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502828
21549	NC_014251	GGT	2	6	1219700	1219705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502828
21550	NC_014251	CCA	2	6	1219785	1219790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298502828
21551	NC_014251	GAT	2	6	1219821	1219826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502828
21552	NC_014251	CTT	2	6	1219881	1219886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502828
21553	NC_014251	CTG	2	6	1219906	1219911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502828
21554	NC_014251	GGT	2	6	1219970	1219975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502828
21555	NC_014251	ATC	2	6	1219978	1219983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502828
21556	NC_014251	TAGA	2	8	1219984	1219991	50 %	25 %	25 %	0 %	298502828
21557	NC_014251	AAG	3	9	1220028	1220036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502828
21558	NC_014251	TCA	2	6	1220054	1220059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502828
21559	NC_014251	CGA	2	6	1220212	1220217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502829
21560	NC_014251	TAA	2	6	1220261	1220266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502829
21561	NC_014251	ATG	2	6	1220275	1220280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502829
21562	NC_014251	GTGG	2	8	1220304	1220311	0 %	25 %	75 %	0 %	298502829
21563	NC_014251	AG	4	8	1220318	1220325	50 %	0 %	50 %	0 %	298502829
21564	NC_014251	GA	3	6	1220326	1220331	50 %	0 %	50 %	0 %	298502829
21565	NC_014251	GAA	2	6	1220364	1220369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502829
21566	NC_014251	AGCCA	2	10	1220381	1220390	40 %	0 %	20 %	40 %	298502829
21567	NC_014251	TCA	2	6	1220404	1220409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502829
21568	NC_014251	TTGA	2	8	1220481	1220488	25 %	50 %	25 %	0 %	298502829
21569	NC_014251	ATG	2	6	1220521	1220526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502829
21570	NC_014251	TTG	2	6	1220566	1220571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502829
21571	NC_014251	CTT	2	6	1220594	1220599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502829
21572	NC_014251	GTTT	2	8	1220609	1220616	0 %	75 %	25 %	0 %	298502829
21573	NC_014251	ATG	2	6	1220617	1220622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502829
21574	NC_014251	TTG	2	6	1220631	1220636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502829
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21584	NC_014251	TGAC	2	8	1221073	1221080	25 %	25 %	25 %	25 %	298502830
21585	NC_014251	GGTT	2	8	1221107	1221114	0 %	50 %	50 %	0 %	298502830
21586	NC_014251	TGA	2	6	1221119	1221124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502830
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21589	NC_014251	ATG	2	6	1221306	1221311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502830
21590	NC_014251	GAA	2	6	1221375	1221380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502830
21591	NC_014251	AGT	2	6	1221389	1221394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502830
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21597	NC_014251	A	7	7	1221607	1221613	100 %	0 %	0 %	0 %	298502830
21598	NC_014251	TC	3	6	1221669	1221674	0 %	50 %	0 %	50 %	298502830
21599	NC_014251	A	6	6	1221727	1221732	100 %	0 %	0 %	0 %	298502830
21600	NC_014251	CAG	2	6	1221793	1221798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502830
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21603	NC_014251	GA	3	6	1221982	1221987	50 %	0 %	50 %	0 %	298502831
21604	NC_014251	TTAG	2	8	1222096	1222103	25 %	50 %	25 %	0 %	298502831
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21609	NC_014251	GA	3	6	1222251	1222256	50 %	0 %	50 %	0 %	298502832
21610	NC_014251	TAT	2	6	1222263	1222268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502832
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21615	NC_014251	CTTT	2	8	1222404	1222411	0 %	75 %	0 %	25 %	298502832
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21617	NC_014251	GAA	2	6	1222481	1222486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502832
21618	NC_014251	ATTT	3	12	1222507	1222518	25 %	75 %	0 %	0 %	298502832
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21624	NC_014251	CTTG	2	8	1222846	1222853	0 %	50 %	25 %	25 %	298502832
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21626	NC_014251	TTTA	2	8	1222870	1222877	25 %	75 %	0 %	0 %	298502832
21627	NC_014251	AAGG	2	8	1222940	1222947	50 %	0 %	50 %	0 %	298502832
21628	NC_014251	GGCTAT	2	12	1223113	1223124	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298502832
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21733	NC_014251	GAA	2	6	1228944	1228949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502837
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21969	NC_014251	GATT	2	8	1240282	1240289	25 %	50 %	25 %	0 %	298502844
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21997	NC_014251	TTTC	2	8	1241584	1241591	0 %	75 %	0 %	25 %	298502845
21998	NC_014251	T	6	6	1241690	1241695	0 %	100 %	0 %	0 %	298502845
21999	NC_014251	TTC	2	6	1241706	1241711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502845
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