MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 36584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014251	CTT	2	6	88455	88460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501594
1502	NC_014251	TGA	2	6	88481	88486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501594
1503	NC_014251	ATCA	2	8	88582	88589	50 %	25 %	0 %	25 %	298501594
1504	NC_014251	AAG	2	6	88613	88618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501594
1505	NC_014251	AGGT	2	8	88657	88664	25 %	25 %	50 %	0 %	298501594
1506	NC_014251	A	6	6	88793	88798	100 %	0 %	0 %	0 %	298501594
1507	NC_014251	TGA	2	6	88809	88814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501594
1508	NC_014251	TTG	2	6	88817	88822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501594
1509	NC_014251	CAC	2	6	88852	88857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501594
1510	NC_014251	AAC	2	6	88888	88893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501594
1511	NC_014251	GCC	2	6	88922	88927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298501594
1512	NC_014251	ACCTTT	2	12	88969	88980	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	298501594
1513	NC_014251	GGAC	2	8	89057	89064	25 %	0 %	50 %	25 %	298501594
1514	NC_014251	ACC	2	6	89128	89133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501594
1515	NC_014251	CAG	2	6	89148	89153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501594
1516	NC_014251	ATT	2	6	89173	89178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501594
1517	NC_014251	CTC	2	6	89188	89193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501594
1518	NC_014251	GC	3	6	89198	89203	0 %	0 %	50 %	50 %	298501594
1519	NC_014251	GCAT	2	8	89249	89256	25 %	25 %	25 %	25 %	298501594
1520	NC_014251	TGTT	2	8	89290	89297	0 %	75 %	25 %	0 %	298501594
1521	NC_014251	CGA	2	6	89298	89303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501594
1522	NC_014251	AGGC	2	8	89305	89312	25 %	0 %	50 %	25 %	298501594
1523	NC_014251	CCAA	2	8	89329	89336	50 %	0 %	0 %	50 %	298501594
1524	NC_014251	CTC	2	6	89464	89469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501594
1525	NC_014251	ATCT	2	8	89525	89532	25 %	50 %	0 %	25 %	298501594
1526	NC_014251	TTACAA	2	12	89588	89599	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298501595
1527	NC_014251	T	6	6	89626	89631	0 %	100 %	0 %	0 %	298501595
1528	NC_014251	ATA	2	6	89658	89663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501595
1529	NC_014251	CTA	2	6	89680	89685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501595
1530	NC_014251	CTG	2	6	89722	89727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501595
1531	NC_014251	CTGCAC	2	12	89848	89859	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	298501595
1532	NC_014251	T	6	6	89871	89876	0 %	100 %	0 %	0 %	298501595
1533	NC_014251	CCA	2	6	89892	89897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501595
1534	NC_014251	CAT	2	6	89963	89968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501595
1535	NC_014251	ATA	2	6	90006	90011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501595
1536	NC_014251	ACA	2	6	90087	90092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501595
1537	NC_014251	AAG	2	6	90119	90124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501595
1538	NC_014251	ACA	2	6	90171	90176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501595
1539	NC_014251	CAG	2	6	90187	90192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501595
1540	NC_014251	TTTTC	2	10	90229	90238	0 %	80 %	0 %	20 %	298501595
1541	NC_014251	CTTT	2	8	90529	90536	0 %	75 %	0 %	25 %	298501596
1542	NC_014251	CTT	2	6	90539	90544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501596
1543	NC_014251	AAT	2	6	90570	90575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501596
1544	NC_014251	AGG	2	6	90592	90597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501596
1545	NC_014251	ACT	2	6	90607	90612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501596
1546	NC_014251	AG	3	6	90635	90640	50 %	0 %	50 %	0 %	298501596
1547	NC_014251	AGA	2	6	90642	90647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501596
1548	NC_014251	GA	3	6	90646	90651	50 %	0 %	50 %	0 %	298501596
1549	NC_014251	ACC	2	6	90676	90681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501596
1550	NC_014251	A	6	6	90718	90723	100 %	0 %	0 %	0 %	298501596
1551	NC_014251	AAAG	2	8	90738	90745	75 %	0 %	25 %	0 %	298501596
1552	NC_014251	AAAC	2	8	90822	90829	75 %	0 %	0 %	25 %	298501596
1553	NC_014251	ATC	2	6	90838	90843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501596
1554	NC_014251	CCCA	2	8	90845	90852	25 %	0 %	0 %	75 %	298501596
1555	NC_014251	GCG	2	6	90950	90955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298501596
1556	NC_014251	GA	4	8	90968	90975	50 %	0 %	50 %	0 %	298501596
1557	NC_014251	TAA	2	6	91094	91099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501596
1558	NC_014251	A	6	6	91150	91155	100 %	0 %	0 %	0 %	298501596
1559	NC_014251	ACTGA	2	10	91157	91166	40 %	20 %	20 %	20 %	298501596
1560	NC_014251	A	6	6	91166	91171	100 %	0 %	0 %	0 %	298501596
1561	NC_014251	AAG	2	6	91336	91341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501596
1562	NC_014251	A	6	6	91456	91461	100 %	0 %	0 %	0 %	298501596
1563	NC_014251	ATTG	2	8	91472	91479	25 %	50 %	25 %	0 %	298501596
1564	NC_014251	GAA	3	9	91514	91522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501597
1565	NC_014251	GTA	2	6	91529	91534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501597
1566	NC_014251	ACT	3	9	91558	91566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501597
1567	NC_014251	CTG	2	6	91571	91576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501597
1568	NC_014251	TGGA	2	8	91581	91588	25 %	25 %	50 %	0 %	298501597
1569	NC_014251	TTA	2	6	91685	91690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501597
1570	NC_014251	CTT	2	6	91728	91733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501597
1571	NC_014251	CACTA	2	10	91792	91801	40 %	20 %	0 %	40 %	298501597
1572	NC_014251	AAAGC	2	10	91808	91817	60 %	0 %	20 %	20 %	298501597
1573	NC_014251	TTA	2	6	91886	91891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501597
1574	NC_014251	AATG	2	8	91913	91920	50 %	25 %	25 %	0 %	298501597
1575	NC_014251	ATC	2	6	91924	91929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501597
1576	NC_014251	TTGG	2	8	91993	92000	0 %	50 %	50 %	0 %	298501597
1577	NC_014251	CAATC	2	10	92016	92025	40 %	20 %	0 %	40 %	298501597
1578	NC_014251	AAG	2	6	92049	92054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501597
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1580	NC_014251	TCG	2	6	92121	92126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501597
1581	NC_014251	CTG	2	6	92187	92192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501597
1582	NC_014251	TGA	2	6	92219	92224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501597
1583	NC_014251	ATT	2	6	92233	92238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501597
1584	NC_014251	ACC	3	9	92287	92295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501597
1585	NC_014251	TCA	2	6	92442	92447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501597
1586	NC_014251	CATA	2	8	92469	92476	50 %	25 %	0 %	25 %	298501597
1587	NC_014251	TTG	2	6	92499	92504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501597
1588	NC_014251	TAGA	2	8	92511	92518	50 %	25 %	25 %	0 %	298501597
1589	NC_014251	GTA	2	6	92579	92584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501597
1590	NC_014251	ATT	2	6	92617	92622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501597
1591	NC_014251	ACC	2	6	92644	92649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501597
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1593	NC_014251	GTA	3	9	92786	92794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501597
1594	NC_014251	ACC	2	6	92803	92808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501597
1595	NC_014251	TC	3	6	92888	92893	0 %	50 %	0 %	50 %	298501597
1596	NC_014251	CATA	2	8	92907	92914	50 %	25 %	0 %	25 %	298501597
1597	NC_014251	ATAC	2	8	93055	93062	50 %	25 %	0 %	25 %	298501597
1598	NC_014251	TCA	2	6	93107	93112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501597
1599	NC_014251	AGTA	2	8	93144	93151	50 %	25 %	25 %	0 %	298501597
1600	NC_014251	TGC	2	6	93181	93186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501597
1601	NC_014251	ACTG	2	8	93201	93208	25 %	25 %	25 %	25 %	298501597
1602	NC_014251	GCT	2	6	93233	93238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501597
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1606	NC_014251	CTG	2	6	93400	93405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501597
1607	NC_014251	TAC	2	6	93496	93501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501597
1608	NC_014251	TCT	2	6	93527	93532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501597
1609	NC_014251	CTT	2	6	93547	93552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501597
1610	NC_014251	CAA	2	6	93592	93597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501597
1611	NC_014251	CT	3	6	93602	93607	0 %	50 %	0 %	50 %	298501597
1612	NC_014251	CCGTC	2	10	93621	93630	0 %	20 %	20 %	60 %	298501597
1613	NC_014251	AGA	2	6	93652	93657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501597
1614	NC_014251	TTC	2	6	93682	93687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501597
1615	NC_014251	TCC	2	6	93757	93762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501597
1616	NC_014251	TAAAT	2	10	93784	93793	60 %	40 %	0 %	0 %	298501597
1617	NC_014251	T	6	6	93853	93858	0 %	100 %	0 %	0 %	298501597
1618	NC_014251	T	6	6	93892	93897	0 %	100 %	0 %	0 %	298501597
1619	NC_014251	T	7	7	93899	93905	0 %	100 %	0 %	0 %	298501597
1620	NC_014251	TGA	2	6	94116	94121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501598
1621	NC_014251	TGA	2	6	94155	94160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501598
1622	NC_014251	AGA	2	6	94182	94187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501598
1623	NC_014251	TTA	2	6	94200	94205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501598
1624	NC_014251	CTG	2	6	94223	94228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501598
1625	NC_014251	GTC	2	6	94268	94273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501598
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1627	NC_014251	CAA	2	6	94467	94472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501598
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1752	NC_014251	ACG	2	6	101521	101526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501606
1753	NC_014251	GTTT	2	8	101539	101546	0 %	75 %	25 %	0 %	298501606
1754	NC_014251	TGT	2	6	101547	101552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501606
1755	NC_014251	TGC	2	6	101620	101625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501606
1756	NC_014251	GAT	2	6	101692	101697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501606
1757	NC_014251	ACG	2	6	101731	101736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501606
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1759	NC_014251	GAT	2	6	101749	101754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501606
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1761	NC_014251	TG	3	6	101824	101829	0 %	50 %	50 %	0 %	298501606
1762	NC_014251	TCG	2	6	102002	102007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501606
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1770	NC_014251	AAAGT	2	10	102251	102260	60 %	20 %	20 %	0 %	298501606
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1786	NC_014251	TCAAG	2	10	102838	102847	40 %	20 %	20 %	20 %	298501607
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1791	NC_014251	GT	3	6	103124	103129	0 %	50 %	50 %	0 %	298501607
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1867	NC_014251	TATC	2	8	107611	107618	25 %	50 %	0 %	25 %	298501610
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1991	NC_014251	TAGAG	2	10	114503	114512	40 %	20 %	40 %	0 %	298501618
1992	NC_014251	AGA	2	6	114602	114607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501618
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1995	NC_014251	CAAG	2	8	114713	114720	50 %	0 %	25 %	25 %	298501619
1996	NC_014251	TC	3	6	114737	114742	0 %	50 %	0 %	50 %	298501619
1997	NC_014251	AAGA	2	8	114748	114755	75 %	0 %	25 %	0 %	298501619
1998	NC_014251	ATA	2	6	114760	114765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501619
1999	NC_014251	AT	3	6	114772	114777	50 %	50 %	0 %	0 %	298501619
2000	NC_014251	TCA	2	6	114853	114858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501619

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