MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 36584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_014251	AACAA	2	10	881156	881165	80 %	0 %	0 %	20 %	298502458
15502	NC_014251	GAA	2	6	881189	881194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
15503	NC_014251	GTT	3	9	881195	881203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502458
15504	NC_014251	AGA	2	6	881260	881265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
15505	NC_014251	A	7	7	881364	881370	100 %	0 %	0 %	0 %	298502458
15506	NC_014251	ACTCCA	2	12	881417	881428	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	298502458
15507	NC_014251	GC	3	6	881507	881512	0 %	0 %	50 %	50 %	298502458
15508	NC_014251	ATT	2	6	881515	881520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502458
15509	NC_014251	TTG	2	6	881529	881534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502458
15510	NC_014251	GGT	2	6	881624	881629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502458
15511	NC_014251	GTG	2	6	881709	881714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502458
15512	NC_014251	TTG	2	6	881787	881792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502458
15513	NC_014251	GCT	2	6	881861	881866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502458
15514	NC_014251	ATA	2	6	881898	881903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502458
15515	NC_014251	TGG	2	6	881980	881985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502458
15516	NC_014251	TA	3	6	882014	882019	50 %	50 %	0 %	0 %	298502458
15517	NC_014251	ATG	2	6	882035	882040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
15518	NC_014251	TTG	2	6	882129	882134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502458
15519	NC_014251	ACA	2	6	882175	882180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502458
15520	NC_014251	CAG	2	6	882243	882248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502458
15521	NC_014251	TAAA	2	8	882276	882283	75 %	25 %	0 %	0 %	298502458
15522	NC_014251	AAC	2	6	882287	882292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502458
15523	NC_014251	CAAA	2	8	882295	882302	75 %	0 %	0 %	25 %	298502458
15524	NC_014251	ACTT	2	8	882349	882356	25 %	50 %	0 %	25 %	298502458
15525	NC_014251	TAA	2	6	882415	882420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502458
15526	NC_014251	ATT	2	6	882439	882444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502458
15527	NC_014251	TAT	2	6	882456	882461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502458
15528	NC_014251	GAA	2	6	882548	882553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
15529	NC_014251	CAA	2	6	882584	882589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502458
15530	NC_014251	TGA	2	6	882663	882668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
15531	NC_014251	AG	3	6	882735	882740	50 %	0 %	50 %	0 %	298502458
15532	NC_014251	AAGA	2	8	882746	882753	75 %	0 %	25 %	0 %	298502458
15533	NC_014251	GTC	2	6	882774	882779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502458
15534	NC_014251	GAA	2	6	882809	882814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
15535	NC_014251	ATC	2	6	882876	882881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502458
15536	NC_014251	GAA	2	6	882919	882924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
15537	NC_014251	ATA	2	6	882933	882938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502458
15538	NC_014251	ATG	2	6	882950	882955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
15539	NC_014251	ATG	2	6	883019	883024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
15540	NC_014251	GATT	2	8	883068	883075	25 %	50 %	25 %	0 %	298502458
15541	NC_014251	AAT	2	6	883094	883099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502458
15542	NC_014251	CTT	2	6	883174	883179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502458
15543	NC_014251	ATT	2	6	883195	883200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502458
15544	NC_014251	AAC	2	6	883266	883271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502458
15545	NC_014251	CAA	2	6	883294	883299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502458
15546	NC_014251	A	6	6	883298	883303	100 %	0 %	0 %	0 %	298502458
15547	NC_014251	TAA	2	6	883324	883329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502458
15548	NC_014251	CTT	2	6	883358	883363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502458
15549	NC_014251	ACA	2	6	883401	883406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502458
15550	NC_014251	CTT	2	6	883556	883561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502458
15551	NC_014251	ATA	2	6	883602	883607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502458
15552	NC_014251	TAG	2	6	883624	883629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
15553	NC_014251	ATATGG	2	12	883711	883722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
15554	NC_014251	GCATAT	2	12	883724	883735	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298502458
15555	NC_014251	GCA	2	6	883742	883747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502458
15556	NC_014251	GATG	2	8	883756	883763	25 %	25 %	50 %	0 %	298502458
15557	NC_014251	ACT	2	6	883826	883831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502458
15558	NC_014251	TGG	2	6	883858	883863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502458
15559	NC_014251	ATG	2	6	883989	883994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
15560	NC_014251	CTT	2	6	884084	884089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502458
15561	NC_014251	AAC	2	6	884138	884143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502458
15562	NC_014251	A	6	6	884153	884158	100 %	0 %	0 %	0 %	298502458
15563	NC_014251	GAA	2	6	884188	884193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
15564	NC_014251	GAT	2	6	884255	884260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
15565	NC_014251	ATA	2	6	884268	884273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502458
15566	NC_014251	TAC	2	6	884438	884443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502458
15567	NC_014251	TGA	2	6	884524	884529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
15568	NC_014251	TCA	2	6	884532	884537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502458
15569	NC_014251	ATA	2	6	884553	884558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502458
15570	NC_014251	GAA	2	6	884581	884586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
15571	NC_014251	AAG	2	6	884598	884603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
15572	NC_014251	TAAAGC	2	12	884611	884622	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298502458
15573	NC_014251	TAC	2	6	884650	884655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502458
15574	NC_014251	TAG	2	6	884659	884664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502458
15575	NC_014251	GAA	2	6	884677	884682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502458
15576	NC_014251	TGC	2	6	884689	884694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502458
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15587	NC_014251	GCA	2	6	885218	885223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502459
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15590	NC_014251	T	6	6	885428	885433	0 %	100 %	0 %	0 %	298502459
15591	NC_014251	ACA	2	6	885455	885460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502459
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15593	NC_014251	AAG	2	6	885501	885506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502459
15594	NC_014251	GTTG	2	8	885522	885529	0 %	50 %	50 %	0 %	298502459
15595	NC_014251	ATG	2	6	885560	885565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502459
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15597	NC_014251	TTG	2	6	885711	885716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502459
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15599	NC_014251	TCA	2	6	885970	885975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502459
15600	NC_014251	GCA	2	6	885980	885985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502459
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15602	NC_014251	CTG	2	6	886049	886054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502459
15603	NC_014251	CCTTT	2	10	886104	886113	0 %	60 %	0 %	40 %	298502459
15604	NC_014251	AGA	2	6	886120	886125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502459
15605	NC_014251	GA	3	6	886209	886214	50 %	0 %	50 %	0 %	298502459
15606	NC_014251	GTCT	2	8	886271	886278	0 %	50 %	25 %	25 %	298502459
15607	NC_014251	GCT	2	6	886286	886291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502459
15608	NC_014251	AATC	2	8	886295	886302	50 %	25 %	0 %	25 %	298502459
15609	NC_014251	ACCG	2	8	886326	886333	25 %	0 %	25 %	50 %	298502459
15610	NC_014251	AGA	2	6	886356	886361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502459
15611	NC_014251	AC	3	6	886437	886442	50 %	0 %	0 %	50 %	298502459
15612	NC_014251	ACAGG	2	10	886496	886505	40 %	0 %	40 %	20 %	298502459
15613	NC_014251	AGA	2	6	886507	886512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502459
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