MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 36584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014251	TTTC	2	8	739606	739613	0 %	75 %	0 %	25 %	298502306
13002	NC_014251	ATAA	2	8	739635	739642	75 %	25 %	0 %	0 %	298502306
13003	NC_014251	CTG	2	6	739669	739674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502306
13004	NC_014251	T	6	6	739683	739688	0 %	100 %	0 %	0 %	298502306
13005	NC_014251	TCA	2	6	739723	739728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502306
13006	NC_014251	TAA	2	6	739729	739734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502306
13007	NC_014251	TCA	2	6	739746	739751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502306
13008	NC_014251	TCA	2	6	739806	739811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502306
13009	NC_014251	GAA	2	6	739819	739824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502306
13010	NC_014251	CTTT	2	8	739858	739865	0 %	75 %	0 %	25 %	298502306
13011	NC_014251	TAT	2	6	739885	739890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502306
13012	NC_014251	T	6	6	739892	739897	0 %	100 %	0 %	0 %	298502306
13013	NC_014251	ACT	2	6	739922	739927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502306
13014	NC_014251	AAG	2	6	739950	739955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502306
13015	NC_014251	CCT	2	6	739956	739961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298502306
13016	NC_014251	GCAA	2	8	739967	739974	50 %	0 %	25 %	25 %	298502306
13017	NC_014251	T	6	6	740089	740094	0 %	100 %	0 %	0 %	298502306
13018	NC_014251	TCA	2	6	740145	740150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502306
13019	NC_014251	TGA	2	6	740158	740163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502306
13020	NC_014251	GTT	2	6	740195	740200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502306
13021	NC_014251	TCT	3	9	740397	740405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502306
13022	NC_014251	AAT	2	6	740445	740450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502306
13023	NC_014251	ATG	2	6	740533	740538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502306
13024	NC_014251	T	6	6	740615	740620	0 %	100 %	0 %	0 %	298502307
13025	NC_014251	TGA	2	6	740638	740643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502307
13026	NC_014251	CCA	2	6	740655	740660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298502307
13027	NC_014251	TA	3	6	740776	740781	50 %	50 %	0 %	0 %	298502307
13028	NC_014251	TTTG	2	8	740791	740798	0 %	75 %	25 %	0 %	298502307
13029	NC_014251	AAATCA	2	12	740859	740870	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298502307
13030	NC_014251	T	6	6	740927	740932	0 %	100 %	0 %	0 %	298502307
13031	NC_014251	CTT	2	6	740954	740959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502307
13032	NC_014251	CCG	2	6	740965	740970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298502307
13033	NC_014251	TTC	2	6	741021	741026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502307
13034	NC_014251	AT	3	6	741123	741128	50 %	50 %	0 %	0 %	298502307
13035	NC_014251	ACTG	2	8	741176	741183	25 %	25 %	25 %	25 %	298502307
13036	NC_014251	CAAA	2	8	741238	741245	75 %	0 %	0 %	25 %	298502307
13037	NC_014251	AAT	2	6	741266	741271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502307
13038	NC_014251	A	6	6	741275	741280	100 %	0 %	0 %	0 %	298502307
13039	NC_014251	AAT	2	6	741320	741325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502307
13040	NC_014251	TGGAT	2	10	741343	741352	20 %	40 %	40 %	0 %	298502307
13041	NC_014251	TAA	2	6	741404	741409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502307
13042	NC_014251	GTT	2	6	741417	741422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502307
13043	NC_014251	TCT	2	6	741519	741524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502307
13044	NC_014251	GCA	2	6	741555	741560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502307
13045	NC_014251	A	6	6	741592	741597	100 %	0 %	0 %	0 %	298502307
13046	NC_014251	TTGCT	2	10	741621	741630	0 %	60 %	20 %	20 %	298502307
13047	NC_014251	AAAC	2	8	741643	741650	75 %	0 %	0 %	25 %	298502307
13048	NC_014251	ATC	2	6	741671	741676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502307
13049	NC_014251	GTA	2	6	741710	741715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502307
13050	NC_014251	TCT	2	6	741720	741725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502307
13051	NC_014251	CATCCA	2	12	741772	741783	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	298502307
13052	NC_014251	A	6	6	741819	741824	100 %	0 %	0 %	0 %	298502307
13053	NC_014251	AAT	2	6	741946	741951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502307
13054	NC_014251	TCA	2	6	742002	742007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502307
13055	NC_014251	AAG	2	6	742023	742028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502307
13056	NC_014251	AGTT	2	8	742073	742080	25 %	50 %	25 %	0 %	298502307
13057	NC_014251	AATTT	2	10	742111	742120	40 %	60 %	0 %	0 %	298502307
13058	NC_014251	CTA	2	6	742201	742206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502307
13059	NC_014251	AAT	2	6	742268	742273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502307
13060	NC_014251	ATA	2	6	742379	742384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502307
13061	NC_014251	TTC	2	6	742487	742492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502307
13062	NC_014251	TTC	2	6	742526	742531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502307
13063	NC_014251	TC	3	6	742530	742535	0 %	50 %	0 %	50 %	298502307
13064	NC_014251	GAA	2	6	742572	742577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502307
13065	NC_014251	TC	3	6	742600	742605	0 %	50 %	0 %	50 %	298502307
13066	NC_014251	TTG	2	6	742619	742624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502307
13067	NC_014251	TAT	2	6	742648	742653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502307
13068	NC_014251	CAA	2	6	742663	742668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502307
13069	NC_014251	T	7	7	742712	742718	0 %	100 %	0 %	0 %	298502307
13070	NC_014251	CTT	2	6	742720	742725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502307
13071	NC_014251	ACG	2	6	742727	742732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502307
13072	NC_014251	TTC	2	6	742775	742780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502307
13073	NC_014251	TGA	2	6	742831	742836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502307
13074	NC_014251	TCC	2	6	742851	742856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298502307
13075	NC_014251	TTTC	2	8	742864	742871	0 %	75 %	0 %	25 %	298502307
13076	NC_014251	ATA	2	6	743372	743377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502308
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13078	NC_014251	TAA	2	6	743458	743463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502308
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13082	NC_014251	TTC	2	6	743755	743760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502309
13083	NC_014251	TCT	2	6	743769	743774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502309
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13085	NC_014251	TTG	2	6	743875	743880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502309
13086	NC_014251	GTTT	2	8	743890	743897	0 %	75 %	25 %	0 %	298502309
13087	NC_014251	AG	3	6	743898	743903	50 %	0 %	50 %	0 %	298502309
13088	NC_014251	TCTT	3	12	743916	743927	0 %	75 %	0 %	25 %	298502309
13089	NC_014251	CAGA	2	8	744154	744161	50 %	0 %	25 %	25 %	298502310
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13091	NC_014251	TGA	2	6	744168	744173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502310
13092	NC_014251	CAG	2	6	744190	744195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502310
13093	NC_014251	ATT	2	6	744211	744216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502310
13094	NC_014251	GGCT	2	8	744416	744423	0 %	25 %	50 %	25 %	298502310
13095	NC_014251	TTC	2	6	744466	744471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502310
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13098	NC_014251	GTT	2	6	744586	744591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502310
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13100	NC_014251	AGG	2	6	744680	744685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298502310
13101	NC_014251	CAT	2	6	744705	744710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502310
13102	NC_014251	CGGA	2	8	744760	744767	25 %	0 %	50 %	25 %	298502310
13103	NC_014251	ACA	2	6	744796	744801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502310
13104	NC_014251	AGC	2	6	744903	744908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502310
13105	NC_014251	TAG	2	6	745035	745040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502310
13106	NC_014251	AATC	2	8	745116	745123	50 %	25 %	0 %	25 %	298502310
13107	NC_014251	CAG	2	6	745182	745187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502310
13108	NC_014251	A	6	6	745250	745255	100 %	0 %	0 %	0 %	298502311
13109	NC_014251	GAA	2	6	745257	745262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502311
13110	NC_014251	AGA	2	6	745265	745270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502311
13111	NC_014251	AAG	2	6	745276	745281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502311
13112	NC_014251	GAA	2	6	745302	745307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502311
13113	NC_014251	GAA	2	6	745419	745424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502311
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13118	NC_014251	GCA	2	6	745602	745607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502311
13119	NC_014251	CAG	2	6	745654	745659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502311
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13363	NC_014251	TCT	2	6	759928	759933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502327
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13485	NC_014251	TCA	2	6	766798	766803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502342
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13488	NC_014251	T	6	6	767193	767198	0 %	100 %	0 %	0 %	298502343
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13490	NC_014251	T	7	7	767279	767285	0 %	100 %	0 %	0 %	298502343
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