MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 36584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014251	AGA	2	6	570284	570289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502139
10002	NC_014251	CAAG	2	8	570306	570313	50 %	0 %	25 %	25 %	298502139
10003	NC_014251	GAAA	2	8	570345	570352	75 %	0 %	25 %	0 %	298502139
10004	NC_014251	A	7	7	570423	570429	100 %	0 %	0 %	0 %	298502140
10005	NC_014251	TAT	2	6	570503	570508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502140
10006	NC_014251	T	7	7	570527	570533	0 %	100 %	0 %	0 %	298502140
10007	NC_014251	ATT	2	6	570550	570555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502140
10008	NC_014251	GAAG	2	8	570588	570595	50 %	0 %	50 %	0 %	298502140
10009	NC_014251	AAG	2	6	570598	570603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502140
10010	NC_014251	TCA	2	6	570606	570611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502140
10011	NC_014251	ACC	2	6	570613	570618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298502140
10012	NC_014251	CCT	2	6	570686	570691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298502140
10013	NC_014251	TGA	2	6	570711	570716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502140
10014	NC_014251	A	6	6	570755	570760	100 %	0 %	0 %	0 %	298502140
10015	NC_014251	GAA	2	6	570808	570813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502140
10016	NC_014251	AG	3	6	570823	570828	50 %	0 %	50 %	0 %	298502140
10017	NC_014251	CAAG	2	8	570849	570856	50 %	0 %	25 %	25 %	298502140
10018	NC_014251	ATG	2	6	570898	570903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502140
10019	NC_014251	A	6	6	570910	570915	100 %	0 %	0 %	0 %	298502140
10020	NC_014251	GATT	2	8	570942	570949	25 %	50 %	25 %	0 %	298502140
10021	NC_014251	AGCTC	2	10	571011	571020	20 %	20 %	20 %	40 %	298502140
10022	NC_014251	TAT	2	6	571107	571112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502140
10023	NC_014251	CAA	2	6	571168	571173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502140
10024	NC_014251	ACA	2	6	571198	571203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502140
10025	NC_014251	GATG	2	8	571239	571246	25 %	25 %	50 %	0 %	298502140
10026	NC_014251	ACC	2	6	571321	571326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298502140
10027	NC_014251	ACCT	2	8	571332	571339	25 %	25 %	0 %	50 %	298502140
10028	NC_014251	AAG	2	6	571355	571360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502140
10029	NC_014251	TTTG	2	8	571375	571382	0 %	75 %	25 %	0 %	298502140
10030	NC_014251	CTT	2	6	571445	571450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502140
10031	NC_014251	ATA	3	9	571457	571465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502140
10032	NC_014251	CGA	2	6	571517	571522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502140
10033	NC_014251	ACT	2	6	571552	571557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502140
10034	NC_014251	GAT	2	6	571563	571568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502140
10035	NC_014251	A	6	6	571625	571630	100 %	0 %	0 %	0 %	298502140
10036	NC_014251	TTGG	2	8	571644	571651	0 %	50 %	50 %	0 %	298502140
10037	NC_014251	ATA	2	6	571730	571735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502140
10038	NC_014251	ACACAA	2	12	571780	571791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502140
10039	NC_014251	ATG	2	6	571820	571825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502140
10040	NC_014251	GGAC	2	8	571967	571974	25 %	0 %	50 %	25 %	298502140
10041	NC_014251	TGA	2	6	572073	572078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502140
10042	NC_014251	GGA	2	6	572086	572091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298502140
10043	NC_014251	TTGG	2	8	572095	572102	0 %	50 %	50 %	0 %	298502140
10044	NC_014251	CTG	2	6	572141	572146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502140
10045	NC_014251	TGTA	2	8	572165	572172	25 %	50 %	25 %	0 %	298502140
10046	NC_014251	ATT	2	6	572192	572197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502140
10047	NC_014251	TC	3	6	572260	572265	0 %	50 %	0 %	50 %	298502140
10048	NC_014251	GAC	2	6	572301	572306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502140
10049	NC_014251	GTT	2	6	572395	572400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298502140
10050	NC_014251	AGA	2	6	572433	572438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502140
10051	NC_014251	A	6	6	572442	572447	100 %	0 %	0 %	0 %	298502140
10052	NC_014251	ACCAA	2	10	572454	572463	60 %	0 %	0 %	40 %	298502140
10053	NC_014251	AGA	2	6	572490	572495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502140
10054	NC_014251	AGGTTC	2	12	572574	572585	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298502140
10055	NC_014251	A	7	7	572635	572641	100 %	0 %	0 %	0 %	298502140
10056	NC_014251	CAG	2	6	572765	572770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502141
10057	NC_014251	GGTTT	2	10	572825	572834	0 %	60 %	40 %	0 %	298502141
10058	NC_014251	CTTT	2	8	572859	572866	0 %	75 %	0 %	25 %	298502141
10059	NC_014251	AAT	2	6	572894	572899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502141
10060	NC_014251	TTTA	2	8	572911	572918	25 %	75 %	0 %	0 %	298502141
10061	NC_014251	GGT	2	6	573026	573031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502141
10062	NC_014251	GTG	2	6	573057	573062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502141
10063	NC_014251	TAGC	2	8	573183	573190	25 %	25 %	25 %	25 %	298502141
10064	NC_014251	TGG	2	6	573280	573285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502141
10065	NC_014251	CCA	2	6	573391	573396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298502141
10066	NC_014251	CT	3	6	573405	573410	0 %	50 %	0 %	50 %	298502141
10067	NC_014251	ATT	2	6	573422	573427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502141
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10069	NC_014251	ATG	2	6	573452	573457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502141
10070	NC_014251	TGG	2	6	573481	573486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502141
10071	NC_014251	GGA	2	6	573533	573538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298502141
10072	NC_014251	CTT	3	9	573580	573588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502141
10073	NC_014251	A	7	7	573954	573960	100 %	0 %	0 %	0 %	298502142
10074	NC_014251	AAC	2	6	574261	574266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502143
10075	NC_014251	TAA	2	6	574269	574274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502143
10076	NC_014251	TAA	2	6	574278	574283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502143
10077	NC_014251	GAT	2	6	574288	574293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502143
10078	NC_014251	GGT	2	6	574312	574317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502143
10079	NC_014251	TTAA	2	8	574351	574358	50 %	50 %	0 %	0 %	298502143
10080	NC_014251	CAG	2	6	574505	574510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502143
10081	NC_014251	CGC	2	6	574585	574590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298502143
10082	NC_014251	CAG	2	6	574637	574642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502143
10083	NC_014251	CTG	2	6	574685	574690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502143
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10085	NC_014251	GAA	2	6	574765	574770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502143
10086	NC_014251	AAG	2	6	574799	574804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502143
10087	NC_014251	CTT	2	6	574821	574826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502143
10088	NC_014251	TGA	2	6	574827	574832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502143
10089	NC_014251	TGG	2	6	574863	574868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298502143
10090	NC_014251	CT	4	8	574910	574917	0 %	50 %	0 %	50 %	298502143
10091	NC_014251	CAA	2	6	574943	574948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502143
10092	NC_014251	GAA	2	6	574977	574982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502143
10093	NC_014251	TGC	2	6	574983	574988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502143
10094	NC_014251	TCG	2	6	574995	575000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502143
10095	NC_014251	CAG	2	6	575030	575035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502143
10096	NC_014251	TTC	2	6	575051	575056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502143
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10101	NC_014251	GCT	2	6	575197	575202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502143
10102	NC_014251	GGC	2	6	575208	575213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298502143
10103	NC_014251	CAAG	2	8	575271	575278	50 %	0 %	25 %	25 %	298502143
10104	NC_014251	AGA	2	6	575295	575300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502143
10105	NC_014251	AGC	2	6	575307	575312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502143
10106	NC_014251	GAAAA	2	10	575344	575353	80 %	0 %	20 %	0 %	298502143
10107	NC_014251	CA	3	6	575362	575367	50 %	0 %	0 %	50 %	298502143
10108	NC_014251	CGT	2	6	575548	575553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502143
10109	NC_014251	TGA	2	6	575568	575573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502143
10110	NC_014251	ACA	2	6	575740	575745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502143
10111	NC_014251	ATG	2	6	575762	575767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502143
10112	NC_014251	TCG	2	6	575796	575801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298502143
10113	NC_014251	TTA	2	6	575855	575860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298502143
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10118	NC_014251	TTC	2	6	576028	576033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298502143
10119	NC_014251	CTC	2	6	576043	576048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298502143
10120	NC_014251	AAGA	2	8	576148	576155	75 %	0 %	25 %	0 %	298502143
10121	NC_014251	AGTC	2	8	576168	576175	25 %	25 %	25 %	25 %	298502143
10122	NC_014251	AGA	2	6	576198	576203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298502143
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10211	NC_014251	TGGG	2	8	582519	582526	0 %	25 %	75 %	0 %	298502148
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10223	NC_014251	CT	3	6	583063	583068	0 %	50 %	0 %	50 %	298502149
10224	NC_014251	CAGG	2	8	583082	583089	25 %	0 %	50 %	25 %	298502149
10225	NC_014251	GAAGA	2	10	583146	583155	60 %	0 %	40 %	0 %	298502149
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10228	NC_014251	A	7	7	583267	583273	100 %	0 %	0 %	0 %	298502149
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10230	NC_014251	ATG	2	6	583411	583416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298502149
10231	NC_014251	AAT	2	6	583425	583430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298502149
10232	NC_014251	A	7	7	583533	583539	100 %	0 %	0 %	0 %	298502149
10233	NC_014251	T	6	6	583550	583555	0 %	100 %	0 %	0 %	298502149
10234	NC_014251	CAG	2	6	583604	583609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298502149
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10238	NC_014251	CAC	2	6	583882	583887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298502150
10239	NC_014251	GCAG	2	8	583948	583955	25 %	0 %	50 %	25 %	298502150
10240	NC_014251	AAC	2	6	584121	584126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502150
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10242	NC_014251	ATC	2	6	584180	584185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298502150
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10487	NC_014251	AAC	2	6	597090	597095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298502163
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