MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 37029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_014220	GTA	2	6	999229	999234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297617152
15502	NC_014220	GTT	2	6	999328	999333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297617153
15503	NC_014220	GAG	2	6	999409	999414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297617153
15504	NC_014220	CCGGTA	2	12	999428	999439	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297617153
15505	NC_014220	TCG	2	6	999482	999487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297617153
15506	NC_014220	CTGG	2	8	999495	999502	0 %	25 %	50 %	25 %	297617153
15507	NC_014220	TGT	2	6	999599	999604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297617153
15508	NC_014220	G	7	7	999612	999618	0 %	0 %	100 %	0 %	297617153
15509	NC_014220	AGA	2	6	999690	999695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297617153
15510	NC_014220	AAAG	2	8	999702	999709	75 %	0 %	25 %	0 %	297617153
15511	NC_014220	GAAA	2	8	999715	999722	75 %	0 %	25 %	0 %	297617153
15512	NC_014220	TCT	2	6	999750	999755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297617153
15513	NC_014220	GAACGG	2	12	999808	999819	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	297617153
15514	NC_014220	AGG	2	6	999839	999844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297617153
15515	NC_014220	CCGG	2	8	999872	999879	0 %	0 %	50 %	50 %	297617153
15516	NC_014220	GAC	2	6	999910	999915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297617153
15517	NC_014220	CTT	2	6	999964	999969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297617154
15518	NC_014220	CGG	2	6	1000045	1000050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297617154
15519	NC_014220	GTG	2	6	1000166	1000171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297617154
15520	NC_014220	CAG	2	6	1000202	1000207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297617154
15521	NC_014220	GCC	2	6	1000210	1000215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297617154
15522	NC_014220	AAG	2	6	1000278	1000283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297617154
15523	NC_014220	CAAA	2	8	1000378	1000385	75 %	0 %	0 %	25 %	297617154
15524	NC_014220	GTT	2	6	1000405	1000410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297617154
15525	NC_014220	ATC	2	6	1000523	1000528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297617154
15526	NC_014220	T	6	6	1000537	1000542	0 %	100 %	0 %	0 %	297617154
15527	NC_014220	TGG	2	6	1000554	1000559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297617154
15528	NC_014220	ATG	2	6	1000604	1000609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297617154
15529	NC_014220	GTC	2	6	1000664	1000669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297617154
15530	NC_014220	GAT	2	6	1000692	1000697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297617154
15531	NC_014220	AAG	2	6	1000815	1000820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297617155
15532	NC_014220	GTTG	2	8	1000837	1000844	0 %	50 %	50 %	0 %	297617155
15533	NC_014220	TAA	2	6	1000884	1000889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297617155
15534	NC_014220	TTG	2	6	1000950	1000955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297617155
15535	NC_014220	TGG	2	6	1000959	1000964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297617155
15536	NC_014220	ATA	2	6	1001214	1001219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297617156
15537	NC_014220	T	7	7	1001269	1001275	0 %	100 %	0 %	0 %	297617156
15538	NC_014220	TGTTT	2	10	1001330	1001339	0 %	80 %	20 %	0 %	297617156
15539	NC_014220	TAT	2	6	1001448	1001453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297617156
15540	NC_014220	CAT	2	6	1001490	1001495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297617156
15541	NC_014220	CAG	2	6	1001506	1001511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297617156
15542	NC_014220	ATG	2	6	1001524	1001529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297617156
15543	NC_014220	T	6	6	1001573	1001578	0 %	100 %	0 %	0 %	297617156
15544	NC_014220	G	6	6	1001588	1001593	0 %	0 %	100 %	0 %	297617156
15545	NC_014220	AT	3	6	1001594	1001599	50 %	50 %	0 %	0 %	297617156
15546	NC_014220	AGT	2	6	1001630	1001635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297617156
15547	NC_014220	TAG	2	6	1001647	1001652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297617156
15548	NC_014220	TGG	2	6	1001707	1001712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297617156
15549	NC_014220	G	6	6	1001732	1001737	0 %	0 %	100 %	0 %	297617156
15550	NC_014220	GTT	2	6	1001777	1001782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297617156
15551	NC_014220	T	6	6	1001802	1001807	0 %	100 %	0 %	0 %	297617156
15552	NC_014220	AGG	2	6	1001901	1001906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297617157
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15554	NC_014220	CGG	3	9	1001932	1001940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297617157
15555	NC_014220	AG	3	6	1001943	1001948	50 %	0 %	50 %	0 %	297617157
15556	NC_014220	TGC	2	6	1002020	1002025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297617157
15557	NC_014220	TGG	2	6	1002188	1002193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297617157
15558	NC_014220	GTTT	2	8	1002225	1002232	0 %	75 %	25 %	0 %	297617157
15559	NC_014220	GGT	2	6	1002360	1002365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297617157
15560	NC_014220	CAT	2	6	1002450	1002455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297617157
15561	NC_014220	GTT	2	6	1002481	1002486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297617157
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15567	NC_014220	AGCA	2	8	1002610	1002617	50 %	0 %	25 %	25 %	297617157
15568	NC_014220	AGC	2	6	1002626	1002631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297617157
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15570	NC_014220	TGT	2	6	1002678	1002683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297617157
15571	NC_014220	AACC	2	8	1002687	1002694	50 %	0 %	0 %	50 %	297617157
15572	NC_014220	GAAGCG	2	12	1002724	1002735	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	297617157
15573	NC_014220	TAG	2	6	1002821	1002826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297617157
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15575	NC_014220	TCGG	2	8	1003476	1003483	0 %	25 %	50 %	25 %	297617158
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15577	NC_014220	ATG	3	9	1003500	1003508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297617158
15578	NC_014220	TAC	2	6	1003524	1003529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297617158
15579	NC_014220	ATC	2	6	1003572	1003577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297617158
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15589	NC_014220	GAG	2	6	1004223	1004228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297617158
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15593	NC_014220	AGA	2	6	1004414	1004419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297617158
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15599	NC_014220	ATCAAG	2	12	1004646	1004657	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	297617158
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15601	NC_014220	TGCC	2	8	1004773	1004780	0 %	25 %	25 %	50 %	297617158
15602	NC_014220	TTA	2	6	1004875	1004880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297617158
15603	NC_014220	AGT	2	6	1004957	1004962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297617158
15604	NC_014220	TCT	2	6	1004981	1004986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297617158
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15607	NC_014220	GA	3	6	1005221	1005226	50 %	0 %	50 %	0 %	297617158
15608	NC_014220	CTT	2	6	1005348	1005353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297617158
15609	NC_014220	T	7	7	1005592	1005598	0 %	100 %	0 %	0 %	297617159
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15615	NC_014220	TCA	2	6	1005958	1005963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297617159
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15617	NC_014220	AAG	2	6	1006013	1006018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297617159
15618	NC_014220	AGGC	2	8	1006042	1006049	25 %	0 %	50 %	25 %	297617159
15619	NC_014220	AGT	2	6	1006054	1006059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297617159
15620	NC_014220	GAT	2	6	1006063	1006068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297617159
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15728	NC_014220	GGAA	2	8	1012227	1012234	50 %	0 %	50 %	0 %	297617165
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