MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 37029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_014220	AGA	2	6	839248	839253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616990
13003	NC_014220	TCC	2	6	839305	839310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616990
13004	NC_014220	GGA	2	6	839312	839317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616990
13005	NC_014220	TCTAA	2	10	839339	839348	40 %	40 %	0 %	20 %	297616990
13006	NC_014220	GGTC	2	8	839361	839368	0 %	25 %	50 %	25 %	297616990
13007	NC_014220	GAA	2	6	839369	839374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616990
13008	NC_014220	GGTT	2	8	839395	839402	0 %	50 %	50 %	0 %	297616990
13009	NC_014220	TGC	2	6	839452	839457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616990
13010	NC_014220	TGT	2	6	839472	839477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616990
13011	NC_014220	GAA	2	6	839485	839490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616990
13012	NC_014220	GAG	2	6	839516	839521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616990
13013	NC_014220	TTG	3	9	839522	839530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616990
13014	NC_014220	GCTG	2	8	839535	839542	0 %	25 %	50 %	25 %	297616990
13015	NC_014220	AGG	2	6	839580	839585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616990
13016	NC_014220	GTG	2	6	839593	839598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616991
13017	NC_014220	CAA	2	6	839620	839625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616991
13018	NC_014220	CGG	2	6	839652	839657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616991
13019	NC_014220	CAA	2	6	839664	839669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616991
13020	NC_014220	AGA	2	6	839765	839770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616991
13021	NC_014220	GA	3	6	839780	839785	50 %	0 %	50 %	0 %	297616991
13022	NC_014220	AGGAGC	2	12	839802	839813	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	297616991
13023	NC_014220	A	6	6	839830	839835	100 %	0 %	0 %	0 %	297616991
13024	NC_014220	GCA	2	6	839836	839841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616991
13025	NC_014220	GAA	2	6	839842	839847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616991
13026	NC_014220	CGA	2	6	839853	839858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616991
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13028	NC_014220	GTA	2	6	839986	839991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616991
13029	NC_014220	GCGGG	2	10	840021	840030	0 %	0 %	80 %	20 %	297616991
13030	NC_014220	CGA	2	6	840153	840158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616991
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13032	NC_014220	CAT	2	6	840243	840248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616991
13033	NC_014220	GA	3	6	840293	840298	50 %	0 %	50 %	0 %	297616991
13034	NC_014220	TTA	2	6	840340	840345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616991
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13037	NC_014220	GCG	2	6	840636	840641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616991
13038	NC_014220	GAT	2	6	840965	840970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616992
13039	NC_014220	CGG	2	6	841077	841082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616992
13040	NC_014220	CTG	3	9	841090	841098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616992
13041	NC_014220	AT	3	6	841110	841115	50 %	50 %	0 %	0 %	297616992
13042	NC_014220	TTATT	2	10	841295	841304	20 %	80 %	0 %	0 %	297616992
13043	NC_014220	TGGC	2	8	841341	841348	0 %	25 %	50 %	25 %	297616992
13044	NC_014220	TG	3	6	841360	841365	0 %	50 %	50 %	0 %	297616992
13045	NC_014220	GT	3	6	841425	841430	0 %	50 %	50 %	0 %	297616992
13046	NC_014220	CAA	2	6	841493	841498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616992
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13050	NC_014220	CAG	2	6	841755	841760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616992
13051	NC_014220	ACA	2	6	841801	841806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616992
13052	NC_014220	TCCA	2	8	841823	841830	25 %	25 %	0 %	50 %	297616992
13053	NC_014220	GAG	2	6	841928	841933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616993
13054	NC_014220	TAT	2	6	841950	841955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616993
13055	NC_014220	GCA	2	6	841960	841965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616993
13056	NC_014220	A	6	6	842093	842098	100 %	0 %	0 %	0 %	297616993
13057	NC_014220	GCG	2	6	842249	842254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616993
13058	NC_014220	TGATA	2	10	842354	842363	40 %	40 %	20 %	0 %	297616993
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13060	NC_014220	GAA	2	6	842390	842395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616993
13061	NC_014220	CTCC	2	8	842421	842428	0 %	25 %	0 %	75 %	297616993
13062	NC_014220	AAG	2	6	842491	842496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616993
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13064	NC_014220	CGC	2	6	842565	842570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616993
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13069	NC_014220	GA	3	6	843117	843122	50 %	0 %	50 %	0 %	297616994
13070	NC_014220	AAG	3	9	843191	843199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616994
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13072	NC_014220	ACG	2	6	843257	843262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616994
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13075	NC_014220	GCT	2	6	843475	843480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616994
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13077	NC_014220	TTA	2	6	843602	843607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616995
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13086	NC_014220	TGA	2	6	844361	844366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616997
13087	NC_014220	GA	3	6	844369	844374	50 %	0 %	50 %	0 %	297616997
13088	NC_014220	ACGAAG	2	12	844379	844390	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	297616997
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13090	NC_014220	GA	3	6	844428	844433	50 %	0 %	50 %	0 %	297616997
13091	NC_014220	TCG	2	6	844453	844458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616997
13092	NC_014220	CAG	2	6	844487	844492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616997
13093	NC_014220	AGC	2	6	844502	844507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616997
13094	NC_014220	AG	3	6	844556	844561	50 %	0 %	50 %	0 %	297616997
13095	NC_014220	GA	3	6	844589	844594	50 %	0 %	50 %	0 %	297616997
13096	NC_014220	AGG	2	6	844765	844770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616997
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13098	NC_014220	AG	3	6	844798	844803	50 %	0 %	50 %	0 %	297616998
13099	NC_014220	GA	3	6	844808	844813	50 %	0 %	50 %	0 %	297616998
13100	NC_014220	AGC	2	6	844856	844861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616998
13101	NC_014220	AGAC	2	8	844880	844887	50 %	0 %	25 %	25 %	297616998
13102	NC_014220	ACTT	2	8	844901	844908	25 %	50 %	0 %	25 %	297616998
13103	NC_014220	TTG	2	6	844978	844983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616998
13104	NC_014220	GAA	2	6	845094	845099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616998
13105	NC_014220	TGC	2	6	845158	845163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616998
13106	NC_014220	AGCA	2	8	845181	845188	50 %	0 %	25 %	25 %	297616998
13107	NC_014220	TAC	2	6	845190	845195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616998
13108	NC_014220	AAG	2	6	845274	845279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616998
13109	NC_014220	TGC	2	6	845318	845323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616998
13110	NC_014220	C	6	6	845355	845360	0 %	0 %	0 %	100 %	297616998
13111	NC_014220	GCG	2	6	845388	845393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616998
13112	NC_014220	T	6	6	845445	845450	0 %	100 %	0 %	0 %	297616998
13113	NC_014220	GAA	2	6	845487	845492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616998
13114	NC_014220	TA	3	6	845521	845526	50 %	50 %	0 %	0 %	297616998
13115	NC_014220	CGGG	2	8	845547	845554	0 %	0 %	75 %	25 %	297616998
13116	NC_014220	TTC	2	6	845570	845575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616998
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13118	NC_014220	G	6	6	845659	845664	0 %	0 %	100 %	0 %	297616998
13119	NC_014220	TCAATC	2	12	845710	845721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616998
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13484	NC_014220	GTA	2	6	869141	869146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297617022
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