MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Starkeya novella DSM 506 chromosome

Total Repeats: 122484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014217	GCCGG	2	10	160	169	0 %	0 %	60 %	40 %	298290018
2	NC_014217	CG	3	6	215	220	0 %	0 %	50 %	50 %	298290018
3	NC_014217	GGC	2	6	237	242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290018
4	NC_014217	CGG	2	6	245	250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290018
5	NC_014217	CCG	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290018
6	NC_014217	AGG	2	6	422	427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298290018
7	NC_014217	GCC	2	6	457	462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290019
8	NC_014217	CGG	3	9	474	482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290019
9	NC_014217	GCG	3	9	508	516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290019
10	NC_014217	GC	3	6	533	538	0 %	0 %	50 %	50 %	298290019
11	NC_014217	GCCC	2	8	546	553	0 %	0 %	25 %	75 %	298290019
12	NC_014217	GCC	2	6	556	561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290019
13	NC_014217	CGG	2	6	570	575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290019
14	NC_014217	TGCC	2	8	582	589	0 %	25 %	25 %	50 %	298290019
15	NC_014217	CGT	2	6	607	612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290019
16	NC_014217	GCC	2	6	616	621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290019
17	NC_014217	CGC	2	6	630	635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290019
18	NC_014217	CGC	2	6	712	717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290019
19	NC_014217	GC	3	6	720	725	0 %	0 %	50 %	50 %	298290019
20	NC_014217	CTG	2	6	791	796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290019
21	NC_014217	GGC	2	6	811	816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290019
22	NC_014217	GGA	2	6	817	822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298290019
23	NC_014217	TCG	2	6	873	878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290019
24	NC_014217	CG	3	6	911	916	0 %	0 %	50 %	50 %	298290019
25	NC_014217	CTG	2	6	938	943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290019
26	NC_014217	CGA	2	6	946	951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298290019
27	NC_014217	GCA	2	6	979	984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298290019
28	NC_014217	GGT	2	6	1030	1035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298290019
29	NC_014217	CGC	2	6	1039	1044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290019
30	NC_014217	CGA	2	6	1075	1080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298290019
31	NC_014217	GCTC	2	8	1125	1132	0 %	25 %	25 %	50 %	298290019
32	NC_014217	GAC	2	6	1133	1138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298290019
33	NC_014217	GC	3	6	1144	1149	0 %	0 %	50 %	50 %	298290019
34	NC_014217	ATC	2	6	1154	1159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298290019
35	NC_014217	GCGG	2	8	1174	1181	0 %	0 %	75 %	25 %	298290019
36	NC_014217	GCT	2	6	1282	1287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290019
37	NC_014217	CGG	2	6	1303	1308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290019
38	NC_014217	GAC	2	6	1388	1393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298290019
39	NC_014217	GTG	2	6	1403	1408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298290019
40	NC_014217	GCG	2	6	1450	1455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290019
41	NC_014217	CGG	2	6	1546	1551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290019
42	NC_014217	ACCAC	2	10	1557	1566	40 %	0 %	0 %	60 %	298290019
43	NC_014217	TGC	2	6	1569	1574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290019
44	NC_014217	ACG	2	6	1608	1613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298290019
45	NC_014217	GC	3	6	1621	1626	0 %	0 %	50 %	50 %	298290019
46	NC_014217	CGA	2	6	1633	1638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298290019
47	NC_014217	CCCG	2	8	1696	1703	0 %	0 %	25 %	75 %	298290020
48	NC_014217	GCC	2	6	1708	1713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290020
49	NC_014217	CTGGTG	2	12	1714	1725	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	298290020
50	NC_014217	GCT	2	6	1739	1744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290020
51	NC_014217	CCA	2	6	1760	1765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298290020
52	NC_014217	GCGGCC	2	12	1766	1777	0 %	0 %	50 %	50 %	298290020
53	NC_014217	GCG	2	6	1781	1786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290020
54	NC_014217	GGT	2	6	1833	1838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298290020
55	NC_014217	GCG	2	6	1854	1859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290020
56	NC_014217	TGC	2	6	1909	1914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290020
57	NC_014217	GAA	2	6	1947	1952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298290020
58	NC_014217	GC	3	6	1969	1974	0 %	0 %	50 %	50 %	298290020
59	NC_014217	CGC	3	9	1972	1980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290020
60	NC_014217	TGA	2	6	2008	2013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298290020
61	NC_014217	CGGG	2	8	2033	2040	0 %	0 %	75 %	25 %	298290021
62	NC_014217	GCG	2	6	2053	2058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290021
63	NC_014217	AGG	2	6	2158	2163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298290021
64	NC_014217	GCGCC	2	10	2164	2173	0 %	0 %	40 %	60 %	298290021
65	NC_014217	GCG	2	6	2182	2187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290021
66	NC_014217	GC	3	6	2195	2200	0 %	0 %	50 %	50 %	298290021
67	NC_014217	GGC	2	6	2205	2210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290021
68	NC_014217	CG	3	6	2277	2282	0 %	0 %	50 %	50 %	298290021
69	NC_014217	CGG	2	6	2312	2317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290021
70	NC_014217	ACC	2	6	2329	2334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298290021
71	NC_014217	TCG	2	6	2422	2427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290021
72	NC_014217	CGA	2	6	2435	2440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298290021
73	NC_014217	ACG	2	6	2533	2538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298290021
74	NC_014217	GGCG	2	8	2561	2568	0 %	0 %	75 %	25 %	298290021
75	NC_014217	AACG	2	8	2608	2615	50 %	0 %	25 %	25 %	298290021
76	NC_014217	CTG	5	15	2683	2697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290021
77	NC_014217	CGA	2	6	2837	2842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298290021
78	NC_014217	CTCG	2	8	2864	2871	0 %	25 %	25 %	50 %	298290021
79	NC_014217	CAT	2	6	2972	2977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298290021
80	NC_014217	ATG	2	6	2980	2985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298290021
81	NC_014217	CGA	2	6	2990	2995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298290021
82	NC_014217	GGT	2	6	2996	3001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298290021
83	NC_014217	GCG	2	6	3025	3030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290021
84	NC_014217	GC	3	6	3044	3049	0 %	0 %	50 %	50 %	298290021
85	NC_014217	CGG	2	6	3052	3057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290021
86	NC_014217	CGGC	2	8	3097	3104	0 %	0 %	50 %	50 %	298290021
87	NC_014217	GAT	2	6	3110	3115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298290021
88	NC_014217	CTT	2	6	3146	3151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298290021
89	NC_014217	CGGCT	2	10	3180	3189	0 %	20 %	40 %	40 %	298290021
90	NC_014217	GGC	2	6	3255	3260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290021
91	NC_014217	CCGGCA	2	12	3280	3291	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	298290021
92	NC_014217	GCG	2	6	3303	3308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290021
93	NC_014217	CCG	3	9	3368	3376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290021
94	NC_014217	CCG	2	6	3391	3396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290021
95	NC_014217	GC	3	6	3413	3418	0 %	0 %	50 %	50 %	298290021
96	NC_014217	GGAA	2	8	3443	3450	50 %	0 %	50 %	0 %	298290021
97	NC_014217	CGG	2	6	3476	3481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290021
98	NC_014217	CG	3	6	3510	3515	0 %	0 %	50 %	50 %	298290022
99	NC_014217	CTT	2	6	3553	3558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298290022
100	NC_014217	CGG	2	6	3628	3633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290022
101	NC_014217	CGC	2	6	3673	3678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290022
102	NC_014217	GCC	2	6	3712	3717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290022
103	NC_014217	CAG	2	6	3748	3753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298290022
104	NC_014217	GTG	2	6	3782	3787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298290022
105	NC_014217	CGC	2	6	3798	3803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290022
106	NC_014217	TGA	2	6	3818	3823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298290022
107	NC_014217	GCG	2	6	3840	3845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290023
108	NC_014217	ACG	2	6	3857	3862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298290023
109	NC_014217	GGC	2	6	3895	3900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290023
110	NC_014217	AAC	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298290023
111	NC_014217	GCC	2	6	3984	3989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290023
112	NC_014217	GCA	2	6	3995	4000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298290023
113	NC_014217	CG	3	6	4071	4076	0 %	0 %	50 %	50 %	298290023
114	NC_014217	CGC	2	6	4117	4122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290023
115	NC_014217	AAT	2	6	4204	4209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298290023
116	NC_014217	TCT	2	6	4241	4246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298290023
117	NC_014217	CTTG	2	8	4251	4258	0 %	50 %	25 %	25 %	298290023
118	NC_014217	GCT	2	6	4304	4309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290023
119	NC_014217	GCC	3	9	4310	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290023
120	NC_014217	CCG	2	6	4334	4339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290023
121	NC_014217	ACC	2	6	4427	4432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298290023
122	NC_014217	GAA	2	6	4435	4440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298290023
123	NC_014217	TTG	2	6	4546	4551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298290024
124	NC_014217	CGT	2	6	4616	4621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290024
125	NC_014217	GC	3	6	4625	4630	0 %	0 %	50 %	50 %	298290024
126	NC_014217	CGC	2	6	4634	4639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290024
127	NC_014217	GGTC	2	8	4657	4664	0 %	25 %	50 %	25 %	298290024
128	NC_014217	CTG	2	6	4668	4673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290024
129	NC_014217	GGA	2	6	4679	4684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298290024
130	NC_014217	GCA	2	6	4687	4692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298290024
131	NC_014217	CAT	2	6	4700	4705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298290024
132	NC_014217	GCG	2	6	4786	4791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290024
133	NC_014217	GCC	2	6	4811	4816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290024
134	NC_014217	GAG	2	6	4830	4835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298290024
135	NC_014217	GGA	2	6	4850	4855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298290024
136	NC_014217	GCG	2	6	4860	4865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290024
137	NC_014217	GC	3	6	4935	4940	0 %	0 %	50 %	50 %	298290024
138	NC_014217	TGG	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298290024
139	NC_014217	GCC	2	6	5036	5041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290024
140	NC_014217	GCC	2	6	5066	5071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290024
141	NC_014217	GAA	2	6	5072	5077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298290024
142	NC_014217	GGC	2	6	5183	5188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290024
143	NC_014217	GCC	2	6	5199	5204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290024
144	NC_014217	GC	3	6	5208	5213	0 %	0 %	50 %	50 %	298290024
145	NC_014217	GGC	2	6	5222	5227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290024
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148	NC_014217	CG	4	8	5397	5404	0 %	0 %	50 %	50 %	298290025
149	NC_014217	GC	3	6	5420	5425	0 %	0 %	50 %	50 %	298290025
150	NC_014217	CAC	2	6	5470	5475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298290025
151	NC_014217	CTG	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290025
152	NC_014217	CGGC	2	8	5510	5517	0 %	0 %	50 %	50 %	298290025
153	NC_014217	C	7	7	5520	5526	0 %	0 %	0 %	100 %	298290025
154	NC_014217	TGA	2	6	5536	5541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298290025
155	NC_014217	G	6	6	5542	5547	0 %	0 %	100 %	0 %	298290025
156	NC_014217	ATG	2	6	5559	5564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298290025
157	NC_014217	TCA	2	6	5573	5578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298290025
158	NC_014217	TCA	2	6	5595	5600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298290025
159	NC_014217	TGA	2	6	5604	5609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298290025
160	NC_014217	C	6	6	5646	5651	0 %	0 %	0 %	100 %	298290025
161	NC_014217	C	6	6	5655	5660	0 %	0 %	0 %	100 %	298290025
162	NC_014217	GAAGGG	2	12	5696	5707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298290025
163	NC_014217	GC	3	6	5709	5714	0 %	0 %	50 %	50 %	298290025
164	NC_014217	CCGAC	2	10	5754	5763	20 %	0 %	20 %	60 %	298290025
165	NC_014217	AAGGCG	2	12	5771	5782	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	298290025
166	NC_014217	CTG	2	6	5834	5839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290025
167	NC_014217	CGC	2	6	5944	5949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290025
168	NC_014217	GAG	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298290025
169	NC_014217	TCG	2	6	6051	6056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290025
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171	NC_014217	CGGCG	2	10	6097	6106	0 %	0 %	60 %	40 %	298290025
172	NC_014217	GGC	2	6	6161	6166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290025
173	NC_014217	GCCC	2	8	6234	6241	0 %	0 %	25 %	75 %	298290025
174	NC_014217	CGG	2	6	6255	6260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290025
175	NC_014217	GCG	2	6	6285	6290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290025
176	NC_014217	GAG	2	6	6294	6299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298290025
177	NC_014217	GGTC	2	8	6315	6322	0 %	25 %	50 %	25 %	298290026
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181	NC_014217	CAT	2	6	6483	6488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298290026
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195	NC_014217	CGGCG	2	10	7326	7335	0 %	0 %	60 %	40 %	298290027
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198	NC_014217	GC	3	6	7596	7601	0 %	0 %	50 %	50 %	298290028
199	NC_014217	CGA	2	6	7622	7627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298290028
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256	NC_014217	GAT	2	6	9586	9591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298290029
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264	NC_014217	TGC	2	6	9892	9897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290030
265	NC_014217	GAG	2	6	9915	9920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298290030
266	NC_014217	GAA	3	9	9923	9931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298290030
267	NC_014217	TGC	2	6	9958	9963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290030
268	NC_014217	ATGG	2	8	9976	9983	25 %	25 %	50 %	0 %	298290030
269	NC_014217	TGC	2	6	10054	10059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290030
270	NC_014217	CGG	2	6	10097	10102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290030
271	NC_014217	CGA	2	6	10145	10150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298290030
272	NC_014217	GGTC	2	8	10153	10160	0 %	25 %	50 %	25 %	298290030
273	NC_014217	CGC	2	6	10301	10306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290030
274	NC_014217	CGC	2	6	10313	10318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290030
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279	NC_014217	GAG	2	6	10539	10544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298290030
280	NC_014217	TGA	2	6	10579	10584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298290030
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284	NC_014217	TTC	2	6	10779	10784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298290030
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286	NC_014217	GCG	2	6	10870	10875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290030
287	NC_014217	CGG	2	6	10907	10912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290030
288	NC_014217	CGA	2	6	10922	10927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298290030
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294	NC_014217	CCG	3	9	11102	11110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290031
295	NC_014217	GC	3	6	11115	11120	0 %	0 %	50 %	50 %	298290031
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298	NC_014217	AAG	2	6	11200	11205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298290031
299	NC_014217	CGG	2	6	11265	11270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290031
300	NC_014217	TGC	2	6	11303	11308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298290031
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302	NC_014217	CGG	2	6	11357	11362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290031
303	NC_014217	ATC	2	6	11368	11373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298290031
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381	NC_014217	CCGAG	2	10	13815	13824	20 %	0 %	40 %	40 %	298290034
382	NC_014217	GC	3	6	13867	13872	0 %	0 %	50 %	50 %	298290034
383	NC_014217	GCC	2	6	13917	13922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298290035
384	NC_014217	CG	3	6	13954	13959	0 %	0 %	50 %	50 %	298290035
385	NC_014217	GAT	2	6	13961	13966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298290035
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387	NC_014217	GAC	2	6	14003	14008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298290035
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389	NC_014217	GCG	3	9	14044	14052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298290035
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391	NC_014217	CG	3	6	14122	14127	0 %	0 %	50 %	50 %	298290035
392	NC_014217	CGAC	2	8	14134	14141	25 %	0 %	25 %	50 %	298290035
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395	NC_014217	CCGA	2	8	14196	14203	25 %	0 %	25 %	50 %	298290035
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