MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylothermus hellenicus DSM 12710 chromosome

Total Repeats: 33117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_014205	ACTG	2	8	23753	23760	25 %	25 %	25 %	25 %	297526053
503	NC_014205	CTA	2	6	23777	23782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526053
504	NC_014205	ACT	2	6	23803	23808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526053
505	NC_014205	TCAT	2	8	23837	23844	25 %	50 %	0 %	25 %	297526053
506	NC_014205	ATT	2	6	23929	23934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526053
507	NC_014205	AT	3	6	23936	23941	50 %	50 %	0 %	0 %	297526053
508	NC_014205	ATT	2	6	24017	24022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526053
509	NC_014205	CA	3	6	24056	24061	50 %	0 %	0 %	50 %	297526053
510	NC_014205	GA	3	6	24081	24086	50 %	0 %	50 %	0 %	297526053
511	NC_014205	TA	3	6	24141	24146	50 %	50 %	0 %	0 %	297526053
512	NC_014205	ATA	2	6	24161	24166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526053
513	NC_014205	AT	3	6	24303	24308	50 %	50 %	0 %	0 %	297526054
514	NC_014205	TTG	2	6	24325	24330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526054
515	NC_014205	CTT	2	6	24350	24355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526054
516	NC_014205	ATT	2	6	24378	24383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526054
517	NC_014205	TCT	2	6	24384	24389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526054
518	NC_014205	TTG	2	6	24397	24402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297526054
519	NC_014205	CTT	2	6	24418	24423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526054
520	NC_014205	CTA	2	6	24433	24438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526054
521	NC_014205	TTTCC	2	10	24447	24456	0 %	60 %	0 %	40 %	297526054
522	NC_014205	TAT	2	6	24521	24526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526054
523	NC_014205	ATA	2	6	24634	24639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526054
524	NC_014205	CT	4	8	24682	24689	0 %	50 %	0 %	50 %	297526054
525	NC_014205	TCT	2	6	24702	24707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526054
526	NC_014205	ACC	2	6	24708	24713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297526054
527	NC_014205	AT	3	6	24714	24719	50 %	50 %	0 %	0 %	297526054
528	NC_014205	T	6	6	24745	24750	0 %	100 %	0 %	0 %	297526055
529	NC_014205	CTC	2	6	24766	24771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526055
530	NC_014205	TCA	2	6	24781	24786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526055
531	NC_014205	GAG	2	6	24797	24802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297526055
532	NC_014205	CTG	2	6	24806	24811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297526055
533	NC_014205	TAA	2	6	24870	24875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526055
534	NC_014205	T	7	7	24896	24902	0 %	100 %	0 %	0 %	297526055
535	NC_014205	ATA	2	6	24965	24970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526055
536	NC_014205	TGA	2	6	24997	25002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526055
537	NC_014205	TC	3	6	25031	25036	0 %	50 %	0 %	50 %	297526055
538	NC_014205	TCA	2	6	25075	25080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526055
539	NC_014205	CTT	2	6	25484	25489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526056
540	NC_014205	TTC	2	6	25554	25559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526056
541	NC_014205	AGT	2	6	25577	25582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526056
542	NC_014205	TTAT	2	8	25585	25592	25 %	75 %	0 %	0 %	297526056
543	NC_014205	GTTT	2	8	25625	25632	0 %	75 %	25 %	0 %	297526056
544	NC_014205	TCT	2	6	25633	25638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526056
545	NC_014205	CTT	2	6	25676	25681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526056
546	NC_014205	TTA	2	6	25703	25708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526056
547	NC_014205	ATA	2	6	25732	25737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526056
548	NC_014205	TCT	2	6	25813	25818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526056
549	NC_014205	TG	3	6	25844	25849	0 %	50 %	50 %	0 %	297526056
550	NC_014205	TC	3	6	25860	25865	0 %	50 %	0 %	50 %	297526056
551	NC_014205	ACT	2	6	25869	25874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526056
552	NC_014205	GA	3	6	25948	25953	50 %	0 %	50 %	0 %	297526056
553	NC_014205	ACT	2	6	26001	26006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526056
554	NC_014205	TCC	2	6	26026	26031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526056
555	NC_014205	AGCT	2	8	26118	26125	25 %	25 %	25 %	25 %	297526056
556	NC_014205	GTG	2	6	26141	26146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297526056
557	NC_014205	TTA	2	6	26159	26164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526056
558	NC_014205	TG	3	6	26165	26170	0 %	50 %	50 %	0 %	297526056
559	NC_014205	AGCTTA	2	12	26176	26187	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	297526056
560	NC_014205	AAT	2	6	26209	26214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526056
561	NC_014205	TTC	2	6	26378	26383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526056
562	NC_014205	ATT	2	6	26434	26439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526056
563	NC_014205	CTT	3	9	26448	26456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526056
564	NC_014205	ATT	2	6	26587	26592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526056
565	NC_014205	TCTCCT	2	12	26603	26614	0 %	50 %	0 %	50 %	297526056
566	NC_014205	CCTTA	2	10	26634	26643	20 %	40 %	0 %	40 %	297526056
567	NC_014205	TCATC	2	10	26657	26666	20 %	40 %	0 %	40 %	297526056
568	NC_014205	CTT	2	6	26717	26722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526056
569	NC_014205	TTTCA	2	10	26769	26778	20 %	60 %	0 %	20 %	297526056
570	NC_014205	GCT	2	6	26951	26956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297526057
571	NC_014205	AAT	2	6	27057	27062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297526057
572	NC_014205	CA	3	6	27101	27106	50 %	0 %	0 %	50 %	297526057
573	NC_014205	ATC	2	6	27118	27123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526057
574	NC_014205	CTT	2	6	27198	27203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297526057
575	NC_014205	CCTA	2	8	27226	27233	25 %	25 %	0 %	50 %	297526057
576	NC_014205	TC	3	6	27239	27244	0 %	50 %	0 %	50 %	297526057
577	NC_014205	TCC	2	6	27252	27257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526057
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580	NC_014205	TCC	2	6	27350	27355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526057
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582	NC_014205	CTA	2	6	27441	27446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526057
583	NC_014205	CCT	2	6	27462	27467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297526057
584	NC_014205	TCA	2	6	27512	27517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526057
585	NC_014205	TAC	2	6	27535	27540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526057
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587	NC_014205	TTA	2	6	27722	27727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526057
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591	NC_014205	TC	3	6	27907	27912	0 %	50 %	0 %	50 %	297526057
592	NC_014205	GAA	2	6	27929	27934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297526057
593	NC_014205	TAT	2	6	28069	28074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526057
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595	NC_014205	CTCC	2	8	28104	28111	0 %	25 %	0 %	75 %	297526057
596	NC_014205	CATG	2	8	28117	28124	25 %	25 %	25 %	25 %	297526057
597	NC_014205	AGT	2	6	28154	28159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526057
598	NC_014205	ATG	2	6	28171	28176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526057
599	NC_014205	CT	3	6	28190	28195	0 %	50 %	0 %	50 %	297526057
600	NC_014205	CAT	2	6	28287	28292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526057
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602	NC_014205	ACT	2	6	28372	28377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526058
603	NC_014205	CT	3	6	28422	28427	0 %	50 %	0 %	50 %	297526058
604	NC_014205	ATC	2	6	28434	28439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526058
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608	NC_014205	TC	3	6	28625	28630	0 %	50 %	0 %	50 %	297526058
609	NC_014205	CTAC	2	8	28645	28652	25 %	25 %	0 %	50 %	297526058
610	NC_014205	AGC	2	6	28725	28730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297526058
611	NC_014205	GTA	2	6	28738	28743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526058
612	NC_014205	CTG	2	6	28851	28856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297526058
613	NC_014205	GAC	2	6	28907	28912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297526058
614	NC_014205	CT	4	8	28990	28997	0 %	50 %	0 %	50 %	297526058
615	NC_014205	ATCA	2	8	29094	29101	50 %	25 %	0 %	25 %	297526058
616	NC_014205	CAC	2	6	29105	29110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297526058
617	NC_014205	CTA	2	6	29261	29266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526058
618	NC_014205	TCA	2	6	29281	29286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297526058
619	NC_014205	A	6	6	29290	29295	100 %	0 %	0 %	0 %	297526058
620	NC_014205	TA	3	6	29492	29497	50 %	50 %	0 %	0 %	297526059
621	NC_014205	CAA	2	6	29536	29541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297526059
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623	NC_014205	GGA	2	6	29621	29626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297526059
624	NC_014205	TAG	2	6	29688	29693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297526059
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629	NC_014205	TAT	2	6	29774	29779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297526059
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