MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 chromosome

Total Repeats: 79613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014032	GCC	2	6	158492	158497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505942
3502	NC_014032	GTG	2	6	158507	158512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505942
3503	NC_014032	GAA	2	6	158528	158533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294505942
3504	NC_014032	CGA	2	6	158554	158559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505942
3505	NC_014032	GTGC	2	8	158591	158598	0 %	25 %	50 %	25 %	294505942
3506	NC_014032	CAC	2	6	158624	158629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505942
3507	NC_014032	CGG	2	6	158653	158658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505942
3508	NC_014032	CGC	2	6	158663	158668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505942
3509	NC_014032	GGC	2	6	158711	158716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505942
3510	NC_014032	GCC	2	6	158732	158737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505942
3511	NC_014032	TCG	2	6	158820	158825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505942
3512	NC_014032	CAG	2	6	158858	158863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505942
3513	NC_014032	TCTGCT	2	12	158943	158954	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	294505942
3514	NC_014032	CTC	2	6	159167	159172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505943
3515	NC_014032	TGGC	2	8	159207	159214	0 %	25 %	50 %	25 %	294505943
3516	NC_014032	GAG	2	6	159312	159317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505943
3517	NC_014032	TCG	2	6	159321	159326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505943
3518	NC_014032	ATC	2	6	159327	159332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505943
3519	NC_014032	GAG	2	6	159348	159353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505943
3520	NC_014032	ACGCG	2	10	159390	159399	20 %	0 %	40 %	40 %	294505943
3521	NC_014032	CGATT	2	10	159884	159893	20 %	40 %	20 %	20 %	294505944
3522	NC_014032	GCC	2	6	159919	159924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505944
3523	NC_014032	CCG	3	9	159931	159939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505944
3524	NC_014032	TGG	2	6	159946	159951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505944
3525	NC_014032	TG	3	6	159961	159966	0 %	50 %	50 %	0 %	294505944
3526	NC_014032	CGG	2	6	160034	160039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505944
3527	NC_014032	CCG	2	6	160078	160083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505944
3528	NC_014032	GCC	2	6	160115	160120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505944
3529	NC_014032	GAC	2	6	160158	160163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505944
3530	NC_014032	G	6	6	160214	160219	0 %	0 %	100 %	0 %	294505944
3531	NC_014032	GCA	2	6	160241	160246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505944
3532	NC_014032	GTC	2	6	160284	160289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505944
3533	NC_014032	CGG	2	6	160306	160311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505944
3534	NC_014032	CTC	2	6	160416	160421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505944
3535	NC_014032	ACA	2	6	160432	160437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294505944
3536	NC_014032	GC	3	6	160438	160443	0 %	0 %	50 %	50 %	294505944
3537	NC_014032	ACG	2	6	160467	160472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505944
3538	NC_014032	CGGACC	2	12	160522	160533	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	294505944
3539	NC_014032	CGG	2	6	160603	160608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505944
3540	NC_014032	GCA	2	6	160622	160627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505944
3541	NC_014032	TGAT	2	8	160633	160640	25 %	50 %	25 %	0 %	294505944
3542	NC_014032	CCG	2	6	160663	160668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505944
3543	NC_014032	CGC	2	6	160687	160692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505944
3544	NC_014032	CGA	2	6	160694	160699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505944
3545	NC_014032	TCGGTG	2	12	160758	160769	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	294505944
3546	NC_014032	ACGA	2	8	160776	160783	50 %	0 %	25 %	25 %	294505944
3547	NC_014032	C	6	6	160784	160789	0 %	0 %	0 %	100 %	294505944
3548	NC_014032	GCC	3	9	160794	160802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505944
3549	NC_014032	GCA	2	6	160817	160822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505944
3550	NC_014032	TGC	2	6	160841	160846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505944
3551	NC_014032	CGG	2	6	160900	160905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505944
3552	NC_014032	GC	3	6	160954	160959	0 %	0 %	50 %	50 %	294505944
3553	NC_014032	ACCA	2	8	161082	161089	50 %	0 %	0 %	50 %	294505944
3554	NC_014032	GT	3	6	161095	161100	0 %	50 %	50 %	0 %	294505944
3555	NC_014032	GC	3	6	161125	161130	0 %	0 %	50 %	50 %	294505944
3556	NC_014032	TACG	2	8	161156	161163	25 %	25 %	25 %	25 %	294505944
3557	NC_014032	GGT	2	6	161243	161248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505944
3558	NC_014032	CCGACA	2	12	161323	161334	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	294505944
3559	NC_014032	CGA	2	6	161354	161359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505944
3560	NC_014032	CCCTGG	2	12	161413	161424	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	294505944
3561	NC_014032	ACG	2	6	161425	161430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505944
3562	NC_014032	GGA	2	6	161462	161467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505944
3563	NC_014032	CGT	2	6	161491	161496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505944
3564	NC_014032	CGGG	2	8	161545	161552	0 %	0 %	75 %	25 %	294505944
3565	NC_014032	CGC	2	6	161648	161653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505944
3566	NC_014032	TCG	2	6	161665	161670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505944
3567	NC_014032	CGTC	2	8	161734	161741	0 %	25 %	25 %	50 %	294505944
3568	NC_014032	ACGCTG	2	12	161829	161840	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294505944
3569	NC_014032	G	7	7	161840	161846	0 %	0 %	100 %	0 %	294505944
3570	NC_014032	GCA	2	6	161857	161862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505944
3571	NC_014032	CCTC	2	8	161914	161921	0 %	25 %	0 %	75 %	294505944
3572	NC_014032	CGA	3	9	161930	161938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505944
3573	NC_014032	CTC	2	6	162013	162018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505944
3574	NC_014032	C	6	6	162087	162092	0 %	0 %	0 %	100 %	294505944
3575	NC_014032	ACG	2	6	162100	162105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505944
3576	NC_014032	GGC	2	6	162150	162155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505944
3577	NC_014032	CGTCCG	2	12	162170	162181	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	294505944
3578	NC_014032	GC	3	6	162313	162318	0 %	0 %	50 %	50 %	294505944
3579	NC_014032	GGCC	2	8	162334	162341	0 %	0 %	50 %	50 %	294505944
3580	NC_014032	AC	3	6	162369	162374	50 %	0 %	0 %	50 %	294505944
3581	NC_014032	GAG	2	6	162404	162409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505944
3582	NC_014032	ACG	2	6	162451	162456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505944
3583	NC_014032	CCG	2	6	162508	162513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505944
3584	NC_014032	AGA	2	6	162553	162558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294505944
3585	NC_014032	GTT	2	6	163577	163582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294505945
3586	NC_014032	GACC	2	8	163604	163611	25 %	0 %	25 %	50 %	294505945
3587	NC_014032	ACC	2	6	163647	163652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505945
3588	NC_014032	TCGG	2	8	163697	163704	0 %	25 %	50 %	25 %	294505945
3589	NC_014032	GCAGT	2	10	163768	163777	20 %	20 %	40 %	20 %	294505945
3590	NC_014032	CCT	2	6	163836	163841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505946
3591	NC_014032	GCC	3	9	163855	163863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505946
3592	NC_014032	TGC	2	6	163919	163924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505946
3593	NC_014032	ACGG	2	8	164014	164021	25 %	0 %	50 %	25 %	294505946
3594	NC_014032	CA	3	6	164061	164066	50 %	0 %	0 %	50 %	294505946
3595	NC_014032	CGT	2	6	164170	164175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505947
3596	NC_014032	CAG	2	6	164180	164185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505947
3597	NC_014032	C	6	6	164196	164201	0 %	0 %	0 %	100 %	294505947
3598	NC_014032	ATG	2	6	164202	164207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294505947
3599	NC_014032	GAC	2	6	164222	164227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505947
3600	NC_014032	CGCGCC	2	12	164285	164296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505947
3601	NC_014032	GAG	2	6	164388	164393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505947
3602	NC_014032	TGCG	2	8	164409	164416	0 %	25 %	50 %	25 %	294505947
3603	NC_014032	GC	3	6	164506	164511	0 %	0 %	50 %	50 %	294505947
3604	NC_014032	GCC	2	6	164615	164620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505947
3605	NC_014032	CGA	2	6	164656	164661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505947
3606	NC_014032	TCG	2	6	164688	164693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505947
3607	NC_014032	CTT	2	6	164741	164746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505947
3608	NC_014032	CGG	2	6	164778	164783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505947
3609	NC_014032	CGC	2	6	164861	164866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505947
3610	NC_014032	ACG	2	6	164962	164967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505947
3611	NC_014032	TGA	2	6	164992	164997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294505947
3612	NC_014032	CGGAT	2	10	165006	165015	20 %	20 %	40 %	20 %	294505947
3613	NC_014032	TCG	2	6	165054	165059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505947
3614	NC_014032	GC	3	6	165064	165069	0 %	0 %	50 %	50 %	294505947
3615	NC_014032	CGTCC	2	10	165098	165107	0 %	20 %	20 %	60 %	294505947
3616	NC_014032	GACCG	2	10	165153	165162	20 %	0 %	40 %	40 %	294505947
3617	NC_014032	GACG	2	8	165240	165247	25 %	0 %	50 %	25 %	294505947
3618	NC_014032	GGGC	2	8	165261	165268	0 %	0 %	75 %	25 %	294505947
3619	NC_014032	TCG	2	6	165297	165302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505947
3620	NC_014032	GC	3	6	165313	165318	0 %	0 %	50 %	50 %	294505947
3621	NC_014032	GAG	2	6	165320	165325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505947
3622	NC_014032	CGG	2	6	165379	165384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505947
3623	NC_014032	CGTCT	2	10	165836	165845	0 %	40 %	20 %	40 %	294505948
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3745	NC_014032	ATC	2	6	173492	173497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505952
3746	NC_014032	GTG	2	6	173498	173503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505952
3747	NC_014032	CG	3	6	173525	173530	0 %	0 %	50 %	50 %	294505952
3748	NC_014032	GGGAGG	2	12	173538	173549	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	294505952
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3755	NC_014032	ATTGA	2	10	176374	176383	40 %	40 %	20 %	0 %	294505954
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3757	NC_014032	TCT	2	6	176416	176421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505954
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3869	NC_014032	CGGG	2	8	181497	181504	0 %	0 %	75 %	25 %	294505962
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3986	NC_014032	CAGG	2	8	186306	186313	25 %	0 %	50 %	25 %	294505966
3987	NC_014032	GCC	2	6	186330	186335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505966
3988	NC_014032	CGG	2	6	186340	186345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505966
3989	NC_014032	ACGA	2	8	186649	186656	50 %	0 %	25 %	25 %	294505967
3990	NC_014032	GGAT	2	8	186666	186673	25 %	25 %	50 %	0 %	294505967
3991	NC_014032	GTC	2	6	186691	186696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505967
3992	NC_014032	G	6	6	186708	186713	0 %	0 %	100 %	0 %	294505967
3993	NC_014032	TTC	2	6	186716	186721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505967
3994	NC_014032	CGA	2	6	187448	187453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505968
3995	NC_014032	CTG	2	6	187488	187493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505968
3996	NC_014032	ACG	2	6	187531	187536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505968
3997	NC_014032	TGCCGG	2	12	187678	187689	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	294505968
3998	NC_014032	GCT	2	6	187763	187768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505968
3999	NC_014032	GAG	2	6	187797	187802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505968
4000	NC_014032	CGA	2	6	187865	187870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505968

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