MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

< Previous12...3334353637383940414243...142143Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_014012	TG	3	6	1303453	1303458	0 %	50 %	50 %	0 %	294139880
18503	NC_014012	GAA	2	6	1303468	1303473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139880
18504	NC_014012	GAG	2	6	1303514	1303519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139880
18505	NC_014012	GTCGAT	2	12	1303534	1303545	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294139880
18506	NC_014012	GAA	2	6	1303546	1303551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139880
18507	NC_014012	GCA	2	6	1303614	1303619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139880
18508	NC_014012	GCCC	2	8	1303653	1303660	0 %	0 %	25 %	75 %	294139880
18509	NC_014012	CAAGG	2	10	1303675	1303684	40 %	0 %	40 %	20 %	294139880
18510	NC_014012	CT	3	6	1304116	1304121	0 %	50 %	0 %	50 %	294139881
18511	NC_014012	AG	3	6	1304270	1304275	50 %	0 %	50 %	0 %	294139881
18512	NC_014012	CAG	2	6	1304306	1304311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139881
18513	NC_014012	CCAG	2	8	1304332	1304339	25 %	0 %	25 %	50 %	294139881
18514	NC_014012	AGT	3	9	1304417	1304425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139881
18515	NC_014012	AGC	2	6	1304453	1304458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139881
18516	NC_014012	CAGT	2	8	1304505	1304512	25 %	25 %	25 %	25 %	294139881
18517	NC_014012	TCT	2	6	1304526	1304531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139881
18518	NC_014012	CT	3	6	1304533	1304538	0 %	50 %	0 %	50 %	294139881
18519	NC_014012	GAT	2	6	1304580	1304585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139881
18520	NC_014012	TGT	2	6	1304593	1304598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139881
18521	NC_014012	GATC	2	8	1304621	1304628	25 %	25 %	25 %	25 %	294139881
18522	NC_014012	GTG	2	6	1304685	1304690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139881
18523	NC_014012	CAAG	2	8	1304729	1304736	50 %	0 %	25 %	25 %	294139881
18524	NC_014012	GGC	3	9	1304763	1304771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139881
18525	NC_014012	A	6	6	1304825	1304830	100 %	0 %	0 %	0 %	294139882
18526	NC_014012	GCG	2	6	1304850	1304855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139882
18527	NC_014012	AGC	2	6	1304857	1304862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139882
18528	NC_014012	TCCC	2	8	1304882	1304889	0 %	25 %	0 %	75 %	294139882
18529	NC_014012	GGC	2	6	1304902	1304907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139882
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18532	NC_014012	CCG	2	6	1305018	1305023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139882
18533	NC_014012	CCTG	2	8	1305056	1305063	0 %	25 %	25 %	50 %	294139882
18534	NC_014012	AGC	2	6	1305227	1305232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139882
18535	NC_014012	AAG	2	6	1305254	1305259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139882
18536	NC_014012	TGA	2	6	1305262	1305267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139882
18537	NC_014012	AGG	2	6	1305376	1305381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139882
18538	NC_014012	TC	3	6	1305483	1305488	0 %	50 %	0 %	50 %	294139882
18539	NC_014012	T	6	6	1305525	1305530	0 %	100 %	0 %	0 %	294139882
18540	NC_014012	ATT	2	6	1305561	1305566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139882
18541	NC_014012	ATA	2	6	1305594	1305599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139882
18542	NC_014012	CGG	2	6	1305664	1305669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139882
18543	NC_014012	GAT	2	6	1305740	1305745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139882
18544	NC_014012	CTT	2	6	1305850	1305855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139882
18545	NC_014012	CTA	2	6	1306003	1306008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139882
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18547	NC_014012	TGG	2	6	1306037	1306042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139882
18548	NC_014012	ATC	2	6	1306116	1306121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139883
18549	NC_014012	GAT	2	6	1306131	1306136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139883
18550	NC_014012	TCG	2	6	1306238	1306243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139883
18551	NC_014012	TGG	2	6	1306571	1306576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139883
18552	NC_014012	TGT	2	6	1306619	1306624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139883
18553	NC_014012	AAT	2	6	1306677	1306682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139883
18554	NC_014012	CAC	2	6	1306691	1306696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139883
18555	NC_014012	AT	3	6	1306747	1306752	50 %	50 %	0 %	0 %	294139883
18556	NC_014012	CGA	2	6	1306892	1306897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139883
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18558	NC_014012	TTAT	2	8	1306946	1306953	25 %	75 %	0 %	0 %	294139884
18559	NC_014012	GCA	2	6	1307017	1307022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139884
18560	NC_014012	TAT	2	6	1307090	1307095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139884
18561	NC_014012	GCA	2	6	1307173	1307178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139884
18562	NC_014012	CGA	2	6	1307287	1307292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139884
18563	NC_014012	TGGCAG	2	12	1307445	1307456	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294139885
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18587	NC_014012	TG	3	6	1309139	1309144	0 %	50 %	50 %	0 %	294139886
18588	NC_014012	AGGT	2	8	1309217	1309224	25 %	25 %	50 %	0 %	294139886
18589	NC_014012	TCG	2	6	1309226	1309231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139886
18590	NC_014012	GATT	2	8	1309274	1309281	25 %	50 %	25 %	0 %	294139886
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18598	NC_014012	ACT	2	6	1309895	1309900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139887
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18615	NC_014012	CAT	2	6	1311072	1311077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139888
18616	NC_014012	GAAAC	2	10	1311196	1311205	60 %	0 %	20 %	20 %	294139888
18617	NC_014012	CGC	2	6	1311360	1311365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139888
18618	NC_014012	ATCGC	2	10	1311382	1311391	20 %	20 %	20 %	40 %	294139888
18619	NC_014012	CCA	2	6	1311456	1311461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139888
18620	NC_014012	TGA	2	6	1311524	1311529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139888
18621	NC_014012	AGAACA	2	12	1311739	1311750	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294139889
18622	NC_014012	GTA	2	6	1311761	1311766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139889
18623	NC_014012	TGA	2	6	1311808	1311813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139889
18624	NC_014012	TGG	2	6	1311822	1311827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139889
18625	NC_014012	AGC	2	6	1311903	1311908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139889
18626	NC_014012	CGC	2	6	1311925	1311930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139889
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18628	NC_014012	ATG	2	6	1312244	1312249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139889
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18630	NC_014012	TAA	2	6	1312583	1312588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139890
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18634	NC_014012	GA	3	6	1312785	1312790	50 %	0 %	50 %	0 %	294139890
18635	NC_014012	CGG	2	6	1312793	1312798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139890
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18639	NC_014012	GC	3	6	1313038	1313043	0 %	0 %	50 %	50 %	294139890
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18673	NC_014012	TTC	2	6	1315470	1315475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139892
18674	NC_014012	T	6	6	1315494	1315499	0 %	100 %	0 %	0 %	294139892
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18677	NC_014012	A	6	6	1315617	1315622	100 %	0 %	0 %	0 %	294139893
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18682	NC_014012	ATG	2	6	1315986	1315991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139894
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18724	NC_014012	TA	3	6	1318193	1318198	50 %	50 %	0 %	0 %	294139896
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18731	NC_014012	TTC	2	6	1318525	1318530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139896
18732	NC_014012	ATC	2	6	1318577	1318582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139896
18733	NC_014012	CA	3	6	1318604	1318609	50 %	0 %	0 %	50 %	294139896
18734	NC_014012	A	6	6	1318661	1318666	100 %	0 %	0 %	0 %	294139896
18735	NC_014012	ATG	3	9	1318702	1318710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139896
18736	NC_014012	AAC	2	6	1318829	1318834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139896
18737	NC_014012	ATC	2	6	1318873	1318878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139896
18738	NC_014012	TGC	2	6	1319034	1319039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139896
18739	NC_014012	ATC	2	6	1319044	1319049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139896
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18742	NC_014012	ATC	2	6	1319131	1319136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139896
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18745	NC_014012	CCT	2	6	1319607	1319612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139897
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18749	NC_014012	TTC	2	6	1319749	1319754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139897
18750	NC_014012	ATC	2	6	1319785	1319790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139897
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18753	NC_014012	TTA	2	6	1319942	1319947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139897
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18847	NC_014012	TTC	2	6	1325262	1325267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139903
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18963	NC_014012	TCG	2	6	1334011	1334016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139913
18964	NC_014012	GCA	2	6	1334026	1334031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139913
18965	NC_014012	T	6	6	1334118	1334123	0 %	100 %	0 %	0 %	294139913
18966	NC_014012	GCT	2	6	1334138	1334143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139913
18967	NC_014012	TGG	2	6	1334194	1334199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139913
18968	NC_014012	TTA	2	6	1334212	1334217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139913
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18970	NC_014012	A	6	6	1334314	1334319	100 %	0 %	0 %	0 %	294139913
18971	NC_014012	TATC	2	8	1334436	1334443	25 %	50 %	0 %	25 %	294139914
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18973	NC_014012	CAG	2	6	1334506	1334511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139914
18974	NC_014012	CAT	2	6	1334518	1334523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139914
18975	NC_014012	TCA	2	6	1334685	1334690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139914
18976	NC_014012	T	6	6	1334771	1334776	0 %	100 %	0 %	0 %	294139914
18977	NC_014012	AAT	2	6	1334910	1334915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139914
18978	NC_014012	CT	3	6	1334921	1334926	0 %	50 %	0 %	50 %	294139914
18979	NC_014012	TAGA	2	8	1334992	1334999	50 %	25 %	25 %	0 %	294139914
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18981	NC_014012	CGG	2	6	1335129	1335134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139914
18982	NC_014012	ATA	2	6	1335137	1335142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139914
18983	NC_014012	CTTG	2	8	1335167	1335174	0 %	50 %	25 %	25 %	294139914
18984	NC_014012	TC	3	6	1335261	1335266	0 %	50 %	0 %	50 %	294139914
18985	NC_014012	ACC	2	6	1335328	1335333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139914
18986	NC_014012	ACG	2	6	1335341	1335346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139914
18987	NC_014012	GAC	2	6	1335397	1335402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139914
18988	NC_014012	G	7	7	1335544	1335550	0 %	0 %	100 %	0 %	294139914
18989	NC_014012	TCAAT	2	10	1335555	1335564	40 %	40 %	0 %	20 %	294139914
18990	NC_014012	TGC	2	6	1335937	1335942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139915
18991	NC_014012	TGA	2	6	1335966	1335971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139915
18992	NC_014012	TTA	2	6	1335977	1335982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139915
18993	NC_014012	TGC	2	6	1335991	1335996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139915
18994	NC_014012	ACTGTA	2	12	1336007	1336018	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294139915
18995	NC_014012	TC	3	6	1336059	1336064	0 %	50 %	0 %	50 %	294139915
18996	NC_014012	AAT	2	6	1336111	1336116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139915
18997	NC_014012	TTC	2	6	1336126	1336131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139915
18998	NC_014012	ACC	2	6	1336132	1336137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139915
18999	NC_014012	CAA	2	6	1336146	1336151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139915
19000	NC_014012	GTT	2	6	1336281	1336286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139915

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