MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

< Previous12...3233343536373839404142...142143Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_014012	CG	4	8	1272747	1272754	0 %	0 %	50 %	50 %	294139858
18003	NC_014012	CGG	2	6	1272766	1272771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139858
18004	NC_014012	TCA	2	6	1272816	1272821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139858
18005	NC_014012	CT	3	6	1272882	1272887	0 %	50 %	0 %	50 %	294139858
18006	NC_014012	TCT	2	6	1272918	1272923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139858
18007	NC_014012	CATC	2	8	1273009	1273016	25 %	25 %	0 %	50 %	294139858
18008	NC_014012	AGCC	2	8	1273023	1273030	25 %	0 %	25 %	50 %	294139858
18009	NC_014012	TA	3	6	1273166	1273171	50 %	50 %	0 %	0 %	294139858
18010	NC_014012	AAG	2	6	1273194	1273199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139858
18011	NC_014012	GTG	2	6	1273207	1273212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139858
18012	NC_014012	GGTC	2	8	1273221	1273228	0 %	25 %	50 %	25 %	294139858
18013	NC_014012	TTC	2	6	1273232	1273237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139858
18014	NC_014012	AAACC	2	10	1273275	1273284	60 %	0 %	0 %	40 %	294139858
18015	NC_014012	TTC	2	6	1273301	1273306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139858
18016	NC_014012	GCC	2	6	1273349	1273354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139858
18017	NC_014012	ATCT	2	8	1273379	1273386	25 %	50 %	0 %	25 %	294139858
18018	NC_014012	GCT	2	6	1273408	1273413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139858
18019	NC_014012	GCC	2	6	1273428	1273433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139858
18020	NC_014012	CCG	3	9	1273449	1273457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139858
18021	NC_014012	TCT	2	6	1273468	1273473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139858
18022	NC_014012	AGC	2	6	1273548	1273553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139858
18023	NC_014012	TTC	2	6	1273784	1273789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139858
18024	NC_014012	TAA	2	6	1273907	1273912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139858
18025	NC_014012	GA	3	6	1273939	1273944	50 %	0 %	50 %	0 %	294139858
18026	NC_014012	CA	3	6	1274014	1274019	50 %	0 %	0 %	50 %	294139858
18027	NC_014012	TGA	2	6	1274053	1274058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139858
18028	NC_014012	CAT	2	6	1274068	1274073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139858
18029	NC_014012	TCA	2	6	1274115	1274120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139858
18030	NC_014012	TGCC	2	8	1274136	1274143	0 %	25 %	25 %	50 %	294139858
18031	NC_014012	ATA	2	6	1274160	1274165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139858
18032	NC_014012	GAA	2	6	1274345	1274350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139858
18033	NC_014012	GATA	2	8	1274410	1274417	50 %	25 %	25 %	0 %	294139858
18034	NC_014012	GTT	2	6	1274431	1274436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139858
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18036	NC_014012	CT	3	6	1274858	1274863	0 %	50 %	0 %	50 %	294139859
18037	NC_014012	CTT	2	6	1274905	1274910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139859
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18040	NC_014012	CGA	2	6	1275214	1275219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139860
18041	NC_014012	TG	3	6	1275288	1275293	0 %	50 %	50 %	0 %	294139860
18042	NC_014012	AAG	2	6	1275327	1275332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139860
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18044	NC_014012	ATC	2	6	1275572	1275577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139860
18045	NC_014012	GC	3	6	1275624	1275629	0 %	0 %	50 %	50 %	294139860
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18049	NC_014012	TTGT	2	8	1275689	1275696	0 %	75 %	25 %	0 %	294139860
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18051	NC_014012	GTG	3	9	1275915	1275923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139860
18052	NC_014012	AG	3	6	1276001	1276006	50 %	0 %	50 %	0 %	294139860
18053	NC_014012	GCT	2	6	1276027	1276032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139860
18054	NC_014012	GGC	2	6	1276205	1276210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139860
18055	NC_014012	ATGA	2	8	1276225	1276232	50 %	25 %	25 %	0 %	294139860
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18057	NC_014012	CAAA	2	8	1276351	1276358	75 %	0 %	0 %	25 %	294139860
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18060	NC_014012	GCT	2	6	1276438	1276443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139860
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18112	NC_014012	TAT	2	6	1280182	1280187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139864
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18115	NC_014012	ATGCT	2	10	1280265	1280274	20 %	40 %	20 %	20 %	294139864
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18117	NC_014012	ACC	2	6	1280320	1280325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139864
18118	NC_014012	TA	3	6	1280464	1280469	50 %	50 %	0 %	0 %	294139864
18119	NC_014012	ATC	3	9	1280614	1280622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139864
18120	NC_014012	GTG	2	6	1280655	1280660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139864
18121	NC_014012	TAT	2	6	1280751	1280756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139864
18122	NC_014012	ATC	2	6	1280812	1280817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139864
18123	NC_014012	CAT	2	6	1280883	1280888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139864
18124	NC_014012	TGATC	2	10	1281278	1281287	20 %	40 %	20 %	20 %	294139864
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18126	NC_014012	CGT	2	6	1281357	1281362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139864
18127	NC_014012	ATC	2	6	1281376	1281381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139864
18128	NC_014012	ATC	2	6	1281388	1281393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139864
18129	NC_014012	TCA	2	6	1281396	1281401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139864
18130	NC_014012	CTG	2	6	1281487	1281492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139864
18131	NC_014012	ATA	2	6	1281493	1281498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139864
18132	NC_014012	TAG	2	6	1281551	1281556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139864
18133	NC_014012	GGCT	2	8	1281658	1281665	0 %	25 %	50 %	25 %	294139864
18134	NC_014012	GTA	2	6	1281667	1281672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139864
18135	NC_014012	ATC	2	6	1281691	1281696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139864
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18145	NC_014012	TCT	2	6	1282196	1282201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139864
18146	NC_014012	ATC	2	6	1282205	1282210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139864
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18153	NC_014012	GGT	2	6	1283016	1283021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139865
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18171	NC_014012	GAG	2	6	1283791	1283796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139865
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18214	NC_014012	ATC	2	6	1286830	1286835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139866
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18225	NC_014012	CGC	2	6	1287483	1287488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139866
18226	NC_014012	CGC	3	9	1287576	1287584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139866
18227	NC_014012	TCA	2	6	1287591	1287596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139866
18228	NC_014012	CAA	2	6	1287613	1287618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139866
18229	NC_014012	ATA	2	6	1287650	1287655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139866
18230	NC_014012	CAT	2	6	1287868	1287873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139867
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18232	NC_014012	GGC	2	6	1287918	1287923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139867
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18350	NC_014012	TTA	2	6	1295261	1295266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139870
18351	NC_014012	ATT	2	6	1295288	1295293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139871
18352	NC_014012	TTA	2	6	1295294	1295299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139871
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18457	NC_014012	GTT	2	6	1301175	1301180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139877
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18461	NC_014012	TTAT	2	8	1301347	1301354	25 %	75 %	0 %	0 %	294139877
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18465	NC_014012	CTG	2	6	1301531	1301536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139878
18466	NC_014012	AGC	2	6	1301601	1301606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139878
18467	NC_014012	GAT	2	6	1301648	1301653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139878
18468	NC_014012	CAG	2	6	1301689	1301694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139878
18469	NC_014012	AGC	2	6	1301727	1301732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139878
18470	NC_014012	GA	3	6	1301745	1301750	50 %	0 %	50 %	0 %	294139878
18471	NC_014012	GC	3	6	1301869	1301874	0 %	0 %	50 %	50 %	294139878
18472	NC_014012	GT	3	6	1301894	1301899	0 %	50 %	50 %	0 %	294139878
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18475	NC_014012	TC	3	6	1302159	1302164	0 %	50 %	0 %	50 %	294139879
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18480	NC_014012	AT	3	6	1302442	1302447	50 %	50 %	0 %	0 %	294139879
18481	NC_014012	TTA	2	6	1302484	1302489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139879
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18485	NC_014012	GCA	2	6	1302751	1302756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139879
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18488	NC_014012	C	6	6	1302908	1302913	0 %	0 %	0 %	100 %	294139879
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18491	NC_014012	CAT	2	6	1303029	1303034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139879
18492	NC_014012	GCA	2	6	1303079	1303084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139879
18493	NC_014012	CTT	2	6	1303151	1303156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139879
18494	NC_014012	CAGA	2	8	1303170	1303177	50 %	0 %	25 %	25 %	294139879
18495	NC_014012	GAG	2	6	1303203	1303208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139879
18496	NC_014012	A	6	6	1303300	1303305	100 %	0 %	0 %	0 %	294139880
18497	NC_014012	CAG	2	6	1303363	1303368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139880
18498	NC_014012	GCT	2	6	1303374	1303379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139880
18499	NC_014012	CAG	2	6	1303393	1303398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139880
18500	NC_014012	T	7	7	1303437	1303443	0 %	100 %	0 %	0 %	294139880

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