MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_014012	CTG	2	6	1235029	1235034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139833
17502	NC_014012	TAT	2	6	1235049	1235054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139833
17503	NC_014012	T	6	6	1235082	1235087	0 %	100 %	0 %	0 %	294139833
17504	NC_014012	ACT	2	6	1235329	1235334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139833
17505	NC_014012	TAG	2	6	1235344	1235349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139833
17506	NC_014012	AGG	2	6	1235600	1235605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139833
17507	NC_014012	ATT	2	6	1235704	1235709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139834
17508	NC_014012	TCT	2	6	1235729	1235734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139834
17509	NC_014012	TTG	2	6	1235790	1235795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139834
17510	NC_014012	AGT	2	6	1235809	1235814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139834
17511	NC_014012	TGG	2	6	1235823	1235828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139834
17512	NC_014012	T	6	6	1236128	1236133	0 %	100 %	0 %	0 %	294139835
17513	NC_014012	TGC	2	6	1236153	1236158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139835
17514	NC_014012	CAT	2	6	1236229	1236234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139835
17515	NC_014012	ACG	2	6	1236291	1236296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139835
17516	NC_014012	GATT	2	8	1236372	1236379	25 %	50 %	25 %	0 %	294139835
17517	NC_014012	TG	3	6	1236427	1236432	0 %	50 %	50 %	0 %	294139835
17518	NC_014012	AT	3	6	1236474	1236479	50 %	50 %	0 %	0 %	294139835
17519	NC_014012	GTG	2	6	1237012	1237017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139836
17520	NC_014012	GCGT	2	8	1237210	1237217	0 %	25 %	50 %	25 %	294139836
17521	NC_014012	GA	3	6	1237330	1237335	50 %	0 %	50 %	0 %	294139836
17522	NC_014012	CAC	2	6	1237429	1237434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139836
17523	NC_014012	AAGCCG	2	12	1237452	1237463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139836
17524	NC_014012	ATC	2	6	1237556	1237561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139836
17525	NC_014012	AGA	2	6	1237629	1237634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139836
17526	NC_014012	TCA	2	6	1237758	1237763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139836
17527	NC_014012	GCG	2	6	1237778	1237783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139836
17528	NC_014012	CAA	2	6	1237922	1237927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139836
17529	NC_014012	AGA	2	6	1238029	1238034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139836
17530	NC_014012	AGA	2	6	1238064	1238069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139836
17531	NC_014012	TAA	2	6	1238143	1238148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139836
17532	NC_014012	T	7	7	1238182	1238188	0 %	100 %	0 %	0 %	294139837
17533	NC_014012	TGTCGG	2	12	1238262	1238273	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	294139837
17534	NC_014012	GTGCCA	2	12	1238325	1238336	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294139837
17535	NC_014012	TGG	2	6	1238586	1238591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139837
17536	NC_014012	ACTA	2	8	1238636	1238643	50 %	25 %	0 %	25 %	294139837
17537	NC_014012	GT	3	6	1238685	1238690	0 %	50 %	50 %	0 %	294139837
17538	NC_014012	CTGG	2	8	1238734	1238741	0 %	25 %	50 %	25 %	294139837
17539	NC_014012	CGC	2	6	1238818	1238823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139837
17540	NC_014012	AGC	2	6	1238856	1238861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139837
17541	NC_014012	TGA	2	6	1238922	1238927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139837
17542	NC_014012	AAT	2	6	1238936	1238941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139837
17543	NC_014012	TCG	2	6	1238958	1238963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139837
17544	NC_014012	ATG	2	6	1239000	1239005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139837
17545	NC_014012	CAA	2	6	1239019	1239024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139837
17546	NC_014012	ATT	2	6	1239038	1239043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139837
17547	NC_014012	ATCA	2	8	1239051	1239058	50 %	25 %	0 %	25 %	294139837
17548	NC_014012	GGC	2	6	1239085	1239090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139837
17549	NC_014012	ACC	2	6	1239161	1239166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139837
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17551	NC_014012	GTG	2	6	1239236	1239241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139837
17552	NC_014012	TCT	2	6	1239246	1239251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139837
17553	NC_014012	CTT	2	6	1239319	1239324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139837
17554	NC_014012	GAT	2	6	1239395	1239400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139837
17555	NC_014012	TGG	3	9	1239408	1239416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139837
17556	NC_014012	AAG	2	6	1239459	1239464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139837
17557	NC_014012	ATT	2	6	1239500	1239505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139837
17558	NC_014012	CCA	2	6	1239507	1239512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139837
17559	NC_014012	TG	3	6	1239651	1239656	0 %	50 %	50 %	0 %	294139837
17560	NC_014012	CTTAGT	2	12	1239778	1239789	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294139837
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17563	NC_014012	TGA	2	6	1239930	1239935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139837
17564	NC_014012	TGG	2	6	1240030	1240035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139837
17565	NC_014012	TGA	2	6	1240038	1240043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139837
17566	NC_014012	GGA	2	6	1240063	1240068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139837
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17568	NC_014012	ATGT	2	8	1240337	1240344	25 %	50 %	25 %	0 %	294139837
17569	NC_014012	TAAGGC	2	12	1240360	1240371	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294139837
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17571	NC_014012	TA	3	6	1240461	1240466	50 %	50 %	0 %	0 %	294139837
17572	NC_014012	GAT	2	6	1240549	1240554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139837
17573	NC_014012	TGATG	2	10	1240597	1240606	20 %	40 %	40 %	0 %	294139837
17574	NC_014012	ACA	2	6	1240614	1240619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139837
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17582	NC_014012	CCTTCT	2	12	1241094	1241105	0 %	50 %	0 %	50 %	294139837
17583	NC_014012	GGC	2	6	1241194	1241199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139837
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17585	NC_014012	TGA	2	6	1241238	1241243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139837
17586	NC_014012	GGC	2	6	1241275	1241280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139837
17587	NC_014012	AGCC	2	8	1241293	1241300	25 %	0 %	25 %	50 %	294139837
17588	NC_014012	T	6	6	1241476	1241481	0 %	100 %	0 %	0 %	294139838
17589	NC_014012	GTG	2	6	1241482	1241487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139838
17590	NC_014012	ATA	2	6	1241491	1241496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139838
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17594	NC_014012	TC	3	6	1241744	1241749	0 %	50 %	0 %	50 %	294139838
17595	NC_014012	TTG	2	6	1241758	1241763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139838
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17597	NC_014012	T	6	6	1242188	1242193	0 %	100 %	0 %	0 %	294139838
17598	NC_014012	TCTG	2	8	1242195	1242202	0 %	50 %	25 %	25 %	294139838
17599	NC_014012	GTG	2	6	1242226	1242231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139838
17600	NC_014012	TC	3	6	1242281	1242286	0 %	50 %	0 %	50 %	294139838
17601	NC_014012	TAG	2	6	1242359	1242364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139838
17602	NC_014012	GTG	2	6	1242421	1242426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139838
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17604	NC_014012	AATC	2	8	1242518	1242525	50 %	25 %	0 %	25 %	294139838
17605	NC_014012	G	7	7	1242536	1242542	0 %	0 %	100 %	0 %	294139838
17606	NC_014012	TGGAC	2	10	1242702	1242711	20 %	20 %	40 %	20 %	294139838
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17608	NC_014012	GCA	2	6	1242750	1242755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139838
17609	NC_014012	AG	3	6	1242784	1242789	50 %	0 %	50 %	0 %	294139838
17610	NC_014012	GGT	2	6	1242831	1242836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139838
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17612	NC_014012	CTG	2	6	1242916	1242921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139838
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17614	NC_014012	CAT	2	6	1243104	1243109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139838
17615	NC_014012	AGC	2	6	1243139	1243144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139838
17616	NC_014012	GTCT	2	8	1243214	1243221	0 %	50 %	25 %	25 %	294139838
17617	NC_014012	TGG	2	6	1243322	1243327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139838
17618	NC_014012	GAA	2	6	1243377	1243382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139838
17619	NC_014012	ATT	2	6	1243940	1243945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139839
17620	NC_014012	TAT	2	6	1244031	1244036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139840
17621	NC_014012	TGA	2	6	1244088	1244093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139841
17622	NC_014012	ACT	2	6	1244137	1244142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139841
17623	NC_014012	T	6	6	1244185	1244190	0 %	100 %	0 %	0 %	294139841
17624	NC_014012	CTGC	2	8	1244207	1244214	0 %	25 %	25 %	50 %	294139841
17625	NC_014012	TGGT	2	8	1244275	1244282	0 %	50 %	50 %	0 %	294139841
17626	NC_014012	ATC	2	6	1244394	1244399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139841
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17629	NC_014012	TCC	2	6	1244542	1244547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139841
17630	NC_014012	TCA	2	6	1244658	1244663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139841
17631	NC_014012	TGCTG	2	10	1244740	1244749	0 %	40 %	40 %	20 %	294139841
17632	NC_014012	GA	3	6	1244826	1244831	50 %	0 %	50 %	0 %	294139841
17633	NC_014012	TTGC	2	8	1244879	1244886	0 %	50 %	25 %	25 %	294139841
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17636	NC_014012	TTG	2	6	1244994	1244999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139841
17637	NC_014012	CAGT	2	8	1245128	1245135	25 %	25 %	25 %	25 %	294139841
17638	NC_014012	TGGA	2	8	1245186	1245193	25 %	25 %	50 %	0 %	294139841
17639	NC_014012	TGC	2	6	1245222	1245227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139841
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17642	NC_014012	ATC	2	6	1245299	1245304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139841
17643	NC_014012	AG	3	6	1245348	1245353	50 %	0 %	50 %	0 %	294139841
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17645	NC_014012	GGC	2	6	1245760	1245765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139842
17646	NC_014012	TCA	2	6	1245779	1245784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139842
17647	NC_014012	CTG	2	6	1245859	1245864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139842
17648	NC_014012	CATGG	2	10	1245934	1245943	20 %	20 %	40 %	20 %	294139842
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17650	NC_014012	ATGCC	2	10	1245969	1245978	20 %	20 %	20 %	40 %	294139842
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17652	NC_014012	TGA	2	6	1246272	1246277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139842
17653	NC_014012	GCC	2	6	1246384	1246389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139842
17654	NC_014012	CCA	2	6	1246436	1246441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139842
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17666	NC_014012	TTTA	2	8	1247077	1247084	25 %	75 %	0 %	0 %	294139843
17667	NC_014012	AG	3	6	1248018	1248023	50 %	0 %	50 %	0 %	294139844
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17672	NC_014012	GT	3	6	1248407	1248412	0 %	50 %	50 %	0 %	294139844
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17678	NC_014012	CT	3	6	1248988	1248993	0 %	50 %	0 %	50 %	294139844
17679	NC_014012	TTGG	2	8	1249091	1249098	0 %	50 %	50 %	0 %	294139844
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17713	NC_014012	GCA	2	6	1251242	1251247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139845
17714	NC_014012	CAT	2	6	1251252	1251257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139845
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17718	NC_014012	TGCT	2	8	1251707	1251714	0 %	50 %	25 %	25 %	294139845
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17720	NC_014012	G	7	7	1251821	1251827	0 %	0 %	100 %	0 %	294139845
17721	NC_014012	TCC	2	6	1251853	1251858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139845
17722	NC_014012	TCA	3	9	1252043	1252051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139845
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17724	NC_014012	GAT	2	6	1252164	1252169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139845
17725	NC_014012	CTG	2	6	1252302	1252307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139845
17726	NC_014012	C	6	6	1252315	1252320	0 %	0 %	0 %	100 %	294139845
17727	NC_014012	GT	3	6	1252444	1252449	0 %	50 %	50 %	0 %	294139845
17728	NC_014012	TCA	2	6	1252520	1252525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139845
17729	NC_014012	TGG	2	6	1252595	1252600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139845
17730	NC_014012	CTAA	2	8	1252771	1252778	50 %	25 %	0 %	25 %	294139845
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17732	NC_014012	GA	3	6	1252959	1252964	50 %	0 %	50 %	0 %	294139846
17733	NC_014012	TGG	2	6	1253066	1253071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139846
17734	NC_014012	TA	3	6	1253104	1253109	50 %	50 %	0 %	0 %	294139846
17735	NC_014012	TC	3	6	1253130	1253135	0 %	50 %	0 %	50 %	294139846
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17849	NC_014012	CAGT	2	8	1260078	1260085	25 %	25 %	25 %	25 %	294139850
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17952	NC_014012	TAC	2	6	1269569	1269574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139857
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17967	NC_014012	T	6	6	1270231	1270236	0 %	100 %	0 %	0 %	294139857
17968	NC_014012	AT	3	6	1270256	1270261	50 %	50 %	0 %	0 %	294139857
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