MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_014012	CTG	2	6	1198711	1198716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139796
17002	NC_014012	GTATT	2	10	1198732	1198741	20 %	60 %	20 %	0 %	294139796
17003	NC_014012	A	6	6	1199277	1199282	100 %	0 %	0 %	0 %	294139797
17004	NC_014012	GCTT	2	8	1199299	1199306	0 %	50 %	25 %	25 %	294139797
17005	NC_014012	TTC	2	6	1199308	1199313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139797
17006	NC_014012	ATGG	2	8	1201227	1201234	25 %	25 %	50 %	0 %	294139798
17007	NC_014012	ATT	2	6	1201299	1201304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139798
17008	NC_014012	GTTT	2	8	1201305	1201312	0 %	75 %	25 %	0 %	294139798
17009	NC_014012	CTTG	2	8	1201327	1201334	0 %	50 %	25 %	25 %	294139798
17010	NC_014012	CAC	2	6	1201358	1201363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139798
17011	NC_014012	TGAG	2	8	1201364	1201371	25 %	25 %	50 %	0 %	294139798
17012	NC_014012	CCG	2	6	1201391	1201396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139798
17013	NC_014012	GT	3	6	1201487	1201492	0 %	50 %	50 %	0 %	294139798
17014	NC_014012	TTTG	2	8	1201497	1201504	0 %	75 %	25 %	0 %	294139798
17015	NC_014012	TCA	2	6	1201560	1201565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139798
17016	NC_014012	T	6	6	1201630	1201635	0 %	100 %	0 %	0 %	294139798
17017	NC_014012	GAA	2	6	1201755	1201760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139799
17018	NC_014012	GTG	2	6	1201817	1201822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139799
17019	NC_014012	GTG	2	6	1201909	1201914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139799
17020	NC_014012	A	6	6	1201957	1201962	100 %	0 %	0 %	0 %	294139799
17021	NC_014012	T	6	6	1202052	1202057	0 %	100 %	0 %	0 %	294139799
17022	NC_014012	T	6	6	1202124	1202129	0 %	100 %	0 %	0 %	294139799
17023	NC_014012	G	7	7	1202213	1202219	0 %	0 %	100 %	0 %	294139799
17024	NC_014012	TCA	2	6	1202296	1202301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139799
17025	NC_014012	AAG	2	6	1202463	1202468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139800
17026	NC_014012	TCA	2	6	1202499	1202504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139800
17027	NC_014012	TCA	2	6	1202509	1202514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139800
17028	NC_014012	CTT	2	6	1202572	1202577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139800
17029	NC_014012	TTCT	2	8	1202645	1202652	0 %	75 %	0 %	25 %	294139800
17030	NC_014012	TTAA	2	8	1202693	1202700	50 %	50 %	0 %	0 %	294139801
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17032	NC_014012	TGG	2	6	1202755	1202760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139801
17033	NC_014012	TTC	2	6	1202941	1202946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139801
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17038	NC_014012	T	7	7	1203053	1203059	0 %	100 %	0 %	0 %	294139801
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17043	NC_014012	GCCA	2	8	1203285	1203292	25 %	0 %	25 %	50 %	294139801
17044	NC_014012	TGCAAG	2	12	1203355	1203366	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294139801
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17062	NC_014012	CGT	2	6	1204558	1204563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139802
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17085	NC_014012	GT	4	8	1206008	1206015	0 %	50 %	50 %	0 %	294139804
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17099	NC_014012	A	6	6	1207029	1207034	100 %	0 %	0 %	0 %	294139805
17100	NC_014012	TG	3	6	1207110	1207115	0 %	50 %	50 %	0 %	294139805
17101	NC_014012	AGC	2	6	1207143	1207148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139805
17102	NC_014012	GCA	2	6	1207691	1207696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139806
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17105	NC_014012	ATG	2	6	1207887	1207892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139806
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17114	NC_014012	GT	3	6	1208226	1208231	0 %	50 %	50 %	0 %	294139806
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17116	NC_014012	TCA	2	6	1208419	1208424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139806
17117	NC_014012	AAG	2	6	1208449	1208454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139806
17118	NC_014012	AAAG	2	8	1208556	1208563	75 %	0 %	25 %	0 %	294139806
17119	NC_014012	GCA	2	6	1209258	1209263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139807
17120	NC_014012	T	6	6	1209307	1209312	0 %	100 %	0 %	0 %	294139807
17121	NC_014012	TC	4	8	1209318	1209325	0 %	50 %	0 %	50 %	294139807
17122	NC_014012	ACA	2	6	1209404	1209409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139807
17123	NC_014012	GGC	2	6	1209501	1209506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139807
17124	NC_014012	GCC	2	6	1209625	1209630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139807
17125	NC_014012	GGCTAT	2	12	1209667	1209678	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294139807
17126	NC_014012	TC	3	6	1209831	1209836	0 %	50 %	0 %	50 %	294139807
17127	NC_014012	CAT	2	6	1209933	1209938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139807
17128	NC_014012	TAAG	2	8	1209940	1209947	50 %	25 %	25 %	0 %	294139807
17129	NC_014012	CAT	2	6	1209957	1209962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139807
17130	NC_014012	ATA	2	6	1209973	1209978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139807
17131	NC_014012	AAG	2	6	1210007	1210012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139807
17132	NC_014012	CTT	2	6	1210039	1210044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139807
17133	NC_014012	ATG	2	6	1210046	1210051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139807
17134	NC_014012	ATT	2	6	1210147	1210152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139807
17135	NC_014012	GTA	2	6	1210153	1210158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139807
17136	NC_014012	CA	3	6	1210181	1210186	50 %	0 %	0 %	50 %	294139807
17137	NC_014012	TAAT	2	8	1210230	1210237	50 %	50 %	0 %	0 %	294139807
17138	NC_014012	TGCT	2	8	1210270	1210277	0 %	50 %	25 %	25 %	294139807
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17141	NC_014012	TCT	2	6	1210364	1210369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139807
17142	NC_014012	TGA	2	6	1210392	1210397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139807
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17144	NC_014012	T	6	6	1210452	1210457	0 %	100 %	0 %	0 %	294139807
17145	NC_014012	GCT	2	6	1210485	1210490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139807
17146	NC_014012	AAG	2	6	1210571	1210576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139807
17147	NC_014012	CCA	2	6	1210595	1210600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139807
17148	NC_014012	CTT	2	6	1210650	1210655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139807
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17150	NC_014012	GCT	2	6	1210961	1210966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139807
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17152	NC_014012	GGCT	2	8	1210986	1210993	0 %	25 %	50 %	25 %	294139807
17153	NC_014012	TAGTTT	2	12	1211013	1211024	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	294139807
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17159	NC_014012	TCA	2	6	1211814	1211819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139808
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17164	NC_014012	GTC	2	6	1212131	1212136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139808
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17203	NC_014012	GCG	2	6	1214215	1214220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139812
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17213	NC_014012	ATC	2	6	1214767	1214772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139813
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17220	NC_014012	GCT	2	6	1215254	1215259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139813
17221	NC_014012	TGA	3	9	1215264	1215272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139813
17222	NC_014012	T	6	6	1215274	1215279	0 %	100 %	0 %	0 %	294139813
17223	NC_014012	GTT	2	6	1215472	1215477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139813
17224	NC_014012	TGC	2	6	1215495	1215500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139813
17225	NC_014012	T	8	8	1215532	1215539	0 %	100 %	0 %	0 %	294139813
17226	NC_014012	GGA	2	6	1215904	1215909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139814
17227	NC_014012	TCC	2	6	1215954	1215959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139814
17228	NC_014012	GTG	2	6	1216018	1216023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139814
17229	NC_014012	TGGC	2	8	1216098	1216105	0 %	25 %	50 %	25 %	294139814
17230	NC_014012	GAT	2	6	1216106	1216111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139814
17231	NC_014012	GCA	2	6	1216163	1216168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139814
17232	NC_014012	GGC	2	6	1216244	1216249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139814
17233	NC_014012	TACT	2	8	1216276	1216283	25 %	50 %	0 %	25 %	294139814
17234	NC_014012	GAA	2	6	1216314	1216319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139814
17235	NC_014012	TTCGA	2	10	1216334	1216343	20 %	40 %	20 %	20 %	294139814
17236	NC_014012	GTCT	2	8	1216360	1216367	0 %	50 %	25 %	25 %	294139814
17237	NC_014012	TTG	2	6	1216372	1216377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139814
17238	NC_014012	ATG	2	6	1216380	1216385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139814
17239	NC_014012	ATC	2	6	1216545	1216550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139815
17240	NC_014012	CAT	2	6	1216576	1216581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139815
17241	NC_014012	AGC	2	6	1216590	1216595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139815
17242	NC_014012	AGAT	2	8	1216620	1216627	50 %	25 %	25 %	0 %	294139815
17243	NC_014012	GAG	2	6	1216686	1216691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139815
17244	NC_014012	CGG	2	6	1216695	1216700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139815
17245	NC_014012	AGC	2	6	1216737	1216742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139815
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17247	NC_014012	GTC	2	6	1216866	1216871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139815
17248	NC_014012	GC	3	6	1216989	1216994	0 %	0 %	50 %	50 %	294139815
17249	NC_014012	TGG	2	6	1217019	1217024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139815
17250	NC_014012	CAG	2	6	1217064	1217069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139815
17251	NC_014012	AC	3	6	1217101	1217106	50 %	0 %	0 %	50 %	294139815
17252	NC_014012	A	6	6	1217225	1217230	100 %	0 %	0 %	0 %	294139815
17253	NC_014012	GAG	2	6	1217235	1217240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139815
17254	NC_014012	GGC	2	6	1217248	1217253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139815
17255	NC_014012	ATG	2	6	1217264	1217269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139815
17256	NC_014012	TAT	2	6	1217475	1217480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139816
17257	NC_014012	TATT	2	8	1217531	1217538	25 %	75 %	0 %	0 %	294139816
17258	NC_014012	C	6	6	1217550	1217555	0 %	0 %	0 %	100 %	294139816
17259	NC_014012	TC	3	6	1217603	1217608	0 %	50 %	0 %	50 %	294139816
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17268	NC_014012	TCA	3	9	1217852	1217860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139816
17269	NC_014012	TGG	2	6	1217906	1217911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139816
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17320	NC_014012	CTAG	2	8	1221888	1221895	25 %	25 %	25 %	25 %	294139821
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17326	NC_014012	AAAG	2	8	1222157	1222164	75 %	0 %	25 %	0 %	294139821
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17328	NC_014012	GAAT	2	8	1222360	1222367	50 %	25 %	25 %	0 %	294139822
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17330	NC_014012	TTGGT	2	10	1222414	1222423	0 %	60 %	40 %	0 %	294139822
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17332	NC_014012	GCG	2	6	1222599	1222604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139822
17333	NC_014012	A	7	7	1222671	1222677	100 %	0 %	0 %	0 %	294139822
17334	NC_014012	ACTA	2	8	1222698	1222705	50 %	25 %	0 %	25 %	294139822
17335	NC_014012	GCA	2	6	1222747	1222752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139822
17336	NC_014012	ATA	2	6	1222870	1222875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139822
17337	NC_014012	GAG	2	6	1222881	1222886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139822
17338	NC_014012	GTTA	2	8	1222922	1222929	25 %	50 %	25 %	0 %	294139822
17339	NC_014012	CTC	2	6	1223329	1223334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139823
17340	NC_014012	GCT	2	6	1223485	1223490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139823
17341	NC_014012	ACT	2	6	1223534	1223539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139823
17342	NC_014012	ACC	2	6	1223737	1223742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139824
17343	NC_014012	TGA	2	6	1224339	1224344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139825
17344	NC_014012	TA	3	6	1224347	1224352	50 %	50 %	0 %	0 %	294139825
17345	NC_014012	TAT	2	6	1224423	1224428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139825
17346	NC_014012	T	6	6	1224428	1224433	0 %	100 %	0 %	0 %	294139825
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17348	NC_014012	ACG	2	6	1224593	1224598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139825
17349	NC_014012	GAT	2	6	1224635	1224640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139825
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17462	NC_014012	GAT	2	6	1232053	1232058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139831
17463	NC_014012	GCCG	2	8	1232142	1232149	0 %	0 %	50 %	50 %	294139831
17464	NC_014012	CTG	2	6	1232160	1232165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139831
17465	NC_014012	CCG	2	6	1232233	1232238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139831
17466	NC_014012	CTG	2	6	1232253	1232258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139831
17467	NC_014012	GATA	2	8	1232264	1232271	50 %	25 %	25 %	0 %	294139831
17468	NC_014012	GCC	2	6	1232275	1232280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139831
17469	NC_014012	TGGCT	2	10	1232330	1232339	0 %	40 %	40 %	20 %	294139831
17470	NC_014012	TTG	2	6	1232341	1232346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139831
17471	NC_014012	CGA	2	6	1232366	1232371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139831
17472	NC_014012	GCC	2	6	1232434	1232439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139831
17473	NC_014012	CATGA	2	10	1232455	1232464	40 %	20 %	20 %	20 %	294139831
17474	NC_014012	ATC	2	6	1232494	1232499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139831
17475	NC_014012	TGT	2	6	1233096	1233101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139832
17476	NC_014012	CGCGGC	2	12	1233104	1233115	0 %	0 %	50 %	50 %	294139832
17477	NC_014012	TCA	3	9	1233196	1233204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139832
17478	NC_014012	CT	3	6	1233209	1233214	0 %	50 %	0 %	50 %	294139832
17479	NC_014012	CATG	2	8	1233465	1233472	25 %	25 %	25 %	25 %	294139832
17480	NC_014012	TAA	2	6	1233518	1233523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139832
17481	NC_014012	TCT	2	6	1233593	1233598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139832
17482	NC_014012	TGG	2	6	1233604	1233609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139832
17483	NC_014012	AGTGG	2	10	1233663	1233672	20 %	20 %	60 %	0 %	294139832
17484	NC_014012	TGG	2	6	1233826	1233831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139832
17485	NC_014012	CGA	2	6	1233865	1233870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139832
17486	NC_014012	CAT	2	6	1233965	1233970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139832
17487	NC_014012	TGG	2	6	1233981	1233986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139832
17488	NC_014012	CTG	2	6	1234056	1234061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139832
17489	NC_014012	ACCA	2	8	1234076	1234083	50 %	0 %	0 %	50 %	294139832
17490	NC_014012	GGC	2	6	1234113	1234118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139832
17491	NC_014012	TGT	2	6	1234148	1234153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139832
17492	NC_014012	CTAT	2	8	1234282	1234289	25 %	50 %	0 %	25 %	294139832
17493	NC_014012	ATG	2	6	1234299	1234304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139832
17494	NC_014012	CAC	2	6	1234361	1234366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139832
17495	NC_014012	AAT	2	6	1234383	1234388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139832
17496	NC_014012	GC	3	6	1234420	1234425	0 %	0 %	50 %	50 %	294139832
17497	NC_014012	CAT	2	6	1234460	1234465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139832
17498	NC_014012	GCG	2	6	1234894	1234899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139833
17499	NC_014012	CTA	2	6	1234958	1234963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139833
17500	NC_014012	ATC	2	6	1235011	1235016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139833

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