MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

< Previous12...2930313233343536373839...142143Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_014012	CTG	2	6	1165996	1166001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139768
16503	NC_014012	TGA	2	6	1166105	1166110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139768
16504	NC_014012	CTCC	2	8	1166156	1166163	0 %	25 %	0 %	75 %	294139768
16505	NC_014012	CAT	2	6	1166172	1166177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139768
16506	NC_014012	TG	3	6	1166181	1166186	0 %	50 %	50 %	0 %	294139768
16507	NC_014012	CTG	2	6	1166246	1166251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139768
16508	NC_014012	GATG	2	8	1166403	1166410	25 %	25 %	50 %	0 %	294139768
16509	NC_014012	C	6	6	1166443	1166448	0 %	0 %	0 %	100 %	294139768
16510	NC_014012	GGCT	2	8	1166467	1166474	0 %	25 %	50 %	25 %	294139768
16511	NC_014012	CTT	2	6	1166534	1166539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139768
16512	NC_014012	TGT	2	6	1166689	1166694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139768
16513	NC_014012	CTG	2	6	1166697	1166702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139768
16514	NC_014012	AGATT	2	10	1166713	1166722	40 %	40 %	20 %	0 %	294139768
16515	NC_014012	GT	3	6	1166789	1166794	0 %	50 %	50 %	0 %	294139768
16516	NC_014012	GCA	2	6	1166954	1166959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139769
16517	NC_014012	CGT	2	6	1167006	1167011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139769
16518	NC_014012	CTT	2	6	1167030	1167035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139769
16519	NC_014012	GA	3	6	1167043	1167048	50 %	0 %	50 %	0 %	294139769
16520	NC_014012	TG	3	6	1167049	1167054	0 %	50 %	50 %	0 %	294139769
16521	NC_014012	AAG	2	6	1167148	1167153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139769
16522	NC_014012	AAG	2	6	1167184	1167189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139769
16523	NC_014012	AGC	2	6	1167368	1167373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139770
16524	NC_014012	AGC	2	6	1167413	1167418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139770
16525	NC_014012	AAT	2	6	1167431	1167436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139770
16526	NC_014012	CAA	2	6	1167457	1167462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139770
16527	NC_014012	GCA	2	6	1167471	1167476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139770
16528	NC_014012	TG	3	6	1167497	1167502	0 %	50 %	50 %	0 %	294139770
16529	NC_014012	CTTT	2	8	1167529	1167536	0 %	75 %	0 %	25 %	294139770
16530	NC_014012	ACG	2	6	1167557	1167562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139770
16531	NC_014012	GAC	2	6	1167577	1167582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139770
16532	NC_014012	GC	4	8	1167598	1167605	0 %	0 %	50 %	50 %	294139770
16533	NC_014012	TTTA	2	8	1167891	1167898	25 %	75 %	0 %	0 %	294139771
16534	NC_014012	GTTA	2	8	1167948	1167955	25 %	50 %	25 %	0 %	294139771
16535	NC_014012	GCG	2	6	1167992	1167997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139771
16536	NC_014012	T	7	7	1168004	1168010	0 %	100 %	0 %	0 %	294139771
16537	NC_014012	TAA	2	6	1168017	1168022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139771
16538	NC_014012	T	6	6	1168032	1168037	0 %	100 %	0 %	0 %	294139771
16539	NC_014012	AC	3	6	1168107	1168112	50 %	0 %	0 %	50 %	294139771
16540	NC_014012	GGC	2	6	1168228	1168233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139771
16541	NC_014012	AGC	2	6	1168284	1168289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139771
16542	NC_014012	TTA	2	6	1168325	1168330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139771
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16544	NC_014012	CTC	2	6	1168442	1168447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139771
16545	NC_014012	TCT	2	6	1168484	1168489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139771
16546	NC_014012	TGG	2	6	1168491	1168496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139771
16547	NC_014012	AATTC	2	10	1168500	1168509	40 %	40 %	0 %	20 %	294139771
16548	NC_014012	CCTG	2	8	1168555	1168562	0 %	25 %	25 %	50 %	294139771
16549	NC_014012	GT	3	6	1168622	1168627	0 %	50 %	50 %	0 %	294139771
16550	NC_014012	TGA	2	6	1168676	1168681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139771
16551	NC_014012	TAT	2	6	1168702	1168707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139771
16552	NC_014012	GTTT	2	8	1168736	1168743	0 %	75 %	25 %	0 %	294139771
16553	NC_014012	ATCGCA	2	12	1168747	1168758	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294139771
16554	NC_014012	AAG	2	6	1168783	1168788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139771
16555	NC_014012	GAAG	2	8	1168801	1168808	50 %	0 %	50 %	0 %	294139771
16556	NC_014012	CCA	2	6	1168820	1168825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139771
16557	NC_014012	GTG	2	6	1168922	1168927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139771
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16559	NC_014012	CAT	2	6	1169067	1169072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139771
16560	NC_014012	TCTGC	2	10	1169155	1169164	0 %	40 %	20 %	40 %	294139771
16561	NC_014012	TTTC	2	8	1169235	1169242	0 %	75 %	0 %	25 %	294139771
16562	NC_014012	TTA	2	6	1169251	1169256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139771
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16584	NC_014012	GCTGAA	2	12	1171606	1171617	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294139773
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16587	NC_014012	GGC	2	6	1171677	1171682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139773
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16589	NC_014012	CGG	2	6	1171787	1171792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139773
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16601	NC_014012	AAGC	2	8	1172323	1172330	50 %	0 %	25 %	25 %	294139773
16602	NC_014012	TTTG	2	8	1172454	1172461	0 %	75 %	25 %	0 %	294139773
16603	NC_014012	GAA	2	6	1172476	1172481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139773
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