MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014012	CA	3	6	1129910	1129915	50 %	0 %	0 %	50 %	294139736
16002	NC_014012	GCA	2	6	1129954	1129959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139736
16003	NC_014012	AT	3	6	1129963	1129968	50 %	50 %	0 %	0 %	294139736
16004	NC_014012	CAG	2	6	1130034	1130039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139736
16005	NC_014012	AAT	2	6	1130071	1130076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139736
16006	NC_014012	GCT	2	6	1130092	1130097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139736
16007	NC_014012	ATA	2	6	1130128	1130133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139736
16008	NC_014012	AG	3	6	1130153	1130158	50 %	0 %	50 %	0 %	294139736
16009	NC_014012	CTT	2	6	1130160	1130165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139736
16010	NC_014012	CTT	2	6	1130237	1130242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139736
16011	NC_014012	CCA	3	9	1130317	1130325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139736
16012	NC_014012	TTA	2	6	1130416	1130421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139736
16013	NC_014012	CTG	2	6	1130437	1130442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139736
16014	NC_014012	ATG	2	6	1130725	1130730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139736
16015	NC_014012	ACG	2	6	1130782	1130787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139736
16016	NC_014012	ATC	2	6	1130892	1130897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139736
16017	NC_014012	GCC	2	6	1131036	1131041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139736
16018	NC_014012	GCAG	2	8	1131053	1131060	25 %	0 %	50 %	25 %	294139736
16019	NC_014012	TGG	2	6	1131074	1131079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139736
16020	NC_014012	CAT	2	6	1131116	1131121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139736
16021	NC_014012	ATTG	2	8	1131129	1131136	25 %	50 %	25 %	0 %	294139736
16022	NC_014012	AGGA	2	8	1131159	1131166	50 %	0 %	50 %	0 %	294139736
16023	NC_014012	TCG	2	6	1131208	1131213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139736
16024	NC_014012	TGC	2	6	1131322	1131327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139736
16025	NC_014012	TTG	2	6	1131366	1131371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139736
16026	NC_014012	ATA	2	6	1131391	1131396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139736
16027	NC_014012	AG	4	8	1131404	1131411	50 %	0 %	50 %	0 %	294139736
16028	NC_014012	ATCT	2	8	1131507	1131514	25 %	50 %	0 %	25 %	294139736
16029	NC_014012	GCGA	2	8	1131522	1131529	25 %	0 %	50 %	25 %	294139736
16030	NC_014012	ACG	2	6	1131546	1131551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139736
16031	NC_014012	AAGAT	2	10	1131844	1131853	60 %	20 %	20 %	0 %	294139737
16032	NC_014012	A	6	6	1131881	1131886	100 %	0 %	0 %	0 %	294139737
16033	NC_014012	TGT	2	6	1132102	1132107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139738
16034	NC_014012	TCA	2	6	1132933	1132938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139739
16035	NC_014012	GAT	2	6	1133124	1133129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139739
16036	NC_014012	TGA	2	6	1133141	1133146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139739
16037	NC_014012	AG	3	6	1133163	1133168	50 %	0 %	50 %	0 %	294139739
16038	NC_014012	A	6	6	1133541	1133546	100 %	0 %	0 %	0 %	294139740
16039	NC_014012	AAT	2	6	1133549	1133554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139740
16040	NC_014012	CAA	2	6	1133577	1133582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139740
16041	NC_014012	TGG	2	6	1133624	1133629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139740
16042	NC_014012	ATC	2	6	1133702	1133707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139740
16043	NC_014012	AT	3	6	1133776	1133781	50 %	50 %	0 %	0 %	294139740
16044	NC_014012	CAT	2	6	1133795	1133800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139740
16045	NC_014012	GGT	2	6	1133834	1133839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139740
16046	NC_014012	AAAC	2	8	1133978	1133985	75 %	0 %	0 %	25 %	294139740
16047	NC_014012	AAG	2	6	1134086	1134091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139740
16048	NC_014012	TCTT	2	8	1134128	1134135	0 %	75 %	0 %	25 %	294139740
16049	NC_014012	CTGG	2	8	1134161	1134168	0 %	25 %	50 %	25 %	294139740
16050	NC_014012	TGT	2	6	1134207	1134212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139740
16051	NC_014012	TCTT	2	8	1134329	1134336	0 %	75 %	0 %	25 %	294139741
16052	NC_014012	T	6	6	1134397	1134402	0 %	100 %	0 %	0 %	294139741
16053	NC_014012	AGC	2	6	1134425	1134430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139741
16054	NC_014012	GCA	3	9	1134431	1134439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139741
16055	NC_014012	GC	3	6	1134578	1134583	0 %	0 %	50 %	50 %	294139741
16056	NC_014012	CTT	2	6	1134610	1134615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139741
16057	NC_014012	CAT	2	6	1134690	1134695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139741
16058	NC_014012	CTT	2	6	1134699	1134704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139741
16059	NC_014012	CTG	2	6	1134723	1134728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139741
16060	NC_014012	GGT	2	6	1135049	1135054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139742
16061	NC_014012	CAC	2	6	1135059	1135064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139742
16062	NC_014012	GCT	2	6	1135076	1135081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139742
16063	NC_014012	GTT	2	6	1135085	1135090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139742
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16065	NC_014012	TAGCA	2	10	1135205	1135214	40 %	20 %	20 %	20 %	294139742
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16067	NC_014012	A	6	6	1135267	1135272	100 %	0 %	0 %	0 %	294139742
16068	NC_014012	ATT	2	6	1135277	1135282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139742
16069	NC_014012	AG	3	6	1135698	1135703	50 %	0 %	50 %	0 %	294139743
16070	NC_014012	AT	3	6	1135781	1135786	50 %	50 %	0 %	0 %	294139743
16071	NC_014012	CAT	2	6	1135798	1135803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139743
16072	NC_014012	T	6	6	1135835	1135840	0 %	100 %	0 %	0 %	294139743
16073	NC_014012	GGA	2	6	1135981	1135986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139743
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16075	NC_014012	T	6	6	1136228	1136233	0 %	100 %	0 %	0 %	294139744
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16086	NC_014012	TTTA	2	8	1137138	1137145	25 %	75 %	0 %	0 %	294139745
16087	NC_014012	CTTT	2	8	1137160	1137167	0 %	75 %	0 %	25 %	294139745
16088	NC_014012	TTTG	2	8	1137182	1137189	0 %	75 %	25 %	0 %	294139745
16089	NC_014012	ATC	2	6	1137220	1137225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139745
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16097	NC_014012	ACTT	2	8	1137996	1138003	25 %	50 %	0 %	25 %	294139746
16098	NC_014012	TCGAG	2	10	1138041	1138050	20 %	20 %	40 %	20 %	294139746
16099	NC_014012	CTG	2	6	1138170	1138175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139746
16100	NC_014012	CAT	2	6	1138200	1138205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139746
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16102	NC_014012	TGG	2	6	1138524	1138529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139746
16103	NC_014012	TC	3	6	1138557	1138562	0 %	50 %	0 %	50 %	294139746
16104	NC_014012	CATTTC	2	12	1138570	1138581	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294139746
16105	NC_014012	ATG	2	6	1138635	1138640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139746
16106	NC_014012	TTC	2	6	1138787	1138792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139746
16107	NC_014012	CTC	2	6	1138840	1138845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139746
16108	NC_014012	AGC	2	6	1138872	1138877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139746
16109	NC_014012	TCA	2	6	1138906	1138911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139746
16110	NC_014012	T	6	6	1138915	1138920	0 %	100 %	0 %	0 %	294139746
16111	NC_014012	GTTG	2	8	1138952	1138959	0 %	50 %	50 %	0 %	294139746
16112	NC_014012	AGC	2	6	1138995	1139000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139746
16113	NC_014012	GAC	2	6	1139109	1139114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139746
16114	NC_014012	AGC	2	6	1139172	1139177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139746
16115	NC_014012	TGG	2	6	1139193	1139198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139746
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16117	NC_014012	AAG	2	6	1139276	1139281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139746
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16227	NC_014012	TCA	2	6	1145744	1145749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139751
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16230	NC_014012	TAAA	2	8	1145877	1145884	75 %	25 %	0 %	0 %	294139752
16231	NC_014012	G	6	6	1145939	1145944	0 %	0 %	100 %	0 %	294139752
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16233	NC_014012	GAT	3	9	1145977	1145985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139753
16234	NC_014012	ATT	2	6	1145990	1145995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139753
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16334	NC_014012	TC	3	6	1153372	1153377	0 %	50 %	0 %	50 %	294139760
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16337	NC_014012	AACC	2	8	1153426	1153433	50 %	0 %	0 %	50 %	294139760
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16341	NC_014012	ATG	2	6	1153551	1153556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139760
16342	NC_014012	GGCA	2	8	1153616	1153623	25 %	0 %	50 %	25 %	294139760
16343	NC_014012	GAT	2	6	1153634	1153639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139760
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16346	NC_014012	GAG	2	6	1153722	1153727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139760
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16348	NC_014012	GA	3	6	1153825	1153830	50 %	0 %	50 %	0 %	294139760
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