MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_014012	T	6	6	1098978	1098983	0 %	100 %	0 %	0 %	294139715
15502	NC_014012	AGA	2	6	1099053	1099058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139715
15503	NC_014012	CTT	2	6	1099082	1099087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139715
15504	NC_014012	TTA	2	6	1099133	1099138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139715
15505	NC_014012	ATT	2	6	1099159	1099164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139715
15506	NC_014012	TGGG	2	8	1099165	1099172	0 %	25 %	75 %	0 %	294139715
15507	NC_014012	CAG	2	6	1099288	1099293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139715
15508	NC_014012	AGGTG	2	10	1099473	1099482	20 %	20 %	60 %	0 %	294139715
15509	NC_014012	TTCTAT	2	12	1099695	1099706	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294139715
15510	NC_014012	TGC	2	6	1099719	1099724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139715
15511	NC_014012	TTG	2	6	1099784	1099789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139715
15512	NC_014012	ATCT	2	8	1099805	1099812	25 %	50 %	0 %	25 %	294139715
15513	NC_014012	TGA	2	6	1099878	1099883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139715
15514	NC_014012	TAT	2	6	1099965	1099970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139715
15515	NC_014012	GACT	2	8	1099979	1099986	25 %	25 %	25 %	25 %	294139715
15516	NC_014012	TAT	2	6	1100007	1100012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139715
15517	NC_014012	TTA	2	6	1100076	1100081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139715
15518	NC_014012	GCT	2	6	1100215	1100220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139715
15519	NC_014012	GAG	2	6	1100233	1100238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139715
15520	NC_014012	TTC	2	6	1100404	1100409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139716
15521	NC_014012	ATT	2	6	1100421	1100426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139716
15522	NC_014012	CTA	2	6	1100574	1100579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139716
15523	NC_014012	AAC	2	6	1100600	1100605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139716
15524	NC_014012	GTG	2	6	1100626	1100631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139716
15525	NC_014012	GTTA	2	8	1100675	1100682	25 %	50 %	25 %	0 %	294139716
15526	NC_014012	TAGCTT	2	12	1100713	1100724	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294139716
15527	NC_014012	GCA	2	6	1100792	1100797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139716
15528	NC_014012	TGC	2	6	1100827	1100832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139716
15529	NC_014012	TAT	2	6	1100909	1100914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139716
15530	NC_014012	GCC	2	6	1101021	1101026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139716
15531	NC_014012	CAA	3	9	1101138	1101146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139716
15532	NC_014012	GTG	2	6	1101261	1101266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139716
15533	NC_014012	GCA	2	6	1101275	1101280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139716
15534	NC_014012	TGA	2	6	1101299	1101304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139716
15535	NC_014012	ATT	2	6	1101414	1101419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139716
15536	NC_014012	AGC	2	6	1101463	1101468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139716
15537	NC_014012	CAT	2	6	1101512	1101517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139716
15538	NC_014012	CCG	2	6	1101562	1101567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139716
15539	NC_014012	CGA	2	6	1101585	1101590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139716
15540	NC_014012	AG	3	6	1101632	1101637	50 %	0 %	50 %	0 %	294139716
15541	NC_014012	ATA	2	6	1101724	1101729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139717
15542	NC_014012	TCA	2	6	1101771	1101776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139717
15543	NC_014012	ATT	2	6	1101961	1101966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139717
15544	NC_014012	GGAT	2	8	1102060	1102067	25 %	25 %	50 %	0 %	294139717
15545	NC_014012	CCT	2	6	1102162	1102167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139717
15546	NC_014012	ACT	2	6	1102298	1102303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139717
15547	NC_014012	GGT	2	6	1102353	1102358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139717
15548	NC_014012	CCA	2	6	1102364	1102369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139717
15549	NC_014012	GCG	2	6	1102392	1102397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139717
15550	NC_014012	TCG	2	6	1102460	1102465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139717
15551	NC_014012	ATC	2	6	1102511	1102516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139717
15552	NC_014012	ATC	2	6	1102527	1102532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139717
15553	NC_014012	ATG	2	6	1102540	1102545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139717
15554	NC_014012	GAT	2	6	1102584	1102589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139717
15555	NC_014012	CAATGG	2	12	1102610	1102621	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294139717
15556	NC_014012	GATT	2	8	1102625	1102632	25 %	50 %	25 %	0 %	294139717
15557	NC_014012	ATA	2	6	1102654	1102659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139717
15558	NC_014012	TGC	2	6	1102697	1102702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139717
15559	NC_014012	ATG	2	6	1102747	1102752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139717
15560	NC_014012	ATG	2	6	1102861	1102866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139717
15561	NC_014012	TCAA	2	8	1102876	1102883	50 %	25 %	0 %	25 %	294139717
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15566	NC_014012	GATA	2	8	1103153	1103160	50 %	25 %	25 %	0 %	294139717
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15570	NC_014012	AGCTG	2	10	1103774	1103783	20 %	20 %	40 %	20 %	294139717
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15573	NC_014012	T	6	6	1103952	1103957	0 %	100 %	0 %	0 %	294139717
15574	NC_014012	GAA	2	6	1103973	1103978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139717
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15584	NC_014012	GTA	2	6	1104178	1104183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139717
15585	NC_014012	GAT	2	6	1104243	1104248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139717
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15731	NC_014012	TAT	2	6	1112239	1112244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139720
15732	NC_014012	AAT	2	6	1112245	1112250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139720
15733	NC_014012	ATG	2	6	1112291	1112296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139720
15734	NC_014012	GTAATG	2	12	1112342	1112353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139720
15735	NC_014012	ACC	2	6	1112356	1112361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139720
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15737	NC_014012	GAA	2	6	1112472	1112477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139720
15738	NC_014012	GTG	2	6	1112485	1112490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139720
15739	NC_014012	ATTT	2	8	1112495	1112502	25 %	75 %	0 %	0 %	294139720
15740	NC_014012	ATT	2	6	1112652	1112657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139720
15741	NC_014012	T	6	6	1112690	1112695	0 %	100 %	0 %	0 %	294139720
15742	NC_014012	CTG	2	6	1112729	1112734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139720
15743	NC_014012	TGC	2	6	1112763	1112768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139720
15744	NC_014012	AT	3	6	1112769	1112774	50 %	50 %	0 %	0 %	294139720
15745	NC_014012	ATC	2	6	1112786	1112791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139720
15746	NC_014012	TGA	2	6	1112864	1112869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139720
15747	NC_014012	GGC	2	6	1112905	1112910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139720
15748	NC_014012	TAA	3	9	1112932	1112940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139720
15749	NC_014012	A	6	6	1113000	1113005	100 %	0 %	0 %	0 %	294139721
15750	NC_014012	TAGTC	2	10	1113040	1113049	20 %	40 %	20 %	20 %	294139721
15751	NC_014012	ATTAT	2	10	1113050	1113059	40 %	60 %	0 %	0 %	294139721
15752	NC_014012	ATT	2	6	1113221	1113226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139721
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15755	NC_014012	CTG	2	6	1113363	1113368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139721
15756	NC_014012	GCT	2	6	1113422	1113427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139721
15757	NC_014012	TGC	2	6	1113430	1113435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139721
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15766	NC_014012	CAAT	2	8	1113690	1113697	50 %	25 %	0 %	25 %	294139721
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15769	NC_014012	TTAC	2	8	1113915	1113922	25 %	50 %	0 %	25 %	294139721
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15775	NC_014012	TATT	2	8	1114146	1114153	25 %	75 %	0 %	0 %	294139721
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15801	NC_014012	GTA	2	6	1117105	1117110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139723
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15846	NC_014012	TGC	2	6	1119745	1119750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139726
15847	NC_014012	GTC	2	6	1119804	1119809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139726
15848	NC_014012	CGA	2	6	1119817	1119822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139726
15849	NC_014012	ATG	2	6	1119827	1119832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139726
15850	NC_014012	TGT	2	6	1119883	1119888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139726
15851	NC_014012	CGATG	2	10	1119889	1119898	20 %	20 %	40 %	20 %	294139726
15852	NC_014012	GGC	2	6	1119992	1119997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139726
15853	NC_014012	TGGGTG	2	12	1120044	1120055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139726
15854	NC_014012	TCCA	2	8	1120080	1120087	25 %	25 %	0 %	50 %	294139726
15855	NC_014012	GAA	2	6	1120139	1120144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139726
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15859	NC_014012	GCA	2	6	1120240	1120245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139726
15860	NC_014012	ATG	2	6	1120265	1120270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139726
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15862	NC_014012	CAT	2	6	1120363	1120368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139726
15863	NC_014012	GCTT	2	8	1120473	1120480	0 %	50 %	25 %	25 %	294139726
15864	NC_014012	AGA	2	6	1120500	1120505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139726
15865	NC_014012	TGA	2	6	1120506	1120511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139726
15866	NC_014012	AGA	2	6	1120512	1120517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139726
15867	NC_014012	GAA	2	6	1120537	1120542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139726
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15869	NC_014012	GGC	2	6	1120923	1120928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139727
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15875	NC_014012	CG	3	6	1121129	1121134	0 %	0 %	50 %	50 %	294139727
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15936	NC_014012	TCTTA	2	10	1125021	1125030	20 %	60 %	0 %	20 %	294139732
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15951	NC_014012	TG	3	6	1126325	1126330	0 %	50 %	50 %	0 %	294139733
15952	NC_014012	ATCT	2	8	1126369	1126376	25 %	50 %	0 %	25 %	294139733
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15955	NC_014012	TTG	2	6	1126505	1126510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139733
15956	NC_014012	GAAT	2	8	1126527	1126534	50 %	25 %	25 %	0 %	294139733
15957	NC_014012	GCG	2	6	1126573	1126578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139733
15958	NC_014012	CAGCT	2	10	1126610	1126619	20 %	20 %	20 %	40 %	294139733
15959	NC_014012	GTG	2	6	1126679	1126684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139733
15960	NC_014012	GCG	2	6	1126741	1126746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139733
15961	NC_014012	ATG	2	6	1126784	1126789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139733
15962	NC_014012	CAT	2	6	1126896	1126901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139733
15963	NC_014012	GCA	2	6	1127031	1127036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139733
15964	NC_014012	AGGGCA	2	12	1127042	1127053	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	294139733
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15966	NC_014012	TAT	2	6	1127208	1127213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139733
15967	NC_014012	ATT	2	6	1127231	1127236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139733
15968	NC_014012	CGA	2	6	1127295	1127300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139733
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15973	NC_014012	GCGCTA	2	12	1127659	1127670	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294139733
15974	NC_014012	TTG	2	6	1127761	1127766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139733
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15984	NC_014012	GAGTC	2	10	1128715	1128724	20 %	20 %	40 %	20 %	294139734
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15988	NC_014012	CAT	2	6	1128923	1128928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139734
15989	NC_014012	GCT	2	6	1128930	1128935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139734
15990	NC_014012	CG	3	6	1128939	1128944	0 %	0 %	50 %	50 %	294139734
15991	NC_014012	TGTAAG	2	12	1128960	1128971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139734
15992	NC_014012	CTA	2	6	1129054	1129059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139734
15993	NC_014012	CTAT	2	8	1129238	1129245	25 %	50 %	0 %	25 %	294139735
15994	NC_014012	AG	3	6	1129263	1129268	50 %	0 %	50 %	0 %	294139735
15995	NC_014012	TCT	2	6	1129329	1129334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139735
15996	NC_014012	TGA	2	6	1129395	1129400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139735
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16000	NC_014012	CTA	2	6	1129847	1129852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139736

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