MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

< Previous12...2627282930313233343536...142143Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_014012	TACC	2	8	1063684	1063691	25 %	25 %	0 %	50 %	294139686
15002	NC_014012	AGCG	2	8	1063753	1063760	25 %	0 %	50 %	25 %	294139686
15003	NC_014012	CT	3	6	1063787	1063792	0 %	50 %	0 %	50 %	294139686
15004	NC_014012	CCTA	2	8	1063820	1063827	25 %	25 %	0 %	50 %	294139686
15005	NC_014012	TCA	2	6	1064044	1064049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139686
15006	NC_014012	AGT	2	6	1064085	1064090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139686
15007	NC_014012	GTT	2	6	1064120	1064125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139686
15008	NC_014012	TAA	2	6	1064201	1064206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139686
15009	NC_014012	GCC	2	6	1064208	1064213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139686
15010	NC_014012	ACC	2	6	1064369	1064374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139686
15011	NC_014012	GGT	2	6	1064547	1064552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139686
15012	NC_014012	TCT	2	6	1064772	1064777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139686
15013	NC_014012	TA	3	6	1064890	1064895	50 %	50 %	0 %	0 %	294139686
15014	NC_014012	TGGC	2	8	1064902	1064909	0 %	25 %	50 %	25 %	294139686
15015	NC_014012	CTG	2	6	1064929	1064934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139686
15016	NC_014012	TC	3	6	1064961	1064966	0 %	50 %	0 %	50 %	294139686
15017	NC_014012	CAAG	2	8	1065035	1065042	50 %	0 %	25 %	25 %	294139686
15018	NC_014012	GT	3	6	1065049	1065054	0 %	50 %	50 %	0 %	294139686
15019	NC_014012	GAC	2	6	1065056	1065061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139686
15020	NC_014012	CGC	2	6	1065085	1065090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139686
15021	NC_014012	GCC	2	6	1065110	1065115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139686
15022	NC_014012	TGG	2	6	1065129	1065134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139686
15023	NC_014012	TGATC	2	10	1065160	1065169	20 %	40 %	20 %	20 %	294139686
15024	NC_014012	TTGC	2	8	1065240	1065247	0 %	50 %	25 %	25 %	294139686
15025	NC_014012	TTG	2	6	1065266	1065271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139686
15026	NC_014012	TCTT	2	8	1065319	1065326	0 %	75 %	0 %	25 %	294139686
15027	NC_014012	CTT	2	6	1065389	1065394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139686
15028	NC_014012	AGAT	2	8	1065406	1065413	50 %	25 %	25 %	0 %	294139686
15029	NC_014012	AGT	2	6	1065456	1065461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139686
15030	NC_014012	ATG	2	6	1065470	1065475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139686
15031	NC_014012	AGCC	2	8	1065641	1065648	25 %	0 %	25 %	50 %	294139686
15032	NC_014012	ATA	2	6	1065731	1065736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139686
15033	NC_014012	GTAAA	2	10	1065773	1065782	60 %	20 %	20 %	0 %	294139686
15034	NC_014012	CT	3	6	1065842	1065847	0 %	50 %	0 %	50 %	294139686
15035	NC_014012	GA	3	6	1065863	1065868	50 %	0 %	50 %	0 %	294139686
15036	NC_014012	TC	4	8	1065880	1065887	0 %	50 %	0 %	50 %	294139686
15037	NC_014012	GGTT	2	8	1065904	1065911	0 %	50 %	50 %	0 %	294139686
15038	NC_014012	TA	3	6	1065942	1065947	50 %	50 %	0 %	0 %	294139686
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15040	NC_014012	CTT	2	6	1066006	1066011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139686
15041	NC_014012	ATC	2	6	1066094	1066099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139686
15042	NC_014012	CAT	2	6	1066123	1066128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139686
15043	NC_014012	CCAT	2	8	1066171	1066178	25 %	25 %	0 %	50 %	294139686
15044	NC_014012	GAA	2	6	1066224	1066229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139686
15045	NC_014012	TCG	2	6	1066299	1066304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139686
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15051	NC_014012	CAT	2	6	1066877	1066882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139686
15052	NC_014012	AG	3	6	1066910	1066915	50 %	0 %	50 %	0 %	294139686
15053	NC_014012	TGC	2	6	1066950	1066955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139686
15054	NC_014012	GAC	2	6	1066981	1066986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139686
15055	NC_014012	GCCA	2	8	1067005	1067012	25 %	0 %	25 %	50 %	294139686
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15060	NC_014012	AGC	2	6	1067277	1067282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139686
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15064	NC_014012	CTTC	2	8	1068130	1068137	0 %	50 %	0 %	50 %	294139687
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15068	NC_014012	ATG	2	6	1068283	1068288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139687
15069	NC_014012	TG	3	6	1068342	1068347	0 %	50 %	50 %	0 %	294139687
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15077	NC_014012	ATATT	2	10	1068745	1068754	40 %	60 %	0 %	0 %	294139687
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15089	NC_014012	AT	4	8	1069645	1069652	50 %	50 %	0 %	0 %	294139689
15090	NC_014012	CTG	2	6	1069657	1069662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139689
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15101	NC_014012	TAC	2	6	1070721	1070726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139690
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15106	NC_014012	TGC	2	6	1070997	1071002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139690
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15109	NC_014012	TCTAA	2	10	1071374	1071383	40 %	40 %	0 %	20 %	294139691
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15236	NC_014012	TGG	2	6	1079527	1079532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139697
15237	NC_014012	CGC	2	6	1079534	1079539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139697
15238	NC_014012	ATC	2	6	1079670	1079675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139697
15239	NC_014012	ATC	2	6	1079760	1079765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139697
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15241	NC_014012	GCATT	2	10	1079848	1079857	20 %	40 %	20 %	20 %	294139697
15242	NC_014012	TGC	2	6	1079863	1079868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139697
15243	NC_014012	GT	3	6	1079884	1079889	0 %	50 %	50 %	0 %	294139697
15244	NC_014012	TTC	2	6	1079929	1079934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139697
15245	NC_014012	TG	3	6	1079977	1079982	0 %	50 %	50 %	0 %	294139697
15246	NC_014012	ATCTC	2	10	1080009	1080018	20 %	40 %	0 %	40 %	294139697
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15253	NC_014012	CTG	2	6	1080494	1080499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139698
15254	NC_014012	AT	3	6	1080619	1080624	50 %	50 %	0 %	0 %	294139699
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15262	NC_014012	CAG	2	6	1081226	1081231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139699
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15336	NC_014012	ATGGC	2	10	1086215	1086224	20 %	20 %	40 %	20 %	294139705
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15339	NC_014012	GGC	2	6	1086684	1086689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139706
15340	NC_014012	TATC	2	8	1086696	1086703	25 %	50 %	0 %	25 %	294139706
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15343	NC_014012	AAG	2	6	1086850	1086855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139706
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15347	NC_014012	CGAGCG	2	12	1087193	1087204	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	294139707
15348	NC_014012	CT	3	6	1087325	1087330	0 %	50 %	0 %	50 %	294139707
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15465	NC_014012	CGT	2	6	1096137	1096142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139714
15466	NC_014012	CAGA	2	8	1096144	1096151	50 %	0 %	25 %	25 %	294139714
15467	NC_014012	ACGC	2	8	1096188	1096195	25 %	0 %	25 %	50 %	294139714
15468	NC_014012	ACC	2	6	1096213	1096218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139714
15469	NC_014012	TTC	2	6	1096333	1096338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139714
15470	NC_014012	GCT	2	6	1096433	1096438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139714
15471	NC_014012	TAA	2	6	1096509	1096514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139714
15472	NC_014012	A	6	6	1096634	1096639	100 %	0 %	0 %	0 %	294139714
15473	NC_014012	TGA	2	6	1096712	1096717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139714
15474	NC_014012	TTC	2	6	1096789	1096794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139714
15475	NC_014012	AAT	2	6	1096807	1096812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139714
15476	NC_014012	TCA	2	6	1096830	1096835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139714
15477	NC_014012	TCA	2	6	1097979	1097984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139715
15478	NC_014012	AGC	2	6	1098002	1098007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139715
15479	NC_014012	TTG	2	6	1098058	1098063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139715
15480	NC_014012	GCG	2	6	1098064	1098069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139715
15481	NC_014012	AGC	2	6	1098092	1098097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139715
15482	NC_014012	TATC	2	8	1098104	1098111	25 %	50 %	0 %	25 %	294139715
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15484	NC_014012	TCA	2	6	1098187	1098192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139715
15485	NC_014012	TGA	2	6	1098222	1098227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139715
15486	NC_014012	ACA	2	6	1098228	1098233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139715
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15488	NC_014012	GC	3	6	1098293	1098298	0 %	0 %	50 %	50 %	294139715
15489	NC_014012	TGA	2	6	1098315	1098320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139715
15490	NC_014012	GCA	2	6	1098387	1098392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139715
15491	NC_014012	CTT	2	6	1098464	1098469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139715
15492	NC_014012	CTT	2	6	1098504	1098509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139715
15493	NC_014012	CAC	2	6	1098549	1098554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139715
15494	NC_014012	T	7	7	1098576	1098582	0 %	100 %	0 %	0 %	294139715
15495	NC_014012	GTG	2	6	1098586	1098591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139715
15496	NC_014012	AGG	2	6	1098609	1098614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139715
15497	NC_014012	CAGG	2	8	1098720	1098727	25 %	0 %	50 %	25 %	294139715
15498	NC_014012	TTCGTT	2	12	1098817	1098828	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	294139715
15499	NC_014012	TAC	2	6	1098847	1098852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139715
15500	NC_014012	ACG	2	6	1098930	1098935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139715

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