MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_014012	CAT	2	6	1032247	1032252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139654
14502	NC_014012	AGA	2	6	1032628	1032633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139655
14503	NC_014012	TTG	2	6	1032645	1032650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139655
14504	NC_014012	ATA	2	6	1032673	1032678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139655
14505	NC_014012	GCG	2	6	1032684	1032689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139655
14506	NC_014012	GAT	2	6	1032696	1032701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139655
14507	NC_014012	ATCGA	2	10	1032731	1032740	40 %	20 %	20 %	20 %	294139655
14508	NC_014012	GAT	2	6	1032794	1032799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139655
14509	NC_014012	GCT	2	6	1032805	1032810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139655
14510	NC_014012	TGA	2	6	1032850	1032855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139655
14511	NC_014012	GCT	2	6	1032879	1032884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139655
14512	NC_014012	GCT	3	9	1033013	1033021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139656
14513	NC_014012	CTC	2	6	1033022	1033027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139656
14514	NC_014012	TGG	2	6	1033078	1033083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139656
14515	NC_014012	TGGATC	2	12	1033192	1033203	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294139656
14516	NC_014012	ATG	2	6	1033213	1033218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139656
14517	NC_014012	ACTC	2	8	1033438	1033445	25 %	25 %	0 %	50 %	294139656
14518	NC_014012	ATCTT	2	10	1033593	1033602	20 %	60 %	0 %	20 %	294139657
14519	NC_014012	CTT	2	6	1033613	1033618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139657
14520	NC_014012	ATC	2	6	1033682	1033687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139657
14521	NC_014012	GCA	2	6	1033731	1033736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139657
14522	NC_014012	ATG	2	6	1033755	1033760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139657
14523	NC_014012	TGG	2	6	1033775	1033780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139657
14524	NC_014012	TCG	2	6	1033809	1033814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139657
14525	NC_014012	TGC	2	6	1033819	1033824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139657
14526	NC_014012	GGT	2	6	1033861	1033866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139657
14527	NC_014012	CGA	2	6	1033869	1033874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139657
14528	NC_014012	TGG	2	6	1033901	1033906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139657
14529	NC_014012	GAA	2	6	1033954	1033959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139657
14530	NC_014012	CGG	2	6	1034031	1034036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139657
14531	NC_014012	GC	3	6	1034069	1034074	0 %	0 %	50 %	50 %	294139657
14532	NC_014012	GTG	2	6	1034145	1034150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139657
14533	NC_014012	TTTC	2	8	1034190	1034197	0 %	75 %	0 %	25 %	294139657
14534	NC_014012	CGC	2	6	1034200	1034205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139657
14535	NC_014012	TG	4	8	1034295	1034302	0 %	50 %	50 %	0 %	294139657
14536	NC_014012	ATT	2	6	1034317	1034322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139657
14537	NC_014012	GT	3	6	1034405	1034410	0 %	50 %	50 %	0 %	294139658
14538	NC_014012	GTA	2	6	1034454	1034459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139658
14539	NC_014012	CAT	2	6	1034465	1034470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139658
14540	NC_014012	TC	3	6	1034580	1034585	0 %	50 %	0 %	50 %	294139658
14541	NC_014012	TGG	2	6	1034589	1034594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139658
14542	NC_014012	AGC	2	6	1034748	1034753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139658
14543	NC_014012	CGG	2	6	1034787	1034792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139658
14544	NC_014012	TAG	2	6	1034860	1034865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139658
14545	NC_014012	GAA	2	6	1034915	1034920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139658
14546	NC_014012	A	6	6	1034919	1034924	100 %	0 %	0 %	0 %	294139658
14547	NC_014012	AGC	2	6	1035000	1035005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139658
14548	NC_014012	CAAG	2	8	1035034	1035041	50 %	0 %	25 %	25 %	294139658
14549	NC_014012	TATC	2	8	1035100	1035107	25 %	50 %	0 %	25 %	294139658
14550	NC_014012	GAAAGA	2	12	1035115	1035126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139658
14551	NC_014012	TTA	2	6	1035158	1035163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139658
14552	NC_014012	AG	3	6	1035171	1035176	50 %	0 %	50 %	0 %	294139658
14553	NC_014012	GCT	2	6	1035217	1035222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139658
14554	NC_014012	AAG	2	6	1035266	1035271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139658
14555	NC_014012	GAA	2	6	1035325	1035330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139658
14556	NC_014012	ATG	2	6	1035556	1035561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139659
14557	NC_014012	TGT	2	6	1035572	1035577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139659
14558	NC_014012	AGT	2	6	1035640	1035645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139659
14559	NC_014012	ATT	2	6	1035686	1035691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139659
14560	NC_014012	CTA	2	6	1035864	1035869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139659
14561	NC_014012	CCT	2	6	1036036	1036041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139659
14562	NC_014012	GAT	2	6	1036186	1036191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139659
14563	NC_014012	ATCA	2	8	1036240	1036247	50 %	25 %	0 %	25 %	294139659
14564	NC_014012	CAT	2	6	1036284	1036289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139659
14565	NC_014012	TTA	2	6	1036373	1036378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139659
14566	NC_014012	ATAG	2	8	1036390	1036397	50 %	25 %	25 %	0 %	294139659
14567	NC_014012	ATG	2	6	1036409	1036414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139659
14568	NC_014012	CTG	2	6	1036417	1036422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139659
14569	NC_014012	CTT	2	6	1036760	1036765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139660
14570	NC_014012	AAG	3	9	1036768	1036776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139660
14571	NC_014012	AGC	2	6	1036829	1036834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139660
14572	NC_014012	AG	3	6	1036884	1036889	50 %	0 %	50 %	0 %	294139660
14573	NC_014012	AGA	2	6	1036898	1036903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139660
14574	NC_014012	TCT	2	6	1036941	1036946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139660
14575	NC_014012	TAG	2	6	1036973	1036978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139660
14576	NC_014012	ATC	2	6	1037001	1037006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139660
14577	NC_014012	T	6	6	1037012	1037017	0 %	100 %	0 %	0 %	294139660
14578	NC_014012	GAA	2	6	1037252	1037257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139661
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14580	NC_014012	TAGC	2	8	1037402	1037409	25 %	25 %	25 %	25 %	294139661
14581	NC_014012	GT	3	6	1037532	1037537	0 %	50 %	50 %	0 %	294139661
14582	NC_014012	CCATGA	2	12	1037666	1037677	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294139661
14583	NC_014012	TAGG	2	8	1037682	1037689	25 %	25 %	50 %	0 %	294139661
14584	NC_014012	TCT	2	6	1037690	1037695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139661
14585	NC_014012	GTAT	2	8	1037792	1037799	25 %	50 %	25 %	0 %	294139661
14586	NC_014012	TATC	2	8	1037805	1037812	25 %	50 %	0 %	25 %	294139661
14587	NC_014012	CAT	2	6	1038007	1038012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139661
14588	NC_014012	GCG	2	6	1038059	1038064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139661
14589	NC_014012	AGC	2	6	1038125	1038130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139661
14590	NC_014012	CGC	2	6	1038150	1038155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139661
14591	NC_014012	TCA	2	6	1038179	1038184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139661
14592	NC_014012	TCTT	2	8	1038288	1038295	0 %	75 %	0 %	25 %	294139661
14593	NC_014012	TTG	2	6	1038319	1038324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139661
14594	NC_014012	A	7	7	1038338	1038344	100 %	0 %	0 %	0 %	294139661
14595	NC_014012	TGA	2	6	1038365	1038370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139661
14596	NC_014012	TG	3	6	1038395	1038400	0 %	50 %	50 %	0 %	294139661
14597	NC_014012	ACC	2	6	1038407	1038412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139661
14598	NC_014012	CGC	2	6	1038462	1038467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139661
14599	NC_014012	GTAT	2	8	1038714	1038721	25 %	50 %	25 %	0 %	294139662
14600	NC_014012	T	6	6	1038728	1038733	0 %	100 %	0 %	0 %	294139662
14601	NC_014012	TGG	2	6	1038841	1038846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139662
14602	NC_014012	TAT	2	6	1038852	1038857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139662
14603	NC_014012	ATACCG	2	12	1038924	1038935	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294139662
14604	NC_014012	TGA	2	6	1038988	1038993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139662
14605	NC_014012	AGC	2	6	1039029	1039034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139662
14606	NC_014012	TCT	2	6	1039042	1039047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139662
14607	NC_014012	CTG	2	6	1039058	1039063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139662
14608	NC_014012	ATT	2	6	1039097	1039102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139662
14609	NC_014012	GAA	2	6	1039174	1039179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139662
14610	NC_014012	ACT	2	6	1039180	1039185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139662
14611	NC_014012	ACA	2	6	1039216	1039221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139662
14612	NC_014012	ATC	2	6	1039275	1039280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139662
14613	NC_014012	GCA	2	6	1039318	1039323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139662
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14615	NC_014012	GATT	2	8	1039410	1039417	25 %	50 %	25 %	0 %	294139662
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14844	NC_014012	CACTAA	2	12	1054309	1054320	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	294139676
14845	NC_014012	AC	3	6	1054322	1054327	50 %	0 %	0 %	50 %	294139676
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14848	NC_014012	CA	3	6	1054670	1054675	50 %	0 %	0 %	50 %	294139677
14849	NC_014012	TCC	2	6	1054786	1054791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139677
14850	NC_014012	CTGG	2	8	1054891	1054898	0 %	25 %	50 %	25 %	294139677
14851	NC_014012	TGC	2	6	1054909	1054914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139677
14852	NC_014012	ATG	2	6	1054955	1054960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139677
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14860	NC_014012	ATC	2	6	1055402	1055407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139677
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14866	NC_014012	TATCGC	2	12	1055524	1055535	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294139677
14867	NC_014012	AGAT	2	8	1055610	1055617	50 %	25 %	25 %	0 %	294139677
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14951	NC_014012	T	7	7	1060143	1060149	0 %	100 %	0 %	0 %	294139682
14952	NC_014012	CT	3	6	1060194	1060199	0 %	50 %	0 %	50 %	294139682
14953	NC_014012	GGCGA	3	15	1060204	1060218	20 %	0 %	60 %	20 %	294139682
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14956	NC_014012	CAT	2	6	1060242	1060247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139682
14957	NC_014012	GTT	2	6	1060446	1060451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139683
14958	NC_014012	GGC	2	6	1060518	1060523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139683
14959	NC_014012	AGC	2	6	1060539	1060544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139683
14960	NC_014012	TCA	2	6	1060639	1060644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139683
14961	NC_014012	AGC	2	6	1060665	1060670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139683
14962	NC_014012	T	6	6	1060680	1060685	0 %	100 %	0 %	0 %	294139683
14963	NC_014012	GCG	2	6	1060699	1060704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139683
14964	NC_014012	TGGC	2	8	1060708	1060715	0 %	25 %	50 %	25 %	294139683
14965	NC_014012	CAT	2	6	1060754	1060759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139683
14966	NC_014012	CGA	2	6	1060808	1060813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139683
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14968	NC_014012	TGA	2	6	1060835	1060840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139683
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14972	NC_014012	AGC	2	6	1060995	1061000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139683
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14988	NC_014012	GTC	2	6	1062226	1062231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139685
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14996	NC_014012	AT	3	6	1063350	1063355	50 %	50 %	0 %	0 %	294139686
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