MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014012	TAA	2	6	67438	67443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138834
1002	NC_014012	CTT	2	6	67551	67556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138834
1003	NC_014012	CTG	2	6	67574	67579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138834
1004	NC_014012	CAA	2	6	67581	67586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138834
1005	NC_014012	TCTT	2	8	67612	67619	0 %	75 %	0 %	25 %	294138834
1006	NC_014012	TTA	2	6	68042	68047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138835
1007	NC_014012	AAG	2	6	68114	68119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138835
1008	NC_014012	AT	3	6	68136	68141	50 %	50 %	0 %	0 %	294138835
1009	NC_014012	CATCT	2	10	68213	68222	20 %	40 %	0 %	40 %	294138835
1010	NC_014012	GGT	2	6	68426	68431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138835
1011	NC_014012	TGGT	2	8	68454	68461	0 %	50 %	50 %	0 %	294138835
1012	NC_014012	GAG	2	6	68540	68545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138835
1013	NC_014012	CT	3	6	68551	68556	0 %	50 %	0 %	50 %	294138835
1014	NC_014012	AGTTA	2	10	68617	68626	40 %	40 %	20 %	0 %	294138835
1015	NC_014012	TGC	2	6	68664	68669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138835
1016	NC_014012	GAA	2	6	68675	68680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138835
1017	NC_014012	AGC	2	6	68713	68718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138835
1018	NC_014012	TCT	2	6	68835	68840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138835
1019	NC_014012	TTA	2	6	68868	68873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138835
1020	NC_014012	TCA	2	6	69024	69029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138835
1021	NC_014012	GA	3	6	69038	69043	50 %	0 %	50 %	0 %	294138835
1022	NC_014012	AGA	2	6	69303	69308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138836
1023	NC_014012	TCAC	2	8	69373	69380	25 %	25 %	0 %	50 %	294138836
1024	NC_014012	TGT	2	6	69410	69415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138836
1025	NC_014012	CAA	2	6	69418	69423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138836
1026	NC_014012	TA	3	6	69439	69444	50 %	50 %	0 %	0 %	294138836
1027	NC_014012	GCTT	2	8	69606	69613	0 %	50 %	25 %	25 %	294138836
1028	NC_014012	AGTG	2	8	69642	69649	25 %	25 %	50 %	0 %	294138836
1029	NC_014012	GGCTC	2	10	69670	69679	0 %	20 %	40 %	40 %	294138836
1030	NC_014012	ATG	2	6	69698	69703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138836
1031	NC_014012	TATC	2	8	69741	69748	25 %	50 %	0 %	25 %	294138836
1032	NC_014012	GAA	2	6	69772	69777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138836
1033	NC_014012	CGAAA	2	10	69845	69854	60 %	0 %	20 %	20 %	294138836
1034	NC_014012	TTA	2	6	69920	69925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138836
1035	NC_014012	TCT	2	6	70011	70016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138836
1036	NC_014012	ATA	2	6	70054	70059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138836
1037	NC_014012	GAA	2	6	70060	70065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138836
1038	NC_014012	GAA	2	6	70093	70098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138836
1039	NC_014012	AGG	2	6	70121	70126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138836
1040	NC_014012	CAA	2	6	70184	70189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138836
1041	NC_014012	GAT	2	6	70192	70197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138836
1042	NC_014012	CTTGAA	2	12	70246	70257	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294138836
1043	NC_014012	GTA	2	6	70276	70281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138836
1044	NC_014012	GGT	2	6	70285	70290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138836
1045	NC_014012	TA	3	6	70291	70296	50 %	50 %	0 %	0 %	294138836
1046	NC_014012	TCA	2	6	70421	70426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138837
1047	NC_014012	TG	3	6	70498	70503	0 %	50 %	50 %	0 %	294138837
1048	NC_014012	TCT	2	6	70577	70582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138837
1049	NC_014012	ATCG	2	8	70632	70639	25 %	25 %	25 %	25 %	294138837
1050	NC_014012	TGA	2	6	70652	70657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138837
1051	NC_014012	ATCTT	2	10	70750	70759	20 %	60 %	0 %	20 %	294138837
1052	NC_014012	AGC	2	6	70762	70767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138837
1053	NC_014012	TTA	2	6	71090	71095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138838
1054	NC_014012	ATC	2	6	71201	71206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138838
1055	NC_014012	TGCTC	2	10	71211	71220	0 %	40 %	20 %	40 %	294138838
1056	NC_014012	GCT	2	6	71234	71239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138838
1057	NC_014012	AGT	2	6	71293	71298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138838
1058	NC_014012	TCA	2	6	71484	71489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138838
1059	NC_014012	ACC	2	6	71521	71526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138838
1060	NC_014012	GCC	2	6	71555	71560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138838
1061	NC_014012	TGA	2	6	71566	71571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138838
1062	NC_014012	AAAG	2	8	71654	71661	75 %	0 %	25 %	0 %	294138838
1063	NC_014012	TA	3	6	71696	71701	50 %	50 %	0 %	0 %	294138838
1064	NC_014012	AAC	2	6	71733	71738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138838
1065	NC_014012	CAT	2	6	71791	71796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138838
1066	NC_014012	ATT	2	6	71819	71824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138838
1067	NC_014012	TAA	2	6	71831	71836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138838
1068	NC_014012	AATA	2	8	71915	71922	75 %	25 %	0 %	0 %	294138838
1069	NC_014012	ATG	2	6	71936	71941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138838
1070	NC_014012	TCT	2	6	72003	72008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138838
1071	NC_014012	GCA	2	6	72057	72062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138838
1072	NC_014012	TAG	3	9	72278	72286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138838
1073	NC_014012	GTA	2	6	72467	72472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138838
1074	NC_014012	TAG	2	6	72624	72629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138838
1075	NC_014012	TGAG	2	8	72699	72706	25 %	25 %	50 %	0 %	294138838
1076	NC_014012	TGA	2	6	72778	72783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138838
1077	NC_014012	TGAGG	2	10	72786	72795	20 %	20 %	60 %	0 %	294138838
1078	NC_014012	TAC	2	6	72796	72801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138838
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1080	NC_014012	TGG	2	6	73103	73108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138839
1081	NC_014012	GGC	2	6	73496	73501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138839
1082	NC_014012	GAA	2	6	73523	73528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138839
1083	NC_014012	ATG	2	6	73761	73766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138840
1084	NC_014012	TGA	2	6	73861	73866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138840
1085	NC_014012	GGCCC	2	10	73911	73920	0 %	0 %	40 %	60 %	294138840
1086	NC_014012	TCA	2	6	73929	73934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138840
1087	NC_014012	CAA	2	6	74078	74083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138840
1088	NC_014012	GCA	3	9	74367	74375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138841
1089	NC_014012	GAA	2	6	74440	74445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138841
1090	NC_014012	GGT	2	6	74452	74457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138841
1091	NC_014012	TAA	2	6	74616	74621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138841
1092	NC_014012	TGG	2	6	74692	74697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138841
1093	NC_014012	TTA	2	6	74724	74729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138841
1094	NC_014012	TGA	2	6	74793	74798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138841
1095	NC_014012	AAG	2	6	74815	74820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138841
1096	NC_014012	TGA	2	6	74826	74831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138841
1097	NC_014012	GAT	2	6	74887	74892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138841
1098	NC_014012	AAG	2	6	74900	74905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138841
1099	NC_014012	GGTA	2	8	74937	74944	25 %	25 %	50 %	0 %	294138841
1100	NC_014012	CTT	2	6	74949	74954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138841
1101	NC_014012	CCG	2	6	75030	75035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138841
1102	NC_014012	TGG	2	6	75096	75101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138841
1103	NC_014012	AT	3	6	75150	75155	50 %	50 %	0 %	0 %	294138841
1104	NC_014012	AC	3	6	75158	75163	50 %	0 %	0 %	50 %	294138841
1105	NC_014012	GCTTT	2	10	75184	75193	0 %	60 %	20 %	20 %	294138841
1106	NC_014012	GA	3	6	75213	75218	50 %	0 %	50 %	0 %	294138841
1107	NC_014012	TTGG	2	8	75219	75226	0 %	50 %	50 %	0 %	294138841
1108	NC_014012	TAG	2	6	75235	75240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138841
1109	NC_014012	AT	3	6	75324	75329	50 %	50 %	0 %	0 %	294138842
1110	NC_014012	AC	3	6	75332	75337	50 %	0 %	0 %	50 %	294138842
1111	NC_014012	GCTTT	2	10	75358	75367	0 %	60 %	20 %	20 %	294138842
1112	NC_014012	CTGG	2	8	75393	75400	0 %	25 %	50 %	25 %	294138842
1113	NC_014012	AT	3	6	75503	75508	50 %	50 %	0 %	0 %	294138843
1114	NC_014012	AC	3	6	75511	75516	50 %	0 %	0 %	50 %	294138843
1115	NC_014012	GCTTT	2	10	75537	75546	0 %	60 %	20 %	20 %	294138843
1116	NC_014012	GA	3	6	75566	75571	50 %	0 %	50 %	0 %	294138843
1117	NC_014012	CTGG	2	8	75572	75579	0 %	25 %	50 %	25 %	294138843
1118	NC_014012	AGT	2	6	75589	75594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138843
1119	NC_014012	TGAC	2	8	75827	75834	25 %	25 %	25 %	25 %	294138844
1120	NC_014012	CA	3	6	75863	75868	50 %	0 %	0 %	50 %	294138844
1121	NC_014012	A	6	6	75959	75964	100 %	0 %	0 %	0 %	294138844
1122	NC_014012	TAA	2	6	75984	75989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138844
1123	NC_014012	ATTTA	2	10	76032	76041	40 %	60 %	0 %	0 %	294138844
1124	NC_014012	TGA	2	6	76044	76049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138844
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1126	NC_014012	GTG	2	6	76118	76123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138844
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1135	NC_014012	A	6	6	76481	76486	100 %	0 %	0 %	0 %	294138844
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1241	NC_014012	ATTA	2	8	96319	96326	50 %	50 %	0 %	0 %	294138853
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1247	NC_014012	ACG	2	6	96585	96590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138853
1248	NC_014012	TTCTGG	2	12	96676	96687	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	294138853
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1250	NC_014012	GGT	2	6	96753	96758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138853
1251	NC_014012	GTC	2	6	96782	96787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138853
1252	NC_014012	TAGC	2	8	96803	96810	25 %	25 %	25 %	25 %	294138853
1253	NC_014012	TCA	2	6	96811	96816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138853
1254	NC_014012	TGT	2	6	96904	96909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138853
1255	NC_014012	GTTG	2	8	97077	97084	0 %	50 %	50 %	0 %	294138853
1256	NC_014012	TTAGCC	2	12	97102	97113	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294138853
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1267	NC_014012	TGGG	2	8	97684	97691	0 %	25 %	75 %	0 %	294138853
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1361	NC_014012	TAGC	2	8	104512	104519	25 %	25 %	25 %	25 %	294138859
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1367	NC_014012	TTA	2	6	104634	104639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138859
1368	NC_014012	TCAA	2	8	104688	104695	50 %	25 %	0 %	25 %	294138859
1369	NC_014012	GCC	2	6	104888	104893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138859
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1372	NC_014012	CGA	2	6	105082	105087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138859
1373	NC_014012	CAT	2	6	105169	105174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138859
1374	NC_014012	ATAC	2	8	105192	105199	50 %	25 %	0 %	25 %	294138859
1375	NC_014012	GGC	2	6	105270	105275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138859
1376	NC_014012	TGG	2	6	105440	105445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138859
1377	NC_014012	AAT	2	6	105448	105453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138859
1378	NC_014012	AGG	2	6	105469	105474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138859
1379	NC_014012	CTA	2	6	105481	105486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138859
1380	NC_014012	A	7	7	105944	105950	100 %	0 %	0 %	0 %	294138860
1381	NC_014012	TGG	2	6	106219	106224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138860
1382	NC_014012	GGC	2	6	106456	106461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138860
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1385	NC_014012	GGC	2	6	106525	106530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138860
1386	NC_014012	GAA	2	6	106570	106575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138860
1387	NC_014012	GAT	2	6	106585	106590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138860
1388	NC_014012	GA	3	6	106596	106601	50 %	0 %	50 %	0 %	294138860
1389	NC_014012	ATCA	2	8	106812	106819	50 %	25 %	0 %	25 %	294138861
1390	NC_014012	CGA	2	6	106835	106840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138861
1391	NC_014012	GATA	2	8	106869	106876	50 %	25 %	25 %	0 %	294138861
1392	NC_014012	TGG	2	6	106935	106940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138861
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1400	NC_014012	A	6	6	107244	107249	100 %	0 %	0 %	0 %	294138861
1401	NC_014012	GCT	2	6	107255	107260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138861
1402	NC_014012	TA	3	6	107263	107268	50 %	50 %	0 %	0 %	294138861
1403	NC_014012	TAA	2	6	107351	107356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138861
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1405	NC_014012	AGGG	2	8	107374	107381	25 %	0 %	75 %	0 %	294138861
1406	NC_014012	AGCTTA	2	12	107395	107406	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294138861
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1410	NC_014012	CGCT	2	8	107595	107602	0 %	25 %	25 %	50 %	294138861
1411	NC_014012	GCCT	2	8	107612	107619	0 %	25 %	25 %	50 %	294138861
1412	NC_014012	CAT	2	6	107708	107713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138862
1413	NC_014012	GCT	2	6	107751	107756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138862
1414	NC_014012	AAT	2	6	107778	107783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138862
1415	NC_014012	ATTG	2	8	107933	107940	25 %	50 %	25 %	0 %	294138862
1416	NC_014012	TGA	2	6	108134	108139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138863
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1424	NC_014012	ATA	2	6	109279	109284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138864
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1481	NC_014012	TCA	2	6	112168	112173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138867
1482	NC_014012	CGG	2	6	112230	112235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138867
1483	NC_014012	GCG	2	6	112295	112300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138867
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1485	NC_014012	A	6	6	112401	112406	100 %	0 %	0 %	0 %	294138867
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1489	NC_014012	AGCC	2	8	112770	112777	25 %	0 %	25 %	50 %	294138867
1490	NC_014012	TCG	2	6	112797	112802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138867
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1492	NC_014012	TAAG	2	8	112902	112909	50 %	25 %	25 %	0 %	294138867
1493	NC_014012	GC	3	6	112977	112982	0 %	0 %	50 %	50 %	294138867
1494	NC_014012	TTG	2	6	113210	113215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138868
1495	NC_014012	TCA	2	6	113306	113311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138868
1496	NC_014012	TGG	2	6	113363	113368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138868
1497	NC_014012	CTG	2	6	113401	113406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138868
1498	NC_014012	GTCA	2	8	113407	113414	25 %	25 %	25 %	25 %	294138868
1499	NC_014012	CTT	2	6	113418	113423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138868
1500	NC_014012	GGC	2	6	113512	113517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138868

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