MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014012	TTG	2	6	998290	998295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139630
14002	NC_014012	TGAC	2	8	998356	998363	25 %	25 %	25 %	25 %	294139630
14003	NC_014012	AGC	2	6	998422	998427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139630
14004	NC_014012	TGA	2	6	998498	998503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139630
14005	NC_014012	CAT	2	6	998668	998673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139630
14006	NC_014012	GCC	2	6	999024	999029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139630
14007	NC_014012	GGGT	2	8	999091	999098	0 %	25 %	75 %	0 %	294139630
14008	NC_014012	GTCA	2	8	999149	999156	25 %	25 %	25 %	25 %	294139630
14009	NC_014012	GGCT	2	8	999209	999216	0 %	25 %	50 %	25 %	294139630
14010	NC_014012	TCT	2	6	999244	999249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139630
14011	NC_014012	TAGTGC	2	12	999389	999400	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294139630
14012	NC_014012	AGA	2	6	999521	999526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139630
14013	NC_014012	ATG	2	6	999559	999564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139630
14014	NC_014012	CTTG	2	8	999617	999624	0 %	50 %	25 %	25 %	294139630
14015	NC_014012	CA	3	6	999629	999634	50 %	0 %	0 %	50 %	294139630
14016	NC_014012	ATGG	2	8	999852	999859	25 %	25 %	50 %	0 %	294139630
14017	NC_014012	ATT	2	6	999891	999896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139630
14018	NC_014012	TTG	2	6	999937	999942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139630
14019	NC_014012	G	6	6	1000125	1000130	0 %	0 %	100 %	0 %	294139630
14020	NC_014012	GGT	2	6	1000202	1000207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139630
14021	NC_014012	TAA	3	9	1000268	1000276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139630
14022	NC_014012	AG	3	6	1000369	1000374	50 %	0 %	50 %	0 %	294139630
14023	NC_014012	CTG	2	6	1000432	1000437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139630
14024	NC_014012	GCAT	2	8	1000474	1000481	25 %	25 %	25 %	25 %	294139630
14025	NC_014012	GAT	2	6	1000605	1000610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139630
14026	NC_014012	GAC	2	6	1000652	1000657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139630
14027	NC_014012	CGG	2	6	1000667	1000672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139630
14028	NC_014012	TAC	2	6	1000742	1000747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139630
14029	NC_014012	CAG	2	6	1000809	1000814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139630
14030	NC_014012	ATG	2	6	1000864	1000869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139630
14031	NC_014012	ATGGAG	2	12	1000957	1000968	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	294139630
14032	NC_014012	TGA	2	6	1001006	1001011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139630
14033	NC_014012	TTA	2	6	1001016	1001021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139630
14034	NC_014012	AC	3	6	1001035	1001040	50 %	0 %	0 %	50 %	294139630
14035	NC_014012	AGT	2	6	1001166	1001171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139630
14036	NC_014012	GTAG	2	8	1001220	1001227	25 %	25 %	50 %	0 %	294139630
14037	NC_014012	TAGG	2	8	1001355	1001362	25 %	25 %	50 %	0 %	294139631
14038	NC_014012	ATC	2	6	1001384	1001389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139631
14039	NC_014012	AAT	2	6	1001393	1001398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139631
14040	NC_014012	AGAC	2	8	1001429	1001436	50 %	0 %	25 %	25 %	294139631
14041	NC_014012	AGT	2	6	1001516	1001521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139631
14042	NC_014012	GGC	2	6	1001560	1001565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139631
14043	NC_014012	GAC	2	6	1001605	1001610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139631
14044	NC_014012	GATA	2	8	1001613	1001620	50 %	25 %	25 %	0 %	294139631
14045	NC_014012	A	6	6	1001647	1001652	100 %	0 %	0 %	0 %	294139631
14046	NC_014012	CAA	2	6	1001664	1001669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139631
14047	NC_014012	A	6	6	1001755	1001760	100 %	0 %	0 %	0 %	294139631
14048	NC_014012	GAGT	2	8	1001763	1001770	25 %	25 %	50 %	0 %	294139631
14049	NC_014012	A	7	7	1001843	1001849	100 %	0 %	0 %	0 %	294139631
14050	NC_014012	AGT	2	6	1001907	1001912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139632
14051	NC_014012	A	6	6	1001954	1001959	100 %	0 %	0 %	0 %	294139632
14052	NC_014012	GCA	2	6	1001991	1001996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139632
14053	NC_014012	GAT	2	6	1002055	1002060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139632
14054	NC_014012	ACC	2	6	1002070	1002075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139632
14055	NC_014012	CCTGAA	2	12	1002081	1002092	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294139632
14056	NC_014012	AT	4	8	1002116	1002123	50 %	50 %	0 %	0 %	294139632
14057	NC_014012	GTT	2	6	1002146	1002151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139632
14058	NC_014012	CAT	2	6	1002217	1002222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139632
14059	NC_014012	CTTTT	2	10	1002292	1002301	0 %	80 %	0 %	20 %	294139632
14060	NC_014012	TGGTT	2	10	1002337	1002346	0 %	60 %	40 %	0 %	294139632
14061	NC_014012	TAA	2	6	1002356	1002361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139632
14062	NC_014012	T	6	6	1002421	1002426	0 %	100 %	0 %	0 %	294139632
14063	NC_014012	ATC	2	6	1002458	1002463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139632
14064	NC_014012	AG	3	6	1002508	1002513	50 %	0 %	50 %	0 %	294139632
14065	NC_014012	TTAATT	2	12	1002525	1002536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139632
14066	NC_014012	TGT	2	6	1002541	1002546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139632
14067	NC_014012	AAAC	2	8	1002553	1002560	75 %	0 %	0 %	25 %	294139632
14068	NC_014012	TAT	2	6	1002589	1002594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139632
14069	NC_014012	CT	3	6	1002597	1002602	0 %	50 %	0 %	50 %	294139632
14070	NC_014012	AATT	2	8	1002604	1002611	50 %	50 %	0 %	0 %	294139632
14071	NC_014012	AGG	2	6	1002620	1002625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139632
14072	NC_014012	TCA	2	6	1002652	1002657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139632
14073	NC_014012	T	7	7	1002718	1002724	0 %	100 %	0 %	0 %	294139632
14074	NC_014012	AGCC	2	8	1002730	1002737	25 %	0 %	25 %	50 %	294139632
14075	NC_014012	TTTG	2	8	1002820	1002827	0 %	75 %	25 %	0 %	294139632
14076	NC_014012	AGTC	2	8	1002881	1002888	25 %	25 %	25 %	25 %	294139632
14077	NC_014012	T	6	6	1002899	1002904	0 %	100 %	0 %	0 %	294139632
14078	NC_014012	TAT	2	6	1002925	1002930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139632
14079	NC_014012	GCT	2	6	1002940	1002945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139632
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14081	NC_014012	CTAT	2	8	1003495	1003502	25 %	50 %	0 %	25 %	294139633
14082	NC_014012	CTGC	2	8	1003505	1003512	0 %	25 %	25 %	50 %	294139633
14083	NC_014012	TCA	2	6	1003586	1003591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139633
14084	NC_014012	CCA	2	6	1003599	1003604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139633
14085	NC_014012	TGA	2	6	1003637	1003642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139633
14086	NC_014012	TGAAA	2	10	1003696	1003705	60 %	20 %	20 %	0 %	294139633
14087	NC_014012	CT	3	6	1003711	1003716	0 %	50 %	0 %	50 %	294139633
14088	NC_014012	CCACC	2	10	1003796	1003805	20 %	0 %	0 %	80 %	294139633
14089	NC_014012	AAC	2	6	1003815	1003820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139633
14090	NC_014012	AAT	2	6	1003853	1003858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139633
14091	NC_014012	TTC	2	6	1003863	1003868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139633
14092	NC_014012	T	7	7	1003965	1003971	0 %	100 %	0 %	0 %	294139634
14093	NC_014012	ATT	2	6	1003987	1003992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139634
14094	NC_014012	ATG	2	6	1004033	1004038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139634
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14097	NC_014012	GAC	2	6	1004182	1004187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139635
14098	NC_014012	ATG	2	6	1004189	1004194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139635
14099	NC_014012	TCA	2	6	1004201	1004206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139635
14100	NC_014012	TGA	2	6	1004445	1004450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139635
14101	NC_014012	TTG	2	6	1004543	1004548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139635
14102	NC_014012	TTG	2	6	1004570	1004575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139635
14103	NC_014012	TGT	2	6	1004603	1004608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139635
14104	NC_014012	GGT	2	6	1005058	1005063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139636
14105	NC_014012	TG	5	10	1005115	1005124	0 %	50 %	50 %	0 %	294139636
14106	NC_014012	TCT	2	6	1005175	1005180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139636
14107	NC_014012	TG	3	6	1005199	1005204	0 %	50 %	50 %	0 %	294139636
14108	NC_014012	CTT	3	9	1005208	1005216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139636
14109	NC_014012	GCT	2	6	1005264	1005269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139636
14110	NC_014012	AT	3	6	1005363	1005368	50 %	50 %	0 %	0 %	294139636
14111	NC_014012	GCA	2	6	1005378	1005383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139636
14112	NC_014012	TTG	2	6	1005431	1005436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139636
14113	NC_014012	TTA	2	6	1005437	1005442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139636
14114	NC_014012	TGCT	2	8	1005492	1005499	0 %	50 %	25 %	25 %	294139636
14115	NC_014012	TCT	2	6	1005544	1005549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139636
14116	NC_014012	TCT	2	6	1005588	1005593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139636
14117	NC_014012	AGC	2	6	1005760	1005765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139636
14118	NC_014012	TAA	2	6	1005850	1005855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139636
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14219	NC_014012	TGCT	2	8	1013534	1013541	0 %	50 %	25 %	25 %	294139644
14220	NC_014012	CCG	2	6	1013588	1013593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139644
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14222	NC_014012	TAGG	2	8	1013725	1013732	25 %	25 %	50 %	0 %	294139644
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14224	NC_014012	TAG	3	9	1013756	1013764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139644
14225	NC_014012	GA	3	6	1013847	1013852	50 %	0 %	50 %	0 %	294139644
14226	NC_014012	TGG	2	6	1013913	1013918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139644
14227	NC_014012	TTA	2	6	1014011	1014016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139644
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14229	NC_014012	GTA	2	6	1014060	1014065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139644
14230	NC_014012	T	6	6	1014238	1014243	0 %	100 %	0 %	0 %	294139644
14231	NC_014012	GGT	2	6	1014357	1014362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139644
14232	NC_014012	TC	3	6	1014467	1014472	0 %	50 %	0 %	50 %	294139644
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14234	NC_014012	TTG	2	6	1014508	1014513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139644
14235	NC_014012	CCG	2	6	1014542	1014547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139644
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14265	NC_014012	CTG	2	6	1016970	1016975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139645
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14351	NC_014012	TCA	2	6	1021968	1021973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139647
14352	NC_014012	GTA	2	6	1021991	1021996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139647
14353	NC_014012	CTG	2	6	1021998	1022003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139647
14354	NC_014012	ATCAAA	2	12	1022027	1022038	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294139647
14355	NC_014012	TCT	2	6	1022061	1022066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139647
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14357	NC_014012	GAT	2	6	1022363	1022368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139647
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14370	NC_014012	TGG	2	6	1022892	1022897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139647
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14465	NC_014012	GTT	2	6	1030107	1030112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139652
14466	NC_014012	GC	3	6	1030134	1030139	0 %	0 %	50 %	50 %	294139652
14467	NC_014012	ACG	2	6	1030181	1030186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139652
14468	NC_014012	ATT	2	6	1030224	1030229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139652
14469	NC_014012	ATG	2	6	1030605	1030610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139653
14470	NC_014012	CA	3	6	1030631	1030636	50 %	0 %	0 %	50 %	294139653
14471	NC_014012	TA	3	6	1030638	1030643	50 %	50 %	0 %	0 %	294139653
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14475	NC_014012	TG	3	6	1030829	1030834	0 %	50 %	50 %	0 %	294139653
14476	NC_014012	CAT	2	6	1030880	1030885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139653
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14490	NC_014012	TCTT	2	8	1031681	1031688	0 %	75 %	0 %	25 %	294139654
14491	NC_014012	TTC	2	6	1031707	1031712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139654
14492	NC_014012	TGA	2	6	1031748	1031753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139654
14493	NC_014012	GAT	2	6	1031782	1031787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139654
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14497	NC_014012	AT	3	6	1031988	1031993	50 %	50 %	0 %	0 %	294139654
14498	NC_014012	AGC	2	6	1032106	1032111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139654
14499	NC_014012	TG	3	6	1032167	1032172	0 %	50 %	50 %	0 %	294139654
14500	NC_014012	AGCC	2	8	1032225	1032232	25 %	0 %	25 %	50 %	294139654

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