MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

< Previous12...2324252627282930313233...142143Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_014012	TCA	2	6	963204	963209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139600
13503	NC_014012	TGA	2	6	963271	963276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139600
13504	NC_014012	TCA	2	6	963286	963291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139600
13505	NC_014012	AGA	3	9	963310	963318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139600
13506	NC_014012	TTC	2	6	963378	963383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139600
13507	NC_014012	GCCA	2	8	963385	963392	25 %	0 %	25 %	50 %	294139600
13508	NC_014012	CAT	2	6	963439	963444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139600
13509	NC_014012	GTC	2	6	963467	963472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139600
13510	NC_014012	TCG	2	6	963501	963506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139600
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13512	NC_014012	CTG	2	6	963629	963634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139600
13513	NC_014012	ATAC	2	8	963700	963707	50 %	25 %	0 %	25 %	294139600
13514	NC_014012	AGTA	2	8	963716	963723	50 %	25 %	25 %	0 %	294139600
13515	NC_014012	ATCT	2	8	963779	963786	25 %	50 %	0 %	25 %	294139600
13516	NC_014012	GAT	2	6	963818	963823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139600
13517	NC_014012	CAGG	2	8	963865	963872	25 %	0 %	50 %	25 %	294139600
13518	NC_014012	TGT	2	6	963955	963960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139600
13519	NC_014012	CA	3	6	964025	964030	50 %	0 %	0 %	50 %	294139600
13520	NC_014012	TCG	2	6	964059	964064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139600
13521	NC_014012	TCA	2	6	964134	964139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139600
13522	NC_014012	TGC	2	6	964264	964269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139600
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13525	NC_014012	CTT	2	6	964558	964563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139600
13526	NC_014012	CAAC	2	8	964582	964589	50 %	0 %	0 %	50 %	294139600
13527	NC_014012	TACC	2	8	964618	964625	25 %	25 %	0 %	50 %	294139600
13528	NC_014012	TGG	2	6	964727	964732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139600
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13532	NC_014012	CAAA	2	8	964869	964876	75 %	0 %	0 %	25 %	294139601
13533	NC_014012	GTT	2	6	964885	964890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139601
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13536	NC_014012	GCT	3	9	965221	965229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139601
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13539	NC_014012	AT	3	6	965784	965789	50 %	50 %	0 %	0 %	294139603
13540	NC_014012	GCAC	2	8	965804	965811	25 %	0 %	25 %	50 %	294139603
13541	NC_014012	AT	3	6	965845	965850	50 %	50 %	0 %	0 %	294139603
13542	NC_014012	TGT	2	6	965852	965857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139603
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13549	NC_014012	TG	3	6	966919	966924	0 %	50 %	50 %	0 %	294139604
13550	NC_014012	TTG	2	6	966951	966956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139604
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13552	NC_014012	TGC	2	6	967082	967087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139604
13553	NC_014012	A	7	7	967116	967122	100 %	0 %	0 %	0 %	294139604
13554	NC_014012	CTG	2	6	967158	967163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139604
13555	NC_014012	AT	3	6	967190	967195	50 %	50 %	0 %	0 %	294139604
13556	NC_014012	AGC	2	6	967197	967202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139604
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13564	NC_014012	GCC	2	6	967392	967397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139604
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13594	NC_014012	CTGA	2	8	969371	969378	25 %	25 %	25 %	25 %	294139604
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13599	NC_014012	TA	3	6	969452	969457	50 %	50 %	0 %	0 %	294139604
13600	NC_014012	GGT	2	6	969504	969509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139604
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13613	NC_014012	ATGA	2	8	971188	971195	50 %	25 %	25 %	0 %	294139607
13614	NC_014012	AG	3	6	971220	971225	50 %	0 %	50 %	0 %	294139607
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13980	NC_014012	GGA	2	6	996588	996593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139630
13981	NC_014012	CAG	2	6	996651	996656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139630
13982	NC_014012	TGC	2	6	996698	996703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139630
13983	NC_014012	GTT	2	6	996915	996920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139630
13984	NC_014012	GAAT	2	8	996934	996941	50 %	25 %	25 %	0 %	294139630
13985	NC_014012	CTG	2	6	996970	996975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139630
13986	NC_014012	TC	3	6	997004	997009	0 %	50 %	0 %	50 %	294139630
13987	NC_014012	TAC	2	6	997320	997325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139630
13988	NC_014012	CAC	2	6	997337	997342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139630
13989	NC_014012	ATG	2	6	997354	997359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139630
13990	NC_014012	GAT	2	6	997374	997379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139630
13991	NC_014012	TTG	2	6	997396	997401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139630
13992	NC_014012	GGGC	2	8	997415	997422	0 %	0 %	75 %	25 %	294139630
13993	NC_014012	GTG	2	6	997492	997497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139630
13994	NC_014012	CTTG	2	8	997622	997629	0 %	50 %	25 %	25 %	294139630
13995	NC_014012	AGT	2	6	997641	997646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139630
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13998	NC_014012	TCTG	2	8	997772	997779	0 %	50 %	25 %	25 %	294139630
13999	NC_014012	TCAAA	2	10	998034	998043	60 %	20 %	0 %	20 %	294139630
14000	NC_014012	TCT	2	6	998188	998193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139630

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