MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_014012	T	6	6	928771	928776	0 %	100 %	0 %	0 %	294139565
13003	NC_014012	CTG	2	6	928841	928846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139565
13004	NC_014012	GGC	2	6	928848	928853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139565
13005	NC_014012	AGT	2	6	928903	928908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139565
13006	NC_014012	CGG	2	6	928925	928930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139565
13007	NC_014012	ATC	2	6	928999	929004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139565
13008	NC_014012	CAA	2	6	929087	929092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139565
13009	NC_014012	AGCT	2	8	929106	929113	25 %	25 %	25 %	25 %	294139565
13010	NC_014012	TTA	2	6	929137	929142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139565
13011	NC_014012	TTA	2	6	929146	929151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139565
13012	NC_014012	T	7	7	929175	929181	0 %	100 %	0 %	0 %	294139565
13013	NC_014012	GTATG	2	10	929182	929191	20 %	40 %	40 %	0 %	294139565
13014	NC_014012	CCA	2	6	929192	929197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139565
13015	NC_014012	GTA	2	6	929273	929278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139565
13016	NC_014012	TG	3	6	929281	929286	0 %	50 %	50 %	0 %	294139565
13017	NC_014012	AG	3	6	929314	929319	50 %	0 %	50 %	0 %	294139565
13018	NC_014012	CTA	2	6	929333	929338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139565
13019	NC_014012	AGTAA	2	10	929341	929350	60 %	20 %	20 %	0 %	294139565
13020	NC_014012	CATT	2	8	929384	929391	25 %	50 %	0 %	25 %	294139565
13021	NC_014012	T	6	6	929548	929553	0 %	100 %	0 %	0 %	294139566
13022	NC_014012	T	6	6	929570	929575	0 %	100 %	0 %	0 %	294139566
13023	NC_014012	GAT	2	6	929603	929608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139566
13024	NC_014012	CAA	2	6	929614	929619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139566
13025	NC_014012	GT	4	8	929695	929702	0 %	50 %	50 %	0 %	294139566
13026	NC_014012	ATC	2	6	929757	929762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139566
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13028	NC_014012	GGGA	2	8	929991	929998	25 %	0 %	75 %	0 %	294139566
13029	NC_014012	AGCC	2	8	930061	930068	25 %	0 %	25 %	50 %	294139566
13030	NC_014012	ACC	2	6	930181	930186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139566
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13032	NC_014012	AAC	2	6	930329	930334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139566
13033	NC_014012	CAT	2	6	930447	930452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139567
13034	NC_014012	TC	3	6	930552	930557	0 %	50 %	0 %	50 %	294139567
13035	NC_014012	CGA	2	6	930558	930563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139567
13036	NC_014012	GGC	2	6	930618	930623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139567
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13039	NC_014012	GAT	2	6	930701	930706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139567
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13041	NC_014012	CTT	2	6	930882	930887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139568
13042	NC_014012	ATG	2	6	930947	930952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139568
13043	NC_014012	TCA	2	6	930979	930984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139568
13044	NC_014012	ACC	2	6	931252	931257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139568
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13051	NC_014012	TTTA	2	8	931724	931731	25 %	75 %	0 %	0 %	294139569
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13053	NC_014012	CATA	2	8	932067	932074	50 %	25 %	0 %	25 %	294139569
13054	NC_014012	TAT	2	6	932129	932134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139569
13055	NC_014012	GGT	2	6	932189	932194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139569
13056	NC_014012	CAT	2	6	932228	932233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139569
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13058	NC_014012	CCTG	2	8	932295	932302	0 %	25 %	25 %	50 %	294139569
13059	NC_014012	T	7	7	932361	932367	0 %	100 %	0 %	0 %	294139569
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13069	NC_014012	TGA	2	6	933111	933116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139570
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13074	NC_014012	ACG	2	6	933343	933348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139570
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13103	NC_014012	TCT	3	9	935328	935336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139571
13104	NC_014012	TTTC	2	8	935379	935386	0 %	75 %	0 %	25 %	294139571
13105	NC_014012	GTT	2	6	935465	935470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139571
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13109	NC_014012	TGG	2	6	935746	935751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139571
13110	NC_014012	CTAT	2	8	935889	935896	25 %	50 %	0 %	25 %	294139571
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13121	NC_014012	TGC	2	6	936961	936966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139572
13122	NC_014012	CAT	2	6	937058	937063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139572
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13124	NC_014012	TGAT	2	8	937227	937234	25 %	50 %	25 %	0 %	294139572
13125	NC_014012	ATG	2	6	937266	937271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139572
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13127	NC_014012	GCCT	2	8	937483	937490	0 %	25 %	25 %	50 %	294139572
13128	NC_014012	GAT	2	6	937620	937625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139573
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13153	NC_014012	GCCT	2	8	939048	939055	0 %	25 %	25 %	50 %	294139574
13154	NC_014012	GAT	2	6	939061	939066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139574
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13228	NC_014012	ATCA	2	8	943984	943991	50 %	25 %	0 %	25 %	294139580
13229	NC_014012	TGAG	2	8	944035	944042	25 %	25 %	50 %	0 %	294139580
13230	NC_014012	CAC	2	6	944060	944065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139580
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13232	NC_014012	TCT	3	9	944210	944218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139580
13233	NC_014012	TCA	2	6	944238	944243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139580
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13238	NC_014012	TGA	2	6	944647	944652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139581
13239	NC_014012	TA	4	8	944704	944711	50 %	50 %	0 %	0 %	294139581
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13477	NC_014012	CAGC	2	8	960976	960983	25 %	0 %	25 %	50 %	294139599
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13480	NC_014012	ATG	2	6	961387	961392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139599
13481	NC_014012	GGC	2	6	961539	961544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139599
13482	NC_014012	GTCAT	2	10	961559	961568	20 %	40 %	20 %	20 %	294139599
13483	NC_014012	TCA	2	6	961576	961581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139599
13484	NC_014012	AG	3	6	962066	962071	50 %	0 %	50 %	0 %	294139600
13485	NC_014012	CAG	2	6	962098	962103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139600
13486	NC_014012	CTT	2	6	962134	962139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139600
13487	NC_014012	AGC	2	6	962172	962177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139600
13488	NC_014012	TCG	3	9	962220	962228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139600
13489	NC_014012	GAA	2	6	962267	962272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139600
13490	NC_014012	CGC	2	6	962314	962319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139600
13491	NC_014012	GTA	2	6	962320	962325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139600
13492	NC_014012	TGA	2	6	962386	962391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139600
13493	NC_014012	CAT	2	6	962537	962542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139600
13494	NC_014012	TTAG	2	8	962637	962644	25 %	50 %	25 %	0 %	294139600
13495	NC_014012	TGC	2	6	962696	962701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139600
13496	NC_014012	TCT	2	6	962868	962873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139600
13497	NC_014012	TCA	2	6	962890	962895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139600
13498	NC_014012	GCA	2	6	963078	963083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139600
13499	NC_014012	CAT	2	6	963095	963100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139600
13500	NC_014012	CTTAGA	2	12	963176	963187	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294139600

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