MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_014012	CTT	2	6	856129	856134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139492
12003	NC_014012	TG	3	6	856152	856157	0 %	50 %	50 %	0 %	294139492
12004	NC_014012	GAA	2	6	856177	856182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139492
12005	NC_014012	TCG	2	6	856186	856191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139492
12006	NC_014012	AAC	2	6	856263	856268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139492
12007	NC_014012	TGC	3	9	856431	856439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139492
12008	NC_014012	GTT	2	6	856460	856465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139492
12009	NC_014012	AAG	2	6	856502	856507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139492
12010	NC_014012	TTA	2	6	856557	856562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139492
12011	NC_014012	AGGC	2	8	856687	856694	25 %	0 %	50 %	25 %	294139492
12012	NC_014012	TGC	2	6	856848	856853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139492
12013	NC_014012	CTGG	2	8	856892	856899	0 %	25 %	50 %	25 %	294139492
12014	NC_014012	TTAGC	2	10	856929	856938	20 %	40 %	20 %	20 %	294139492
12015	NC_014012	CGCC	2	8	856945	856952	0 %	0 %	25 %	75 %	294139492
12016	NC_014012	CG	3	6	857080	857085	0 %	0 %	50 %	50 %	294139492
12017	NC_014012	TCAG	2	8	857124	857131	25 %	25 %	25 %	25 %	294139492
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12019	NC_014012	GCTA	2	8	857366	857373	25 %	25 %	25 %	25 %	294139493
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12021	NC_014012	AAGATG	2	12	857421	857432	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294139493
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12024	NC_014012	TCTG	2	8	857506	857513	0 %	50 %	25 %	25 %	294139493
12025	NC_014012	GATC	2	8	857586	857593	25 %	25 %	25 %	25 %	294139493
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12038	NC_014012	GCTG	2	8	858049	858056	0 %	25 %	50 %	25 %	294139493
12039	NC_014012	TGA	2	6	858070	858075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139493
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12043	NC_014012	AGT	2	6	858261	858266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139493
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12052	NC_014012	GTG	2	6	858766	858771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139493
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12054	NC_014012	GA	3	6	858931	858936	50 %	0 %	50 %	0 %	294139493
12055	NC_014012	GCC	2	6	858950	858955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139493
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12059	NC_014012	TTG	2	6	859187	859192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139493
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12064	NC_014012	TGA	2	6	859618	859623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139494
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12088	NC_014012	TCT	2	6	861082	861087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139495
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12103	NC_014012	GTC	2	6	861932	861937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139495
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12117	NC_014012	GGCGC	2	10	862678	862687	0 %	0 %	60 %	40 %	294139495
12118	NC_014012	TA	3	6	862710	862715	50 %	50 %	0 %	0 %	294139495
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12120	NC_014012	CCG	2	6	862771	862776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139495
12121	NC_014012	ATT	2	6	862855	862860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139495
12122	NC_014012	GCT	2	6	862882	862887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139496
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12126	NC_014012	TGA	2	6	863500	863505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139496
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12137	NC_014012	TCT	2	6	864050	864055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139496
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12149	NC_014012	ATT	2	6	865284	865289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139497
12150	NC_014012	TCT	2	6	865300	865305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139497
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12154	NC_014012	CCG	2	6	865438	865443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139497
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12200	NC_014012	AGTC	2	8	870071	870078	25 %	25 %	25 %	25 %	294139501
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12213	NC_014012	TGA	2	6	870953	870958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139503
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12219	NC_014012	TTG	2	6	871185	871190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139503
12220	NC_014012	GAT	2	6	871199	871204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139503
12221	NC_014012	GCT	2	6	871304	871309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139503
12222	NC_014012	GCT	2	6	871353	871358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139503
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12224	NC_014012	ATC	2	6	871390	871395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139503
12225	NC_014012	GAGCT	2	10	871519	871528	20 %	20 %	40 %	20 %	294139503
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12228	NC_014012	TAA	2	6	871637	871642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139503
12229	NC_014012	TTA	2	6	871710	871715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139503
12230	NC_014012	TGA	2	6	871838	871843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139503
12231	NC_014012	ATG	2	6	871845	871850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139503
12232	NC_014012	GGC	2	6	871865	871870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139503
12233	NC_014012	GCA	2	6	871919	871924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139503
12234	NC_014012	TGG	2	6	872189	872194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139503
12235	NC_014012	CT	3	6	872214	872219	0 %	50 %	0 %	50 %	294139503
12236	NC_014012	TTA	2	6	872277	872282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139503
12237	NC_014012	AGC	2	6	872290	872295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139503
12238	NC_014012	TGAC	2	8	872311	872318	25 %	25 %	25 %	25 %	294139503
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12359	NC_014012	CG	3	6	880008	880013	0 %	0 %	50 %	50 %	294139510
12360	NC_014012	AAGC	2	8	880025	880032	50 %	0 %	25 %	25 %	294139510
12361	NC_014012	CAA	2	6	880055	880060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139510
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12363	NC_014012	GGC	2	6	880256	880261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139510
12364	NC_014012	ACCCA	2	10	880263	880272	40 %	0 %	0 %	60 %	294139510
12365	NC_014012	AGA	2	6	880306	880311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139510
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12386	NC_014012	A	7	7	881988	881994	100 %	0 %	0 %	0 %	294139512
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12391	NC_014012	A	6	6	882169	882174	100 %	0 %	0 %	0 %	294139512
12392	NC_014012	ATC	2	6	882374	882379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139513
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12462	NC_014012	CT	3	6	888805	888810	0 %	50 %	0 %	50 %	294139522
12463	NC_014012	GT	3	6	888815	888820	0 %	50 %	50 %	0 %	294139522
12464	NC_014012	ACC	2	6	888879	888884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139522
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12467	NC_014012	GCGCT	2	10	889067	889076	0 %	20 %	40 %	40 %	294139522
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12470	NC_014012	A	7	7	889217	889223	100 %	0 %	0 %	0 %	294139522
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12477	NC_014012	GAT	2	6	889842	889847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139523
12478	NC_014012	TTCA	2	8	889989	889996	25 %	50 %	0 %	25 %	294139523
12479	NC_014012	GAA	2	6	890004	890009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139523
12480	NC_014012	GAG	2	6	890049	890054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139523
12481	NC_014012	TCC	2	6	890056	890061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139523
12482	NC_014012	GCTA	2	8	890210	890217	25 %	25 %	25 %	25 %	294139524
12483	NC_014012	TATC	2	8	890223	890230	25 %	50 %	0 %	25 %	294139524
12484	NC_014012	CGA	2	6	890391	890396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139524
12485	NC_014012	TGA	2	6	890406	890411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139524
12486	NC_014012	GT	3	6	890720	890725	0 %	50 %	50 %	0 %	294139525
12487	NC_014012	TAA	2	6	890729	890734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139525
12488	NC_014012	CGT	2	6	890744	890749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139525
12489	NC_014012	CT	3	6	890930	890935	0 %	50 %	0 %	50 %	294139525
12490	NC_014012	GGC	2	6	891056	891061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139525
12491	NC_014012	GA	3	6	891107	891112	50 %	0 %	50 %	0 %	294139525
12492	NC_014012	TTGAG	2	10	891138	891147	20 %	40 %	40 %	0 %	294139525
12493	NC_014012	GCCA	2	8	891203	891210	25 %	0 %	25 %	50 %	294139525
12494	NC_014012	GT	3	6	891243	891248	0 %	50 %	50 %	0 %	294139525
12495	NC_014012	CTG	2	6	891363	891368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139525
12496	NC_014012	CTCTTT	2	12	891443	891454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139525
12497	NC_014012	TATT	2	8	891483	891490	25 %	75 %	0 %	0 %	294139525
12498	NC_014012	GGAGC	2	10	891542	891551	20 %	0 %	60 %	20 %	294139525
12499	NC_014012	TCT	2	6	891775	891780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139525
12500	NC_014012	TTGC	2	8	891800	891807	0 %	50 %	25 %	25 %	294139525

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