MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014012	AG	3	6	821166	821171	50 %	0 %	50 %	0 %	294139455
11502	NC_014012	T	6	6	821189	821194	0 %	100 %	0 %	0 %	294139455
11503	NC_014012	TGG	2	6	821240	821245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139455
11504	NC_014012	AG	3	6	821264	821269	50 %	0 %	50 %	0 %	294139455
11505	NC_014012	TA	3	6	821341	821346	50 %	50 %	0 %	0 %	294139455
11506	NC_014012	TTCAA	2	10	821391	821400	40 %	40 %	0 %	20 %	294139455
11507	NC_014012	GGTG	2	8	821677	821684	0 %	25 %	75 %	0 %	294139456
11508	NC_014012	GCC	2	6	821699	821704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139456
11509	NC_014012	TGGC	2	8	821753	821760	0 %	25 %	50 %	25 %	294139456
11510	NC_014012	ATT	2	6	821966	821971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139457
11511	NC_014012	GAA	2	6	822009	822014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139457
11512	NC_014012	CGA	2	6	822020	822025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139457
11513	NC_014012	CAAG	2	8	822125	822132	50 %	0 %	25 %	25 %	294139457
11514	NC_014012	AAG	2	6	822144	822149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139457
11515	NC_014012	CATTC	2	10	822159	822168	20 %	40 %	0 %	40 %	294139457
11516	NC_014012	GAA	2	6	822278	822283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139457
11517	NC_014012	AGA	2	6	822307	822312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139457
11518	NC_014012	ATG	2	6	822600	822605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139458
11519	NC_014012	AGG	2	6	822655	822660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139458
11520	NC_014012	GGCTG	2	10	822662	822671	0 %	20 %	60 %	20 %	294139458
11521	NC_014012	GAT	2	6	822683	822688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139458
11522	NC_014012	GCATGG	2	12	822726	822737	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294139458
11523	NC_014012	CAA	2	6	822775	822780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139458
11524	NC_014012	ATT	2	6	822788	822793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139458
11525	NC_014012	TGA	2	6	822843	822848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139458
11526	NC_014012	GA	3	6	822926	822931	50 %	0 %	50 %	0 %	294139458
11527	NC_014012	ATC	2	6	822980	822985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139458
11528	NC_014012	TCA	2	6	823039	823044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139458
11529	NC_014012	TCA	2	6	823053	823058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139458
11530	NC_014012	TA	3	6	823126	823131	50 %	50 %	0 %	0 %	294139458
11531	NC_014012	TAG	2	6	823166	823171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139458
11532	NC_014012	AATTA	2	10	823217	823226	60 %	40 %	0 %	0 %	294139458
11533	NC_014012	AT	3	6	823274	823279	50 %	50 %	0 %	0 %	294139458
11534	NC_014012	GTT	2	6	823699	823704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139459
11535	NC_014012	AT	3	6	823735	823740	50 %	50 %	0 %	0 %	294139459
11536	NC_014012	CG	3	6	823763	823768	0 %	0 %	50 %	50 %	294139459
11537	NC_014012	GCA	2	6	823799	823804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139459
11538	NC_014012	ATT	2	6	823818	823823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139459
11539	NC_014012	GGT	2	6	823835	823840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139459
11540	NC_014012	TATT	2	8	823849	823856	25 %	75 %	0 %	0 %	294139459
11541	NC_014012	TGG	2	6	823864	823869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139459
11542	NC_014012	GCA	2	6	823931	823936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139459
11543	NC_014012	GTT	2	6	823958	823963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139459
11544	NC_014012	GTG	2	6	823965	823970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139459
11545	NC_014012	GTA	2	6	824000	824005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139459
11546	NC_014012	GAA	2	6	824221	824226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139459
11547	NC_014012	GCTA	2	8	824272	824279	25 %	25 %	25 %	25 %	294139459
11548	NC_014012	TCG	2	6	824304	824309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139459
11549	NC_014012	AGTA	2	8	824420	824427	50 %	25 %	25 %	0 %	294139459
11550	NC_014012	ACA	2	6	824448	824453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139459
11551	NC_014012	GGTG	2	8	824455	824462	0 %	25 %	75 %	0 %	294139459
11552	NC_014012	GT	3	6	824478	824483	0 %	50 %	50 %	0 %	294139459
11553	NC_014012	TGA	2	6	824515	824520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139459
11554	NC_014012	AGT	2	6	824575	824580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139459
11555	NC_014012	TAA	2	6	824855	824860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139460
11556	NC_014012	ATG	2	6	824875	824880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139460
11557	NC_014012	TG	3	6	824912	824917	0 %	50 %	50 %	0 %	294139460
11558	NC_014012	CCA	2	6	825043	825048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139460
11559	NC_014012	GTGCTG	2	12	825087	825098	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	294139460
11560	NC_014012	ATA	2	6	825133	825138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139460
11561	NC_014012	GCC	2	6	825195	825200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139460
11562	NC_014012	CTG	3	9	825285	825293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139460
11563	NC_014012	CCA	2	6	825487	825492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139460
11564	NC_014012	CTT	2	6	825521	825526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139460
11565	NC_014012	CGG	2	6	825590	825595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139460
11566	NC_014012	ATG	2	6	825693	825698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139460
11567	NC_014012	AGC	2	6	825700	825705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139460
11568	NC_014012	GGC	2	6	825725	825730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139460
11569	NC_014012	GGGC	2	8	825784	825791	0 %	0 %	75 %	25 %	294139460
11570	NC_014012	CTT	2	6	825869	825874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139460
11571	NC_014012	TGA	2	6	825955	825960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139460
11572	NC_014012	ATT	2	6	825973	825978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139460
11573	NC_014012	CTG	2	6	826005	826010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139460
11574	NC_014012	ATG	2	6	826011	826016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139460
11575	NC_014012	TAG	2	6	826033	826038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139460
11576	NC_014012	GCG	2	6	826165	826170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139460
11577	NC_014012	CGG	2	6	826171	826176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139460
11578	NC_014012	GGT	2	6	826248	826253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139460
11579	NC_014012	TGG	2	6	826261	826266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139460
11580	NC_014012	TCG	2	6	826285	826290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139460
11581	NC_014012	TCA	2	6	826399	826404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139460
11582	NC_014012	TCT	2	6	826405	826410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139460
11583	NC_014012	CCG	2	6	826437	826442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139460
11584	NC_014012	AGC	2	6	826451	826456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139460
11585	NC_014012	TGG	2	6	826523	826528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139460
11586	NC_014012	ATG	2	6	826548	826553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139460
11587	NC_014012	TAT	2	6	826691	826696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139460
11588	NC_014012	ATG	2	6	826704	826709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139460
11589	NC_014012	ATA	2	6	826962	826967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139461
11590	NC_014012	TTCAGG	2	12	826996	827007	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294139461
11591	NC_014012	CTGGC	2	10	827072	827081	0 %	20 %	40 %	40 %	294139461
11592	NC_014012	GCC	2	6	827092	827097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139461
11593	NC_014012	GCT	2	6	827206	827211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139461
11594	NC_014012	CA	3	6	827295	827300	50 %	0 %	0 %	50 %	294139461
11595	NC_014012	GAAA	2	8	827427	827434	75 %	0 %	25 %	0 %	294139461
11596	NC_014012	AGGC	2	8	827484	827491	25 %	0 %	50 %	25 %	294139461
11597	NC_014012	TTTTA	2	10	827554	827563	20 %	80 %	0 %	0 %	294139462
11598	NC_014012	ACT	2	6	827599	827604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139462
11599	NC_014012	T	6	6	827629	827634	0 %	100 %	0 %	0 %	294139462
11600	NC_014012	GCG	2	6	827749	827754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139462
11601	NC_014012	CTG	2	6	827944	827949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139463
11602	NC_014012	GCA	2	6	827953	827958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139463
11603	NC_014012	GTC	2	6	828083	828088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139463
11604	NC_014012	AAT	2	6	828106	828111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139463
11605	NC_014012	TC	3	6	828186	828191	0 %	50 %	0 %	50 %	294139463
11606	NC_014012	CCAG	2	8	828356	828363	25 %	0 %	25 %	50 %	294139463
11607	NC_014012	A	6	6	828409	828414	100 %	0 %	0 %	0 %	294139463
11608	NC_014012	GAT	2	6	828458	828463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139463
11609	NC_014012	TCA	2	6	828477	828482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139463
11610	NC_014012	TTA	2	6	828484	828489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139463
11611	NC_014012	TCA	2	6	828525	828530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139463
11612	NC_014012	TGA	2	6	828577	828582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139463
11613	NC_014012	ATT	3	9	828726	828734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139463
11614	NC_014012	ACAA	2	8	828768	828775	75 %	0 %	0 %	25 %	294139463
11615	NC_014012	GTTACC	2	12	828795	828806	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294139463
11616	NC_014012	AGGC	2	8	828849	828856	25 %	0 %	50 %	25 %	294139463
11617	NC_014012	GTG	2	6	828871	828876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139463
11618	NC_014012	GGGA	2	8	828886	828893	25 %	0 %	75 %	0 %	294139463
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11620	NC_014012	CTG	2	6	829056	829061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139463
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11741	NC_014012	AGC	2	6	838960	838965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139474
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11978	NC_014012	GAT	2	6	854669	854674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139490
11979	NC_014012	TA	3	6	854738	854743	50 %	50 %	0 %	0 %	294139490
11980	NC_014012	CTAT	2	8	854749	854756	25 %	50 %	0 %	25 %	294139490
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11982	NC_014012	A	7	7	854871	854877	100 %	0 %	0 %	0 %	294139490
11983	NC_014012	ATC	2	6	854886	854891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139490
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