MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_014012	GCG	2	6	784098	784103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139421
11003	NC_014012	ATA	2	6	784203	784208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139421
11004	NC_014012	GCA	2	6	784251	784256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139421
11005	NC_014012	TGAG	2	8	784260	784267	25 %	25 %	50 %	0 %	294139421
11006	NC_014012	GTT	2	6	784280	784285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139421
11007	NC_014012	CGC	2	6	784321	784326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139421
11008	NC_014012	TCTTCC	2	12	784332	784343	0 %	50 %	0 %	50 %	294139421
11009	NC_014012	TTA	2	6	784450	784455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139421
11010	NC_014012	TG	3	6	784611	784616	0 %	50 %	50 %	0 %	294139422
11011	NC_014012	TGTGG	2	10	784711	784720	0 %	40 %	60 %	0 %	294139422
11012	NC_014012	ATA	2	6	784728	784733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139422
11013	NC_014012	AGC	2	6	784738	784743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139422
11014	NC_014012	T	6	6	784772	784777	0 %	100 %	0 %	0 %	294139422
11015	NC_014012	TTA	2	6	785542	785547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139423
11016	NC_014012	TGC	2	6	785583	785588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139423
11017	NC_014012	GTA	2	6	785603	785608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139423
11018	NC_014012	GCC	2	6	785611	785616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139423
11019	NC_014012	CAC	2	6	785625	785630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139423
11020	NC_014012	AT	3	6	785662	785667	50 %	50 %	0 %	0 %	294139423
11021	NC_014012	CTT	2	6	785682	785687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139423
11022	NC_014012	CT	3	6	785728	785733	0 %	50 %	0 %	50 %	294139423
11023	NC_014012	TGA	2	6	785756	785761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139423
11024	NC_014012	TC	3	6	785835	785840	0 %	50 %	0 %	50 %	294139423
11025	NC_014012	GT	3	6	785858	785863	0 %	50 %	50 %	0 %	294139423
11026	NC_014012	ATG	2	6	786076	786081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139423
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11029	NC_014012	GCG	2	6	786208	786213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139423
11030	NC_014012	TCT	2	6	786223	786228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139423
11031	NC_014012	TGG	3	9	786311	786319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139423
11032	NC_014012	A	6	6	786343	786348	100 %	0 %	0 %	0 %	294139423
11033	NC_014012	GTG	2	6	786354	786359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139423
11034	NC_014012	TGA	2	6	786380	786385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139423
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11037	NC_014012	TGT	2	6	786455	786460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139423
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11039	NC_014012	GTTG	2	8	786650	786657	0 %	50 %	50 %	0 %	294139423
11040	NC_014012	TTTA	2	8	786698	786705	25 %	75 %	0 %	0 %	294139423
11041	NC_014012	TTG	2	6	786865	786870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139423
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11043	NC_014012	GGCT	2	8	786934	786941	0 %	25 %	50 %	25 %	294139423
11044	NC_014012	ATTT	2	8	786953	786960	25 %	75 %	0 %	0 %	294139423
11045	NC_014012	GGC	2	6	787005	787010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139423
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11051	NC_014012	TGG	2	6	787355	787360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139423
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11056	NC_014012	GT	3	6	787670	787675	0 %	50 %	50 %	0 %	294139423
11057	NC_014012	GGT	2	6	787707	787712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139423
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11063	NC_014012	GAG	2	6	787909	787914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139423
11064	NC_014012	A	6	6	787942	787947	100 %	0 %	0 %	0 %	294139423
11065	NC_014012	GGT	2	6	788019	788024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139423
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11080	NC_014012	CGC	2	6	788838	788843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139424
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11087	NC_014012	CG	3	6	789850	789855	0 %	0 %	50 %	50 %	294139425
11088	NC_014012	CAT	2	6	789887	789892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139425
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11091	NC_014012	TGG	2	6	790048	790053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139425
11092	NC_014012	CTG	2	6	790103	790108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139425
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11100	NC_014012	CGC	2	6	790679	790684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139426
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11102	NC_014012	TGC	2	6	790858	790863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139426
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11104	NC_014012	TG	3	6	791086	791091	0 %	50 %	50 %	0 %	294139426
11105	NC_014012	AGT	2	6	791103	791108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139426
11106	NC_014012	TGC	2	6	791122	791127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139426
11107	NC_014012	TGGCG	2	10	791132	791141	0 %	20 %	60 %	20 %	294139426
11108	NC_014012	GGC	2	6	791198	791203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139426
11109	NC_014012	GATT	2	8	791257	791264	25 %	50 %	25 %	0 %	294139426
11110	NC_014012	TAT	2	6	791297	791302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139426
11111	NC_014012	GC	3	6	791333	791338	0 %	0 %	50 %	50 %	294139426
11112	NC_014012	TGA	2	6	791342	791347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139426
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11115	NC_014012	CAT	2	6	791411	791416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139426
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11118	NC_014012	TGG	2	6	791531	791536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139426
11119	NC_014012	TCA	2	6	791582	791587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139426
11120	NC_014012	GCA	2	6	791623	791628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139426
11121	NC_014012	TCT	2	6	791629	791634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139426
11122	NC_014012	AAACC	2	10	791783	791792	60 %	0 %	0 %	40 %	294139427
11123	NC_014012	AGATAA	2	12	791847	791858	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294139427
11124	NC_014012	ATC	2	6	791866	791871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139427
11125	NC_014012	GCT	2	6	791880	791885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139427
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11128	NC_014012	GTC	2	6	792002	792007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139427
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11131	NC_014012	GGC	2	6	792162	792167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139427
11132	NC_014012	CGAAT	2	10	792172	792181	40 %	20 %	20 %	20 %	294139427
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11139	NC_014012	TCA	2	6	792564	792569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139427
11140	NC_014012	TGA	2	6	792593	792598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139427
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11142	NC_014012	GCT	2	6	792688	792693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139427
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11149	NC_014012	TGT	3	9	793272	793280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139428
11150	NC_014012	TGC	2	6	793299	793304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139428
11151	NC_014012	CGCTG	2	10	793342	793351	0 %	20 %	40 %	40 %	294139428
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11159	NC_014012	GTC	2	6	793942	793947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139429
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11221	NC_014012	TAG	2	6	799750	799755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139434
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11223	NC_014012	TGC	2	6	799882	799887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139434
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11226	NC_014012	GCT	2	6	800405	800410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139435
11227	NC_014012	GAT	3	9	800758	800766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139436
11228	NC_014012	GGACA	2	10	800780	800789	40 %	0 %	40 %	20 %	294139436
11229	NC_014012	CGG	2	6	800884	800889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139436
11230	NC_014012	AGTG	2	8	800893	800900	25 %	25 %	50 %	0 %	294139436
11231	NC_014012	CACT	2	8	800949	800956	25 %	25 %	0 %	50 %	294139436
11232	NC_014012	CAC	3	9	800965	800973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139436
11233	NC_014012	GGC	2	6	800986	800991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139436
11234	NC_014012	TGG	2	6	801075	801080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139436
11235	NC_014012	AGC	2	6	801117	801122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139436
11236	NC_014012	AAG	2	6	801123	801128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139436
11237	NC_014012	GC	3	6	801150	801155	0 %	0 %	50 %	50 %	294139436
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11479	NC_014012	CTG	2	6	819836	819841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139454
11480	NC_014012	CGG	2	6	819942	819947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139454
11481	NC_014012	TAAAGC	2	12	820083	820094	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294139454
11482	NC_014012	GA	3	6	820095	820100	50 %	0 %	50 %	0 %	294139454
11483	NC_014012	TGG	2	6	820107	820112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139454
11484	NC_014012	TGG	2	6	820167	820172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139454
11485	NC_014012	TAGCC	2	10	820324	820333	20 %	20 %	20 %	40 %	294139454
11486	NC_014012	GGC	2	6	820337	820342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139454
11487	NC_014012	TGC	2	6	820404	820409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139454
11488	NC_014012	GCG	2	6	820472	820477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139454
11489	NC_014012	GTGA	2	8	820502	820509	25 %	25 %	50 %	0 %	294139454
11490	NC_014012	CCT	2	6	820565	820570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139454
11491	NC_014012	CGC	2	6	820738	820743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139454
11492	NC_014012	GTG	2	6	820761	820766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139454
11493	NC_014012	TGG	2	6	820809	820814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139454
11494	NC_014012	TCC	2	6	820853	820858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139454
11495	NC_014012	TGG	2	6	820908	820913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139454
11496	NC_014012	TTA	2	6	820968	820973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139454
11497	NC_014012	GCG	2	6	821012	821017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139454
11498	NC_014012	ACAG	2	8	821030	821037	50 %	0 %	25 %	25 %	294139454
11499	NC_014012	TAA	2	6	821150	821155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139455
11500	NC_014012	GAG	2	6	821162	821167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139455

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