MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014012	ACTC	2	8	712357	712364	25 %	25 %	0 %	50 %	294139368
10002	NC_014012	AGA	2	6	712472	712477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139368
10003	NC_014012	AGG	2	6	712535	712540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139368
10004	NC_014012	CTC	2	6	712610	712615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139368
10005	NC_014012	GAT	2	6	712624	712629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139368
10006	NC_014012	CAAG	2	8	712677	712684	50 %	0 %	25 %	25 %	294139368
10007	NC_014012	GGC	2	6	712713	712718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139368
10008	NC_014012	AG	3	6	712731	712736	50 %	0 %	50 %	0 %	294139368
10009	NC_014012	TGAATT	2	12	712737	712748	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294139368
10010	NC_014012	CAG	2	6	712849	712854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139368
10011	NC_014012	CAG	2	6	712898	712903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139368
10012	NC_014012	CTGAA	2	10	712904	712913	40 %	20 %	20 %	20 %	294139368
10013	NC_014012	GCT	2	6	712981	712986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139368
10014	NC_014012	TACGC	2	10	712991	713000	20 %	20 %	20 %	40 %	294139368
10015	NC_014012	TCA	2	6	713157	713162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139368
10016	NC_014012	T	6	6	713254	713259	0 %	100 %	0 %	0 %	294139368
10017	NC_014012	CT	3	6	713290	713295	0 %	50 %	0 %	50 %	294139368
10018	NC_014012	AATC	2	8	713367	713374	50 %	25 %	0 %	25 %	294139368
10019	NC_014012	TGA	2	6	713417	713422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139368
10020	NC_014012	TTAGC	2	10	713423	713432	20 %	40 %	20 %	20 %	294139368
10021	NC_014012	CTATGG	2	12	714317	714328	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294139369
10022	NC_014012	GCC	2	6	714349	714354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139369
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10024	NC_014012	GTG	2	6	714502	714507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139369
10025	NC_014012	TGG	2	6	714512	714517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139369
10026	NC_014012	TCT	2	6	714527	714532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139369
10027	NC_014012	AAGA	2	8	714550	714557	75 %	0 %	25 %	0 %	294139369
10028	NC_014012	TGA	2	6	714593	714598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139369
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10032	NC_014012	AGC	2	6	714887	714892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139369
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10034	NC_014012	CTG	2	6	714988	714993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139369
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10036	NC_014012	GAT	2	6	715153	715158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139369
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10039	NC_014012	CAG	2	6	715233	715238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139369
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10041	NC_014012	TGG	2	6	715384	715389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139369
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10043	NC_014012	TCT	2	6	715493	715498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139369
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10045	NC_014012	TA	3	6	715672	715677	50 %	50 %	0 %	0 %	294139369
10046	NC_014012	ATG	3	9	715774	715782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139369
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10053	NC_014012	CGGC	2	8	715926	715933	0 %	0 %	50 %	50 %	294139369
10054	NC_014012	TGA	2	6	715958	715963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139369
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10056	NC_014012	CTG	2	6	716060	716065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139369
10057	NC_014012	TAA	2	6	716079	716084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139369
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10068	NC_014012	CAGGTG	2	12	716777	716788	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294139370
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10091	NC_014012	A	6	6	718463	718468	100 %	0 %	0 %	0 %	294139372
10092	NC_014012	TTA	2	6	718469	718474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139372
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10106	NC_014012	CTA	2	6	719357	719362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139373
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10119	NC_014012	ATG	2	6	720043	720048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139374
10120	NC_014012	CAT	2	6	720102	720107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139374
10121	NC_014012	CAT	2	6	720141	720146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139374
10122	NC_014012	GCT	2	6	720211	720216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139374
10123	NC_014012	ATT	2	6	720229	720234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139374
10124	NC_014012	CTG	2	6	720244	720249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139374
10125	NC_014012	GCA	2	6	720432	720437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139374
10126	NC_014012	GCA	2	6	720488	720493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139374
10127	NC_014012	TGA	2	6	720506	720511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139374
10128	NC_014012	TCA	2	6	720515	720520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139374
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10130	NC_014012	GAC	2	6	720624	720629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139374
10131	NC_014012	CCG	2	6	720635	720640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139374
10132	NC_014012	CGA	2	6	720641	720646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139374
10133	NC_014012	ATC	2	6	720850	720855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139374
10134	NC_014012	GCA	2	6	720976	720981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139374
10135	NC_014012	ATC	2	6	720985	720990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139374
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10137	NC_014012	ATC	2	6	721501	721506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139375
10138	NC_014012	TGTT	2	8	721912	721919	0 %	75 %	25 %	0 %	294139375
10139	NC_014012	CT	3	6	721977	721982	0 %	50 %	0 %	50 %	294139375
10140	NC_014012	CCG	2	6	722014	722019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139375
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10143	NC_014012	TAT	2	6	722555	722560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139376
10144	NC_014012	ATC	3	9	722614	722622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139376
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10148	NC_014012	ATG	2	6	723369	723374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139377
10149	NC_014012	TAG	2	6	723731	723736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139378
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10151	NC_014012	CCTA	2	8	724034	724041	25 %	25 %	0 %	50 %	294139378
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10155	NC_014012	CAT	2	6	724347	724352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139379
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10177	NC_014012	TTGG	2	8	726888	726895	0 %	50 %	50 %	0 %	294139382
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10181	NC_014012	GCT	2	6	727042	727047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139382
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10183	NC_014012	AG	3	6	727062	727067	50 %	0 %	50 %	0 %	294139382
10184	NC_014012	CAT	3	9	727126	727134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139382
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10188	NC_014012	CTG	2	6	727534	727539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139382
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10193	NC_014012	A	7	7	728267	728273	100 %	0 %	0 %	0 %	294139383
10194	NC_014012	CATAG	2	10	728352	728361	40 %	20 %	20 %	20 %	294139383
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10197	NC_014012	TGC	2	6	728617	728622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139383
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10205	NC_014012	TCGC	2	8	728926	728933	0 %	25 %	25 %	50 %	294139383
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10209	NC_014012	GACG	2	8	729069	729076	25 %	0 %	50 %	25 %	294139383
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10211	NC_014012	TGC	2	6	729139	729144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139383
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10219	NC_014012	ATG	2	6	729489	729494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139383
10220	NC_014012	AGC	2	6	729559	729564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139383
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10222	NC_014012	ATTG	2	8	729590	729597	25 %	50 %	25 %	0 %	294139383
10223	NC_014012	TGA	2	6	730615	730620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139384
10224	NC_014012	CTGTTT	2	12	730761	730772	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	294139384
10225	NC_014012	TCGAA	2	10	730831	730840	40 %	20 %	20 %	20 %	294139384
10226	NC_014012	GCTT	2	8	730846	730853	0 %	50 %	25 %	25 %	294139384
10227	NC_014012	TGG	2	6	730921	730926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139384
10228	NC_014012	ATT	2	6	730935	730940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139384
10229	NC_014012	CGA	2	6	730979	730984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139384
10230	NC_014012	ATT	2	6	731019	731024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139384
10231	NC_014012	T	6	6	731115	731120	0 %	100 %	0 %	0 %	294139384
10232	NC_014012	TCT	2	6	731131	731136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139384
10233	NC_014012	CCA	2	6	731143	731148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139384
10234	NC_014012	GCTG	2	8	731254	731261	0 %	25 %	50 %	25 %	294139384
10235	NC_014012	ATG	2	6	731489	731494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139385
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10237	NC_014012	G	6	6	731567	731572	0 %	0 %	100 %	0 %	294139385
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10478	NC_014012	CTG	2	6	745576	745581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139394
10479	NC_014012	ATTAAT	2	12	745635	745646	50 %	50 %	0 %	0 %	294139394
10480	NC_014012	GCA	2	6	745679	745684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139394
10481	NC_014012	AGT	2	6	745769	745774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139394
10482	NC_014012	TGA	2	6	745781	745786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139394
10483	NC_014012	GCA	2	6	745811	745816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139394
10484	NC_014012	GTT	2	6	745842	745847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139394
10485	NC_014012	TCG	2	6	745933	745938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139394
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