MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_014012	TCT	2	6	642296	642301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139315
9002	NC_014012	GCA	2	6	642329	642334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139315
9003	NC_014012	ATC	2	6	642396	642401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139315
9004	NC_014012	GCA	2	6	642524	642529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139315
9005	NC_014012	CTAT	2	8	642570	642577	25 %	50 %	0 %	25 %	294139315
9006	NC_014012	GATA	2	8	642623	642630	50 %	25 %	25 %	0 %	294139315
9007	NC_014012	ATG	2	6	642657	642662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
9008	NC_014012	GCT	2	6	642723	642728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139315
9009	NC_014012	GCC	2	6	642786	642791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139315
9010	NC_014012	TGG	2	6	642806	642811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139315
9011	NC_014012	AGCAA	2	10	642812	642821	60 %	0 %	20 %	20 %	294139315
9012	NC_014012	TCGC	2	8	642866	642873	0 %	25 %	25 %	50 %	294139315
9013	NC_014012	CTT	2	6	642895	642900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139315
9014	NC_014012	CTC	2	6	642902	642907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139315
9015	NC_014012	CGGTA	2	10	642924	642933	20 %	20 %	40 %	20 %	294139315
9016	NC_014012	CAT	2	6	643013	643018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139315
9017	NC_014012	GCT	2	6	643124	643129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139315
9018	NC_014012	CCA	2	6	643144	643149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139315
9019	NC_014012	ATG	2	6	643150	643155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
9020	NC_014012	GGT	2	6	643166	643171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139315
9021	NC_014012	CT	3	6	643239	643244	0 %	50 %	0 %	50 %	294139315
9022	NC_014012	GC	3	6	643295	643300	0 %	0 %	50 %	50 %	294139315
9023	NC_014012	GTAATA	2	12	643477	643488	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294139315
9024	NC_014012	A	7	7	643496	643502	100 %	0 %	0 %	0 %	294139315
9025	NC_014012	GGCA	2	8	643627	643634	25 %	0 %	50 %	25 %	294139315
9026	NC_014012	TAT	2	6	643703	643708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139315
9027	NC_014012	AT	3	6	643769	643774	50 %	50 %	0 %	0 %	294139315
9028	NC_014012	AAC	2	6	643787	643792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139315
9029	NC_014012	CAA	2	6	643918	643923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139315
9030	NC_014012	TAA	2	6	644471	644476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139315
9031	NC_014012	GTGACT	2	12	644571	644582	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294139315
9032	NC_014012	GTG	2	6	644583	644588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139315
9033	NC_014012	AAT	2	6	644613	644618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139315
9034	NC_014012	CTGT	2	8	644697	644704	0 %	50 %	25 %	25 %	294139315
9035	NC_014012	ATT	2	6	644779	644784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139315
9036	NC_014012	CAGAT	2	10	644791	644800	40 %	20 %	20 %	20 %	294139315
9037	NC_014012	ATG	2	6	644872	644877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
9038	NC_014012	TGA	2	6	644891	644896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
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9040	NC_014012	ATG	2	6	644947	644952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
9041	NC_014012	TCT	2	6	644969	644974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139315
9042	NC_014012	CT	3	6	644973	644978	0 %	50 %	0 %	50 %	294139315
9043	NC_014012	TGT	2	6	644987	644992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139315
9044	NC_014012	CAG	2	6	645046	645051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139315
9045	NC_014012	ATTA	2	8	645075	645082	50 %	50 %	0 %	0 %	294139315
9046	NC_014012	GCC	2	6	645114	645119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139315
9047	NC_014012	AGTG	2	8	645128	645135	25 %	25 %	50 %	0 %	294139315
9048	NC_014012	GCA	2	6	645304	645309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139315
9049	NC_014012	ATG	2	6	645424	645429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
9050	NC_014012	GCTA	2	8	645491	645498	25 %	25 %	25 %	25 %	294139315
9051	NC_014012	GGC	2	6	645654	645659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139315
9052	NC_014012	CT	3	6	645675	645680	0 %	50 %	0 %	50 %	294139315
9053	NC_014012	AGC	2	6	645690	645695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139315
9054	NC_014012	ATGA	2	8	645717	645724	50 %	25 %	25 %	0 %	294139315
9055	NC_014012	TGG	2	6	645802	645807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139315
9056	NC_014012	GAT	2	6	645996	646001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
9057	NC_014012	CTAACC	2	12	646077	646088	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	294139315
9058	NC_014012	GCC	2	6	646095	646100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139315
9059	NC_014012	ATG	2	6	646126	646131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
9060	NC_014012	GTGA	2	8	646191	646198	25 %	25 %	50 %	0 %	294139315
9061	NC_014012	ATG	2	6	646252	646257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
9062	NC_014012	TTA	2	6	646279	646284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139315
9063	NC_014012	GGA	2	6	646289	646294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139315
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9066	NC_014012	TGGTG	2	10	646412	646421	0 %	40 %	60 %	0 %	294139315
9067	NC_014012	ATG	2	6	646537	646542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
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9072	NC_014012	GTA	2	6	646668	646673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
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9080	NC_014012	GAT	3	9	647139	647147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
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9083	NC_014012	GAT	2	6	647307	647312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
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9087	NC_014012	GAT	2	6	647427	647432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
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9091	NC_014012	GAT	2	6	647637	647642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
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9093	NC_014012	ATG	2	6	647695	647700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
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9103	NC_014012	TC	3	6	648400	648405	0 %	50 %	0 %	50 %	294139315
9104	NC_014012	TGGC	2	8	648481	648488	0 %	25 %	50 %	25 %	294139315
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9109	NC_014012	TGA	2	6	648986	648991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
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9112	NC_014012	GA	3	6	649176	649181	50 %	0 %	50 %	0 %	294139315
9113	NC_014012	TGG	2	6	649204	649209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139315
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9119	NC_014012	TGA	2	6	649547	649552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
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9121	NC_014012	ATG	2	6	649618	649623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139315
9122	NC_014012	GCT	2	6	649660	649665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139315
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9126	NC_014012	CTT	2	6	649808	649813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139315
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9134	NC_014012	GCTATC	2	12	650305	650316	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294139315
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9140	NC_014012	TTTG	2	8	650832	650839	0 %	75 %	25 %	0 %	294139316
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9235	NC_014012	AT	3	6	657255	657260	50 %	50 %	0 %	0 %	294139324
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9239	NC_014012	TTGA	2	8	657554	657561	25 %	50 %	25 %	0 %	294139324
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9248	NC_014012	GATA	2	8	658045	658052	50 %	25 %	25 %	0 %	294139324
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9356	NC_014012	GCTATT	6	36	666582	666617	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294139329
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9359	NC_014012	TGA	2	6	666811	666816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139329
9360	NC_014012	GT	3	6	666836	666841	0 %	50 %	50 %	0 %	294139329
9361	NC_014012	GGA	2	6	666853	666858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139329
9362	NC_014012	TGA	2	6	666915	666920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139329
9363	NC_014012	TAAAAG	2	12	666921	666932	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294139329
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9365	NC_014012	TCA	2	6	667196	667201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139330
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