MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_014012	ATC	2	6	548841	548846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139252
8002	NC_014012	AAC	2	6	548894	548899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139252
8003	NC_014012	GAA	2	6	549033	549038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139252
8004	NC_014012	AT	3	6	549044	549049	50 %	50 %	0 %	0 %	294139252
8005	NC_014012	ATT	2	6	549061	549066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139252
8006	NC_014012	AACA	2	8	549191	549198	75 %	0 %	0 %	25 %	294139252
8007	NC_014012	ATA	2	6	549227	549232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139252
8008	NC_014012	AAT	2	6	549245	549250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139253
8009	NC_014012	CAC	2	6	549442	549447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139253
8010	NC_014012	TAA	2	6	549475	549480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139253
8011	NC_014012	GAT	2	6	549629	549634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139253
8012	NC_014012	CAA	2	6	549642	549647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139253
8013	NC_014012	CA	3	6	549676	549681	50 %	0 %	0 %	50 %	294139253
8014	NC_014012	TGA	2	6	549727	549732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139253
8015	NC_014012	A	6	6	549767	549772	100 %	0 %	0 %	0 %	294139253
8016	NC_014012	AG	3	6	549792	549797	50 %	0 %	50 %	0 %	294139253
8017	NC_014012	TGA	2	6	549837	549842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139253
8018	NC_014012	ATT	2	6	549855	549860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139253
8019	NC_014012	GTT	2	6	550042	550047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139253
8020	NC_014012	GGT	2	6	550049	550054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139253
8021	NC_014012	GA	3	6	550059	550064	50 %	0 %	50 %	0 %	294139253
8022	NC_014012	TGC	2	6	550075	550080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139253
8023	NC_014012	TTG	2	6	550106	550111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139253
8024	NC_014012	GTCA	2	8	550139	550146	25 %	25 %	25 %	25 %	294139253
8025	NC_014012	GAT	2	6	550157	550162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139253
8026	NC_014012	AGGTA	2	10	550177	550186	40 %	20 %	40 %	0 %	294139253
8027	NC_014012	TGG	2	6	550260	550265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139253
8028	NC_014012	AGAGG	2	10	550291	550300	40 %	0 %	60 %	0 %	294139253
8029	NC_014012	ACA	2	6	550315	550320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139253
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8033	NC_014012	TAA	2	6	550513	550518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139253
8034	NC_014012	CATA	2	8	550519	550526	50 %	25 %	0 %	25 %	294139253
8035	NC_014012	G	6	6	550558	550563	0 %	0 %	100 %	0 %	294139253
8036	NC_014012	CCG	2	6	550606	550611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139254
8037	NC_014012	TGC	2	6	550629	550634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139254
8038	NC_014012	GAGCT	2	10	550786	550795	20 %	20 %	40 %	20 %	294139254
8039	NC_014012	CGG	2	6	550928	550933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139254
8040	NC_014012	GCT	2	6	550996	551001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139254
8041	NC_014012	T	6	6	551038	551043	0 %	100 %	0 %	0 %	294139254
8042	NC_014012	AGA	2	6	551056	551061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139254
8043	NC_014012	GCATT	2	10	551117	551126	20 %	40 %	20 %	20 %	294139254
8044	NC_014012	ACAT	2	8	551138	551145	50 %	25 %	0 %	25 %	294139254
8045	NC_014012	AAT	2	6	551158	551163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139254
8046	NC_014012	TA	3	6	551302	551307	50 %	50 %	0 %	0 %	294139254
8047	NC_014012	AGCT	2	8	551436	551443	25 %	25 %	25 %	25 %	294139254
8048	NC_014012	TCA	2	6	551469	551474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139254
8049	NC_014012	T	7	7	551591	551597	0 %	100 %	0 %	0 %	294139254
8050	NC_014012	TAA	2	6	551613	551618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139254
8051	NC_014012	CAAG	2	8	551641	551648	50 %	0 %	25 %	25 %	294139254
8052	NC_014012	TAC	2	6	551770	551775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139254
8053	NC_014012	CTTC	2	8	551830	551837	0 %	50 %	0 %	50 %	294139254
8054	NC_014012	GGC	2	6	551841	551846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139254
8055	NC_014012	CTT	2	6	551852	551857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139254
8056	NC_014012	TTAC	2	8	551866	551873	25 %	50 %	0 %	25 %	294139254
8057	NC_014012	TCC	2	6	551886	551891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139254
8058	NC_014012	GCC	2	6	551931	551936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139254
8059	NC_014012	CAGC	2	8	552060	552067	25 %	0 %	25 %	50 %	294139254
8060	NC_014012	AAGA	2	8	552141	552148	75 %	0 %	25 %	0 %	294139254
8061	NC_014012	ATA	2	6	552184	552189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139254
8062	NC_014012	TTA	2	6	552244	552249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139254
8063	NC_014012	GA	3	6	552375	552380	50 %	0 %	50 %	0 %	294139254
8064	NC_014012	TCA	2	6	552398	552403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139254
8065	NC_014012	A	6	6	552427	552432	100 %	0 %	0 %	0 %	294139254
8066	NC_014012	ATTG	3	12	552435	552446	25 %	50 %	25 %	0 %	294139254
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8071	NC_014012	AG	3	6	552745	552750	50 %	0 %	50 %	0 %	294139255
8072	NC_014012	CTTG	2	8	552783	552790	0 %	50 %	25 %	25 %	294139255
8073	NC_014012	CAG	2	6	552845	552850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139255
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8079	NC_014012	CTTC	2	8	553204	553211	0 %	50 %	0 %	50 %	294139255
8080	NC_014012	CTA	2	6	553298	553303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139255
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8082	NC_014012	GCTA	2	8	553409	553416	25 %	25 %	25 %	25 %	294139255
8083	NC_014012	TA	3	6	553669	553674	50 %	50 %	0 %	0 %	294139256
8084	NC_014012	CAG	2	6	553764	553769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139256
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8087	NC_014012	AGA	2	6	553878	553883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139257
8088	NC_014012	ACT	2	6	553942	553947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139257
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8093	NC_014012	AG	3	6	554070	554075	50 %	0 %	50 %	0 %	294139257
8094	NC_014012	AG	3	6	554144	554149	50 %	0 %	50 %	0 %	294139257
8095	NC_014012	GGT	2	6	554248	554253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139257
8096	NC_014012	AG	3	6	554357	554362	50 %	0 %	50 %	0 %	294139257
8097	NC_014012	AAG	2	6	554379	554384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139257
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8105	NC_014012	GATT	2	8	554787	554794	25 %	50 %	25 %	0 %	294139257
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8109	NC_014012	TGA	2	6	554985	554990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139257
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8111	NC_014012	CGG	2	6	555263	555268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139258
8112	NC_014012	AGTT	2	8	555296	555303	25 %	50 %	25 %	0 %	294139258
8113	NC_014012	AAG	2	6	555373	555378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139258
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8118	NC_014012	GACA	2	8	555632	555639	50 %	0 %	25 %	25 %	294139258
8119	NC_014012	GTTAT	2	10	555649	555658	20 %	60 %	20 %	0 %	294139258
8120	NC_014012	ATA	2	6	555664	555669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139258
8121	NC_014012	CGT	2	6	555708	555713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139258
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8123	NC_014012	CCTG	2	8	555785	555792	0 %	25 %	25 %	50 %	294139258
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8241	NC_014012	TA	3	6	563336	563341	50 %	50 %	0 %	0 %	294139266
8242	NC_014012	GAG	2	6	563347	563352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139266
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8486	NC_014012	GAT	2	6	578931	578936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139281
8487	NC_014012	ATT	2	6	578994	578999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139281
8488	NC_014012	AAC	2	6	579043	579048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139281
8489	NC_014012	TGA	2	6	579109	579114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139281
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8499	NC_014012	ATC	2	6	579616	579621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139282
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