MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_014012	CAG	2	6	480389	480394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139182
7003	NC_014012	AAG	2	6	480414	480419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139182
7004	NC_014012	AGT	2	6	480426	480431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139182
7005	NC_014012	TGC	2	6	480526	480531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139182
7006	NC_014012	GTT	2	6	480538	480543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139182
7007	NC_014012	AGT	2	6	480586	480591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139182
7008	NC_014012	TCT	2	6	480600	480605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139182
7009	NC_014012	ACA	2	6	480618	480623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139182
7010	NC_014012	TTA	2	6	480672	480677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139183
7011	NC_014012	TTA	2	6	480731	480736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139183
7012	NC_014012	TGC	2	6	480773	480778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139183
7013	NC_014012	T	6	6	480951	480956	0 %	100 %	0 %	0 %	294139183
7014	NC_014012	TGA	2	6	481026	481031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139183
7015	NC_014012	TGC	2	6	481092	481097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139183
7016	NC_014012	ATT	2	6	481106	481111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139183
7017	NC_014012	TAA	2	6	481140	481145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139184
7018	NC_014012	ATCA	2	8	481162	481169	50 %	25 %	0 %	25 %	294139184
7019	NC_014012	CAC	2	6	481221	481226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139184
7020	NC_014012	TGC	2	6	481256	481261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139184
7021	NC_014012	T	6	6	481263	481268	0 %	100 %	0 %	0 %	294139184
7022	NC_014012	ATT	2	6	481291	481296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139184
7023	NC_014012	TTC	2	6	481333	481338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139184
7024	NC_014012	TGG	2	6	481648	481653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139185
7025	NC_014012	TAA	2	6	481717	481722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139185
7026	NC_014012	CGG	2	6	481764	481769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139185
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7028	NC_014012	CAT	2	6	481821	481826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139185
7029	NC_014012	A	7	7	481845	481851	100 %	0 %	0 %	0 %	294139185
7030	NC_014012	AT	3	6	481886	481891	50 %	50 %	0 %	0 %	294139185
7031	NC_014012	TGG	2	6	481914	481919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139185
7032	NC_014012	CTT	2	6	481974	481979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139185
7033	NC_014012	GAA	2	6	481990	481995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139185
7034	NC_014012	CT	3	6	482051	482056	0 %	50 %	0 %	50 %	294139185
7035	NC_014012	TGT	2	6	482175	482180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139185
7036	NC_014012	TCT	2	6	482211	482216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139185
7037	NC_014012	CT	3	6	482601	482606	0 %	50 %	0 %	50 %	294139185
7038	NC_014012	ATG	2	6	482621	482626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139185
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7040	NC_014012	TCG	3	9	482729	482737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139185
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7042	NC_014012	CT	3	6	482876	482881	0 %	50 %	0 %	50 %	294139185
7043	NC_014012	GTCTT	2	10	482912	482921	0 %	60 %	20 %	20 %	294139185
7044	NC_014012	TTG	2	6	482986	482991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139185
7045	NC_014012	TTG	2	6	482998	483003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139185
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7048	NC_014012	CTG	2	6	483067	483072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139185
7049	NC_014012	CGG	2	6	483313	483318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139186
7050	NC_014012	TGAC	2	8	483345	483352	25 %	25 %	25 %	25 %	294139186
7051	NC_014012	GCT	2	6	483433	483438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139186
7052	NC_014012	T	7	7	483445	483451	0 %	100 %	0 %	0 %	294139186
7053	NC_014012	GCT	2	6	483519	483524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139186
7054	NC_014012	C	6	6	483558	483563	0 %	0 %	0 %	100 %	294139186
7055	NC_014012	TTC	2	6	483608	483613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139186
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7057	NC_014012	GTT	2	6	483628	483633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139186
7058	NC_014012	GTT	2	6	483644	483649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139186
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7064	NC_014012	GTT	2	6	484107	484112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139187
7065	NC_014012	TGA	2	6	484161	484166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139187
7066	NC_014012	TGT	2	6	484212	484217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139187
7067	NC_014012	TAAGGT	2	12	484276	484287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139187
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7072	NC_014012	GATC	2	8	484447	484454	25 %	25 %	25 %	25 %	294139187
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7076	NC_014012	TTTGC	2	10	484554	484563	0 %	60 %	20 %	20 %	294139187
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7087	NC_014012	GAG	2	6	485323	485328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139189
7088	NC_014012	GCTT	2	8	485393	485400	0 %	50 %	25 %	25 %	294139189
7089	NC_014012	ATC	2	6	485470	485475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139189
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7091	NC_014012	CAT	2	6	485505	485510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139189
7092	NC_014012	ATA	2	6	485517	485522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139189
7093	NC_014012	TGT	2	6	485544	485549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139189
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7101	NC_014012	CGG	2	6	485956	485961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139190
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7105	NC_014012	TCA	2	6	486093	486098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139190
7106	NC_014012	AG	3	6	486142	486147	50 %	0 %	50 %	0 %	294139190
7107	NC_014012	ACC	2	6	486242	486247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139190
7108	NC_014012	ATC	2	6	486266	486271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139190
7109	NC_014012	GTG	2	6	486336	486341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139190
7110	NC_014012	CTT	2	6	486373	486378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139190
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7117	NC_014012	GCCA	2	8	487129	487136	25 %	0 %	25 %	50 %	294139191
7118	NC_014012	CA	3	6	487135	487140	50 %	0 %	0 %	50 %	294139191
7119	NC_014012	TAT	2	6	487174	487179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139191
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7239	NC_014012	CAGCGC	2	12	494545	494556	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	294139201
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7241	NC_014012	CGG	2	6	494766	494771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139201
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7368	NC_014012	AC	3	6	502651	502656	50 %	0 %	0 %	50 %	294139209
7369	NC_014012	TCG	2	6	502718	502723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139209
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7385	NC_014012	AAGT	2	8	503492	503499	50 %	25 %	25 %	0 %	294139209
7386	NC_014012	A	6	6	503520	503525	100 %	0 %	0 %	0 %	294139210
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7482	NC_014012	ATC	2	6	510898	510903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139218
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7484	NC_014012	TC	3	6	510966	510971	0 %	50 %	0 %	50 %	294139218
7485	NC_014012	ATC	2	6	511078	511083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139218
7486	NC_014012	TGT	2	6	511098	511103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139218
7487	NC_014012	GCA	2	6	511202	511207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139218
7488	NC_014012	ATT	2	6	511225	511230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139218
7489	NC_014012	CCA	2	6	511259	511264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139218
7490	NC_014012	ACC	2	6	511291	511296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139218
7491	NC_014012	CGG	2	6	511355	511360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139218
7492	NC_014012	TAA	2	6	511383	511388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139218
7493	NC_014012	ACC	2	6	511414	511419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139218
7494	NC_014012	AAG	2	6	511471	511476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139218
7495	NC_014012	GAT	2	6	511553	511558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139218
7496	NC_014012	GATA	2	8	511630	511637	50 %	25 %	25 %	0 %	294139218
7497	NC_014012	TTAT	2	8	511790	511797	25 %	75 %	0 %	0 %	294139218
7498	NC_014012	TAT	2	6	511872	511877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139218
7499	NC_014012	ATG	2	6	511886	511891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139218
7500	NC_014012	GCT	2	6	511925	511930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139218

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