MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
70001	NC_014012	AC	3	6	4860260	4860265	50 %	0 %	0 %	50 %	294143031
70002	NC_014012	ATG	2	6	4860325	4860330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294143031
70003	NC_014012	AGC	2	6	4860339	4860344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294143031
70004	NC_014012	CAT	2	6	4860384	4860389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294143031
70005	NC_014012	CAT	2	6	4860407	4860412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294143031
70006	NC_014012	CCT	2	6	4860472	4860477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294143031
70007	NC_014012	GTT	2	6	4860564	4860569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294143031
70008	NC_014012	CATAAT	2	12	4860692	4860703	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294143031
70009	NC_014012	ATT	2	6	4860783	4860788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294143031
70010	NC_014012	AAT	2	6	4860809	4860814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294143031
70011	NC_014012	TAG	2	6	4860851	4860856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294143031
70012	NC_014012	TTGA	2	8	4860879	4860886	25 %	50 %	25 %	0 %	294143031
70013	NC_014012	GAC	2	6	4860915	4860920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294143031
70014	NC_014012	TGC	2	6	4860958	4860963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294143031
70015	NC_014012	TAC	2	6	4861046	4861051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294143031
70016	NC_014012	GTA	2	6	4861114	4861119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294143031
70017	NC_014012	T	6	6	4861212	4861217	0 %	100 %	0 %	0 %	294143031
70018	NC_014012	AGCAC	2	10	4861297	4861306	40 %	0 %	20 %	40 %	294143031
70019	NC_014012	CTT	2	6	4861316	4861321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294143031
70020	NC_014012	TGAA	2	8	4861332	4861339	50 %	25 %	25 %	0 %	294143031
70021	NC_014012	CAT	2	6	4861415	4861420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294143031
70022	NC_014012	ATT	2	6	4861503	4861508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294143031
70023	NC_014012	GCC	2	6	4861524	4861529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294143031
70024	NC_014012	ATT	2	6	4861542	4861547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294143031
70025	NC_014012	TTA	2	6	4861628	4861633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294143031
70026	NC_014012	GTG	2	6	4861663	4861668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294143031
70027	NC_014012	TTC	2	6	4862227	4862232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294143032
70028	NC_014012	ATT	2	6	4862270	4862275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294143032
70029	NC_014012	T	6	6	4862288	4862293	0 %	100 %	0 %	0 %	294143032
70030	NC_014012	TGATG	2	10	4862342	4862351	20 %	40 %	40 %	0 %	294143032
70031	NC_014012	TCT	2	6	4862431	4862436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294143032
70032	NC_014012	TTA	2	6	4862505	4862510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294143032
70033	NC_014012	AAG	2	6	4862556	4862561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294143032
70034	NC_014012	TCT	2	6	4862615	4862620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294143032
70035	NC_014012	TATT	2	8	4862818	4862825	25 %	75 %	0 %	0 %	294143033
70036	NC_014012	CTG	2	6	4862832	4862837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294143033
70037	NC_014012	AAT	2	6	4862848	4862853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294143033
70038	NC_014012	TGC	2	6	4862925	4862930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294143033
70039	NC_014012	GCTGA	2	10	4863135	4863144	20 %	20 %	40 %	20 %	294143033
70040	NC_014012	CAT	2	6	4863153	4863158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294143033
70041	NC_014012	GCA	2	6	4863223	4863228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294143033
70042	NC_014012	AGA	2	6	4863269	4863274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294143033
70043	NC_014012	TCA	2	6	4863505	4863510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294143033
70044	NC_014012	GCC	2	6	4863547	4863552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294143033
70045	NC_014012	GCCATT	2	12	4863627	4863638	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294143033
70046	NC_014012	ACC	2	6	4863656	4863661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294143033
70047	NC_014012	ATGA	2	8	4863662	4863669	50 %	25 %	25 %	0 %	294143033
70048	NC_014012	CTG	2	6	4863720	4863725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294143033
70049	NC_014012	AT	3	6	4863726	4863731	50 %	50 %	0 %	0 %	294143033
70050	NC_014012	A	6	6	4863821	4863826	100 %	0 %	0 %	0 %	294143033
70051	NC_014012	ACA	2	6	4863899	4863904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294143033
70052	NC_014012	CAT	2	6	4864016	4864021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294143033
70053	NC_014012	CTTA	2	8	4864119	4864126	25 %	50 %	0 %	25 %	294143033
70054	NC_014012	CTG	2	6	4864131	4864136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294143033
70055	NC_014012	AAT	2	6	4864159	4864164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294143033
70056	NC_014012	CTG	2	6	4864209	4864214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294143033
70057	NC_014012	ATG	2	6	4864384	4864389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294143033
70058	NC_014012	TTAA	2	8	4864435	4864442	50 %	50 %	0 %	0 %	294143033
70059	NC_014012	TGGG	2	8	4864461	4864468	0 %	25 %	75 %	0 %	294143033
70060	NC_014012	GTC	2	6	4864537	4864542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294143033
70061	NC_014012	TCC	2	6	4864690	4864695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294143033
70062	NC_014012	CT	3	6	4864853	4864858	0 %	50 %	0 %	50 %	294143033
70063	NC_014012	CTC	2	6	4864866	4864871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294143033
70064	NC_014012	AGA	2	6	4864900	4864905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294143033
70065	NC_014012	CGAGT	2	10	4864920	4864929	20 %	20 %	40 %	20 %	294143033
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70067	NC_014012	TAGC	2	8	4865197	4865204	25 %	25 %	25 %	25 %	294143034
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70069	NC_014012	AGA	2	6	4865312	4865317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294143034
70070	NC_014012	CTGT	2	8	4865383	4865390	0 %	50 %	25 %	25 %	294143034
70071	NC_014012	GT	3	6	4865389	4865394	0 %	50 %	50 %	0 %	294143034
70072	NC_014012	TAA	2	6	4865397	4865402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294143034
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70074	NC_014012	GACC	2	8	4865483	4865490	25 %	0 %	25 %	50 %	294143034
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70080	NC_014012	ATG	2	6	4865731	4865736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294143034
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70083	NC_014012	TAT	2	6	4866097	4866102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294143035
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70085	NC_014012	TGC	2	6	4866193	4866198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294143035
70086	NC_014012	GGC	2	6	4866228	4866233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294143035
70087	NC_014012	TCA	2	6	4866253	4866258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294143035
70088	NC_014012	TAGGCG	2	12	4866337	4866348	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294143035
70089	NC_014012	AC	3	6	4866359	4866364	50 %	0 %	0 %	50 %	294143035
70090	NC_014012	CGG	2	6	4866374	4866379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294143035
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70099	NC_014012	TGA	2	6	4866760	4866765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294143035
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70101	NC_014012	CAT	2	6	4866792	4866797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294143035
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70104	NC_014012	ATC	2	6	4866960	4866965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294143035
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70110	NC_014012	CCG	2	6	4867306	4867311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294143035
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70112	NC_014012	TGA	2	6	4867363	4867368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294143035
70113	NC_014012	AG	3	6	4867378	4867383	50 %	0 %	50 %	0 %	294143035
70114	NC_014012	CTA	2	6	4867518	4867523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294143035
70115	NC_014012	CAT	2	6	4867553	4867558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294143035
70116	NC_014012	GT	3	6	4868088	4868093	0 %	50 %	50 %	0 %	294143036
70117	NC_014012	CAC	2	6	4868112	4868117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294143036
70118	NC_014012	CCA	2	6	4868145	4868150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294143036
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70122	NC_014012	AG	3	6	4868388	4868393	50 %	0 %	50 %	0 %	294143036
70123	NC_014012	CTCA	2	8	4868424	4868431	25 %	25 %	0 %	50 %	294143036
70124	NC_014012	GAT	2	6	4868472	4868477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294143036
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70127	NC_014012	ATCT	2	8	4868645	4868652	25 %	50 %	0 %	25 %	294143036
70128	NC_014012	TGC	2	6	4868695	4868700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294143036
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70131	NC_014012	TTC	2	6	4868895	4868900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294143037
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70144	NC_014012	TGC	2	6	4869715	4869720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294143038
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70151	NC_014012	TCG	2	6	4870116	4870121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294143039
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70212	NC_014012	GATC	2	8	4874904	4874911	25 %	25 %	25 %	25 %	294143045
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70215	NC_014012	AGT	2	6	4875047	4875052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294143045
70216	NC_014012	GAC	2	6	4875096	4875101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294143045
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70218	NC_014012	ACG	2	6	4875310	4875315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294143045
70219	NC_014012	GGCAAT	2	12	4875337	4875348	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294143045
70220	NC_014012	CCG	2	6	4875360	4875365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294143045
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70223	NC_014012	CGC	2	6	4875475	4875480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294143045
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70227	NC_014012	GCG	2	6	4875815	4875820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294143045
70228	NC_014012	CAT	2	6	4876075	4876080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294143045
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70230	NC_014012	CTG	2	6	4876243	4876248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294143045
70231	NC_014012	CTT	2	6	4876388	4876393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294143046
70232	NC_014012	CGGCAT	2	12	4876460	4876471	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294143046
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70342	NC_014012	TAT	2	6	4883842	4883847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294143053
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70346	NC_014012	ATG	2	6	4884339	4884344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294143053
70347	NC_014012	TTC	2	6	4884345	4884350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294143053
70348	NC_014012	ATC	2	6	4884419	4884424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294143053
70349	NC_014012	CAC	2	6	4884433	4884438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294143053
70350	NC_014012	GTT	2	6	4884560	4884565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294143053
70351	NC_014012	CAC	2	6	4884586	4884591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294143053
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70353	NC_014012	AAC	2	6	4884636	4884641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294143053
70354	NC_014012	GCCTGT	2	12	4884755	4884766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294143053
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70451	NC_014012	AAAT	2	8	4892053	4892060	75 %	25 %	0 %	0 %	294143061
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70462	NC_014012	CCA	2	6	4892624	4892629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294143062
70463	NC_014012	AGC	2	6	4892698	4892703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294143062
70464	NC_014012	TTG	2	6	4892991	4892996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294143062
70465	NC_014012	CAGG	2	8	4893049	4893056	25 %	0 %	50 %	25 %	294143062
70466	NC_014012	GCT	2	6	4893116	4893121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294143062
70467	NC_014012	GGT	2	6	4893183	4893188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294143062
70468	NC_014012	TAA	2	6	4893264	4893269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294143062
70469	NC_014012	GA	3	6	4893301	4893306	50 %	0 %	50 %	0 %	294143062
70470	NC_014012	TAC	2	6	4893437	4893442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294143063
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70473	NC_014012	ACG	2	6	4893592	4893597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294143063
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70475	NC_014012	GCA	2	6	4893693	4893698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294143063
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70480	NC_014012	AG	3	6	4893928	4893933	50 %	0 %	50 %	0 %	294143064
70481	NC_014012	ATA	2	6	4893943	4893948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294143064
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70485	NC_014012	GTCT	2	8	4894100	4894107	0 %	50 %	25 %	25 %	294143064
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70488	NC_014012	AT	3	6	4894319	4894324	50 %	50 %	0 %	0 %	294143064
70489	NC_014012	GCCT	2	8	4894441	4894448	0 %	25 %	25 %	50 %	294143064
70490	NC_014012	GAT	2	6	4894498	4894503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294143064
70491	NC_014012	TAC	2	6	4894594	4894599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294143064
70492	NC_014012	TTA	2	6	4894693	4894698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294143064
70493	NC_014012	CAA	2	6	4894716	4894721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294143064
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70495	NC_014012	GCAT	2	8	4895006	4895013	25 %	25 %	25 %	25 %	294143064
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70497	NC_014012	ACG	2	6	4895066	4895071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294143064
70498	NC_014012	AG	3	6	4895092	4895097	50 %	0 %	50 %	0 %	294143064
70499	NC_014012	AGC	2	6	4895173	4895178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294143064
70500	NC_014012	CGC	2	6	4895222	4895227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294143064

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