MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014012	CAT	2	6	448229	448234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139144
6502	NC_014012	TC	3	6	448272	448277	0 %	50 %	0 %	50 %	294139144
6503	NC_014012	AG	3	6	448286	448291	50 %	0 %	50 %	0 %	294139144
6504	NC_014012	GTT	2	6	448390	448395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139145
6505	NC_014012	CGT	2	6	448411	448416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139145
6506	NC_014012	GTT	2	6	448445	448450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139145
6507	NC_014012	GTT	2	6	448495	448500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139145
6508	NC_014012	CT	3	6	448575	448580	0 %	50 %	0 %	50 %	294139145
6509	NC_014012	GGC	2	6	448607	448612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139145
6510	NC_014012	CGG	2	6	448660	448665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139145
6511	NC_014012	GAT	2	6	448740	448745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139145
6512	NC_014012	GCTG	2	8	448756	448763	0 %	25 %	50 %	25 %	294139145
6513	NC_014012	AAC	2	6	448829	448834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139145
6514	NC_014012	TTG	2	6	448883	448888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139145
6515	NC_014012	TCT	2	6	449115	449120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139146
6516	NC_014012	AGGT	2	8	449134	449141	25 %	25 %	50 %	0 %	294139146
6517	NC_014012	TGGCT	2	10	449144	449153	0 %	40 %	40 %	20 %	294139146
6518	NC_014012	ACT	2	6	449199	449204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139146
6519	NC_014012	CAG	2	6	449248	449253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139146
6520	NC_014012	GCTAAT	2	12	449340	449351	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294139146
6521	NC_014012	ATG	2	6	449352	449357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139146
6522	NC_014012	ATG	2	6	449370	449375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139146
6523	NC_014012	A	6	6	449549	449554	100 %	0 %	0 %	0 %	294139146
6524	NC_014012	ACTG	2	8	449613	449620	25 %	25 %	25 %	25 %	294139146
6525	NC_014012	AAG	2	6	449622	449627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139146
6526	NC_014012	TTG	2	6	449639	449644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139146
6527	NC_014012	GTT	2	6	449675	449680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139146
6528	NC_014012	CAA	2	6	449687	449692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139146
6529	NC_014012	AGC	2	6	449736	449741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139146
6530	NC_014012	GT	3	6	449751	449756	0 %	50 %	50 %	0 %	294139146
6531	NC_014012	ACC	2	6	449822	449827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139146
6532	NC_014012	TTG	2	6	449916	449921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139146
6533	NC_014012	AAT	2	6	449952	449957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139146
6534	NC_014012	ATA	2	6	450024	450029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139146
6535	NC_014012	ATG	2	6	450039	450044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139146
6536	NC_014012	CTG	2	6	450107	450112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139146
6537	NC_014012	AG	3	6	450155	450160	50 %	0 %	50 %	0 %	294139146
6538	NC_014012	AAT	2	6	450201	450206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139146
6539	NC_014012	ACA	2	6	450243	450248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139146
6540	NC_014012	AGT	2	6	450336	450341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139146
6541	NC_014012	AAATA	2	10	450353	450362	80 %	20 %	0 %	0 %	294139146
6542	NC_014012	A	6	6	450366	450371	100 %	0 %	0 %	0 %	294139146
6543	NC_014012	TG	3	6	450445	450450	0 %	50 %	50 %	0 %	294139146
6544	NC_014012	TCG	2	6	450463	450468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139146
6545	NC_014012	AATT	2	8	450481	450488	50 %	50 %	0 %	0 %	294139147
6546	NC_014012	TTTC	2	8	450489	450496	0 %	75 %	0 %	25 %	294139147
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6549	NC_014012	GCT	2	6	450598	450603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139147
6550	NC_014012	GTA	2	6	450637	450642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139147
6551	NC_014012	ATG	2	6	450706	450711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139147
6552	NC_014012	CAC	2	6	450760	450765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139147
6553	NC_014012	CTT	2	6	450843	450848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139147
6554	NC_014012	CCA	2	6	450897	450902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139147
6555	NC_014012	CTA	2	6	450963	450968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139147
6556	NC_014012	CTG	2	6	450987	450992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139147
6557	NC_014012	ATCGAT	2	12	451012	451023	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294139147
6558	NC_014012	CTT	2	6	451041	451046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139147
6559	NC_014012	ACTCA	2	10	451048	451057	40 %	20 %	0 %	40 %	294139147
6560	NC_014012	AAT	2	6	451090	451095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139147
6561	NC_014012	AT	3	6	451100	451105	50 %	50 %	0 %	0 %	294139147
6562	NC_014012	GTT	2	6	451483	451488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139148
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6564	NC_014012	GCCA	2	8	451524	451531	25 %	0 %	25 %	50 %	294139148
6565	NC_014012	TTAT	2	8	451614	451621	25 %	75 %	0 %	0 %	294139149
6566	NC_014012	CTT	2	6	451679	451684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139149
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6570	NC_014012	T	9	9	451990	451998	0 %	100 %	0 %	0 %	294139150
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6582	NC_014012	CCA	2	6	452642	452647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139150
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6588	NC_014012	ATT	3	9	452995	453003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139150
6589	NC_014012	TTA	2	6	453026	453031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139150
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6591	NC_014012	GTA	2	6	453075	453080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139150
6592	NC_014012	ACC	2	6	453111	453116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139150
6593	NC_014012	TCAA	2	8	453122	453129	50 %	25 %	0 %	25 %	294139150
6594	NC_014012	AAT	2	6	453157	453162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139150
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6600	NC_014012	TCCA	2	8	453611	453618	25 %	25 %	0 %	50 %	294139150
6601	NC_014012	CT	3	6	453629	453634	0 %	50 %	0 %	50 %	294139150
6602	NC_014012	TAT	3	9	453699	453707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139150
6603	NC_014012	ATT	2	6	454012	454017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139151
6604	NC_014012	ATTGAG	2	12	454039	454050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139151
6605	NC_014012	GAA	2	6	454080	454085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139151
6606	NC_014012	GCG	2	6	454163	454168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139151
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6608	NC_014012	ACC	2	6	454429	454434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139151
6609	NC_014012	GAT	2	6	454450	454455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139151
6610	NC_014012	CG	3	6	454460	454465	0 %	0 %	50 %	50 %	294139151
6611	NC_014012	TAT	2	6	454470	454475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139151
6612	NC_014012	ATTA	2	8	454492	454499	50 %	50 %	0 %	0 %	294139151
6613	NC_014012	A	6	6	454941	454946	100 %	0 %	0 %	0 %	294139152
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6615	NC_014012	A	6	6	455011	455016	100 %	0 %	0 %	0 %	294139152
6616	NC_014012	T	6	6	455061	455066	0 %	100 %	0 %	0 %	294139152
6617	NC_014012	TCT	2	6	455184	455189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139152
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6620	NC_014012	TGAG	2	8	455359	455366	25 %	25 %	50 %	0 %	294139152
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6622	NC_014012	GGC	2	6	455513	455518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139152
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6986	NC_014012	TGA	2	6	479194	479199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139180
6987	NC_014012	CTC	2	6	479213	479218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139180
6988	NC_014012	GGAGG	2	10	479289	479298	20 %	0 %	80 %	0 %	294139180
6989	NC_014012	TAAAA	2	10	479303	479312	80 %	20 %	0 %	0 %	294139180
6990	NC_014012	GCC	2	6	479325	479330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139180
6991	NC_014012	TGT	2	6	479408	479413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139180
6992	NC_014012	TC	3	6	479430	479435	0 %	50 %	0 %	50 %	294139180
6993	NC_014012	CGGCAT	2	12	479604	479615	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294139181
6994	NC_014012	T	6	6	479698	479703	0 %	100 %	0 %	0 %	294139181
6995	NC_014012	GC	3	6	479843	479848	0 %	0 %	50 %	50 %	294139182
6996	NC_014012	TGT	2	6	479913	479918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139182
6997	NC_014012	GTT	2	6	479957	479962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139182
6998	NC_014012	GTTG	2	8	480027	480034	0 %	50 %	50 %	0 %	294139182
6999	NC_014012	AACG	2	8	480115	480122	50 %	0 %	25 %	25 %	294139182
7000	NC_014012	CT	3	6	480305	480310	0 %	50 %	0 %	50 %	294139182

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