MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingobium japonicum UT26S plasmid pCHQ1

Total Repeats: 3905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014007	GGCC	2	8	173595	173602	0 %	0 %	50 %	50 %	294023866
3502	NC_014007	GAG	2	6	173654	173659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023867
3503	NC_014007	GGC	2	6	173703	173708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023867
3504	NC_014007	ACG	2	6	173710	173715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023867
3505	NC_014007	CG	3	6	173738	173743	0 %	0 %	50 %	50 %	294023867
3506	NC_014007	GCT	3	9	173773	173781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023867
3507	NC_014007	GC	3	6	173795	173800	0 %	0 %	50 %	50 %	294023867
3508	NC_014007	CGT	3	9	173848	173856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023867
3509	NC_014007	GAC	2	6	173864	173869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023867
3510	NC_014007	GGC	2	6	173899	173904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023867
3511	NC_014007	AGGA	2	8	173909	173916	50 %	0 %	50 %	0 %	294023867
3512	NC_014007	GCC	2	6	174053	174058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023868
3513	NC_014007	GCC	2	6	174066	174071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023868
3514	NC_014007	AAAG	2	8	174077	174084	75 %	0 %	25 %	0 %	294023868
3515	NC_014007	GGCC	2	8	174129	174136	0 %	0 %	50 %	50 %	294023868
3516	NC_014007	CGAC	2	8	174137	174144	25 %	0 %	25 %	50 %	294023868
3517	NC_014007	GAT	2	6	174162	174167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023868
3518	NC_014007	GATC	2	8	174195	174202	25 %	25 %	25 %	25 %	294023868
3519	NC_014007	AGA	2	6	174252	174257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023868
3520	NC_014007	TCG	2	6	174263	174268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023868
3521	NC_014007	GTC	2	6	174275	174280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023868
3522	NC_014007	CGC	2	6	174288	174293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023868
3523	NC_014007	CGAC	2	8	174294	174301	25 %	0 %	25 %	50 %	294023868
3524	NC_014007	CCT	2	6	174324	174329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023868
3525	NC_014007	TGA	2	6	174371	174376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023868
3526	NC_014007	GGCG	2	8	174386	174393	0 %	0 %	75 %	25 %	294023868
3527	NC_014007	CGG	2	6	174453	174458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023868
3528	NC_014007	CGGAG	2	10	174497	174506	20 %	0 %	60 %	20 %	294023868
3529	NC_014007	CG	3	6	174550	174555	0 %	0 %	50 %	50 %	294023868
3530	NC_014007	CCA	2	6	174586	174591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294023868
3531	NC_014007	CGG	2	6	174599	174604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023868
3532	NC_014007	TCG	2	6	174614	174619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023868
3533	NC_014007	CGG	2	6	174633	174638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023868
3534	NC_014007	GCT	2	6	174681	174686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023868
3535	NC_014007	GGA	2	6	174690	174695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023868
3536	NC_014007	CG	3	6	174700	174705	0 %	0 %	50 %	50 %	294023868
3537	NC_014007	GCG	2	6	174711	174716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023868
3538	NC_014007	CAT	2	6	174757	174762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023868
3539	NC_014007	TCC	2	6	174766	174771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023869
3540	NC_014007	TGA	2	6	174781	174786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023869
3541	NC_014007	CGG	2	6	174806	174811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023869
3542	NC_014007	GC	3	6	174831	174836	0 %	0 %	50 %	50 %	294023869
3543	NC_014007	CCG	2	6	174917	174922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023869
3544	NC_014007	GAA	2	6	175041	175046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023869
3545	NC_014007	GCCG	2	8	175079	175086	0 %	0 %	50 %	50 %	294023869
3546	NC_014007	CAG	2	6	175092	175097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023869
3547	NC_014007	GAG	2	6	175119	175124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023869
3548	NC_014007	GCC	2	6	175131	175136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023870
3549	NC_014007	GTCG	2	8	175142	175149	0 %	25 %	50 %	25 %	294023870
3550	NC_014007	GTC	2	6	175163	175168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023870
3551	NC_014007	AGC	2	6	175185	175190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023870
3552	NC_014007	GCC	2	6	175197	175202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023870
3553	NC_014007	CTGG	2	8	175211	175218	0 %	25 %	50 %	25 %	294023870
3554	NC_014007	GCA	2	6	175249	175254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023870
3555	NC_014007	CCAG	2	8	175258	175265	25 %	0 %	25 %	50 %	294023870
3556	NC_014007	GCA	2	6	175316	175321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023870
3557	NC_014007	GGC	2	6	175325	175330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023870
3558	NC_014007	GCG	2	6	175406	175411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023871
3559	NC_014007	GCT	2	6	175428	175433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023871
3560	NC_014007	CGG	2	6	175449	175454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023871
3561	NC_014007	GGC	2	6	175471	175476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023871
3562	NC_014007	GTC	2	6	175495	175500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023871
3563	NC_014007	GC	3	6	175508	175513	0 %	0 %	50 %	50 %	294023871
3564	NC_014007	GGC	2	6	175531	175536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023871
3565	NC_014007	ACGA	2	8	175580	175587	50 %	0 %	25 %	25 %	294023871
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3567	NC_014007	CGA	2	6	175824	175829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023871
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3569	NC_014007	ATC	3	9	175969	175977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023871
3570	NC_014007	GC	3	6	175979	175984	0 %	0 %	50 %	50 %	294023871
3571	NC_014007	CGT	2	6	176011	176016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023871
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3573	NC_014007	GCG	3	9	176143	176151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023871
3574	NC_014007	TGG	3	9	176172	176180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023871
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3584	NC_014007	TCG	2	6	176845	176850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023872
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3586	NC_014007	GCT	2	6	176922	176927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023872
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3589	NC_014007	CG	3	6	177218	177223	0 %	0 %	50 %	50 %	294023872
3590	NC_014007	CCCG	2	8	177229	177236	0 %	0 %	25 %	75 %	294023872
3591	NC_014007	CG	3	6	177235	177240	0 %	0 %	50 %	50 %	294023872
3592	NC_014007	CGC	4	12	177305	177316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023872
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3597	NC_014007	GGCCA	2	10	177621	177630	20 %	0 %	40 %	40 %	294023872
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3602	NC_014007	GCGTTG	2	12	177810	177821	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	294023872
3603	NC_014007	CGA	2	6	177829	177834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023872
3604	NC_014007	AGC	2	6	177961	177966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023872
3605	NC_014007	GCG	2	6	177992	177997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023872
3606	NC_014007	GC	3	6	178074	178079	0 %	0 %	50 %	50 %	294023872
3607	NC_014007	GAT	2	6	178088	178093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023872
3608	NC_014007	GCA	2	6	178124	178129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023872
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3610	NC_014007	CGGC	2	8	178286	178293	0 %	0 %	50 %	50 %	294023872
3611	NC_014007	ATGG	2	8	178366	178373	25 %	25 %	50 %	0 %	294023872
3612	NC_014007	CCG	2	6	178384	178389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023872
3613	NC_014007	CG	3	6	178414	178419	0 %	0 %	50 %	50 %	294023872
3614	NC_014007	GC	3	6	178478	178483	0 %	0 %	50 %	50 %	294023872
3615	NC_014007	AGGG	2	8	178521	178528	25 %	0 %	75 %	0 %	294023872
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3622	NC_014007	CGA	2	6	178747	178752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023873
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.