MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingobium japonicum UT26S plasmid pCHQ1

Total Repeats: 3905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014007	GCC	2	6	81964	81969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023762
1502	NC_014007	CGA	2	6	82002	82007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023762
1503	NC_014007	CGT	2	6	82012	82017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023762
1504	NC_014007	CGC	2	6	82027	82032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023762
1505	NC_014007	CGG	2	6	82041	82046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023762
1506	NC_014007	A	8	8	82052	82059	100 %	0 %	0 %	0 %	294023762
1507	NC_014007	GCT	2	6	82102	82107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023762
1508	NC_014007	ATC	2	6	82160	82165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023762
1509	NC_014007	CCG	2	6	82182	82187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023762
1510	NC_014007	GCT	2	6	82221	82226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023762
1511	NC_014007	GGT	2	6	82318	82323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023762
1512	NC_014007	CCAG	2	8	82327	82334	25 %	0 %	25 %	50 %	294023762
1513	NC_014007	TCG	2	6	82347	82352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023762
1514	NC_014007	GAA	2	6	82363	82368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023762
1515	NC_014007	CGGCG	2	10	82399	82408	0 %	0 %	60 %	40 %	294023762
1516	NC_014007	GCC	2	6	82526	82531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023762
1517	NC_014007	CGG	2	6	82546	82551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023762
1518	NC_014007	CG	3	6	82597	82602	0 %	0 %	50 %	50 %	294023762
1519	NC_014007	TCG	2	6	82617	82622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023762
1520	NC_014007	GTC	3	9	82646	82654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023762
1521	NC_014007	AGG	2	6	82659	82664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023762
1522	NC_014007	CTC	2	6	82762	82767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023763
1523	NC_014007	GCT	2	6	82779	82784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023763
1524	NC_014007	CATC	2	8	82866	82873	25 %	25 %	0 %	50 %	294023763
1525	NC_014007	CCG	2	6	82934	82939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023763
1526	NC_014007	GCT	2	6	82947	82952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023763
1527	NC_014007	GCG	2	6	82958	82963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023763
1528	NC_014007	CGG	2	6	82964	82969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023763
1529	NC_014007	CGG	2	6	82995	83000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023763
1530	NC_014007	GAT	2	6	83086	83091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023763
1531	NC_014007	CGC	2	6	83114	83119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023763
1532	NC_014007	GAC	2	6	83302	83307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023763
1533	NC_014007	GGGC	2	8	83366	83373	0 %	0 %	75 %	25 %	294023764
1534	NC_014007	TCG	2	6	83434	83439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023764
1535	NC_014007	AG	3	6	83451	83456	50 %	0 %	50 %	0 %	294023764
1536	NC_014007	GAT	2	6	83475	83480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023764
1537	NC_014007	TTC	2	6	83584	83589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023764
1538	NC_014007	CGC	2	6	83621	83626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023764
1539	NC_014007	CG	3	6	83655	83660	0 %	0 %	50 %	50 %	294023764
1540	NC_014007	CCG	2	6	83692	83697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023764
1541	NC_014007	CGG	2	6	83784	83789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023764
1542	NC_014007	GCGA	2	8	83796	83803	25 %	0 %	50 %	25 %	294023764
1543	NC_014007	GAG	2	6	83820	83825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023764
1544	NC_014007	CGC	2	6	83883	83888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023764
1545	NC_014007	GC	3	6	83911	83916	0 %	0 %	50 %	50 %	294023764
1546	NC_014007	AGCGA	2	10	83931	83940	40 %	0 %	40 %	20 %	294023764
1547	NC_014007	ATC	2	6	83976	83981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023764
1548	NC_014007	GCG	2	6	84068	84073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023764
1549	NC_014007	CCG	2	6	84079	84084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023764
1550	NC_014007	CG	3	6	84087	84092	0 %	0 %	50 %	50 %	294023764
1551	NC_014007	CGG	2	6	84104	84109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023764
1552	NC_014007	CGG	2	6	84143	84148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023764
1553	NC_014007	AGC	2	6	84233	84238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023764
1554	NC_014007	GAG	2	6	84273	84278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023764
1555	NC_014007	GC	3	6	84358	84363	0 %	0 %	50 %	50 %	294023764
1556	NC_014007	GAGC	2	8	84404	84411	25 %	0 %	50 %	25 %	294023764
1557	NC_014007	ATG	2	6	84423	84428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023764
1558	NC_014007	AGG	2	6	84430	84435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023764
1559	NC_014007	CTG	2	6	84456	84461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023764
1560	NC_014007	GGC	2	6	84542	84547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023764
1561	NC_014007	GCC	2	6	84589	84594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023764
1562	NC_014007	CAA	2	6	84659	84664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294023764
1563	NC_014007	CCG	2	6	84682	84687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023764
1564	NC_014007	GCG	2	6	84691	84696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023764
1565	NC_014007	CAA	2	6	84716	84721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294023764
1566	NC_014007	GC	3	6	84748	84753	0 %	0 %	50 %	50 %	294023764
1567	NC_014007	CAT	2	6	84761	84766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023764
1568	NC_014007	CGG	2	6	84773	84778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023764
1569	NC_014007	ACATCG	2	12	84817	84828	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294023764
1570	NC_014007	GAG	2	6	84831	84836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023764
1571	NC_014007	CGG	2	6	84988	84993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023764
1572	NC_014007	CGA	2	6	85007	85012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023764
1573	NC_014007	GC	3	6	85043	85048	0 %	0 %	50 %	50 %	294023764
1574	NC_014007	CGC	2	6	85073	85078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023764
1575	NC_014007	ATC	2	6	85099	85104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023764
1576	NC_014007	CG	3	6	85115	85120	0 %	0 %	50 %	50 %	294023764
1577	NC_014007	CGAG	2	8	85150	85157	25 %	0 %	50 %	25 %	294023764
1578	NC_014007	CTT	2	6	85172	85177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023764
1579	NC_014007	CGA	2	6	85208	85213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023764
1580	NC_014007	TCG	2	6	85216	85221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023764
1581	NC_014007	CGTCAT	2	12	85265	85276	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294023764
1582	NC_014007	GGT	3	9	85277	85285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023764
1583	NC_014007	CCGC	2	8	85315	85322	0 %	0 %	25 %	75 %	294023764
1584	NC_014007	GC	5	10	85427	85436	0 %	0 %	50 %	50 %	294023764
1585	NC_014007	ATGA	2	8	85473	85480	50 %	25 %	25 %	0 %	294023764
1586	NC_014007	CGG	2	6	85493	85498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023764
1587	NC_014007	GCT	2	6	85610	85615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023764
1588	NC_014007	TCCG	2	8	85620	85627	0 %	25 %	25 %	50 %	294023764
1589	NC_014007	CGC	2	6	85666	85671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023764
1590	NC_014007	CG	3	6	85685	85690	0 %	0 %	50 %	50 %	294023764
1591	NC_014007	TCG	3	9	85693	85701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023764
1592	NC_014007	GC	3	6	85766	85771	0 %	0 %	50 %	50 %	294023764
1593	NC_014007	CGC	2	6	85780	85785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023764
1594	NC_014007	CG	3	6	85837	85842	0 %	0 %	50 %	50 %	294023764
1595	NC_014007	TGC	2	6	85918	85923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023765
1596	NC_014007	AGC	2	6	86055	86060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023765
1597	NC_014007	TCG	2	6	86091	86096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023765
1598	NC_014007	GCT	2	6	86103	86108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023765
1599	NC_014007	TC	3	6	86199	86204	0 %	50 %	0 %	50 %	294023766
1600	NC_014007	TGC	2	6	86252	86257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023766
1601	NC_014007	CAG	2	6	86286	86291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023766
1602	NC_014007	GGC	2	6	86313	86318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023766
1603	NC_014007	CGC	2	6	86361	86366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023766
1604	NC_014007	ATC	2	6	86368	86373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023766
1605	NC_014007	TCC	2	6	86431	86436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294023767
1606	NC_014007	GC	3	6	86447	86452	0 %	0 %	50 %	50 %	294023767
1607	NC_014007	CAGG	2	8	86465	86472	25 %	0 %	50 %	25 %	294023767
1608	NC_014007	CTG	2	6	86486	86491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023767
1609	NC_014007	GCG	2	6	86516	86521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023767
1610	NC_014007	CTCG	2	8	86637	86644	0 %	25 %	25 %	50 %	294023767
1611	NC_014007	GC	3	6	86690	86695	0 %	0 %	50 %	50 %	294023767
1612	NC_014007	CCGA	2	8	86867	86874	25 %	0 %	25 %	50 %	294023767
1613	NC_014007	CTG	2	6	86882	86887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023767
1614	NC_014007	GGC	3	9	86894	86902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023767
1615	NC_014007	CG	3	6	87070	87075	0 %	0 %	50 %	50 %	294023767
1616	NC_014007	GCGCTG	2	12	87101	87112	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	294023768
1617	NC_014007	CTG	2	6	87130	87135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023768
1618	NC_014007	CCG	2	6	87167	87172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023768
1619	NC_014007	CGG	2	6	87231	87236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023768
1620	NC_014007	TCG	2	6	87289	87294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023768
1621	NC_014007	GTG	2	6	87379	87384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023768
1622	NC_014007	ATG	2	6	87400	87405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023768
1623	NC_014007	ACT	2	6	87506	87511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023768
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1995	NC_014007	CGA	2	6	105438	105443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023788
1996	NC_014007	CCCA	2	8	105511	105518	25 %	0 %	0 %	75 %	294023788
1997	NC_014007	GGCAG	2	10	105576	105585	20 %	0 %	60 %	20 %	294023788
1998	NC_014007	GCCCA	2	10	105661	105670	20 %	0 %	20 %	60 %	294023788
1999	NC_014007	TCG	2	6	105692	105697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023788
2000	NC_014007	CGC	2	6	105708	105713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023788

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