MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingobium japonicum UT26S plasmid pCHQ1

Total Repeats: 3905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014007	GGC	2	6	25334	25339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023689
502	NC_014007	C	7	7	25370	25376	0 %	0 %	0 %	100 %	294023689
503	NC_014007	TCGCC	2	10	25377	25386	0 %	20 %	20 %	60 %	294023689
504	NC_014007	GCC	2	6	25459	25464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023689
505	NC_014007	GCC	2	6	25468	25473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023689
506	NC_014007	GAC	2	6	25539	25544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023689
507	NC_014007	CGG	2	6	25592	25597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023689
508	NC_014007	CCGCG	2	10	25607	25616	0 %	0 %	40 %	60 %	294023689
509	NC_014007	CGC	2	6	25689	25694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023689
510	NC_014007	CGG	2	6	25706	25711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023689
511	NC_014007	GGC	2	6	25752	25757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023689
512	NC_014007	TTGC	2	8	25854	25861	0 %	50 %	25 %	25 %	294023690
513	NC_014007	GGC	2	6	25916	25921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023690
514	NC_014007	GCA	2	6	25936	25941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023690
515	NC_014007	GCA	2	6	25957	25962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023690
516	NC_014007	AGC	3	9	25968	25976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023690
517	NC_014007	AAG	2	6	26001	26006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023690
518	NC_014007	CCGC	2	8	26056	26063	0 %	0 %	25 %	75 %	294023690
519	NC_014007	GCC	2	6	26200	26205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023691
520	NC_014007	TTA	2	6	26239	26244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294023691
521	NC_014007	AAT	2	6	26334	26339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294023691
522	NC_014007	GCG	2	6	26373	26378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023691
523	NC_014007	TGC	2	6	26392	26397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023691
524	NC_014007	CA	3	6	26447	26452	50 %	0 %	0 %	50 %	294023691
525	NC_014007	CG	3	6	26514	26519	0 %	0 %	50 %	50 %	294023691
526	NC_014007	CG	3	6	26600	26605	0 %	0 %	50 %	50 %	294023691
527	NC_014007	TCG	2	6	26629	26634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023691
528	NC_014007	CGG	2	6	26635	26640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023691
529	NC_014007	GCG	2	6	26835	26840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023692
530	NC_014007	CCA	2	6	26876	26881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294023692
531	NC_014007	CGT	2	6	26938	26943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023692
532	NC_014007	TCG	2	6	26973	26978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023692
533	NC_014007	TCA	2	6	27042	27047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023692
534	NC_014007	CTT	2	6	27104	27109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023692
535	NC_014007	GCA	2	6	27160	27165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023692
536	NC_014007	CGC	2	6	27196	27201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023692
537	NC_014007	TGA	2	6	27289	27294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023692
538	NC_014007	CTT	2	6	27373	27378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023692
539	NC_014007	GGAC	2	8	27471	27478	25 %	0 %	50 %	25 %	294023693
540	NC_014007	GTGAT	2	10	27516	27525	20 %	40 %	40 %	0 %	294023693
541	NC_014007	ACG	2	6	27617	27622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023693
542	NC_014007	GGC	2	6	27681	27686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023693
543	NC_014007	ACCT	2	8	27746	27753	25 %	25 %	0 %	50 %	294023693
544	NC_014007	CGAT	2	8	27783	27790	25 %	25 %	25 %	25 %	294023693
545	NC_014007	GA	3	6	28169	28174	50 %	0 %	50 %	0 %	294023693
546	NC_014007	ACC	2	6	28224	28229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294023693
547	NC_014007	GCA	2	6	28235	28240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023693
548	NC_014007	GCC	2	6	28241	28246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023693
549	NC_014007	GCC	2	6	28280	28285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023694
550	NC_014007	TGC	2	6	28327	28332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023694
551	NC_014007	GCG	2	6	28333	28338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023694
552	NC_014007	GTGG	2	8	28353	28360	0 %	25 %	75 %	0 %	294023694
553	NC_014007	AGCGCG	2	12	28429	28440	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	294023694
554	NC_014007	GCCA	2	8	28511	28518	25 %	0 %	25 %	50 %	294023694
555	NC_014007	GCG	2	6	28520	28525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023694
556	NC_014007	TCGACG	2	12	28540	28551	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294023694
557	NC_014007	TTC	2	6	28607	28612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023695
558	NC_014007	TGC	2	6	28662	28667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023695
559	NC_014007	GTG	2	6	28738	28743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023695
560	NC_014007	GA	3	6	28775	28780	50 %	0 %	50 %	0 %	294023695
561	NC_014007	AGCG	2	8	28788	28795	25 %	0 %	50 %	25 %	294023695
562	NC_014007	CGGC	2	8	28800	28807	0 %	0 %	50 %	50 %	294023695
563	NC_014007	GC	3	6	28814	28819	0 %	0 %	50 %	50 %	294023695
564	NC_014007	GCTG	2	8	28884	28891	0 %	25 %	50 %	25 %	294023695
565	NC_014007	GACC	2	8	28918	28925	25 %	0 %	25 %	50 %	294023695
566	NC_014007	GGT	2	6	28927	28932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023695
567	NC_014007	GGC	2	6	28961	28966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023695
568	NC_014007	CAT	2	6	29117	29122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023695
569	NC_014007	AGCGA	2	10	29150	29159	40 %	0 %	40 %	20 %	294023695
570	NC_014007	GCT	2	6	29195	29200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023695
571	NC_014007	TCG	2	6	29202	29207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023695
572	NC_014007	CGA	2	6	29291	29296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023695
573	NC_014007	AGG	2	6	29346	29351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023695
574	NC_014007	GCT	2	6	29383	29388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023695
575	NC_014007	CAC	2	6	29423	29428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294023695
576	NC_014007	CAG	2	6	29552	29557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023695
577	NC_014007	GCC	2	6	29594	29599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023695
578	NC_014007	GGGC	2	8	29692	29699	0 %	0 %	75 %	25 %	294023695
579	NC_014007	GCA	2	6	29788	29793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023696
580	NC_014007	AAG	2	6	29801	29806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023696
581	NC_014007	AAG	2	6	29843	29848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023696
582	NC_014007	CAC	2	6	29864	29869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294023696
583	NC_014007	CGGC	2	8	29964	29971	0 %	0 %	50 %	50 %	294023696
584	NC_014007	GGGA	2	8	30046	30053	25 %	0 %	75 %	0 %	294023696
585	NC_014007	ATG	2	6	30064	30069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023696
586	NC_014007	TCCGC	2	10	30126	30135	0 %	20 %	20 %	60 %	294023696
587	NC_014007	GTC	2	6	30146	30151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023696
588	NC_014007	GCC	2	6	30154	30159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023697
589	NC_014007	GGA	2	6	30224	30229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023697
590	NC_014007	GC	3	6	30260	30265	0 %	0 %	50 %	50 %	294023697
591	NC_014007	GGT	3	9	30273	30281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023697
592	NC_014007	G	6	6	30290	30295	0 %	0 %	100 %	0 %	294023697
593	NC_014007	AGC	2	6	30349	30354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023697
594	NC_014007	GCGAT	2	10	30373	30382	20 %	20 %	40 %	20 %	294023697
595	NC_014007	CGGC	2	8	30391	30398	0 %	0 %	50 %	50 %	294023697
596	NC_014007	GCG	2	6	30440	30445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023697
597	NC_014007	ATG	2	6	30613	30618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023697
598	NC_014007	GCG	2	6	30648	30653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023698
599	NC_014007	CGG	2	6	30656	30661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023698
600	NC_014007	CGG	2	6	30774	30779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023698
601	NC_014007	TCG	2	6	30798	30803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023698
602	NC_014007	C	6	6	30872	30877	0 %	0 %	0 %	100 %	294023698
603	NC_014007	CGC	2	6	30901	30906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023698
604	NC_014007	GCC	2	6	30975	30980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023698
605	NC_014007	GCG	2	6	30998	31003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023698
606	NC_014007	CAA	2	6	31016	31021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294023698
607	NC_014007	CGC	2	6	31062	31067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023698
608	NC_014007	GGC	2	6	31076	31081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023698
609	NC_014007	ACCGA	2	10	31101	31110	40 %	0 %	20 %	40 %	294023698
610	NC_014007	GC	3	6	31115	31120	0 %	0 %	50 %	50 %	294023698
611	NC_014007	AGC	2	6	31122	31127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294023698
612	NC_014007	CGG	2	6	31132	31137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023698
613	NC_014007	GGTC	2	8	31138	31145	0 %	25 %	50 %	25 %	294023698
614	NC_014007	CGT	2	6	31208	31213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294023698
615	NC_014007	TGA	2	6	31216	31221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294023698
616	NC_014007	GCG	2	6	31224	31229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023698
617	NC_014007	CAT	2	6	31261	31266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294023698
618	NC_014007	GC	3	6	31445	31450	0 %	0 %	50 %	50 %	294023699
619	NC_014007	CGC	2	6	31476	31481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023699
620	NC_014007	CG	3	6	31500	31505	0 %	0 %	50 %	50 %	294023699
621	NC_014007	GGC	2	6	31515	31520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294023699
622	NC_014007	GAG	2	6	31635	31640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294023699
623	NC_014007	CGC	2	6	31643	31648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294023699
624	NC_014007	TGG	2	6	31678	31683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294023699
625	NC_014007	TCT	2	6	31708	31713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294023699
626	NC_014007	GAA	2	6	31727	31732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294023699
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