MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingobium japonicum UT26S plasmid pUT1

Total Repeats: 626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014005	ATG	2	6	25777	25782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293980679
502	NC_014005	CG	3	6	25790	25795	0 %	0 %	50 %	50 %	293980679
503	NC_014005	GAA	2	6	25848	25853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293980679
504	NC_014005	GCT	2	6	25926	25931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980679
505	NC_014005	CGC	2	6	25932	25937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980679
506	NC_014005	GGA	2	6	25956	25961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293980679
507	NC_014005	CTT	2	6	25992	25997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293980679
508	NC_014005	GGC	2	6	26032	26037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980679
509	NC_014005	GGC	2	6	26162	26167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980680
510	NC_014005	TCG	2	6	26187	26192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980680
511	NC_014005	CGA	3	9	26200	26208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980680
512	NC_014005	GCC	2	6	26243	26248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980680
513	NC_014005	CG	3	6	26249	26254	0 %	0 %	50 %	50 %	293980680
514	NC_014005	GCG	2	6	26287	26292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980680
515	NC_014005	CGGAAG	2	12	26313	26324	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	293980680
516	NC_014005	GGAA	2	8	26338	26345	50 %	0 %	50 %	0 %	293980680
517	NC_014005	TGAC	2	8	26353	26360	25 %	25 %	25 %	25 %	293980680
518	NC_014005	CTCGC	2	10	26436	26445	0 %	20 %	20 %	60 %	293980681
519	NC_014005	CG	3	6	26512	26517	0 %	0 %	50 %	50 %	293980681
520	NC_014005	TGG	2	6	26554	26559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293980681
521	NC_014005	CGC	3	9	26567	26575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980681
522	NC_014005	CG	3	6	26628	26633	0 %	0 %	50 %	50 %	293980682
523	NC_014005	CG	3	6	26666	26671	0 %	0 %	50 %	50 %	293980682
524	NC_014005	CCG	2	6	26694	26699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980682
525	NC_014005	CGA	2	6	26773	26778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980682
526	NC_014005	TGC	2	6	26796	26801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980682
527	NC_014005	GC	3	6	26800	26805	0 %	0 %	50 %	50 %	293980682
528	NC_014005	C	6	6	26815	26820	0 %	0 %	0 %	100 %	293980682
529	NC_014005	GCT	2	6	26848	26853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980682
530	NC_014005	ATC	2	6	26856	26861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980682
531	NC_014005	ATC	2	6	26927	26932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980683
532	NC_014005	CGC	2	6	26937	26942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980683
533	NC_014005	GGC	2	6	27031	27036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980683
534	NC_014005	CG	4	8	27069	27076	0 %	0 %	50 %	50 %	293980683
535	NC_014005	TCG	3	9	27128	27136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980683
536	NC_014005	TGG	2	6	27169	27174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293980683
537	NC_014005	CGA	2	6	27183	27188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980683
538	NC_014005	TC	3	6	27222	27227	0 %	50 %	0 %	50 %	293980683
539	NC_014005	CG	4	8	27279	27286	0 %	0 %	50 %	50 %	293980683
540	NC_014005	CTT	2	6	27294	27299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293980683
541	NC_014005	ACGCC	2	10	27384	27393	20 %	0 %	20 %	60 %	293980683
542	NC_014005	CGC	2	6	27429	27434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980683
543	NC_014005	CG	3	6	27479	27484	0 %	0 %	50 %	50 %	293980683
544	NC_014005	GCG	2	6	27487	27492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980683
545	NC_014005	TGC	2	6	27497	27502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980683
546	NC_014005	TGC	2	6	27533	27538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980683
547	NC_014005	GCTC	2	8	27587	27594	0 %	25 %	25 %	50 %	293980683
548	NC_014005	CG	3	6	27632	27637	0 %	0 %	50 %	50 %	293980683
549	NC_014005	CG	3	6	27643	27648	0 %	0 %	50 %	50 %	293980683
550	NC_014005	CGC	2	6	27652	27657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980683
551	NC_014005	GC	3	6	27675	27680	0 %	0 %	50 %	50 %	293980683
552	NC_014005	CGA	2	6	27723	27728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980683
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554	NC_014005	TCG	2	6	27740	27745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980683
555	NC_014005	CGC	3	9	27771	27779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980683
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557	NC_014005	CGC	2	6	27875	27880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980684
558	NC_014005	CGA	2	6	27920	27925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980684
559	NC_014005	GC	3	6	27953	27958	0 %	0 %	50 %	50 %	293980684
560	NC_014005	GTT	2	6	27980	27985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	293980684
561	NC_014005	CGC	2	6	28007	28012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980684
562	NC_014005	GCC	2	6	28023	28028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980684
563	NC_014005	CCG	2	6	28063	28068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980684
564	NC_014005	ACA	2	6	28195	28200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	293980684
565	NC_014005	CGC	2	6	28220	28225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980684
566	NC_014005	TC	3	6	28265	28270	0 %	50 %	0 %	50 %	293980684
567	NC_014005	CG	4	8	28325	28332	0 %	0 %	50 %	50 %	293980684
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570	NC_014005	GGC	2	6	28398	28403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980684
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574	NC_014005	CG	3	6	28584	28589	0 %	0 %	50 %	50 %	293980685
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598	NC_014005	CG	5	10	29729	29738	0 %	0 %	50 %	50 %	293980685
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602	NC_014005	CG	3	6	29883	29888	0 %	0 %	50 %	50 %	293980685
603	NC_014005	GCGCC	2	10	29897	29906	0 %	0 %	40 %	60 %	293980685
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612	NC_014005	CGA	2	6	30696	30701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980686
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616	NC_014005	GTC	2	6	30998	31003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980687
617	NC_014005	GC	3	6	31004	31009	0 %	0 %	50 %	50 %	293980687
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626	NC_014005	TTC	2	6	31401	31406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293980688

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.