MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 60283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_013959	CGC	2	6	2420220	2420225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614849
48002	NC_013959	GC	3	6	2420233	2420238	0 %	0 %	50 %	50 %	291614849
48003	NC_013959	GATA	2	8	2420306	2420313	50 %	25 %	25 %	0 %	291614849
48004	NC_013959	TCA	2	6	2420336	2420341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614850
48005	NC_013959	CCCAG	2	10	2420342	2420351	20 %	0 %	20 %	60 %	291614850
48006	NC_013959	TGC	2	6	2420369	2420374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614850
48007	NC_013959	GGC	2	6	2420481	2420486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614850
48008	NC_013959	ACA	2	6	2420531	2420536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614850
48009	NC_013959	TGG	2	6	2420590	2420595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614850
48010	NC_013959	TGG	3	9	2420597	2420605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614850
48011	NC_013959	CGG	2	6	2420646	2420651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614850
48012	NC_013959	CAA	2	6	2420658	2420663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614850
48013	NC_013959	GAT	2	6	2420679	2420684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614850
48014	NC_013959	TCA	2	6	2420699	2420704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614850
48015	NC_013959	CGC	2	6	2420738	2420743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614850
48016	NC_013959	GGCA	2	8	2420751	2420758	25 %	0 %	50 %	25 %	291614850
48017	NC_013959	CGC	2	6	2420846	2420851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614850
48018	NC_013959	CGG	2	6	2420970	2420975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614850
48019	NC_013959	ATCT	2	8	2420977	2420984	25 %	50 %	0 %	25 %	291614850
48020	NC_013959	GCT	2	6	2420985	2420990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614850
48021	NC_013959	CAT	2	6	2420997	2421002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614850
48022	NC_013959	CGC	2	6	2421089	2421094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614850
48023	NC_013959	TTC	2	6	2421133	2421138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614850
48024	NC_013959	ACC	3	9	2421166	2421174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614850
48025	NC_013959	GGC	2	6	2421235	2421240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614850
48026	NC_013959	TGA	2	6	2421272	2421277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614850
48027	NC_013959	GGC	2	6	2421337	2421342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614850
48028	NC_013959	TTC	2	6	2421393	2421398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614851
48029	NC_013959	GAA	2	6	2421465	2421470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291614851
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48031	NC_013959	GTT	2	6	2421512	2421517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614851
48032	NC_013959	CAT	2	6	2421527	2421532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614851
48033	NC_013959	CTG	2	6	2421564	2421569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614851
48034	NC_013959	GTG	2	6	2421627	2421632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614851
48035	NC_013959	GGC	2	6	2421660	2421665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614851
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48037	NC_013959	CG	3	6	2421805	2421810	0 %	0 %	50 %	50 %	291614851
48038	NC_013959	GAA	2	6	2421839	2421844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291614851
48039	NC_013959	CGG	2	6	2421848	2421853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614851
48040	NC_013959	CG	4	8	2421889	2421896	0 %	0 %	50 %	50 %	291614851
48041	NC_013959	AAGG	2	8	2421971	2421978	50 %	0 %	50 %	0 %	291614851
48042	NC_013959	GTG	2	6	2422049	2422054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614852
48043	NC_013959	GCT	2	6	2422075	2422080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614852
48044	NC_013959	CAG	2	6	2422087	2422092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614852
48045	NC_013959	GTG	2	6	2422097	2422102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614852
48046	NC_013959	TCA	2	6	2422215	2422220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614852
48047	NC_013959	GTG	2	6	2422238	2422243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614852
48048	NC_013959	TGA	2	6	2422251	2422256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614852
48049	NC_013959	GTC	2	6	2422280	2422285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614852
48050	NC_013959	AAT	2	6	2422358	2422363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291614852
48051	NC_013959	TTC	2	6	2422369	2422374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614852
48052	NC_013959	CCG	2	6	2422410	2422415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614852
48053	NC_013959	ACT	2	6	2422444	2422449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614852
48054	NC_013959	GTT	2	6	2422462	2422467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614852
48055	NC_013959	TGC	2	6	2422512	2422517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614852
48056	NC_013959	CAT	2	6	2422519	2422524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614852
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48058	NC_013959	TCGGCC	2	12	2422575	2422586	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291614852
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48065	NC_013959	AGCA	2	8	2422959	2422966	50 %	0 %	25 %	25 %	291614853
48066	NC_013959	CAT	2	6	2422967	2422972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614853
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48071	NC_013959	GC	3	6	2423268	2423273	0 %	0 %	50 %	50 %	291614853
48072	NC_013959	GCG	2	6	2423284	2423289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614853
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48082	NC_013959	GCGCA	2	10	2423696	2423705	20 %	0 %	40 %	40 %	291614854
48083	NC_013959	AAT	2	6	2423754	2423759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291614854
48084	NC_013959	CGA	2	6	2423790	2423795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614855
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48087	NC_013959	TGC	2	6	2423894	2423899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614855
48088	NC_013959	TGA	2	6	2423928	2423933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614855
48089	NC_013959	GCC	2	6	2424028	2424033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614855
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48098	NC_013959	GAA	2	6	2424526	2424531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291614856
48099	NC_013959	GTA	2	6	2424595	2424600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614856
48100	NC_013959	TGT	2	6	2424681	2424686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614856
48101	NC_013959	CCA	2	6	2424711	2424716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614856
48102	NC_013959	GCT	2	6	2424725	2424730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614856
48103	NC_013959	CGC	2	6	2424802	2424807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614856
48104	NC_013959	GGAT	2	8	2424879	2424886	25 %	25 %	50 %	0 %	291614856
48105	NC_013959	GC	3	6	2424961	2424966	0 %	0 %	50 %	50 %	291614856
48106	NC_013959	CGAATT	2	12	2425020	2425031	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291614856
48107	NC_013959	GCA	2	6	2425076	2425081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614856
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48109	NC_013959	GCA	2	6	2425098	2425103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614856
48110	NC_013959	TGC	2	6	2425110	2425115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614856
48111	NC_013959	GTG	3	9	2425180	2425188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614857
48112	NC_013959	CG	3	6	2425250	2425255	0 %	0 %	50 %	50 %	291614857
48113	NC_013959	CG	3	6	2425286	2425291	0 %	0 %	50 %	50 %	291614857
48114	NC_013959	CGCC	2	8	2425301	2425308	0 %	0 %	25 %	75 %	291614857
48115	NC_013959	GC	3	6	2425329	2425334	0 %	0 %	50 %	50 %	291614857
48116	NC_013959	GTC	3	9	2425378	2425386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614857
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48225	NC_013959	T	6	6	2430231	2430236	0 %	100 %	0 %	0 %	291614863
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48231	NC_013959	CAA	2	6	2430577	2430582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614863
48232	NC_013959	GCG	2	6	2430596	2430601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614863
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48242	NC_013959	GCA	2	6	2431277	2431282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614864
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48342	NC_013959	CGA	2	6	2436095	2436100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614869
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48461	NC_013959	CTA	2	6	2441357	2441362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614873
48462	NC_013959	CAC	2	6	2441391	2441396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614873
48463	NC_013959	TGC	3	9	2441422	2441430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614873
48464	NC_013959	GCT	2	6	2441459	2441464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614873
48465	NC_013959	CGA	2	6	2441465	2441470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614873
48466	NC_013959	TGC	2	6	2441528	2441533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614873
48467	NC_013959	GGCA	2	8	2441538	2441545	25 %	0 %	50 %	25 %	291614873
48468	NC_013959	GCGCG	2	10	2441597	2441606	0 %	0 %	60 %	40 %	291614873
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48470	NC_013959	ACT	2	6	2441644	2441649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614873
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48472	NC_013959	GCC	2	6	2441700	2441705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614873
48473	NC_013959	TAC	2	6	2441706	2441711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614873
48474	NC_013959	GTT	2	6	2441850	2441855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614874
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48481	NC_013959	ATG	2	6	2442017	2442022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614874
48482	NC_013959	GCA	2	6	2442057	2442062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614874
48483	NC_013959	GGC	2	6	2442085	2442090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614874
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48486	NC_013959	CAGC	3	12	2442119	2442130	25 %	0 %	25 %	50 %	291614874
48487	NC_013959	TGG	2	6	2442168	2442173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614874
48488	NC_013959	GGC	2	6	2442181	2442186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614874
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48490	NC_013959	CAA	2	6	2442238	2442243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614874
48491	NC_013959	CAGC	2	8	2442271	2442278	25 %	0 %	25 %	50 %	291614874
48492	NC_013959	CAG	2	6	2442352	2442357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614874
48493	NC_013959	GAA	2	6	2442364	2442369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291614874
48494	NC_013959	CTG	2	6	2442418	2442423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614874
48495	NC_013959	ACG	2	6	2442449	2442454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614874
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48497	NC_013959	CGAG	2	8	2442474	2442481	25 %	0 %	50 %	25 %	291614874
48498	NC_013959	GC	3	6	2442499	2442504	0 %	0 %	50 %	50 %	291614874
48499	NC_013959	CTG	2	6	2442509	2442514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614874
48500	NC_013959	TGG	2	6	2442552	2442557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614874

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