MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 60283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_013959	CGC	2	6	2221621	2221626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614648
44002	NC_013959	CGG	2	6	2221690	2221695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614648
44003	NC_013959	CGG	2	6	2221713	2221718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614648
44004	NC_013959	GCC	2	6	2221784	2221789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614648
44005	NC_013959	ATC	2	6	2221896	2221901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614648
44006	NC_013959	ACGCG	2	10	2221921	2221930	20 %	0 %	40 %	40 %	291614648
44007	NC_013959	TG	3	6	2221976	2221981	0 %	50 %	50 %	0 %	291614648
44008	NC_013959	GAA	2	6	2222005	2222010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291614648
44009	NC_013959	TCA	2	6	2222079	2222084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614648
44010	NC_013959	TGG	2	6	2222118	2222123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614648
44011	NC_013959	GCC	2	6	2222260	2222265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614649
44012	NC_013959	CTG	2	6	2222266	2222271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614649
44013	NC_013959	GCC	2	6	2222297	2222302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614649
44014	NC_013959	ATC	2	6	2222320	2222325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614649
44015	NC_013959	TGG	2	6	2222375	2222380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614649
44016	NC_013959	CT	3	6	2222440	2222445	0 %	50 %	0 %	50 %	291614649
44017	NC_013959	GAT	2	6	2222460	2222465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614649
44018	NC_013959	GC	3	6	2222475	2222480	0 %	0 %	50 %	50 %	291614649
44019	NC_013959	GAC	2	6	2222485	2222490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614649
44020	NC_013959	GGC	2	6	2222586	2222591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614649
44021	NC_013959	GGC	2	6	2222607	2222612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614649
44022	NC_013959	CCA	2	6	2222622	2222627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614649
44023	NC_013959	AGC	2	6	2222665	2222670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614649
44024	NC_013959	TCC	2	6	2222713	2222718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291614649
44025	NC_013959	CGC	2	6	2222722	2222727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614649
44026	NC_013959	GCG	2	6	2222878	2222883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614650
44027	NC_013959	TGG	2	6	2222908	2222913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614650
44028	NC_013959	GCA	2	6	2222968	2222973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614650
44029	NC_013959	CGC	2	6	2222978	2222983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614650
44030	NC_013959	CTGG	2	8	2222987	2222994	0 %	25 %	50 %	25 %	291614650
44031	NC_013959	GCA	2	6	2222998	2223003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614650
44032	NC_013959	CG	3	6	2223085	2223090	0 %	0 %	50 %	50 %	291614650
44033	NC_013959	GCC	2	6	2223487	2223492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614651
44034	NC_013959	CA	3	6	2223538	2223543	50 %	0 %	0 %	50 %	291614651
44035	NC_013959	TTG	2	6	2223552	2223557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614651
44036	NC_013959	GCG	2	6	2223660	2223665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614651
44037	NC_013959	GCA	2	6	2223731	2223736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614651
44038	NC_013959	T	6	6	2223762	2223767	0 %	100 %	0 %	0 %	291614651
44039	NC_013959	TCC	2	6	2223795	2223800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291614652
44040	NC_013959	TA	3	6	2223809	2223814	50 %	50 %	0 %	0 %	291614652
44041	NC_013959	CGC	2	6	2224000	2224005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614652
44042	NC_013959	TGG	2	6	2224318	2224323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614653
44043	NC_013959	GCT	2	6	2224328	2224333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614653
44044	NC_013959	CGC	2	6	2224340	2224345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614653
44045	NC_013959	CTTG	2	8	2224346	2224353	0 %	50 %	25 %	25 %	291614653
44046	NC_013959	GCCA	2	8	2224389	2224396	25 %	0 %	25 %	50 %	291614653
44047	NC_013959	CGA	2	6	2224402	2224407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614653
44048	NC_013959	CGC	2	6	2224409	2224414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614653
44049	NC_013959	GTC	2	6	2224488	2224493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614653
44050	NC_013959	AAG	2	6	2224500	2224505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291614653
44051	NC_013959	CCGG	2	8	2224625	2224632	0 %	0 %	50 %	50 %	291614653
44052	NC_013959	CGA	2	6	2224676	2224681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614653
44053	NC_013959	CAA	2	6	2224686	2224691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614653
44054	NC_013959	GTC	2	6	2224746	2224751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614653
44055	NC_013959	AGGC	2	8	2224777	2224784	25 %	0 %	50 %	25 %	291614653
44056	NC_013959	CAT	2	6	2224796	2224801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614653
44057	NC_013959	ATG	2	6	2224824	2224829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614653
44058	NC_013959	TGGA	2	8	2224839	2224846	25 %	25 %	50 %	0 %	291614653
44059	NC_013959	C	6	6	2224855	2224860	0 %	0 %	0 %	100 %	291614653
44060	NC_013959	CGA	2	6	2224886	2224891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614653
44061	NC_013959	CAGC	2	8	2224927	2224934	25 %	0 %	25 %	50 %	291614653
44062	NC_013959	GC	3	6	2224985	2224990	0 %	0 %	50 %	50 %	291614653
44063	NC_013959	CAA	2	6	2225004	2225009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614653
44064	NC_013959	CTG	2	6	2225049	2225054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614653
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44066	NC_013959	GCC	2	6	2225062	2225067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614653
44067	NC_013959	GCA	2	6	2225069	2225074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614653
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44069	NC_013959	TGG	2	6	2225127	2225132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614653
44070	NC_013959	ATGC	2	8	2225139	2225146	25 %	25 %	25 %	25 %	291614653
44071	NC_013959	CCG	2	6	2225210	2225215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614653
44072	NC_013959	CCA	2	6	2225252	2225257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614653
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44075	NC_013959	GCA	2	6	2225509	2225514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614653
44076	NC_013959	GA	3	6	2225565	2225570	50 %	0 %	50 %	0 %	291614653
44077	NC_013959	AAT	2	6	2225664	2225669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291614653
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44083	NC_013959	CGC	2	6	2226158	2226163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614654
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44085	NC_013959	CTT	3	9	2226247	2226255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614655
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44087	NC_013959	GCC	2	6	2226337	2226342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614655
44088	NC_013959	CGC	2	6	2226348	2226353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614655
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44090	NC_013959	GC	3	6	2226420	2226425	0 %	0 %	50 %	50 %	291614655
44091	NC_013959	TC	3	6	2226444	2226449	0 %	50 %	0 %	50 %	291614655
44092	NC_013959	CGA	2	6	2226495	2226500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614655
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44096	NC_013959	GATC	2	8	2227085	2227092	25 %	25 %	25 %	25 %	291614656
44097	NC_013959	TCA	2	6	2227246	2227251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614656
44098	NC_013959	TGG	2	6	2227267	2227272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614656
44099	NC_013959	CGC	2	6	2227430	2227435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614656
44100	NC_013959	TGC	2	6	2227558	2227563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614656
44101	NC_013959	ACC	2	6	2227600	2227605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614656
44102	NC_013959	CG	3	6	2227646	2227651	0 %	0 %	50 %	50 %	291614656
44103	NC_013959	CAG	2	6	2227722	2227727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614656
44104	NC_013959	GCA	2	6	2227765	2227770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614656
44105	NC_013959	GCG	2	6	2227800	2227805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614656
44106	NC_013959	CTG	2	6	2227833	2227838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614656
44107	NC_013959	AGG	2	6	2227843	2227848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291614656
44108	NC_013959	CGA	2	6	2227886	2227891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614656
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44110	NC_013959	CGG	2	6	2227973	2227978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614656
44111	NC_013959	ACG	2	6	2228038	2228043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614656
44112	NC_013959	CCTG	2	8	2228132	2228139	0 %	25 %	25 %	50 %	291614656
44113	NC_013959	CAT	2	6	2228176	2228181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614656
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44115	NC_013959	CTG	2	6	2228601	2228606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614657
44116	NC_013959	GC	3	6	2228814	2228819	0 %	0 %	50 %	50 %	291614657
44117	NC_013959	ACG	2	6	2228836	2228841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614657
44118	NC_013959	TGG	2	6	2228848	2228853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614657
44119	NC_013959	TGC	3	9	2228860	2228868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614657
44120	NC_013959	CG	3	6	2228869	2228874	0 %	0 %	50 %	50 %	291614657
44121	NC_013959	TG	3	6	2228916	2228921	0 %	50 %	50 %	0 %	291614657
44122	NC_013959	TGC	2	6	2228947	2228952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614657
44123	NC_013959	TCG	2	6	2228974	2228979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614657
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44127	NC_013959	CATGGG	2	12	2229029	2229040	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291614657
44128	NC_013959	CA	3	6	2229049	2229054	50 %	0 %	0 %	50 %	291614657
44129	NC_013959	GCT	2	6	2229083	2229088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614657
44130	NC_013959	GACT	2	8	2229172	2229179	25 %	25 %	25 %	25 %	291614657
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44139	NC_013959	GCT	2	6	2229521	2229526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614657
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44142	NC_013959	GC	4	8	2229704	2229711	0 %	0 %	50 %	50 %	291614657
44143	NC_013959	GC	3	6	2229764	2229769	0 %	0 %	50 %	50 %	291614657
44144	NC_013959	ATA	2	6	2229770	2229775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291614657
44145	NC_013959	CAT	2	6	2229814	2229819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614658
44146	NC_013959	TTTTTC	2	12	2229828	2229839	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	291614658
44147	NC_013959	GGC	2	6	2229931	2229936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614658
44148	NC_013959	CTG	2	6	2229941	2229946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614658
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44152	NC_013959	TTCT	2	8	2230019	2230026	0 %	75 %	0 %	25 %	291614658
44153	NC_013959	TGA	3	9	2230044	2230052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614658
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44155	NC_013959	ATC	2	6	2230173	2230178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614658
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44227	NC_013959	GCG	2	6	2233117	2233122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614661
44228	NC_013959	GCA	2	6	2233125	2233130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614661
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44230	NC_013959	TCG	3	9	2233151	2233159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614661
44231	NC_013959	GGCG	2	8	2233188	2233195	0 %	0 %	75 %	25 %	291614661
44232	NC_013959	TTC	2	6	2233220	2233225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614661
44233	NC_013959	CTT	2	6	2233248	2233253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614661
44234	NC_013959	CCGA	2	8	2233259	2233266	25 %	0 %	25 %	50 %	291614661
44235	NC_013959	CCG	2	6	2233271	2233276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614661
44236	NC_013959	TGC	2	6	2233322	2233327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614661
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44240	NC_013959	GC	4	8	2233550	2233557	0 %	0 %	50 %	50 %	291614661
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44242	NC_013959	CAG	3	9	2233600	2233608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614661
44243	NC_013959	TGC	2	6	2233610	2233615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614661
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44248	NC_013959	GCCA	2	8	2234295	2234302	25 %	0 %	25 %	50 %	291614662
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44254	NC_013959	TCGC	2	8	2234619	2234626	0 %	25 %	25 %	50 %	291614662
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44331	NC_013959	GTGG	2	8	2238528	2238535	0 %	25 %	75 %	0 %	291614668
44332	NC_013959	TTC	2	6	2238552	2238557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614668
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44341	NC_013959	GTT	2	6	2239084	2239089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614668
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44345	NC_013959	GCA	2	6	2239151	2239156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614668
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44347	NC_013959	GATG	2	8	2239262	2239269	25 %	25 %	50 %	0 %	291614668
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44463	NC_013959	GC	3	6	2245805	2245810	0 %	0 %	50 %	50 %	291614673
44464	NC_013959	CAC	2	6	2245835	2245840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614673
44465	NC_013959	GCC	2	6	2245916	2245921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614673
44466	NC_013959	CAT	2	6	2246034	2246039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614673
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44470	NC_013959	TCA	2	6	2246148	2246153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614673
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44483	NC_013959	GC	3	6	2247271	2247276	0 %	0 %	50 %	50 %	291614674
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44485	NC_013959	TCG	2	6	2247363	2247368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614674
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44487	NC_013959	CT	3	6	2247422	2247427	0 %	50 %	0 %	50 %	291614674
44488	NC_013959	ACG	2	6	2247432	2247437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614674
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44491	NC_013959	CGG	2	6	2247900	2247905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614675
44492	NC_013959	CCA	2	6	2247915	2247920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614675
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