MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 60283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_013959	TGT	2	6	840708	840713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291613322
17002	NC_013959	TCG	2	6	840718	840723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613322
17003	NC_013959	GC	3	6	840785	840790	0 %	0 %	50 %	50 %	291613323
17004	NC_013959	AGC	2	6	840791	840796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613323
17005	NC_013959	CGG	2	6	840825	840830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613323
17006	NC_013959	GCCT	2	8	841252	841259	0 %	25 %	25 %	50 %	291613324
17007	NC_013959	GCG	2	6	841268	841273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613324
17008	NC_013959	TCG	2	6	841289	841294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613324
17009	NC_013959	GTC	2	6	841303	841308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613324
17010	NC_013959	CGC	2	6	841329	841334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613324
17011	NC_013959	TCG	2	6	841352	841357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613324
17012	NC_013959	TCA	2	6	841404	841409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613324
17013	NC_013959	GC	3	6	841415	841420	0 %	0 %	50 %	50 %	291613324
17014	NC_013959	GCG	2	6	841484	841489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613324
17015	NC_013959	TGT	2	6	841514	841519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291613324
17016	NC_013959	CCA	2	6	841533	841538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613324
17017	NC_013959	GC	3	6	841543	841548	0 %	0 %	50 %	50 %	291613324
17018	NC_013959	GCG	2	6	841581	841586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613324
17019	NC_013959	GT	3	6	841669	841674	0 %	50 %	50 %	0 %	291613324
17020	NC_013959	GCC	2	6	841714	841719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613324
17021	NC_013959	GCA	2	6	841743	841748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613324
17022	NC_013959	ACG	2	6	841770	841775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613324
17023	NC_013959	TCG	2	6	841793	841798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613324
17024	NC_013959	GCC	2	6	841810	841815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613324
17025	NC_013959	TTGCG	2	10	841838	841847	0 %	40 %	40 %	20 %	291613324
17026	NC_013959	CAG	2	6	841897	841902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613324
17027	NC_013959	ATGG	2	8	841966	841973	25 %	25 %	50 %	0 %	291613324
17028	NC_013959	TGCCGG	2	12	841992	842003	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291613324
17029	NC_013959	CGC	2	6	842007	842012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613324
17030	NC_013959	GGT	2	6	842023	842028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613324
17031	NC_013959	CCA	2	6	842040	842045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613324
17032	NC_013959	GAT	2	6	842089	842094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613324
17033	NC_013959	GCG	2	6	842125	842130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613324
17034	NC_013959	CTC	2	6	842143	842148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291613324
17035	NC_013959	GCC	2	6	842276	842281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613324
17036	NC_013959	CGA	2	6	842322	842327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613324
17037	NC_013959	ATG	2	6	842381	842386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613324
17038	NC_013959	CGC	2	6	842508	842513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613324
17039	NC_013959	GCG	2	6	842516	842521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613324
17040	NC_013959	TGCA	2	8	842569	842576	25 %	25 %	25 %	25 %	291613324
17041	NC_013959	ACA	2	6	842616	842621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613324
17042	NC_013959	CTT	2	6	842684	842689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613324
17043	NC_013959	TTC	2	6	842698	842703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613324
17044	NC_013959	AGC	2	6	842724	842729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613325
17045	NC_013959	TCGATG	2	12	842772	842783	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291613325
17046	NC_013959	GCC	2	6	842786	842791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613325
17047	NC_013959	CAC	2	6	842801	842806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613325
17048	NC_013959	AGGCCG	2	12	842823	842834	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291613325
17049	NC_013959	TGC	2	6	842838	842843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613325
17050	NC_013959	CGC	2	6	842846	842851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613325
17051	NC_013959	TGG	2	6	842857	842862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613325
17052	NC_013959	GAA	2	6	842864	842869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613325
17053	NC_013959	TCG	2	6	842895	842900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613325
17054	NC_013959	CGA	2	6	842923	842928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613325
17055	NC_013959	CGC	2	6	842944	842949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613325
17056	NC_013959	GCC	2	6	842981	842986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613325
17057	NC_013959	GCG	2	6	842987	842992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613325
17058	NC_013959	ACC	2	6	843066	843071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613325
17059	NC_013959	CCA	2	6	843097	843102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613325
17060	NC_013959	GGT	2	6	843128	843133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613325
17061	NC_013959	CTT	2	6	843250	843255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613325
17062	NC_013959	GC	3	6	843259	843264	0 %	0 %	50 %	50 %	291613325
17063	NC_013959	CGG	2	6	843294	843299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613325
17064	NC_013959	CAT	2	6	843305	843310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613325
17065	NC_013959	GCG	2	6	843318	843323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613325
17066	NC_013959	CAG	2	6	843407	843412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613325
17067	NC_013959	CG	3	6	843413	843418	0 %	0 %	50 %	50 %	291613325
17068	NC_013959	CTG	2	6	843443	843448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613325
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17072	NC_013959	CG	4	8	843604	843611	0 %	0 %	50 %	50 %	291613325
17073	NC_013959	AGC	2	6	843678	843683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613325
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17076	NC_013959	CAG	2	6	843764	843769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613325
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17083	NC_013959	CGA	2	6	844066	844071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613325
17084	NC_013959	GCG	2	6	844107	844112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613325
17085	NC_013959	GCTGTC	2	12	844205	844216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613325
17086	NC_013959	GTTC	2	8	844240	844247	0 %	50 %	25 %	25 %	291613325
17087	NC_013959	ATG	2	6	844266	844271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613325
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17100	NC_013959	TCGGC	2	10	844935	844944	0 %	20 %	40 %	40 %	291613326
17101	NC_013959	TGC	2	6	844965	844970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613326
17102	NC_013959	TCG	2	6	845022	845027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613326
17103	NC_013959	TCA	2	6	845043	845048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613326
17104	NC_013959	CTG	2	6	845057	845062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613326
17105	NC_013959	CG	3	6	845278	845283	0 %	0 %	50 %	50 %	291613327
17106	NC_013959	CCG	2	6	845426	845431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613327
17107	NC_013959	GC	3	6	845437	845442	0 %	0 %	50 %	50 %	291613327
17108	NC_013959	GGT	2	6	845443	845448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613327
17109	NC_013959	GGCGCT	2	12	845452	845463	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291613327
17110	NC_013959	GCT	2	6	845556	845561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613327
17111	NC_013959	CGAC	2	8	845574	845581	25 %	0 %	25 %	50 %	291613327
17112	NC_013959	CAT	2	6	845584	845589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613327
17113	NC_013959	GCG	2	6	845594	845599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613327
17114	NC_013959	CAG	2	6	845600	845605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613327
17115	NC_013959	CCGA	2	8	845663	845670	25 %	0 %	25 %	50 %	291613327
17116	NC_013959	CTGGCA	2	12	845710	845721	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291613327
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17118	NC_013959	GCA	2	6	845741	845746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613327
17119	NC_013959	GCA	2	6	845908	845913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613328
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17123	NC_013959	GCA	2	6	846023	846028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613328
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17235	NC_013959	AT	3	6	850333	850338	50 %	50 %	0 %	0 %	291613332
17236	NC_013959	GCCGC	2	10	850368	850377	0 %	0 %	40 %	60 %	291613332
17237	NC_013959	GAC	2	6	850393	850398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613332
17238	NC_013959	TCC	2	6	850435	850440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291613333
17239	NC_013959	AC	3	6	850461	850466	50 %	0 %	0 %	50 %	291613333
17240	NC_013959	CAT	2	6	850482	850487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613333
17241	NC_013959	GTC	2	6	850546	850551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613333
17242	NC_013959	CTG	2	6	850555	850560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613333
17243	NC_013959	CTGATC	2	12	850630	850641	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291613333
17244	NC_013959	CGG	2	6	850668	850673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613333
17245	NC_013959	GTG	2	6	850720	850725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613333
17246	NC_013959	CCA	2	6	850730	850735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613333
17247	NC_013959	GCC	2	6	850753	850758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613333
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17250	NC_013959	GCT	3	9	850809	850817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613333
17251	NC_013959	CGA	2	6	850823	850828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613333
17252	NC_013959	TGA	2	6	850904	850909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613333
17253	NC_013959	CGATG	2	10	850926	850935	20 %	20 %	40 %	20 %	291613333
17254	NC_013959	CAT	2	6	850941	850946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613333
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17256	NC_013959	GTGTTC	2	12	851194	851205	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	291613333
17257	NC_013959	CAT	2	6	851208	851213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613333
17258	NC_013959	ACC	2	6	851287	851292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613333
17259	NC_013959	TGA	2	6	851351	851356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613333
17260	NC_013959	GTG	2	6	851383	851388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613333
17261	NC_013959	TGG	2	6	851402	851407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613333
17262	NC_013959	CGC	2	6	851446	851451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613333
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17264	NC_013959	ATC	2	6	851563	851568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613333
17265	NC_013959	TGA	2	6	851594	851599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613333
17266	NC_013959	ACC	2	6	851620	851625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613333
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17268	NC_013959	GAA	2	6	851637	851642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613333
17269	NC_013959	CTG	2	6	851650	851655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613333
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17272	NC_013959	TGC	2	6	851982	851987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613334
17273	NC_013959	TCT	2	6	851988	851993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613334
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17275	NC_013959	AATG	2	8	852041	852048	50 %	25 %	25 %	0 %	291613334
17276	NC_013959	GCAG	2	8	852116	852123	25 %	0 %	50 %	25 %	291613334
17277	NC_013959	GTGC	2	8	852210	852217	0 %	25 %	50 %	25 %	291613334
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17316	NC_013959	GCA	2	6	853895	853900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613335
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17325	NC_013959	TA	3	6	854399	854404	50 %	50 %	0 %	0 %	291613335
17326	NC_013959	GAAA	2	8	854428	854435	75 %	0 %	25 %	0 %	291613335
17327	NC_013959	GTT	2	6	854475	854480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291613335
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17330	NC_013959	TGC	2	6	854591	854596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613335
17331	NC_013959	TAG	2	6	854608	854613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613335
17332	NC_013959	TGC	2	6	854624	854629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613335
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17334	NC_013959	CAGT	2	8	854675	854682	25 %	25 %	25 %	25 %	291613335
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17339	NC_013959	CAG	2	6	854943	854948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613335
17340	NC_013959	GC	4	8	854950	854957	0 %	0 %	50 %	50 %	291613335
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17343	NC_013959	CTTT	2	8	855021	855028	0 %	75 %	0 %	25 %	291613335
17344	NC_013959	AAGG	2	8	855046	855053	50 %	0 %	50 %	0 %	291613335
17345	NC_013959	GTT	2	6	855056	855061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291613335
17346	NC_013959	GCCG	2	8	855070	855077	0 %	0 %	50 %	50 %	291613335
17347	NC_013959	CGGA	2	8	855084	855091	25 %	0 %	50 %	25 %	291613335
17348	NC_013959	CG	3	6	855188	855193	0 %	0 %	50 %	50 %	291613335
17349	NC_013959	CGA	2	6	855371	855376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613335
17350	NC_013959	CCT	2	6	855380	855385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291613335
17351	NC_013959	GCG	2	6	855413	855418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613335
17352	NC_013959	GC	3	6	855428	855433	0 %	0 %	50 %	50 %	291613335
17353	NC_013959	TGAA	2	8	855434	855441	50 %	25 %	25 %	0 %	291613335
17354	NC_013959	GCAGT	2	10	855671	855680	20 %	20 %	40 %	20 %	291613336
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17471	NC_013959	CAG	2	6	863592	863597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613342
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17476	NC_013959	TGC	2	6	863753	863758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613342
17477	NC_013959	T	9	9	863808	863816	0 %	100 %	0 %	0 %	291613342
17478	NC_013959	CGA	2	6	863845	863850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613342
17479	NC_013959	AGC	2	6	864544	864549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613343
17480	NC_013959	ATC	2	6	864570	864575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613343
17481	NC_013959	TTG	2	6	864643	864648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291613343
17482	NC_013959	CAT	2	6	864651	864656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613343
17483	NC_013959	TTC	2	6	864891	864896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613344
17484	NC_013959	CAGTG	2	10	864908	864917	20 %	20 %	40 %	20 %	291613344
17485	NC_013959	CAT	2	6	864920	864925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613344
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17487	NC_013959	CTTC	2	8	864958	864965	0 %	50 %	0 %	50 %	291613344
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