MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 60283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_013959	GCA	2	6	647506	647511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613110
13002	NC_013959	CCG	2	6	647526	647531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613110
13003	NC_013959	AAG	2	6	647592	647597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613110
13004	NC_013959	AAG	2	6	647619	647624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613110
13005	NC_013959	GAA	2	6	647636	647641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613110
13006	NC_013959	CAG	2	6	647706	647711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613110
13007	NC_013959	AGG	2	6	647725	647730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291613110
13008	NC_013959	GC	3	6	647772	647777	0 %	0 %	50 %	50 %	291613110
13009	NC_013959	CCA	2	6	647816	647821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613110
13010	NC_013959	ATC	2	6	647827	647832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613110
13011	NC_013959	TAAG	2	8	647891	647898	50 %	25 %	25 %	0 %	291613110
13012	NC_013959	TGA	2	6	647940	647945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613111
13013	NC_013959	T	6	6	647971	647976	0 %	100 %	0 %	0 %	291613111
13014	NC_013959	TGGGG	2	10	647985	647994	0 %	20 %	80 %	0 %	291613111
13015	NC_013959	ACT	2	6	648105	648110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613111
13016	NC_013959	CAT	2	6	648148	648153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613111
13017	NC_013959	CGG	2	6	648382	648387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613111
13018	NC_013959	GCA	2	6	648438	648443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613111
13019	NC_013959	TC	3	6	648468	648473	0 %	50 %	0 %	50 %	291613111
13020	NC_013959	GC	3	6	648484	648489	0 %	0 %	50 %	50 %	291613111
13021	NC_013959	CAA	2	6	648493	648498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613111
13022	NC_013959	GGT	3	9	648547	648555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613111
13023	NC_013959	CAG	2	6	648608	648613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613111
13024	NC_013959	ATC	2	6	648755	648760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613111
13025	NC_013959	CGG	2	6	648792	648797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613111
13026	NC_013959	CGG	2	6	648804	648809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613111
13027	NC_013959	GCG	2	6	648840	648845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613111
13028	NC_013959	GCAGA	2	10	648860	648869	40 %	0 %	40 %	20 %	291613111
13029	NC_013959	GCTG	2	8	648877	648884	0 %	25 %	50 %	25 %	291613111
13030	NC_013959	GTG	2	6	648924	648929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613111
13031	NC_013959	GCT	2	6	648976	648981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613111
13032	NC_013959	TTC	2	6	649069	649074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613111
13033	NC_013959	ACG	2	6	649089	649094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613111
13034	NC_013959	GGT	2	6	649117	649122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613111
13035	NC_013959	GCC	2	6	649241	649246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613111
13036	NC_013959	TGC	2	6	649254	649259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613111
13037	NC_013959	GGT	2	6	649291	649296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613111
13038	NC_013959	GCT	2	6	649334	649339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613111
13039	NC_013959	CTG	2	6	649412	649417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613111
13040	NC_013959	AGC	2	6	649428	649433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613111
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13042	NC_013959	GGC	2	6	649514	649519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613111
13043	NC_013959	GAT	2	6	649529	649534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613111
13044	NC_013959	GCG	2	6	649619	649624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613111
13045	NC_013959	ACC	2	6	649757	649762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613111
13046	NC_013959	TCG	2	6	649818	649823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613111
13047	NC_013959	TCG	2	6	649833	649838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613111
13048	NC_013959	CATC	2	8	649891	649898	25 %	25 %	0 %	50 %	291613111
13049	NC_013959	GGTC	2	8	650053	650060	0 %	25 %	50 %	25 %	291613111
13050	NC_013959	TCA	2	6	650067	650072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613111
13051	NC_013959	CGG	2	6	650095	650100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613111
13052	NC_013959	AAG	3	9	650114	650122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613111
13053	NC_013959	AGG	2	6	650163	650168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291613111
13054	NC_013959	ATCC	2	8	650265	650272	25 %	25 %	0 %	50 %	291613112
13055	NC_013959	GGT	2	6	650362	650367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613112
13056	NC_013959	GGCCA	2	10	650390	650399	20 %	0 %	40 %	40 %	291613112
13057	NC_013959	GAT	2	6	650479	650484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613112
13058	NC_013959	CAG	2	6	650489	650494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613112
13059	NC_013959	GT	3	6	650519	650524	0 %	50 %	50 %	0 %	291613112
13060	NC_013959	GGTG	2	8	650527	650534	0 %	25 %	75 %	0 %	291613112
13061	NC_013959	CCA	2	6	650535	650540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613112
13062	NC_013959	CCA	2	6	650655	650660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613112
13063	NC_013959	CGC	2	6	650676	650681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613112
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13065	NC_013959	AGC	2	6	650751	650756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613112
13066	NC_013959	CAA	2	6	650773	650778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613112
13067	NC_013959	CGGC	2	8	650844	650851	0 %	0 %	50 %	50 %	291613112
13068	NC_013959	CAG	2	6	650912	650917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613112
13069	NC_013959	GAAG	2	8	650953	650960	50 %	0 %	50 %	0 %	291613112
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13071	NC_013959	GCA	2	6	651179	651184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613113
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13075	NC_013959	TCT	2	6	651297	651302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613113
13076	NC_013959	ATGC	2	8	651353	651360	25 %	25 %	25 %	25 %	291613113
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13084	NC_013959	CTG	2	6	651656	651661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613113
13085	NC_013959	TTGGG	2	10	651665	651674	0 %	40 %	60 %	0 %	291613113
13086	NC_013959	ACCG	2	8	651680	651687	25 %	0 %	25 %	50 %	291613113
13087	NC_013959	ACCT	2	8	651710	651717	25 %	25 %	0 %	50 %	291613113
13088	NC_013959	GCA	2	6	651790	651795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613113
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13090	NC_013959	GC	3	6	651840	651845	0 %	0 %	50 %	50 %	291613113
13091	NC_013959	ATC	2	6	651866	651871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613113
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13094	NC_013959	TCGCCA	2	12	651957	651968	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	291613113
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13100	NC_013959	TAC	2	6	652238	652243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613113
13101	NC_013959	TGT	2	6	652323	652328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291613113
13102	NC_013959	TGAAG	2	10	652369	652378	40 %	20 %	40 %	0 %	291613113
13103	NC_013959	ACC	2	6	652389	652394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613113
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13106	NC_013959	ACA	2	6	652473	652478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613114
13107	NC_013959	GTC	2	6	652499	652504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613114
13108	NC_013959	CCG	2	6	652542	652547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613114
13109	NC_013959	TGG	2	6	652554	652559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613114
13110	NC_013959	GGC	2	6	652715	652720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613114
13111	NC_013959	C	6	6	652739	652744	0 %	0 %	0 %	100 %	291613114
13112	NC_013959	GCG	2	6	652779	652784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613114
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13115	NC_013959	ATGG	2	8	653164	653171	25 %	25 %	50 %	0 %	291613115
13116	NC_013959	AGA	2	6	653183	653188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613115
13117	NC_013959	TGG	2	6	653288	653293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613115
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13119	NC_013959	GAT	2	6	653370	653375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613115
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13236	NC_013959	TGAC	2	8	660282	660289	25 %	25 %	25 %	25 %	291613124
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13238	NC_013959	TGG	2	6	660345	660350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613124
13239	NC_013959	CTG	2	6	660380	660385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613124
13240	NC_013959	GC	3	6	660437	660442	0 %	0 %	50 %	50 %	291613124
13241	NC_013959	GAA	2	6	660467	660472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613124
13242	NC_013959	GCC	2	6	660477	660482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613124
13243	NC_013959	ACA	2	6	660510	660515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613124
13244	NC_013959	GCT	2	6	660554	660559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613124
13245	NC_013959	ACC	2	6	660569	660574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613124
13246	NC_013959	CCA	3	9	660597	660605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613124
13247	NC_013959	CGG	2	6	660636	660641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613124
13248	NC_013959	CCAG	2	8	660649	660656	25 %	0 %	25 %	50 %	291613124
13249	NC_013959	GCG	2	6	660687	660692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613124
13250	NC_013959	ATC	2	6	660776	660781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613124
13251	NC_013959	GC	3	6	660911	660916	0 %	0 %	50 %	50 %	291613124
13252	NC_013959	CG	3	6	660917	660922	0 %	0 %	50 %	50 %	291613124
13253	NC_013959	AGACCG	2	12	661020	661031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613124
13254	NC_013959	ACC	2	6	661094	661099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613124
13255	NC_013959	GTGCTG	2	12	661145	661156	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291613124
13256	NC_013959	CTG	2	6	661184	661189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613124
13257	NC_013959	GC	3	6	661192	661197	0 %	0 %	50 %	50 %	291613124
13258	NC_013959	GTG	2	6	661346	661351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613124
13259	NC_013959	GCATCG	2	12	661418	661429	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291613125
13260	NC_013959	GTG	2	6	661450	661455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613125
13261	NC_013959	CTG	2	6	661465	661470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613125
13262	NC_013959	GCG	2	6	661499	661504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613125
13263	NC_013959	GAGCGA	2	12	661506	661517	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	291613125
13264	NC_013959	GC	3	6	661541	661546	0 %	0 %	50 %	50 %	291613125
13265	NC_013959	TGC	2	6	661562	661567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613125
13266	NC_013959	AAG	2	6	661585	661590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613125
13267	NC_013959	GTC	2	6	661648	661653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613125
13268	NC_013959	GC	3	6	661666	661671	0 %	0 %	50 %	50 %	291613125
13269	NC_013959	CAC	2	6	661725	661730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613125
13270	NC_013959	CGA	2	6	661737	661742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613125
13271	NC_013959	CTG	2	6	661810	661815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613125
13272	NC_013959	CG	3	6	661951	661956	0 %	0 %	50 %	50 %	291613126
13273	NC_013959	TTC	2	6	661989	661994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613126
13274	NC_013959	CCA	2	6	662021	662026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613126
13275	NC_013959	CGC	2	6	662050	662055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613126
13276	NC_013959	CTG	3	9	662103	662111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613126
13277	NC_013959	CGT	2	6	662153	662158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613126
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13279	NC_013959	CTT	2	6	662321	662326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613127
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13281	NC_013959	CTG	2	6	662376	662381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613127
13282	NC_013959	GCTG	2	8	662402	662409	0 %	25 %	50 %	25 %	291613127
13283	NC_013959	GCAC	2	8	662434	662441	25 %	0 %	25 %	50 %	291613127
13284	NC_013959	GGC	2	6	662507	662512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613127
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13294	NC_013959	CG	3	6	662860	662865	0 %	0 %	50 %	50 %	291613127
13295	NC_013959	CAG	2	6	662897	662902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613127
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13298	NC_013959	CGG	2	6	663050	663055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613127
13299	NC_013959	CTGC	2	8	663079	663086	0 %	25 %	25 %	50 %	291613127
13300	NC_013959	TGA	2	6	663202	663207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613127
13301	NC_013959	TTCGGT	2	12	663304	663315	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	291613128
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13303	NC_013959	CGATG	2	10	663399	663408	20 %	20 %	40 %	20 %	291613128
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13321	NC_013959	GGCTT	2	10	664120	664129	0 %	40 %	40 %	20 %	291613129
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13325	NC_013959	AAG	2	6	664272	664277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613129
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13328	NC_013959	A	7	7	664390	664396	100 %	0 %	0 %	0 %	291613129
13329	NC_013959	GACT	2	8	664398	664405	25 %	25 %	25 %	25 %	291613129
13330	NC_013959	GTC	2	6	664577	664582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613130
13331	NC_013959	GATC	2	8	664708	664715	25 %	25 %	25 %	25 %	291613130
13332	NC_013959	TGC	2	6	664717	664722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613130
13333	NC_013959	TGA	2	6	664729	664734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613130
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13335	NC_013959	CCA	2	6	664759	664764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613130
13336	NC_013959	GCTG	2	8	664765	664772	0 %	25 %	50 %	25 %	291613130
13337	NC_013959	TGG	2	6	664782	664787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613130
13338	NC_013959	GAT	2	6	664922	664927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613130
13339	NC_013959	T	7	7	664934	664940	0 %	100 %	0 %	0 %	291613130
13340	NC_013959	TGC	2	6	664966	664971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613130
13341	NC_013959	CAT	2	6	665193	665198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613131
13342	NC_013959	TTC	2	6	665224	665229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613131
13343	NC_013959	TGC	2	6	665355	665360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613131
13344	NC_013959	CTG	2	6	665443	665448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613131
13345	NC_013959	CCGC	2	8	665456	665463	0 %	0 %	25 %	75 %	291613131
13346	NC_013959	GAT	2	6	665503	665508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613131
13347	NC_013959	AAG	2	6	665546	665551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613131
13348	NC_013959	TGC	2	6	665595	665600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613131
13349	NC_013959	TCG	2	6	665606	665611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613131
13350	NC_013959	GCA	3	9	665631	665639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613131
13351	NC_013959	CTGA	3	12	665659	665670	25 %	25 %	25 %	25 %	291613131
13352	NC_013959	CAA	2	6	665807	665812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613132
13353	NC_013959	CCG	2	6	665826	665831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613132
13354	NC_013959	GC	3	6	665847	665852	0 %	0 %	50 %	50 %	291613132
13355	NC_013959	GCCGT	2	10	665893	665902	0 %	20 %	40 %	40 %	291613132
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13477	NC_013959	GTC	2	6	672494	672499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613137
13478	NC_013959	ATG	2	6	672591	672596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613137
13479	NC_013959	CGA	3	9	672610	672618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613137
13480	NC_013959	TGC	2	6	672661	672666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613137
13481	NC_013959	TGT	2	6	672691	672696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291613137
13482	NC_013959	GC	3	6	672704	672709	0 %	0 %	50 %	50 %	291613137
13483	NC_013959	CG	3	6	672748	672753	0 %	0 %	50 %	50 %	291613137
13484	NC_013959	AGC	2	6	672807	672812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613137
13485	NC_013959	CGG	2	6	672826	672831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613137
13486	NC_013959	GCT	2	6	672931	672936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613137
13487	NC_013959	GGC	2	6	672982	672987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613137
13488	NC_013959	CGG	4	12	672994	673005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613137
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13490	NC_013959	CGT	2	6	673501	673506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613138
13491	NC_013959	CGA	2	6	673537	673542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613138
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13493	NC_013959	GTC	2	6	673574	673579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613138
13494	NC_013959	TGA	2	6	673587	673592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613138
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13497	NC_013959	TCG	2	6	673799	673804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613139
13498	NC_013959	GT	4	8	673900	673907	0 %	50 %	50 %	0 %	291613139
13499	NC_013959	TGC	2	6	673931	673936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613139
13500	NC_013959	GTTC	2	8	673947	673954	0 %	50 %	25 %	25 %	291613139

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