MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 60283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_013959	TGA	2	6	570602	570607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613028
11502	NC_013959	CGG	2	6	570658	570663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613028
11503	NC_013959	GTC	2	6	570668	570673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613028
11504	NC_013959	GGA	2	6	570725	570730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291613028
11505	NC_013959	GC	3	6	570777	570782	0 %	0 %	50 %	50 %	291613028
11506	NC_013959	GTG	2	6	570798	570803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613028
11507	NC_013959	TCG	2	6	570819	570824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613029
11508	NC_013959	GAA	2	6	570875	570880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613029
11509	NC_013959	ATG	2	6	570926	570931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613029
11510	NC_013959	ATG	2	6	570980	570985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613029
11511	NC_013959	GCT	2	6	570988	570993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613029
11512	NC_013959	TGC	2	6	570997	571002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613029
11513	NC_013959	ACG	2	6	571011	571016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613029
11514	NC_013959	GCG	2	6	571046	571051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613029
11515	NC_013959	CGG	2	6	571140	571145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613029
11516	NC_013959	GCC	2	6	571149	571154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613029
11517	NC_013959	GCA	2	6	571156	571161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613029
11518	NC_013959	CAG	2	6	571229	571234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613029
11519	NC_013959	TGC	2	6	571236	571241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613029
11520	NC_013959	GAACGC	2	12	571406	571417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613029
11521	NC_013959	GAT	2	6	571420	571425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613029
11522	NC_013959	GCAT	2	8	571428	571435	25 %	25 %	25 %	25 %	291613029
11523	NC_013959	CG	3	6	571491	571496	0 %	0 %	50 %	50 %	291613029
11524	NC_013959	GC	3	6	571523	571528	0 %	0 %	50 %	50 %	291613029
11525	NC_013959	GTC	2	6	571582	571587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613030
11526	NC_013959	ATC	2	6	571600	571605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613030
11527	NC_013959	GGTC	2	8	571628	571635	0 %	25 %	50 %	25 %	291613030
11528	NC_013959	GGC	2	6	571653	571658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613030
11529	NC_013959	CGG	2	6	571674	571679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613030
11530	NC_013959	TGC	2	6	571697	571702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613030
11531	NC_013959	GC	3	6	571816	571821	0 %	0 %	50 %	50 %	291613030
11532	NC_013959	CGA	2	6	571863	571868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613030
11533	NC_013959	ACT	2	6	571893	571898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613030
11534	NC_013959	CCA	2	6	572015	572020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613030
11535	NC_013959	CCA	2	6	572117	572122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613030
11536	NC_013959	TCGGC	2	10	572132	572141	0 %	20 %	40 %	40 %	291613030
11537	NC_013959	ATC	2	6	572179	572184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613030
11538	NC_013959	TCA	2	6	572371	572376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613031
11539	NC_013959	CTG	2	6	572379	572384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613031
11540	NC_013959	CTT	2	6	572390	572395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613031
11541	NC_013959	GTG	2	6	572397	572402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613031
11542	NC_013959	GAA	2	6	572645	572650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613031
11543	NC_013959	CAG	2	6	572885	572890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613031
11544	NC_013959	CGT	2	6	572891	572896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613031
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11547	NC_013959	CTG	2	6	573212	573217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613032
11548	NC_013959	GGC	2	6	573363	573368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613032
11549	NC_013959	GC	3	6	573380	573385	0 %	0 %	50 %	50 %	291613032
11550	NC_013959	TTG	2	6	573405	573410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291613032
11551	NC_013959	ACG	2	6	573495	573500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613032
11552	NC_013959	AGC	2	6	573512	573517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613032
11553	NC_013959	TCG	2	6	573522	573527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613032
11554	NC_013959	GCTT	2	8	573671	573678	0 %	50 %	25 %	25 %	291613033
11555	NC_013959	CTT	2	6	573691	573696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613033
11556	NC_013959	GCG	2	6	573708	573713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613033
11557	NC_013959	TGC	2	6	573723	573728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613033
11558	NC_013959	TGG	2	6	573753	573758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613033
11559	NC_013959	GCTGT	2	10	573791	573800	0 %	40 %	40 %	20 %	291613033
11560	NC_013959	GCT	2	6	573821	573826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613033
11561	NC_013959	GC	3	6	573830	573835	0 %	0 %	50 %	50 %	291613033
11562	NC_013959	GGGT	2	8	573858	573865	0 %	25 %	75 %	0 %	291613033
11563	NC_013959	T	6	6	573879	573884	0 %	100 %	0 %	0 %	291613033
11564	NC_013959	GCT	2	6	574013	574018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613034
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11568	NC_013959	GC	4	8	574170	574177	0 %	0 %	50 %	50 %	291613034
11569	NC_013959	TCGC	2	8	574298	574305	0 %	25 %	25 %	50 %	291613034
11570	NC_013959	GCAG	2	8	574507	574514	25 %	0 %	50 %	25 %	291613034
11571	NC_013959	GCG	2	6	574525	574530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613034
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11575	NC_013959	TCA	2	6	575297	575302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613035
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11578	NC_013959	GTG	2	6	575499	575504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613036
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11583	NC_013959	GACAT	2	10	575842	575851	40 %	20 %	20 %	20 %	291613037
11584	NC_013959	ACC	2	6	575853	575858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613037
11585	NC_013959	AGC	2	6	575868	575873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613037
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11587	NC_013959	GCT	2	6	575948	575953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613037
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11589	NC_013959	ATCA	2	8	576045	576052	50 %	25 %	0 %	25 %	291613037
11590	NC_013959	GAT	2	6	576119	576124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613037
11591	NC_013959	GATC	2	8	576155	576162	25 %	25 %	25 %	25 %	291613037
11592	NC_013959	GCG	2	6	576183	576188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613037
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11598	NC_013959	CGA	2	6	576397	576402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613037
11599	NC_013959	TGGTC	2	10	576413	576422	0 %	40 %	40 %	20 %	291613037
11600	NC_013959	AAC	2	6	576423	576428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613037
11601	NC_013959	GTG	2	6	576445	576450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613037
11602	NC_013959	TGGGTA	2	12	576457	576468	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	291613037
11603	NC_013959	CAA	2	6	576569	576574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613038
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11605	NC_013959	CGGT	2	8	576645	576652	0 %	25 %	50 %	25 %	291613038
11606	NC_013959	CG	3	6	576735	576740	0 %	0 %	50 %	50 %	291613038
11607	NC_013959	GCA	2	6	576754	576759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613038
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11610	NC_013959	ACA	2	6	576837	576842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613038
11611	NC_013959	CTT	2	6	577116	577121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613038
11612	NC_013959	CGA	2	6	577122	577127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613038
11613	NC_013959	GGGC	2	8	577141	577148	0 %	0 %	75 %	25 %	291613038
11614	NC_013959	TCGCT	2	10	577155	577164	0 %	40 %	20 %	40 %	291613038
11615	NC_013959	CAA	2	6	577182	577187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613038
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11617	NC_013959	CGG	2	6	577284	577289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613038
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11619	NC_013959	GCG	2	6	577331	577336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613038
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11855	NC_013959	GTG	2	6	589323	589328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613049
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11972	NC_013959	AG	4	8	595229	595236	50 %	0 %	50 %	0 %	291613054
11973	NC_013959	CAT	2	6	595306	595311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613054
11974	NC_013959	GC	3	6	595399	595404	0 %	0 %	50 %	50 %	291613054
11975	NC_013959	GAAA	2	8	595455	595462	75 %	0 %	25 %	0 %	291613054
11976	NC_013959	CAG	2	6	595567	595572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613054
11977	NC_013959	AGC	2	6	595616	595621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613054
11978	NC_013959	CAG	2	6	595660	595665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613054
11979	NC_013959	ATG	2	6	595688	595693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613054
11980	NC_013959	CCAT	2	8	595742	595749	25 %	25 %	0 %	50 %	291613054
11981	NC_013959	AGCG	2	8	595865	595872	25 %	0 %	50 %	25 %	291613054
11982	NC_013959	GTC	2	6	595903	595908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613054
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11984	NC_013959	CAAT	2	8	595917	595924	50 %	25 %	0 %	25 %	291613054
11985	NC_013959	ATTCA	2	10	595927	595936	40 %	40 %	0 %	20 %	291613054
11986	NC_013959	CAT	2	6	595945	595950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613054
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11998	NC_013959	TGA	2	6	596578	596583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613055
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