MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 60283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_013959	TGC	2	6	549035	549040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613010
11002	NC_013959	CGA	2	6	549042	549047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613010
11003	NC_013959	TCG	2	6	549101	549106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613010
11004	NC_013959	TGC	2	6	549149	549154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613010
11005	NC_013959	CGA	2	6	549171	549176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613010
11006	NC_013959	GCT	3	9	549180	549188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613010
11007	NC_013959	ACA	2	6	549206	549211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613010
11008	NC_013959	GAT	2	6	549219	549224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613010
11009	NC_013959	GC	3	6	549330	549335	0 %	0 %	50 %	50 %	291613011
11010	NC_013959	GTT	2	6	549383	549388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291613011
11011	NC_013959	TGC	2	6	549421	549426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613011
11012	NC_013959	AGG	2	6	549436	549441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291613011
11013	NC_013959	TGC	2	6	549469	549474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613011
11014	NC_013959	CGAC	2	8	549481	549488	25 %	0 %	25 %	50 %	291613011
11015	NC_013959	GCTG	2	8	549499	549506	0 %	25 %	50 %	25 %	291613011
11016	NC_013959	TCA	2	6	549539	549544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613011
11017	NC_013959	CTG	2	6	549549	549554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613011
11018	NC_013959	TTC	2	6	549678	549683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613011
11019	NC_013959	TGC	2	6	549694	549699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613011
11020	NC_013959	GCG	2	6	549721	549726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613011
11021	NC_013959	ACGA	2	8	549744	549751	50 %	0 %	25 %	25 %	291613011
11022	NC_013959	TCC	2	6	549785	549790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291613011
11023	NC_013959	A	6	6	549810	549815	100 %	0 %	0 %	0 %	291613011
11024	NC_013959	GCC	2	6	549816	549821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613011
11025	NC_013959	AGC	2	6	549830	549835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613011
11026	NC_013959	TCG	2	6	550056	550061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613012
11027	NC_013959	CGG	2	6	550078	550083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613012
11028	NC_013959	GC	3	6	550110	550115	0 %	0 %	50 %	50 %	291613012
11029	NC_013959	TGA	2	6	550137	550142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613012
11030	NC_013959	CGG	2	6	550144	550149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613012
11031	NC_013959	CTT	2	6	550165	550170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613012
11032	NC_013959	ACA	2	6	550242	550247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613012
11033	NC_013959	AG	3	6	550249	550254	50 %	0 %	50 %	0 %	291613012
11034	NC_013959	GCT	2	6	550285	550290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613012
11035	NC_013959	AAG	2	6	550305	550310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613012
11036	NC_013959	AG	3	6	550348	550353	50 %	0 %	50 %	0 %	291613012
11037	NC_013959	GCTG	2	8	550381	550388	0 %	25 %	50 %	25 %	291613012
11038	NC_013959	ACC	2	6	550389	550394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613012
11039	NC_013959	CAT	2	6	550426	550431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613012
11040	NC_013959	GATG	2	8	550471	550478	25 %	25 %	50 %	0 %	291613012
11041	NC_013959	CAC	2	6	550496	550501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613012
11042	NC_013959	TCG	2	6	550563	550568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613012
11043	NC_013959	GTG	2	6	550583	550588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613012
11044	NC_013959	TCCC	2	8	550611	550618	0 %	25 %	0 %	75 %	291613012
11045	NC_013959	TTG	2	6	550673	550678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291613012
11046	NC_013959	GAA	2	6	550727	550732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613012
11047	NC_013959	TGC	2	6	550743	550748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613012
11048	NC_013959	GTC	2	6	550760	550765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613012
11049	NC_013959	CTG	2	6	550766	550771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613012
11050	NC_013959	TCG	2	6	550851	550856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613012
11051	NC_013959	CGAA	2	8	550927	550934	50 %	0 %	25 %	25 %	291613013
11052	NC_013959	TCA	2	6	550951	550956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613013
11053	NC_013959	A	6	6	550964	550969	100 %	0 %	0 %	0 %	291613013
11054	NC_013959	TGG	2	6	550988	550993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613013
11055	NC_013959	ATG	2	6	551031	551036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613013
11056	NC_013959	TTC	2	6	551040	551045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613013
11057	NC_013959	CTG	2	6	551046	551051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613013
11058	NC_013959	GGT	2	6	551136	551141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613013
11059	NC_013959	CAT	2	6	551165	551170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613013
11060	NC_013959	GTCAA	2	10	551206	551215	40 %	20 %	20 %	20 %	291613013
11061	NC_013959	CTG	2	6	551226	551231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613013
11062	NC_013959	AAG	2	6	551238	551243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613013
11063	NC_013959	GAAA	2	8	551286	551293	75 %	0 %	25 %	0 %	291613013
11064	NC_013959	GAA	2	6	551363	551368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613013
11065	NC_013959	CGC	2	6	551631	551636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613013
11066	NC_013959	G	6	6	551649	551654	0 %	0 %	100 %	0 %	291613013
11067	NC_013959	AGA	2	6	551660	551665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613013
11068	NC_013959	GTC	2	6	551690	551695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613013
11069	NC_013959	GCTGT	2	10	551697	551706	0 %	40 %	40 %	20 %	291613013
11070	NC_013959	CCG	2	6	551738	551743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613013
11071	NC_013959	CAT	2	6	551750	551755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613013
11072	NC_013959	TGA	2	6	551758	551763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613013
11073	NC_013959	GGC	2	6	551796	551801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613013
11074	NC_013959	AAC	2	6	552019	552024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613014
11075	NC_013959	TGG	2	6	552025	552030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613014
11076	NC_013959	AGC	2	6	552031	552036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613014
11077	NC_013959	ATCA	2	8	552039	552046	50 %	25 %	0 %	25 %	291613014
11078	NC_013959	CTG	2	6	552079	552084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613014
11079	NC_013959	GTG	2	6	552085	552090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613014
11080	NC_013959	GCG	2	6	552097	552102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613014
11081	NC_013959	GGA	2	6	552141	552146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291613014
11082	NC_013959	CG	3	6	552157	552162	0 %	0 %	50 %	50 %	291613014
11083	NC_013959	GTA	2	6	552163	552168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613014
11084	NC_013959	ATG	3	9	552199	552207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613014
11085	NC_013959	GCA	2	6	552215	552220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613014
11086	NC_013959	AAG	2	6	552253	552258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613014
11087	NC_013959	GGC	2	6	552261	552266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613014
11088	NC_013959	CCAG	2	8	552269	552276	25 %	0 %	25 %	50 %	291613014
11089	NC_013959	CGGCA	2	10	552300	552309	20 %	0 %	40 %	40 %	291613014
11090	NC_013959	CG	3	6	552367	552372	0 %	0 %	50 %	50 %	291613014
11091	NC_013959	CGGTGA	2	12	552530	552541	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291613014
11092	NC_013959	TTC	2	6	552628	552633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613014
11093	NC_013959	GGCT	2	8	552640	552647	0 %	25 %	50 %	25 %	291613014
11094	NC_013959	GCA	2	6	552681	552686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613014
11095	NC_013959	CGC	2	6	552724	552729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613014
11096	NC_013959	CAT	2	6	552804	552809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613014
11097	NC_013959	GCCA	2	8	552850	552857	25 %	0 %	25 %	50 %	291613014
11098	NC_013959	GGAT	2	8	552885	552892	25 %	25 %	50 %	0 %	291613014
11099	NC_013959	GA	3	6	552894	552899	50 %	0 %	50 %	0 %	291613014
11100	NC_013959	TTC	2	6	552915	552920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613014
11101	NC_013959	A	6	6	553001	553006	100 %	0 %	0 %	0 %	291613014
11102	NC_013959	CAG	2	6	553084	553089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613014
11103	NC_013959	GCA	2	6	553146	553151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613014
11104	NC_013959	GACCA	2	10	553168	553177	40 %	0 %	20 %	40 %	291613014
11105	NC_013959	CTG	2	6	553180	553185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613014
11106	NC_013959	GGC	2	6	553206	553211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613014
11107	NC_013959	GGT	2	6	553242	553247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613014
11108	NC_013959	CTG	2	6	553409	553414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613014
11109	NC_013959	GTCGGT	2	12	553453	553464	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291613014
11110	NC_013959	TCG	2	6	553469	553474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613014
11111	NC_013959	GCAAG	2	10	553493	553502	40 %	0 %	40 %	20 %	291613014
11112	NC_013959	GC	3	6	553695	553700	0 %	0 %	50 %	50 %	291613015
11113	NC_013959	CTG	2	6	553707	553712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613015
11114	NC_013959	CAT	2	6	553721	553726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613015
11115	NC_013959	GCG	2	6	553805	553810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613015
11116	NC_013959	CATC	2	8	553811	553818	25 %	25 %	0 %	50 %	291613015
11117	NC_013959	CAT	2	6	553838	553843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613015
11118	NC_013959	GGC	2	6	553877	553882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613015
11119	NC_013959	GCA	2	6	553886	553891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613015
11120	NC_013959	GCA	2	6	553899	553904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613015
11121	NC_013959	CCG	2	6	553906	553911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613015
11122	NC_013959	ATC	2	6	553927	553932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613015
11123	NC_013959	GC	3	6	554055	554060	0 %	0 %	50 %	50 %	291613015
11124	NC_013959	CAA	2	6	554130	554135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613015
11125	NC_013959	CTG	2	6	554136	554141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613015
11126	NC_013959	GCA	2	6	554169	554174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613015
11127	NC_013959	GCAG	2	8	554192	554199	25 %	0 %	50 %	25 %	291613015
11128	NC_013959	GGC	2	6	554213	554218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613015
11129	NC_013959	GGC	2	6	554231	554236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613015
11130	NC_013959	ACA	2	6	554254	554259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613015
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11132	NC_013959	GCGGTA	2	12	554292	554303	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291613015
11133	NC_013959	CAT	2	6	554324	554329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613015
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11135	NC_013959	GCC	2	6	554442	554447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613015
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11139	NC_013959	GCA	2	6	554690	554695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613015
11140	NC_013959	ATG	3	9	554724	554732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613015
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11142	NC_013959	CAA	2	6	554826	554831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613015
11143	NC_013959	GACCA	2	10	554847	554856	40 %	0 %	20 %	40 %	291613015
11144	NC_013959	CTG	2	6	554859	554864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613015
11145	NC_013959	GGC	2	6	554885	554890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613015
11146	NC_013959	GCCAG	2	10	555172	555181	20 %	0 %	40 %	40 %	291613015
11147	NC_013959	CG	3	6	555191	555196	0 %	0 %	50 %	50 %	291613015
11148	NC_013959	GGA	2	6	555224	555229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291613015
11149	NC_013959	GCC	2	6	555237	555242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613015
11150	NC_013959	GA	3	6	555287	555292	50 %	0 %	50 %	0 %	291613015
11151	NC_013959	TCA	2	6	555433	555438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613016
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11154	NC_013959	GAA	2	6	555596	555601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613016
11155	NC_013959	ACT	2	6	555622	555627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613016
11156	NC_013959	GC	3	6	555632	555637	0 %	0 %	50 %	50 %	291613016
11157	NC_013959	GAAGCC	2	12	555720	555731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613016
11158	NC_013959	GTC	2	6	555765	555770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613016
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11162	NC_013959	AGA	2	6	555914	555919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613016
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11200	NC_013959	GAA	2	6	557487	557492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613017
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11204	NC_013959	CG	4	8	557639	557646	0 %	0 %	50 %	50 %	291613017
11205	NC_013959	GCG	2	6	557687	557692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613017
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11212	NC_013959	GGC	2	6	557878	557883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613017
11213	NC_013959	GGAC	2	8	557910	557917	25 %	0 %	50 %	25 %	291613017
11214	NC_013959	TGA	3	9	557924	557932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613017
11215	NC_013959	TCGAT	2	10	557964	557973	20 %	40 %	20 %	20 %	291613017
11216	NC_013959	CGA	2	6	557976	557981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613017
11217	NC_013959	GAT	2	6	557982	557987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613017
11218	NC_013959	GGCAC	2	10	558051	558060	20 %	0 %	40 %	40 %	291613017
11219	NC_013959	CGC	2	6	558102	558107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613017
11220	NC_013959	CA	3	6	558169	558174	50 %	0 %	0 %	50 %	291613017
11221	NC_013959	GATG	2	8	558225	558232	25 %	25 %	50 %	0 %	291613017
11222	NC_013959	CAG	2	6	558322	558327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613017
11223	NC_013959	CTG	2	6	558403	558408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613017
11224	NC_013959	ACG	2	6	558462	558467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613018
11225	NC_013959	GC	3	6	558488	558493	0 %	0 %	50 %	50 %	291613018
11226	NC_013959	CAA	2	6	558511	558516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613018
11227	NC_013959	CTG	2	6	558527	558532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613018
11228	NC_013959	GCA	2	6	558543	558548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613018
11229	NC_013959	TCAAGG	2	12	558573	558584	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291613018
11230	NC_013959	CGG	2	6	558628	558633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613018
11231	NC_013959	CAT	2	6	558787	558792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613018
11232	NC_013959	TCA	2	6	558852	558857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613018
11233	NC_013959	TCT	2	6	558987	558992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291613018
11234	NC_013959	CGA	2	6	558997	559002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291613018
11235	NC_013959	TGG	2	6	559008	559013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613018
11236	NC_013959	CGC	2	6	559016	559021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613018
11237	NC_013959	CAA	2	6	559069	559074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291613018
11238	NC_013959	TGA	2	6	559234	559239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291613018
11239	NC_013959	GGT	2	6	559246	559251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613018
11240	NC_013959	TCG	2	6	559259	559264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613018
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11349	NC_013959	GC	3	6	563908	563913	0 %	0 %	50 %	50 %	291613023
11350	NC_013959	CTG	2	6	563948	563953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613023
11351	NC_013959	CAC	2	6	563998	564003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613023
11352	NC_013959	CTTT	2	8	564015	564022	0 %	75 %	0 %	25 %	291613023
11353	NC_013959	GAA	2	6	564119	564124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291613023
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11355	NC_013959	GGCG	2	8	564167	564174	0 %	0 %	75 %	25 %	291613023
11356	NC_013959	CAT	2	6	564184	564189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291613023
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11358	NC_013959	TTTC	2	8	564286	564293	0 %	75 %	0 %	25 %	291613023
11359	NC_013959	CCG	2	6	564361	564366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291613023
11360	NC_013959	CTG	2	6	564374	564379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613023
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11474	NC_013959	CG	3	6	569247	569252	0 %	0 %	50 %	50 %	291613027
11475	NC_013959	GCG	3	9	569250	569258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613027
11476	NC_013959	GGTC	2	8	569269	569276	0 %	25 %	50 %	25 %	291613027
11477	NC_013959	ACC	4	12	569294	569305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291613027
11478	NC_013959	GGC	2	6	569314	569319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291613027
11479	NC_013959	GTG	2	6	569327	569332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291613027
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11482	NC_013959	CTG	2	6	569585	569590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291613027
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