MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 60283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_013959	CCA	2	6	500656	500661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612962
10002	NC_013959	CGG	2	6	500669	500674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612962
10003	NC_013959	CCG	2	6	500692	500697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612962
10004	NC_013959	TGA	2	6	500740	500745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612962
10005	NC_013959	CATC	2	8	500878	500885	25 %	25 %	0 %	50 %	291612962
10006	NC_013959	CAGC	2	8	500890	500897	25 %	0 %	25 %	50 %	291612962
10007	NC_013959	CAG	2	6	500933	500938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612962
10008	NC_013959	GTT	2	6	500978	500983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612962
10009	NC_013959	GTT	2	6	500990	500995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612962
10010	NC_013959	CTG	2	6	501011	501016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612962
10011	NC_013959	CGA	2	6	501019	501024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612962
10012	NC_013959	CGC	2	6	501040	501045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612962
10013	NC_013959	GCC	2	6	501108	501113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612962
10014	NC_013959	GCGCC	2	10	501164	501173	0 %	0 %	40 %	60 %	291612962
10015	NC_013959	CG	3	6	501200	501205	0 %	0 %	50 %	50 %	291612962
10016	NC_013959	CTG	2	6	501218	501223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612962
10017	NC_013959	GCG	2	6	501237	501242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612962
10018	NC_013959	GTC	2	6	501246	501251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612962
10019	NC_013959	CAG	2	6	501266	501271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612962
10020	NC_013959	CACCAG	2	12	501272	501283	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	291612962
10021	NC_013959	TTG	2	6	501293	501298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612962
10022	NC_013959	CGC	2	6	501342	501347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612963
10023	NC_013959	TTCCAC	2	12	501361	501372	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	291612963
10024	NC_013959	GCGG	2	8	501401	501408	0 %	0 %	75 %	25 %	291612963
10025	NC_013959	GGC	2	6	501429	501434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612963
10026	NC_013959	CAG	2	6	501472	501477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612963
10027	NC_013959	GCA	2	6	501528	501533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612963
10028	NC_013959	GCG	2	6	501573	501578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612963
10029	NC_013959	GCC	2	6	501604	501609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612963
10030	NC_013959	GCA	2	6	501714	501719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612963
10031	NC_013959	TC	3	6	501729	501734	0 %	50 %	0 %	50 %	291612963
10032	NC_013959	CGA	2	6	501867	501872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612963
10033	NC_013959	GAC	2	6	501987	501992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612964
10034	NC_013959	GCG	2	6	501996	502001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612964
10035	NC_013959	TGG	2	6	502004	502009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612964
10036	NC_013959	CTT	2	6	502028	502033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612964
10037	NC_013959	TTC	2	6	502065	502070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612964
10038	NC_013959	GC	3	6	502104	502109	0 %	0 %	50 %	50 %	291612964
10039	NC_013959	CGG	2	6	502208	502213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612964
10040	NC_013959	ATGGCG	2	12	502216	502227	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291612964
10041	NC_013959	CGA	2	6	502241	502246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612964
10042	NC_013959	CGA	2	6	502330	502335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612965
10043	NC_013959	CGC	2	6	502382	502387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612965
10044	NC_013959	GCG	2	6	502427	502432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612965
10045	NC_013959	CG	3	6	502477	502482	0 %	0 %	50 %	50 %	291612965
10046	NC_013959	GCA	2	6	502486	502491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612965
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10048	NC_013959	GCC	2	6	502583	502588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612965
10049	NC_013959	TCG	2	6	502600	502605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612965
10050	NC_013959	CGC	2	6	502606	502611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612965
10051	NC_013959	CAG	2	6	502619	502624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612965
10052	NC_013959	ATG	2	6	502698	502703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612965
10053	NC_013959	CGT	2	6	502923	502928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612966
10054	NC_013959	CCG	2	6	502937	502942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612966
10055	NC_013959	TGG	2	6	503085	503090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612966
10056	NC_013959	TTC	2	6	503093	503098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612966
10057	NC_013959	GTG	2	6	503123	503128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612966
10058	NC_013959	TGG	2	6	503175	503180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612966
10059	NC_013959	GGC	2	6	503194	503199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612966
10060	NC_013959	GC	3	6	503206	503211	0 %	0 %	50 %	50 %	291612966
10061	NC_013959	TCA	2	6	503226	503231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612966
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10064	NC_013959	TCA	3	9	503500	503508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612967
10065	NC_013959	GAT	2	6	503530	503535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612967
10066	NC_013959	GCA	2	6	503538	503543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612967
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10068	NC_013959	AGCG	2	8	503611	503618	25 %	0 %	50 %	25 %	291612967
10069	NC_013959	CTG	2	6	503647	503652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612967
10070	NC_013959	GGC	2	6	503682	503687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612967
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10078	NC_013959	GTT	2	6	503914	503919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612967
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10084	NC_013959	ACG	2	6	504146	504151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612967
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10086	NC_013959	GAC	2	6	504190	504195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612967
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10088	NC_013959	TGC	2	6	504230	504235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612967
10089	NC_013959	CTG	2	6	504241	504246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612967
10090	NC_013959	TGA	2	6	504312	504317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612967
10091	NC_013959	GC	4	8	504362	504369	0 %	0 %	50 %	50 %	291612967
10092	NC_013959	TGG	2	6	504402	504407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612967
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10095	NC_013959	GC	3	6	504643	504648	0 %	0 %	50 %	50 %	291612967
10096	NC_013959	CTG	2	6	504693	504698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612967
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10100	NC_013959	ACC	2	6	505048	505053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612968
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10102	NC_013959	TGC	2	6	505114	505119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612968
10103	NC_013959	GC	3	6	505126	505131	0 %	0 %	50 %	50 %	291612968
10104	NC_013959	TGC	2	6	505142	505147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612968
10105	NC_013959	GCCG	2	8	505224	505231	0 %	0 %	50 %	50 %	291612968
10106	NC_013959	GGC	2	6	505322	505327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612968
10107	NC_013959	CGA	2	6	505352	505357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612968
10108	NC_013959	AG	3	6	505365	505370	50 %	0 %	50 %	0 %	291612968
10109	NC_013959	ACTGC	2	10	505469	505478	20 %	20 %	20 %	40 %	291612968
10110	NC_013959	GC	3	6	505546	505551	0 %	0 %	50 %	50 %	291612968
10111	NC_013959	TCA	2	6	505640	505645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612968
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10113	NC_013959	TGGT	2	8	505744	505751	0 %	50 %	50 %	0 %	291612968
10114	NC_013959	CAT	2	6	505758	505763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612968
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10116	NC_013959	CAC	2	6	506049	506054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612968
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10118	NC_013959	CGT	2	6	506147	506152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612968
10119	NC_013959	CGG	2	6	506171	506176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612968
10120	NC_013959	GCA	3	9	506192	506200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612968
10121	NC_013959	TCG	2	6	506227	506232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612968
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10127	NC_013959	GCG	2	6	506463	506468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612968
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10474	NC_013959	TTG	2	6	522806	522811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612987
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